Desarrollo de nuevos loci de microsatélites para Geoffroea decorticans Burkart

Contreras R.; Carevic, F; Arias, M; Diaz, B

Abstract

Introducción y objetivos: Una de las pocas especies de árboles adaptado a las condiciones ecológicamente limitantes del desierto de Atacama es Geoffroea decorticans, conocido como chañar. Es un valioso recurso multipropósito utilizado como alimento y producto medicinal. Sin embargo, con el fin de realizar estudios genéticos, aún no se han desarrollado marcadores de ADN codominantes específicos para esta especie. El objetivo del presente trabajo es desarrollar y validar marcadores SSR para G. decorticans, con el fin de analizar en el futuro estudios de diversidad genética y estructura genética de poblaciones. M&M: Se buscaron marcadores SSR en el genoma de G. decorticans a partir del método Next-Generation Sequency (NGS), y se validaron a través de treinta individuos distribuidos en diferentes localidades del norte de Chile. Resultados: Se descubrió un total de ~144.117 loci de microsatélites y de ellos se usó un set de 41 pares de cebadores para la validación. Los fragmentos amplificados variaron de 106 pb a 225 pb, y el número de alelos varió de 2 a 9, y el valor PIC de los 41 loci SSR osciló entre 0,32 y 0,86, con un promedio de 0,64. Conclusiones: Por primera vez se han desarrollado marcadores SSR neutros específico de la especie G. decorticans con el fin de apoyar estudios genéticos para la conservación de la especie. El presente estudio provee un set de 38 nuevos marcadores SSR polimórficos, los cuales podrían servir como una herramienta efectiva para estimar diversidad genética, estructura genética y desarrollar programas de mejoramiento.

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Título de la Revista: BOLETIN DE LA SOCIEDAD ARGENTINA DE BOTANICA
Editorial: SOC ARGENTINA BOTANICA
Fecha de publicación: 2021