Desarrollo de un panel reducido de SNP para la identificación de la especie en el género Mytilus para su aplicación en trazabilidad de alimentos

Larraín, María A.; Jilberto, Felipe; Sepúlveda, Matías; Quintrel, Marianela; Araneda, Cristian

Abstract

La identificación de la especie dentro del género Mytilus es problemática por las semejanzas morfológicas que existen entre las especies de importancia comercial (M. chilensis, M. edulis y M. galloprovincialis). Esta dificultad aumenta en productos procesados desconchados, haciendo prácticamente imposible la identificación basándose en criterios morfológicos. Actualmente, gracias a los avances en NGS es posible tener cientos de marcadores SNP que pueden ser usados para la identificación de la especie, pero estos paneles masivos de SNPs no son prácticos para el uso rutinario en laboratorios de análisis. Además, es necesario evaluar el desempeño del método y validarlo según protocolos internacionales. Seleccionamos 20 SNP altamente informativos para la identificación de la especie y estandarizamos la metodología para genotiparlos por “High resolution melting” (HRM). Probamos el método en productos frescos, congelados y enlatados de las especies objetivo (n = 136) y en otras cuatro especies de mejillones (cercanas o comunes en alimentos, n = 80). El 100% de los individuos fue correctamente asignado a especie. Además, se genotiparon individuos de especies cercanas al género Mytilus (Perumytilus purpuratus y Semimytilus algosus) e individuos de otras especies de mejillones comunes en alimentos (Aulacomya atra y Choromytilus chorus), demostrándose que el método las excluye correctamente del género Mytilus. El método fue validado internamente estableciéndose su aplicabilidad, sensibilidad, robustez y especificidad. Se redactaron los procedimientos operacionales estandarizados (POE) y transfiriéndose a un 2° Laboratorio, teniendo máxima concordancia entre los resultados de ambos lugares (Kappa de Cohen = 1)

Más información

Editorial: XXXIX Congreso de Ciencias del Mar.
Fecha de publicación: 2019
Año de Inicio/Término: 27-31 de mayo de 2019.
Financiamiento/Sponsor: FONDEF ID16I10013
URL: http://www.congresocienciasdelmar.cl/wp-content/uploads/2019/05/Libro-de-resumenes-2019.pdf