Análisis in silico de genes de resistencia a antibióticos: definiendo el resistoma de Piscirickettsia salmonis.

Keywords: resistance, antibiotic, piscirickettsia, salmonis, resistome

Abstract

La bacteria gram negativa Piscirickettsia salmonis, es causante de la Septicemia Rickettsial del Salmón (SRS) o Piscirickettsiosis. Debido a su naturaleza intracelular, su prevención y control no ha sido lograda con estrategias convencionales, siendo el uso de antibióticos, tales como oxitetraciclina y florfenicol, los que mejores efectos han logrado. Aun así la enfermedad no ha pos¡dido ser erradicada desde los centros de cultivo, generando pérdidas anuales de US$700-800 millones. El exesivo uso de antibióticos han seleccionado cepas resistentes a las que podrían comenzar a ser refractarias a los tratamientos y generar un problema sanitario aun peor. A pesar de que hoy en día existen análisis de resistomas en P. salmonis se limitan a cepas específicas, es por ello que en este trabajo se analizaron in silico 31 genomas disponibles de distintas cepas y aislados del patógeno, para la identificación y caracterización de su resistoma. Entre los resultados más relevante se puede mencionar que se han encontrando 9 genes comunes entre cepas asociados a la resistencia a los antibióticos de la familia de las quinolonas. Es así como se logró identificar sus regiones QRDR (quinolone resistance determining region) y DRDR (Drug resistance determining regions) y sus mutaciones asociadas. Adicionalmente se logró establecer una diferencia entre los genogrupos LF89-like y EM90-like corroborando a través de filogenia estas organizaciones, siendo este último genogrupo el contenedor de mayor número de mutaciones en los diversos genes encontrados. También se encontró una mayor probabilidad de resistencias a quinolonas, antibiótico actualmente en desuso, mientras que genes dirigidos a la resistencia de antibióticos como oxitetraciclina y florfenicol no aparecieron en el análisis, dando la posibilidad que la resistencia hacia estos últimos sea una resistencia intrínseca de la bacteria o sea algún gen contenido en alguno de los plásmido de esta bacteria.

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Fecha de publicación: 2018