Abstract

C. elegans entra en diapausa en respuesta a la inanición, altas temperaturas y altas concentraciones de feromonas, formando la larva dauer. Nuestro trabajo previo demostró que C. elegans, ademas forma dauers como un mecanismo de defensa transgeneracional ante los patógenos P. aeruginosa y S. Typhimurium, mediado por la maquinaria de RNA de interferencia (RNAi). Propusimos que en la comunicación bacteria-gusano, dsRNAs bacterianos gatillan un proceso dependiente de RNAi, generando endo-siRNA que son acumulados en la línea germinal y transmitidos a la progenie para promover la formación de diapausa (Palominos et al., en revisión). Para entender cuáles son las efectores del gusano que se acumulan en respuesta a patógenos (small RNA y sus blancos mRNA), realizamos un análisis transcriptómico del RNA total de gusanos e identificamos un grupo de small RNAs y mRNA regulados diferencialmente en respuesta a P. aeruginosa PAO1 y S. Typhimurium MST1 en comparación con E. coli OP50 no patogénica. Dentro de los candidatos efectores se encuentran mir-243, mir-51 y mir-52, sobreexpresados en respuesta a ambas bacterias patogénicas. Validamos in vivo la importancia de estos miRNAs, exponiendo cepas mutantes a patógenos y cuantificando la formacion de dauer en la segunda generación. Animales mir-243, mir-51 y mir-52 no forman dauers, confirmando una causalidad directa entre estos miRNAs y la defensa transgeneracional ante patógenos. Los mRNAs blancos de estos miRNAs, fueron predichos usando IntaRNA, un predictor de interacciones RNA-RNA. Finalmente, analizamos redes de interacción in silico entre sRNAs y mRNA expresados diferencialmente, usando LoTo y Cytoscape, lo que nos permitirá tener una visión amplia del proceso de formación de diapausa transgeneracional en respuesta a patógenos.