METODO PARA IDENTIFICAR Y CUANTIFICAR MICROORGANISMOS DE LOS DOMINIOS BACTERIA Y ARCHAEA UTILES EN PROCESOS DE BIOMINERIA, MEDIANTE UN PCR PRIMARIO, CON PARTIDORES UNIVERSALES PARA EL ADN RIBOSOMAL Y UN SEGUNDO PCR CUANTITATIVO, QUE EMPLEA PARTIDORES IDENTIFICADOS POR SUS SECUENCIAS NUCLEOTIDICAS.

Parada, Pilar; Ehrenfeld, Katia; Pacheco Cruz, Igor; Alejandro Maass; Aravena, Andres; Mauricio González

Keywords: biomining, qpcr

Abstract

LA PRESENTE INVENCION DIVULGA UN METODO PARA IDENTIFICAR Y CUANTIFICAR MICROORGANISMOS UTILES EN LOS PROCESOS DE BIOMINERIA, DE LOS DOMINIOS BACTERIA Y ARCHAEA. DONDE EL METODO COMPRENDE LAS SIGUIENTES ETAPAS: (A) EXTRAER ADN DE UNA BIOMINERA, (B) CUANTIFICAR EL ADN EXTRAIDO POR ESPECTROFOTOMETRIA; (C) REALIZAR UN PCR PRIMARIO CON PARTIDORES UINIVERSALES PARA SECUENCIAS DEL GEN 16S ADNR PARA LOS DOMINIOS: (I) BACTERIA Y/O (II)ARCHAEA, (D) EJECUTAR LA TECNICA PCR CUANTITATIVO (QPCR), EMPLEANDO COMO TEMPLADO LA MUESTRA DE ADN O EN CASO DADO EL PRODUCTO AMPLIFICADO OBTENIDO EN EL PCR PRIMARIO, Y PARTIDORES ESPECIFICOS PARA CADA TAXON, DONDE LOS TAXONES SE ESCOGEN ENTRE: (I) BACTERIAS: BACTERIAS TOTALES, ACIDIPHILIUM SP., LEPTOSPIRILLUM SP., SULFOBACILLUS SP., ACIDITHIOBACILLUS FERROOXIDANS Y ACIDITHIOBACILLUS THIOOXIDANS; Y (II) ARCHAEAS TOTALES, ACIDIANUS SP., FERROPLASMA SP., METALLOSPHAERA SP., SULFOLOBUS SP., Y THERMOPLASMA SP., Y LOS PARTIDORES SE ESCOGEN ENTRE LOS PARTIDORES SENTIDO Y ANTISENTIDO DESCRITOS EN LAS SECUENCIAS SEQ. ID N° 4 A 417; Y (E) CALCULAR EL NUMERO DE MICROORGANISMOS DE CADA UNO DE LOS TAXONES ANALIZADOS PRESENTES EN LA MUESTRA. EL PRIMER PCR MULTIPLICA LINEALMENTE LAS SECUENCIAS DE 16S DE LAS BACTERIAS O ARQUEAS, DE MODO DE AUMENTAR LA ABUNDANCIA DE LOS TEMPLADOS PARA EL PCR SECUNDARIO MANTENIENDO LA PROPORCION ORIGINAL DE LOS MICROORGANISMOS PRESENTES EN LA MUESTRA. ESTO GARANTIZA QUE EL METODO TENGA UNA MAYOR SENSIBILIDAD QUE LA QUE TENDRIA EN EL CASO DE UTILIZAR DIRECTAMENTE LOS PARTIDORES TAXON ESPECIFICOS SOBRE LA MUESTRA.

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Fecha de publicación: 2010
URL: https://ion.inapi.cl/Patente/ConsultaAvanzadaPatentes.aspx
DOI:

200502179

Notas: This patent was granted in Chile, USA, SouthAfrica and Australia. It was also presented in MEXICO, ARGENTINA, BRASIL,PERU and FRANCE