ANOTACIÓN FUNCIONAL DE PROTEÍNAS HIPOTÉTICAS DENTRO DEL GENOMA DE Mycobacterium microti POR MEDIO DE HERRAMIENTAS BIOINFORMÁTICAS
Keywords: Mycobacterium tuberculosis, kit, diagnosis, diagnostico, tuberculosis, Proteinas hipoteticas
Abstract
Mycobacterium microti es miembro del complejo MBTC (complejo Mycobacterium tuberculosis) junto con otras especies como M. tuberculosis, M. africanum, M. canetti y M. bovis. Todas pueden desencadenar la enfermedad tuberculosis en los mamíferos. M. microti presenta su información genómica desactualizada en los repositorios públicos en comparación con los otros miembros. El presente estudio tiene como objetivo actualizar la información sobre el genoma de M. microti y ayudar a comprender mejor la biología de los patógenos pertenecientes al complejo MBTC mediante anotación funcional de las proteínas hipotéticas dentro del genoma de M. microti. Además, se pretende predecir in silico islas de patogenicidad, islas de resistencia e identificar pseudogenes en ese genoma. Como resultado, se predijo una nueva función al 65,05% de las 1.217 proteínas anotadas como hipotéticas. Parte de las hipotéticas proteínas de M. microti, son productos de genes asociados a la virulencia, resistencia a metales y antibióticos. Fueron identificadas 18 islas de patogenicidad y 11 islas de resistencia, ambas con elementos clásicos observados en islas de este tipo como diferencia en el contenido G+C y desvío en el uso de codones. Dentro de las proteínas hipotéticas, 14 se predijeron como pseudogenes, un dato que no estaba reportado anteriormente. En conclusión, este estudio bioinformático sobre el genoma de M. microti refuerza el conocimiento sobre la resistencia y patogenicidad de esta micobacteria. El estudio ofrece un nuevo atlas genómico de M. Microti con nuevas anotaciones genómicas, información útil que permite una mejor comprensión del comportamiento de virulencia y patogenicidad de las micobacterias.
Más información
Título de la Revista: | BAG - JOURNAL OF BASIC AND APPLIED GENETICS |
Editorial: | Vol XXXII Suppl. (1): 192-215 |
Fecha de publicación: | 2021 |
Año de Inicio/Término: | 05 - 08 octubre |
Página de inicio: | 109 |
Página final: | 109 |
Idioma: | Español |
URL: | https://sag.org.ar/jbag/project/vol-xxxii-suppl-1/ |
DOI: |
10.35407/bag.2021.32.01.suppl |
Notas: | SCIELO |