Man

sofia alejandra valenzuela aguila

Profesor Titular

UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

Concepción, Chile

Líneas de Investigación


Genomics, forest trees, genetic engineering , biosafety GMOs

Educación

  •  Dr rer Nat, TU Braunschweig . Alemania, 2000

Experiencia Académica

  •   Profesor Titular Full Time

    UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

    1994 - At present

  •   Seremi Macrozona Centro Sur Full Time

    MInisterio de Ciencia, Tecnologia, Conocimiento e Innovacion

    Concepcion, Chile

    2022 - 2024

Experiencia Profesional

  •   Profesor Titular Full Time

    Universidad de Concepcion

    Chile

    1993 - At present

Formación de Capital Humano


During my academic carrer I have supervised more than 50 undergraduate thesis of students from programs of Plant Biotechnology, Bioengineering, Biology, Biochemistry, Forestry from the Universidad de Concepcion, and from other universities.
At graduate level, I have been supervisor of 5 MSc and 9 PhD, all from Forest Sciences Graduate program, amnong the PhDs are:
1.- Renán García (2011) Clonamiento y caracterización de la enzima ferulato 5-hidroxilasa (F5H) de eucaliptus globulus = Cloning and characterization of the enzime ferulate 5-Hidroxilase from Eucalyptus globulus.
2.- Marta Fernández (2011) Caracterización de genes deshidrina en Eucalyptus globulus cuya expresión es inducida por la aclimatación a baja temperatura.
3.- Priscila Moraga (2012) Desarrollo de mapa de ligamiento genético y detección de QTLs asociados a la resistencia contra fusarium circinatum nirenberg & O´Donnell en pinus radiata d.don.
4.- Catherine Delaveau (2013) Contribución a la propagación y conservación ex situ de Gomortega keule (Mol.) Baillon mediante estudios moleculares, fisiológicos y bioquímicos.
5.- Ángela Carrasco (2015) Búsqueda de genes candidatos relacionados con la resistencia a Fusarium circinatum en genotipos contrastantes de Pinus radiata.
6.- Darío Navarrete (2017) Caracterización de genes CBF (c-repeat binding factors) de Eucalyptus globulus y su validación como genes candidatos que regulan la resistencia al frío mediante transformación genética en Arabidopsis thaliana.
7.- Ricardo Durán (2017) Modelos de predicción genómicos para la selección de genotipos de Eucalyptus globulus en base a densidad de la madera y volumen.
8.- José Luis Ulloa (2022) Identificación de genes de respuesta a sequía, en hojas y raíces de un genotipo de Eucalyptus globulus tolerante al estrés.
9.- Paula Aguayo (2024) NAC: una superfamilia de factores transcripcionales y su rol en la tolerancia al estrés abiótico en Eucalyptus globulus.


Difusión y Transferencia


I have been part of several science communication activities, by giving talks in the topics of plant genetic engineering, forest biotechnology, biosafety of GMOs, bioethics and biotechnology and women in science. Most of these talks have been to high school students, society (Cafe Cientificos) and to specific groups (lawyers, physicians, agronomists, among others). As well I have been active by inviting high school students to do some biotechnology labs, such as DNA extraction, PCR and others in our labs. During 2017-2022 I was invited to write an opinion in a local newspaper, twice a month (El Sur), regarding topics related with science and society, as well as science based evidence for public policies.

I have been Organizer of the IUFRO Forest Biotechnology meeting held in Concepcion (2017) and co-chair of LignoBiotech meeting also held at Concepcion in 2015, and part of the scientific committee of those congresses.
Since 2006, I have been responsible of co- organizing the International Forest Genetics and Biotechnology Course, jointly with Dr. Claudio Balocchi (Bioforest-Arauco) and professor from Northampton Carolina State University. We have organized 7 versions, the last one being in April 2024.

I was also invited to participate in a science communication video The Future of Forests, by iBiology (https://www.ibiology.org/ecology/future-of-forests/#part-1) and have made several interviews on local media, TV, radio regarding the use of forestry, genetic engineering and women in science.


Premios y Distinciones

  •   Científica Destacada Bío Bio

    SERVICIO NACIONAL DE LA MUJER

    Chile, 2017

    Premio a mujeres destacadas en diversos ámbitos (5 premio al año), en este caso al aporte en Investigación y desarrollo de Biotecnología en la región.

  •   Lideres Revista El Sábado El Mercurio

    El Mercurio

    Chile, 2006

    Premio a líderes destacados, de una selección de 500 líderes en el período (2001-2005). A su vez este premio me lo dieron el 2003 como uno de los 100 líderes destacados del año.

  •   Deputy

    IUFRO

    Estados Unidos, 2017

    Represente por 5 años en división de IUFRO en sección Molecular Biology of Forest Trees. Reconocimiento al trabajo en el área.

  •   Director

    Institue Forest Biotechnology

    Chile, 2012

    Miembro del Directorio del Institute of Forest Biosciences, del 2012-2014, elegida por trabajo en el área, siendo la única representate chilena a la fecha.


 

Article (51)

bHLH Transcription Factors Undergo Alternative Splicing During Cold Acclimation in a <i>Eucalyptus hybrid</i>
Transcriptomic response in foliar and root tissues of a drought-tolerant <i>Eucalyptus globulus</i> genotype under drought stress
Rapid, simplified microscale quantitative analysis of lignin H/G/S composition with GC–MS in glass ampules and glass capillaries
Transcriptome-wide identification of WRKY family genes and their expression under cold acclimation in Eucalyptus globulus
Efficiency of EUChip60K pipeline in fingerprinting clonal population of Eucalyptus globulus
In-field molecular diagnosis of plant pathogens: recent trends and future perspectives
Comparative evaluation of Eucalyptus globulus and E-nitens wood and fibre quality
Diversidad taxonómica y genética del sitio prioritario Península de Hualpén, Región del Bío-Bío, Chile. Implicancias para la conservación
Expression profiling in Pinus radiata infected with Fusarium circinatum
Genomic predictions of breeding values in a cloned Eucalyptus globulus population in Chile
Overexpression of three novel CBF transcription factors from Eucalyptus globulus improves cold tolerance on transgenic Arabidopsis thaliana
Phytophthora pseudosyringae associated with the mortality of Nothofagus obliqua in a pure stand in central-southern Chile
Transcriptome profiling of Eucalyptus nitens reveals deeper insight into the molecular mechanism of cold acclimation and deacclimation process
Cancro resinoso del pino: ¿una amenaza potencial para las plantaciones de Pinus radiata en Chile?
Overexpression of an SKn-dehydrin gene from Eucalyptus globulus and Eucalyptus nitens enhances tolerance to freezing stress in Arabidopsis
Relative expression of seven candidate genes for pathogen resistance on Pinus radiata infected with Fusarium circinatum
Transcriptome Profile in Response to Frost Tolerance in Eucalyptus globulus
VARIATIONS IN WOOD ANATOMY AND FIBER BIOMETRY OF EUCALYPTUS GLOBULUS GENOTYPES WITH DIFFERENT WOOD DENSITY
Development of a genetic linkage map for Pinus radiata and detection of pitch canker disease resistance associated QTLs
Rescue of syringyl lignin and sinapate ester biosynthesis in Arabidopsis thaliana by a coniferaldehyde 5-hydroxylase from Eucalyptus globulus
ANATOMICAL ELEMENTS FORMATION IN HARDWOODS: A REVIEW FROM A GENOMIC PERSPECTIVE
FORMACIÓN DE ELEMENTOS ANATÓMICOS EN MADERAS DURAS: UNA REVISIÓN DESDE UNA PERSPECTIVA GENÓMICA.
Genetic diversity revealed by AFLP in three relicts of Gomortega keule (Molina) Baillon, endemic and endangered Chilean species
Genetic diversity revealed by AFLP in three relicts of Gomortega keule (Molina) Baillon, endemic and endangered Chilean species [Variabilidad genética mediante AFLP en tres relictos de Gomortega keule (Molina) Baillon, especie endémica chilena en peligro de extinción]
An efficient and reproducible protocol for production of AFLP markers in tree genomes using fluorescent capillary detection
Establishment and optimization of ISSR and SAMPL molecular markers as a tool for breeding programs of Pinus radiata
Isolation and characterization of three cold acclimation-responsive dehydrin genes from Eucalyptus globulus
Photoperiod, temperature and water deficit differentially regulate the expression of four dehydrin genes from Eucalyptus globulus
Production of phytohormones, siderophores and population fluctuation of two root-promoting rhizobacteria in Eucalyptus globulus cuttings
ENDOGENOUS QUANTIFICATION OF ABSCISIC ACID AND INDOLE-3-ACETIC ACID IN SOMATIC AND ZIGOTIC EMBRYOS OF Nothofagus alpina (Poepp. & Endl.) Oerst.
Transcript abundance of enzymes involved in lignin biosynthesis of Eucalyptus globulus genotypes with contrasting levels of pulp yield and wood density
Validation of reference genes for real-time qRT-PCR normalization during cold acclimation in Eucalyptus globulus
Abscisic acid and 3-indolacetic acid levels during the reinvigoration process of Pinus radiata D. Don adult material
Chemical Composition and Wood Anatomy of Eucalyptus globulus Clones: Variations and Relationships with Pulpability and Handsheet Properties
Polymerase Chain Reaction Preparation Of Template For Massively Parallel Pyrosequencing
Wood anatomy and biometric parameters variation of Eucalyptus globulus clones
Fungal endophytes in xylem of healthy Chilean trees and their possible role in early wood decay
Influence of Lignin Structural Features on Eucalyptus globulus Kraft Pulping
Multivariate strategies for classification of Eucalyptus globulus genotypes using carbohydrates content and NIR spectra for evaluation of their cold resistance
SUPERVISED PATTERN RECOGNITION TECHNIQUES FOR CLASSIFICATION OF EUCALYPTUS SPECIES FROM LEAVES NIR SPECTRA
Forest biotechnology: An extension of tree improvement
Evaluation of fungal endophytes for lignocellulolytic enzyme production and wood biodegradation
RAPD and freezing resistance in Eucalyptus globulus
Resistance to freezing in three subspecies of eucalypts
Transgenic trees and forestry biosafety
Transformation of Nicotiana benthamiana with different BWYV (Beet western yellows virus) sequences to test for virus resistance
Inhibition of xylazine induced uterine contractility by clenbuterol and nifedipine
Energetic requirements and physiological adaptation of draught horses to ploughing work
FUNCTION OF ROTAVIRUS VP3 POLYPEPTIDE IN VIRAL MORPHOGENESIS
RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS DETECTION BY DOT BLOT HYBRIDIZATION WITH A NONRADIOACTIVE SYNTHETIC OLIGODEOXYNUCLEOTIDE PROBE
PHOTOAFFINITY-LABELING OF ROTAVIRUS VP1 WITH 8-AZIDO-ATP - IDENTIFICATION OF THE VIRAL-RNA POLYMERASE

BookSection (2)

Nitrogen Fixing Endophytes in Forest Trees
Tree Endophytes and Wood Biodegradation.

ComunicacionBreve (1)

ESTUDIOS ANATOMICOS EN PINGUICULA CHILENSIS CLOS (LENTIBULARIACEAE)

ConferencePaper (1)

Processing Random Amplified Polymorphysm DNA images using the radon transform and mathematical morphology

Letter (1)

Lost in the woods

Proyecto (16)

Bacterias endófitas fijadoras de nitrógeno=> una alternativa innovadora para mejorar la sostenibilidad y productividad forestal
Wrky TF=> are they working for abiotic stress resistance in Eucalyptus globulus?
Wrky TF=> are they working for abiotic stress resistance in Eucalyptus globulus?
Nuevo biopesticida basado en bacterias inductoras de resistencia para el control de la bacteriosis del kiwi-PSA
Ciencia, Tecnología, e innovación para la bioeconomía,"
Dehydrins=>do they confer frost tolerance in Eucalyptus?
Endolyptus: Hongos y bacterias endófitas como agentes de biocontrol de enfermedades y promoción de crecimiento en Eucalyptus globulus, E. nitens e híbridos.
Genomic of anatomical elements formation in Eucalyptus=> differential expression and sequencing of genes involved in elongation and cell wall growth
Apoyo a la formación de redes internacionales entre centros de investigación, China-Chile. Centro de Biotecnología-Universidad Beijing
ENLACE GFSA
EUCAHYDRO=> HERRAMIENTAS PARA EVALUACION TEMPRANA DE GENOTIPOS DE EUCALYPTUS DE MAYOR EFICIENCIA EN EL USO, CONSUMO DE AGUA Y RESISTENCIA A LA SEQUIA
EUCACHIP=> HERRAMIENTA DE SELECCIÓN GENÓMICA PARA LA INDUSTRIA DE BIOCOMBUSTIBLES DE SEGUNDA GENERACION
Study of contrasting genotypes of Eucalyptus globulus=> topochemistry of delignification and effect of lignin and carbohydrates structure in pulping
Consorcio Genómica Forestal. Programa Bicentenario de Ciencia y Tecnología
Sub-proyecto Genómica de Resistencia al frío en Eucalyptus globulus
Desarrollo de herramientas biotecnológicas para predecir la resistencia al frío en Eucalyptus globulus

Review (1)

An overview of cold stress responses in <i>Eucalyptus globulus</i>
4
Rodrigo Hasbun

Profesor asociado

Silvicultura

Universidad de Concepción

Concepcion, Chile

4
Eugenio Sanfuentes

Docente e investigador

Silvicultura

CENTRO DE BIOTECNOLOGÍA- UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

Concepción, Chile

5
Regis Teixeira

Profesor Titular

Manejo de Bosques y Medio Ambiente

UNIVERSIDAD DE CONCEPCION, FACULTAD DE CIENCIAS FORESTALES

Concepcion, Chile

1
Miguel Martinez

Professor Titular

Microbiologia

UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

Concepción, Chile

1
David Contreras

Full professor

Analitycal and Inorganic Chemistry

UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

Concepción, Chile

2
Matilde Uribe

Barrio Universitario

Forestry

UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

Concepción, Chile

1
pilar moraga

Full Professor

Derecho Económico

FACULTAD DE DERECHO U DE CHILE

Santiago, Chile

2
Romulo Oses

INVESTIGADOR ASOCIADO

VICERRECTORIA DE INVESTIGACION Y POSTGRADO

UNIVERSIDAD DE ATACAMA

COPIAPO, Chile

2
Eduardo Ruiz

Profesor Asociado

Botánica

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

2
ROSARIO CASTILLO

Profesor Asociado

Análisis Instrumental

FACULTAD DE FARMACIA- UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

CONCEPCION, Chile

2
Juan Elissetche

Investigador Asociado

Facultad Ciencias Forestales

Universidad de Concepción

concepcion, Chile

2
rene le-feuvre

investigador

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

11
Marta Fernandez

Profesora Asociada

Silvicultura

Universidad de Conceoción

Concepción, Chile

2
Katia Saez

Profesor Asociado

Departamento de Estadística

UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

Concepción, Chile

1
Darcy Ríos

Profesor Titular

Departamento de Silvicultura

FACULTAD DE CIENCIAS FORESTALES, UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

Concepción, Chile

2
Priscila Moraga

Profesora Asistente

Ecosistemas y Medio Ambiente

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Manuel Sánchez

Academico

Silvicultura

UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

Concepcion, Chile

6
Jaime Rodriguez

Director

Universidad de Concepcion

Concepcion, Chile

1
Katherine Sossa

Associate professor

Centro de Biotecnología

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

57
sofia valenzuela

Profesor Titular

Silvicultura

UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

Concepción, Chile

1
María Aguayo

Investigadora

UNIVERSIDAD DEL BIO-BIO

Concepción, Chile

1
Glenda Fuentes

Colaborador Docente

Botánica

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

1
Carlos Villarroel

Académico

Ciencias Forestales

Universidad Católica del Maule

Talca, Chile

2
Darío Navarrete

Colaborador Académico

Departamento de Ciencia y Tecnología Vegetal

Universidad de Concepción

Los Ángeles, Chile

2
Miguel Peredo

Jefe División

Bioforest S.A.

Forestal Arauco

Concepcion, Chile

3
ANGELA CARRASCO

Colaborador académico

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

2
Marcela Norambuena

Investigador Asociado

Centro de Biotecnología

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

4
Paula Aguayo

Investigadora

Centro de Biotecnología

Universidad de concepción

concepción, Chile

2
Victoria Rodriguez

Ingeniera de apoyo al desarrollo tecnológico

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

7
Claudio Balocchi

Jefe Grupo Genética

Forestal

Bioforest S.A.

Concepción, Chile

1
Cristian Balbontin

Investigador

Produccion Vegetal

Instituto de Investigaciones Agropecuarias

Chillán, Chile

1
Valentina Troncoso

investigador

Centro de Biotecnologia

Concepción, Chile

3
ISABEL CARRILLO

Investigadora

CIPA

Centro de Investigación de Polímeros Avanzados CIPA

Concepción, Chile

3
Andrea Donoso

Investigadora y encargada de Gestión Tecnológica

Centro de Biotecnología

Universidad de Concepción

concepcion, Chile

2
Jorge Fernandez

JEFE SUBDEPTO

BIOMEDICO NACIONAL Y DE REFERENCIA

INSTITUTO DE SALUD PUBLICA

santiago, Chile

3
Ana Sandino

Profesor Titular

Biología

Universidad de Santiago de Chile

Santiago, Chile

1
Catalina Lagos

Investigador Líder

Facultad de Ciencias de la Vida

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile