Alexis_fonseca_picture.jpg_thumb90

Alexis Armando Fonseca Poza

PhD Student

Aarhus University

Aarhus, Dinamarca

Líneas de Investigación


Mi principal interés y actividad han estado ligadas a estudios genómicos a través de la bioinformática de comunidades bacterianas marinas de ambientes hipóxicos-anóxicos de la costa de Chile. Pero

Educación

  •  Bioquímica y Bioinformática, UNIVERSIDAD DE CONCEPCION. Chile, 2016
  •  Biólogo Marino, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2008

Experiencia Profesional

  •   Asistente de investigación Part Time

    Lab de Bentos/Universidad de Concepción

    Concepción, Chile

    2007 - 2010

  •   Asistente en enseñanza Part Time

    Lab de Bentos/Universidad de Concepción

    Concepción, Chile

    2011 - 2011

  •   Co-investigador Part Time

    Lab de Bentos/Universidad de Concepción

    Concepción, Chile

    2010 - 2012

  •   Asistente de investigación Part Time

    Lab de Bentos/Universidad de Concepción

    Concepción, Chile

    2011 - 2013

  •   Bioinformático/asistente de Investigación Part Time

    Universidad de Concpeción

    Concepción, Chile

    2016 - 2016

  •   Bioinformático Full Time

    Datagen SpA.

    San Pedro de la Paz, Chile

    2016 - 2019

  •   Asistente de investigación Part Time

    Lab de Biopelículas y Microbiología Ambiental/UdeC

    Concepción, Chile

    2019 - 2020


 

Article (7)

Draft Genome Sequence of Probiotic Lactobacillus brevis TUCO-5E, Isolated from Porcine Milk

Sandra Quilodran, Leonardo Albarracin; Elvira Hebert, Lucila Saavedra; Alexis Fonseca, Alexis Salas Burgos; Haruki Kitazawa, Julio Villena

Article
Microbiology Resource Announcements  (2018)

Genomic features of “Candidatus Venteria ishoeyi”, a new sulfur-oxidizing macrobacterium from the Humboldt Sulfuretum off Chile

Alexis Fonseca, Thomas Ishoey; Carola Espinoza, Danilo Pérez Pantoja; Antonio Manghisi, Marina Morabito; Alexis Salas Burgos, Víctor Gallardo

Article
PloS one  (2017)

Bacteria of the Humboldt sulfuretum comply with unifying macroecological principles

GALLARDO, VA; Fonseca, A; Espinoza, C; Musleh S

Article ISI SCOPUS
MARINE BIODIVERSITY  (2016)

Molecular taxonomy and community dynamics of actinobacteria in marine sediments off central chile [Taxonomía molecular y dinámica comunitaria de Actinobacteria en sedimentos marinos de Chile central]

Espinoza, C; Fonseca, A; GALLARDO, VA

Article SCOPUS
Revista de Biologia Marina y Oceanografia  (2016)

Extrapolations of Standing-Stocks of Big Bacteria in Humboldt Eastern Boundary Current Ecosystem (HEBCE)

Gallardo, Victor A.; Espinoza, Carola

Article
Oceanography  (2013)

Las grandes bacterias del Sulfureto de Humboldt

Víctor Gallardo, Carola Espinoza; Alexis Fonseca, Selim Musleh

Article
Gayana  (2013)

The big bacteria in the Humboldt Sulfuretum

Espinoza, C; Fonseca, A; Musleh S

Article ISI
Gayana (Concepci�n) - International Journal of Biodiversity, Oceanology and Conservation  (2013)

ConferencePoster (5)

Identificación de genes relacionados en biosíntesis de antibióticos en dos genomas bacterianos de sedimentos anóxicos

Fica, Víctor; etc.

ConferencePoster
 (2015)

In silico identification of genes related to biosynthesis of secondary metabolites in two bacterial genomes from the Humboldt Sulfuretum



ConferencePoster
 (2015)

Tentative Identification of a Spirochaetes form from the Humboldt Sulfuretum using genomics of isolated cells and phylogenetic analysis

Ferrada Fuentes Sandra

ConferencePoster
 (2014)

The structure of bacterial communities in the Humboldt Marine Ecosystem (HE) sulfuretum exhibit features that complement the fundamental ecological time-stability hypothesis

Gallardo, Victor Ariel; Espinoza, Carola

ConferencePoster
 (2011)

Community structure of benthic bacteria of a coastal upwelling system

Gallardo, Victor Ariel; Espinoza, Carola

ConferencePoster
 (2009)

Proyecto (5)

Prototipo de innovación Corfo-Eureka 2018 17EURE-72441=> "OncoPrecise=> Plataforma para asistencia en la toma de decisiones basada en análisis multi-ómico integrado a aprendizaje profundo a partir de biopsia líquida en pacientes con cáncer de mama".

Corfo-Eureka (Corfo-Eureka 2018 17EURE-72441)

Proyecto
2018-2018
Inv. Responsable

Metagenomic exploration of harsh environments for increasing tolerance to lignocellulose-derived inhibitors in Escherichia coli

FONDECYT (1171750)

Proyecto
2016-2018
Personal técnico y/o de apoyo

ECOLOGICAL STUDY ON THE COMPOSITION AND STRUCTURE OF THE BENTHIC SUBLITTORAL MICROBIAL PROKARYOTIC COMMUNITIES (ARCHAEA AND BACTERIA) IN THE HUMBOLDT CURRENT ECOSYSTEM OFF CHILE WITH INSIGHTS INTO CULTIVATION OF SELECTED SPECIES AND CHEMICA

FONDAP (1110786)

Proyecto
2011-2014
Investigador(a)

Estructura de la Comunidad Bacteriana del Sulfureto de Chile Central=> Análisis de la Data 454, Temporal y Batimétrica

Universidad de Concepcion

Proyecto
2010-2012
Coinvestigador(a)

STUDY ON THE BIODIVERSITY, FUNCTION, AND TEMPORAL AND SPATIAL PATTERNS OF DISTRIBUTION OF GIANT BENTHIC FILAMENTOUS BACTERIA AND THEIR RELATIONSHIP WITH THE PREVAILING ENSO REGIME CONDITIONS IN THE EASTERN SOUTH PACIF

FONDECYT (1070552)

Proyecto
2007-2010
Personal técnico y/o de apoyo

2
VICTOR GALLARDO

Profesor Titular

Oceanografía

Universidad de Concepción

Concepcion, Chile

2
Nathaly Ruiz-Tagle

Investigador

Centro de Biotecnología

UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN, CENTRO DE BIOTECNOLOGÍA

Concepción, Chile

1
Daniel Gómez

Associate Professor

Dept. Zoology

Universidad de Concepcion

Concepcion, Chile

1
Daniel Gomez-Uchida

9
Alexis Fonseca

PhD Student

Biology

Aarhus University

Aarhus, Dinamarca

3
Selim Musleh

Investigador

Departamento de Evaluación de Recursos

Instituto de Fomento Pesquero

Valparaíso, Chile