Genética Molecular de Patógenos de Peces; Proteomica y Genomica en Peces Salmoni­deos; Sintesis de Peptidos y profilaxis; MICROBIOLOGIA MOLECULAR; ACUICULTURA; PATOGENESIS BACTERIANA; Bioinformática de nuevos compuestos; Estudio teórico de interacciones moleculares; modelamiento molecular; Diseño y análisis estructura-funcionn de peptidos; Peptidos antimicrobianos

THESIS:

Hernán Cortés, Thesis Title: “Uso de extractos de quillay en la prevención y control del Síndrome Rickettsial del Salmón”. PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO, Doctorado en Acuicultura (en ejecución).

Patricio Flores Herrera. Thesis Title: "Diseño de una proteína quimérica multiantigénica y multiepitópica para su potencial uso como vacuna contra la Piscirickettsia salmonis”. PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO, Magister en Ciencias Microbiológicas (Terminada).

Jaid Saldías Jerez. Thesis Title: "Caracterización de molecular del mecanismo involucrado en el sistema de “quórum sensing” del patógeno Xanthomonas arborícola pv. juglandis". PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO, Magister en Ciencias Microbiológicas (Terminada).

Francisca Bravo Risi. Thesis Title: “Desarrollo de un método de detección mediante “Loop Mediated Isothermal Amplification” (LAMP) para el diagnóstico patógenos bacterianos de plantas con interés comercial”. PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO, Magister en Ciencias Microbiológicas (Terminada).

1. Alvaro Labra Martin. Thesis Title: "Identificación y Caracterización de Efectores tipo Ankirina Secretados por el Sistema de Secreción Tipo IV Dot/Icm de Piscirickettsia salmonis". PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO, Magíster en Ciencias Microbiológicas.

2. Jaid Saldias Jerez. Thesis Title: "Caracterización Genética de aislados de Pseudomonas sp. obtenidas de Actinidia chilensis (kiwi Amarillo) y Prunus avium (cerezo), para la identificación de marcadores moleculares con potencial uso en diagnóstico". PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO, Licenciatura en Biología/Biólogo.

3. Patricio Flores Herrera. Thesis Title: "Reconstrucción in silico del núcleo de exportación del sistema de Secreción Dot/Icm en Piscirickettsia salmonis". PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO, Licenciatura en Bioquímica/Bioquímico.

4. Oscar Arredondo Zelada. Thesis Title: "Identificación y Caracterización de Proteínas con dominios F-Box y U-Box relacionadas con el Sistema Dot/Icm en Piscirickettsia salmonis". PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO, Licenciatura en Bioquímica/Bioquímico.

Presentaciones a Congresos Científicos de la especialidad:

F.A. Gómez, P. Flores-Herrera, L.J. Cortés, S.H. Marshall & P. Schmitt. Análisis de
expresión de genes de respuesta inmune en salmón del Atlántico (Salmo salar) desafiado con Piscirickettsia salmonis. XXXVIII Congreso Chileno de Microbiología (Sociedad de Microbiología de Chile), 22-25 noviembre de 2016, Valdivia, Chile.

J. Saldias, R. Alvarado, P. Nuñez, J. Retamales, S.H. Marshall & F.A. Gómez
Identificación y caracterización molecular sistema de quórum-sensing en el rol que cumplem en la formación de biofilms en el fitopatógeno Xanthomonas arborícola pv. juglandis, agente etiológico de la peste negra del nogal. XXXVIII Congreso Chileno de Microbiología (Sociedad de Microbiología de Chile), 22-25 noviembre de 2016, Valdivia, Chile.

G. Carril, R. Albornoz, R. Avendaño, J. Figueroa, F.A Gómez, D. Haussmann, A. Labra,
S.H. Marshall, C. Vásquez, A. Yáñez & F. Avilés. Diseño y puesta a punto de estrategia
experimental para la generación de un cepario oficial de Piscirickettsia salmonis. XXXVIII Congreso Chileno de Microbiología (Sociedad de Microbiología de Chile), 22-25 noviembre de 2016, Valdivia, Chile.

P. Flores-Herrera, S.H. Marshall & F.A. Gómez. In silico description, characterization and reconstruction of the core channel of the Type IV-B Secretion System in Piscirickettsia salmonis. ISCB-Latin America 2016 (Bioinformatic Conference) 21-23 noviembre de 2016, Buenos Aires, Argentina.

P. Flores-Herrera, F.A. Henríquez, L.J. Cortés, S.H. Marshall & F.A Gómez. Identification
of immunogenic epitopes in surface proteins of the fish pathogen Piscirickettsia salmonis: Correlation between immune response and structure. ISCB-Latin America 2016 (Bioinformatic Conference) 21-23 noviembre de 2016, Buenos Aires, Argentina.

F.A. Gómez, P. Flores-Herrera, O. Arredondo-Zelada, F. A. Henríquez, G. Carril & S. H. Marshall. El análisis del genoma de Piscirickettsia salmonis revela la presencia de diferentes genes que podrían explicar su comportamiento y patogénesis. Presentación oral en el XXXVII Congreso Chileno de Microbiología (Sociedad de Microbiología de Chile), 1-4 de Diciembre de 2015, La Serena, Chile.

F. Bravo-Risi, R. Yáñez, S. H. Marshall & F.A. Gómez. Desarrollo de un sistema de detección molecular basado en Loop-Mediated Isothermal Amplification para el diagnóstico del patógeno Piscirickettsia salmonis en la salmonicultura chilena. XXXVII
Congreso Chileno de Microbiología (Sociedad de Microbiologia de Chile), 1-4 de Diciembre de 2015, La Serena, Chile (POSTER).

F.A. Gómez, O. Arredondo-Zelada, P. Flores-Herrera, F. Henríquez & S. H. Marshall. In
silico characterization of proteins implicated in the Dot/Icm secretion apparatus and related virulence effectors in the fish pathogen Piscirickettsia salmonis. VI International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology (BioMicroWorld 2015), 28-30 de Octubre de 2015, Barcelona-España.

S. H. Marshall, P. Flores-Herrera, F. Henríquez & F.A. Gómez. The annotation of
Piscirickettsia salmonis LF89 genome reveals the presence of two functional variants of the Hfq sRNA-chaperone. VI International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology (BioMicroWorld 2015), 28-30 de Octubre de 2015, Barcelona- España.

G.P. Carril, F.A. Gómez & S.H. Marshall. The immunoregulatory effect of the non-motile
Piscirickettsia salmonis flagellin in salmo salar cells. VI International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology (BioMicroWorld 2015), 28-30 de
Octubre de 2015, Barcelona-España.

O. Arredondo-Zelada, P. Flores-Herrera, F. Henríquez, S. H. Marshall & F. A. Gómez. Identification and characterization of virulence effectors Dot/Icm-related in the fish bacterial pathogen Piscirickettsia salmonis. XXXVIII Reunión Anual de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular, 22-25 de septiembre de 2015, Puerto Varas-Chile. F. Bravo-Risi, R. Yáñez, P. Nuñez, R. Alvarado, S. H. Marshall & F.A. Gómez.

Identification of an efficient molecular marker for diagnosis of causal agent of walnut
blight by Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP). XXXVIII Reunión Anual de
la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular, 22-25 de septiembre de 2015, Puerto
Varas-Chile.

F. A. Henríquez, O. Arredondo-Zelada, P. Flores-Herrera S.H. Marshall & F.A. Gómez.
The Piscirickettsia salmonis LF-89 genome contain two variants of the Hfq sRNAchaperone gene. XXXVIII Reunión Anual de la Sociedad de Bioquímica y Biología
Molecular, 22-25 de septiembre de 2015, Puerto Varas-Chile.

P. Flores-Herrera, O. Arredondo-Zelada, F.A. Henriquez, S.H. Marshall & F.A. Gómez.
In silico characterization of proteins implicated in the core of the exportation channel of the Dot/Icm secretion system in Piscirickettsia salmonis. XXXVIII Reunión Anual de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular, 22-25 de septiembre de 2015, Puerto Varas- Chile.

L. J. Cortés, C. A. Álvarez, E. Torres, F.A. Gómez & L. Mercado. Indoleamine 2,3-
dioxygenase (IDO) as potential indicator of the immune response against pathogens in
rainbow trout. 17th International Conference on Diseases of Fish and Shellfish, 7-11 de septiembre de 2015, Las Palmas de Gran Canaria-España.

Gómez F. A, Arredondo O., Flores P. and Marshall S. H. Identificación y Caracterización
in silico de de Proteínas Efectoras de Virulencia Exportadas por el Sistema de Secreción Tipo IV Dot/Icm en Piscirickettsia salmonis. Trabajo de incorporación para ser presentado en el XXXVI Congreso Chileno de Microbiología (Sociedad de Microbiologia de Chile), 4- 8 de diciembre, La Serena, Chile.

Gómez F. A., Labra A., Arredondo O., Flores P. and Marshall S. H. Identificación y caracterización in silico de proteínas estructurales del Sistema de Secreción Tipo IV-B
Dot/Icm y efectores de virulencia asociados en Piscirickettsia salmonis. IX Congreso de la Asociación de Estudiantes de Biología de Chile, Temuco, Chile.