Ecología marina y manejo de recursos pesqueros; Filogenética y filogeografía de peces, Taxonomía molecular de peces marinos, Genómica y genética poblacional; Biología reproductiva y pesquera de peces cartilaginosos (tiburones, rayas y quimeras).

Undergraduate, thesis directed
2009 - Alberto Carlos Cáceres Rojas; B.Sc.(Hons); Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chile.
2010 - Hernán Vicente Flores Monsalves; B.Sc.(Hons); Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chile.
2013 - Astrid Yissenia Isla Isla; B.Sc.(Hons); Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chile.

Postgraduate (Ph.D.), thesis co-directed
2018 - Deborah Bowden; Ph.D.; University of Queensland, Brisbane, Australia
2018 - Carolina Vargas-Caro, Ph.D; University of Queensland, Brisbane, Australia

Mejoramiento de las medidas de manejo y administración pesquera en las pesquerías de rayas
A través de los resultados del proyecto FIP-2013-29, el cual buscó establecer las unidades poblacionales de raya volantín y raya espinosa entre la V y XII Regiones, se han propuesto una serie de medidas de administración para el manejo sustentable de ambos recursos. La aplicación de dichas propuestas por parte de la Subsecretaría de Pesca y Acuicultura, permitirá una explotación racional y acorde a la historia de vida de las rayas chilenas

Eliminación de aleteo de tiburones en Chile
Los resultados de la investigación de Bustamante y Bennett (2013), quienes evaluaron la biología pesquera del tiburón marrajo y azulejo capturado en Chile; han proporcionado información clave para la formulación de la primera Ley de Conservación de Tiburones en aguas chilenas (Ley N ° 20.525 de agosto de 2011) la cual prohíbe el aleteo de tiburones en cualquier pesquería chilena.

Conocimiento de la biodiversidad de peces cartilaginosos (tiburones, rayas y quimeras) presentes en aguas chilenas
A través de la investigaciones de Bustamante et al. (2014a,b), se ha proporcionado el primer análisis cuantitativo de la riqueza de especies y la abundancia de tiburones, rayas y quimeras en Chile, que es una de las pocas evaluaciones de este tipo en todo el mundo. Se ha logrado ampliar el conocimiento de las interacciones biológicas y ecológicas dentro del ecosistema demersal a profundidades de más de 100 m a lo largo de gran parte de la costa chilena, lo cual es particularmente relevante para la evaluación futura del potencial impacto de actividades naturales o antropogénicas. Esta información ha sido difundida a través de las diferentes actividades del “Programa de Conservación de Tiburones” del cual soy Director; utilizando material virtual e impreso como una herramienta didáctica para generar conocimiento sobre la biodiversidad de peces cartilaginosos en Chile.

Genomas mitocondriales como una herramienta taxonómica
A través de varias publicaciones (desde 2014), he publicado las secuencias completas del genoma mitocondrial de peces marinos australianos y chilenos, utilizando la tecnología NGS. Ademas, se han proporcionado pautas para un proceso de validación de proceso de secuenciación, el cual establece las bases para la descripción y aplicaciones prácticas de genomas mitocondriales.