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Patricio Alejandro Oyarzún Cayo

Profesor Asociado

Universidad San Sebastián

Concepción, Chile

Líneas de Investigación


Mis intereses se centran en los campos de la nanobiotecnología y la bioinformática, abordando la interfase entre ambas áreas desde el punto de vista del desarrollo de aplicaciones tecnológicas en genosensores, medio ambiente y salud.

Educación

  •  Bioquímico, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO. Chile, 1996
  •  Magister Ciencias de la Ingeniería m/Ingeniería Bioquímica, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO. Chile, 2001
  •  Bioinformatics, UNIVERSITY OF QUEENSLAND. Australia, 2012

Experiencia Académica

  •   Profesor Asociado Full Time

    Universidad San Sebastián

    Ingeniería y Tecnología

    Concepción, Chile

    2002 - A la fecha

  •   Director carrera Full Time

    Universidad San Sebastián

    Ingeniería y Tecnología

    Concepción, Chile

    2002 - 2007

  •   Director General de Investigación Full Time

    Universidad San Sebastián

    Ingeniería y Tecnología

    Santiago, Chile

    2013 - 2014

  •   Coordinador de Investigación Sede Concepción Full Time

    Universidad San Sebastián

    Ingeniería y Tecnología

    Concepción, Chile

    2015 - 2017

  •   Director de Investigación Full Time

    Universidad San Sebastián

    Ingeniería y Tecnología

    Concepción, Chile

    2017 - A la fecha

Experiencia Profesional

  •   Presidente Interino Part Time

    Asociación Regional de Empresas Biotecnológicas Región del Biobío

    Concepción, Chile

    2007 - 2008

  •   Representante USS Part Time

    Red de Centros Tecnológicos de la Región del Biobío (REDCET BIOBIO)

    Concepción, Chile

    2016 - 2017

  •   Representante Part Time

    Nodo Agroalimentario de la Región del Biobío

    Concepción, Chile

    2016 - 2017

Formación de Capital Humano


Tesis de Pregrado Ingeniería Civil en Biotecnología (últimos 3 años):

Año 2017 (en curso):
Tesis: Desarrollo de un nano-biosensor fluorescente a base de puntos cuánticos para detección genómica de Mycobacterium bovis / Estudiante: Ligia Inostroza
Tesis: Comparación de un nano-biosensor y una técnica instrumental confirmativa para la detección de residuos de antibióticos en leche cruda de bovinos / Estudiante: Camila Rodríguez.

Año 2016:
Tesis: Caracterización del contenido de aminoácidos tipo micosporinas en extractos del alga chilena Porphyra columbina ("Luche") / Estudiante: Felipe Silva.
Tesis: Evaluación de la producción de celulosa bacteriana (CB) a partir de la cepa Gluconacetobacter xylinus como base para una matriz biopolimérica con aplicación en el tratamiento de metales pesados / Estudiante: Rodrigo Cáceres.
Tesis: Evaluación de la remoción de amoníaco mediante un biofiltro de lecho escurrido inoculado con un consorcio microbiano / Estudiante: Lisette Alarcón.

Año 2015:
Tesis: Caracterización de la dinámica poblacional de un consorcio microbiano sulfooxidante durante aclimatación a una mezcla gaseosa azufrada / Estudiante: Nicolás Martínez.
Tesis: Caracterización analítica de un biosensor basado en nanopartículas de oro para detección espectrofotométrica del antibiótico ampicilina / Estudiante: Javiera Aguilar.
Tesis: Evaluación in vitro de nanopartículas biopoliméricas para vehiculización de vacunas plasmidiales / Estudiante: Stephanie Durán.


Difusión y Transferencia


Patentes:
* Kriman L, Reyes M, Oyarzun P, Villegas R & Ñancucheo I. EWOS S.A., assignee. Process and Formulation for Immunizing Fish in Aquaculture Systems. United State Patent US 8,753,878 B2. 2014 Jun 17.
* Kriman L, Reyes M, Oyarzun P, Villegas R & Ñancucheo I. EWOS S.A. and Bioinnovation, assignee. Vacuna de ADN útil para inducir inmunidad y tratar infecciones en peces, composición farmacéutica y alimenticia que comprende dicha vacuna y proceso para producir dicha composición. Chilean Patent CL 50844. 2015 Apr 20.
* Kriman L, Reyes M, Oyarzun P, Villegas R & Ñancucheo I. DNA immunization for Fish. New Zeland Patent NZ 578541. 2012 Aug 06.
* Kriman L, Reyes M, Oyarzun P, Villegas R & Ñancucheo I. EWOS S.A., assignee. Process and Formulation for Immunizing Fish in Aquaculture Systems. Canadian Patent CA 2687208. 2016.


Premios y Distinciones

  •   Premio 1er lugar presentación poster en congreso internacional

    International Society of Vaccines (ISV)

    China, 2012

    Premio 1er lugar presentación poster "PREDIVAC: A bioinformatics tool for multi-epitope peptide vaccine design that effectively accounts for human ethnic diversity" en 6th Vaccine and ISV Congress", Shanghai, China, 14-16 Octubre 2012.


 

Article (18)

A Proteome-Wide Immunoinformatics Tool to Accelerate T-Cell Epitope Discovery and Vaccine Design in the Context of Emerging Infectious Diseases: An Ethnicity-Oriented Approach
An ecofriendly nanocomposite of bacterial cellulose and hydroxyapatite efficiently removes lead from water
Antibiotic copper oxide-curcumin nanomaterials for antibacterial applications
Improved Antibiotic Detection in Raw Milk Using Machine Learning Tools over the Absorption Spectra of a Problem-Specific Nanobiosensor
Generation of engineered core-shell antibiotic nanoparticles
Heavy metal removal from aqueous systems using hydroxyapatite nanocrystals derived from clam shells
Presence and characterization of microplastics in fish of commercial importance from the Biobio region in central Chile
Trickling filter technology for biotreatment of nitrogenous compounds emitted in exhaust gases from fishmeal plants
Hydroxyapatite nanocrystals synthesized from calcium rich bio-wastes
Nano-hydroxyapatite polymeric hydrogels for dye removal
Slight pH Fluctuations in the Gold Nanoparticle Synthesis Process Influence the Performance of the Citrate Reduction Method
Synthesis of Copper Sulfide Nanoparticles Using Biogenic H2S Produced by a Low-pH Sulfidogenic Bioreactor
A novel "in-feed" delivery platform applied for oral DNA vaccination against IPNV enables high protection in Atlantic salmon (Salmon salar)
Recombinant and epitope-based vaccines on the road to the market and implications for vaccine design and production
A bioinformatics tool for epitope-based vaccine design that accounts for human ethnic diversity: Application to emerging infectious diseases
PREDIVAC: CD4+T-cell epitope prediction for vaccine design that covers 95% of HLA class II DR protein diversity
Comparison on the removal of hydrogen sulfide in biotrickling filters inoculated with Thiobacillus thioparus and Acidithiobacillus thiooxidans
Biofiltration of high concentration of hydrogen sulphide using Thiobacillus thioparus

Proyecto (12)

Algas marinas=> masificación de una estrategia tecnológica sustentable para la formulación de ingredientes activos utilizados en alimentos funcionales con propiedades anti-obesidad
Desarrollo de Biosensores Optoelectrónicos y Algoritmos de correlación para cuantificar el espectro emitido por nanopartículas de oro que detectan la presencia de residuos de antibióticos en leche cruda (ID16I10221)
Toward a proteome-wide immunoinformatics tool for rational design of multi-epitope chimeric vaccines=> an ethnicity-oriented approach
Desarrollo de un probiótico que fortalezca la producción y calidad frutícola de la industria del arándano
Producto antitumoral derivado de un probiótico con impacto en la patología de colon
Desarrollo de un modelo de vinculación científica con el sector empresarial ganadero-lechero del Biobío para abordar la problemática sanitaria ganadera mediante la implementación de innovaciones y soluciones biotecnológicas (VCE40000005)
Diplomado en Gestión de la Innovación y Comercialización de Tecnologías (DIP130007)
Optimización a Escala Piloto de la Tecnología de Biofiltración para el Control de Olores Generados en Plantas de Tratamiento de Aguas Servidas
Centro Tecnológico de Control Biológico de Plagas
Bioplaguicidas para una Agricultura Sustentable=> Producción masiva en bioreactores del nemátodo N12 para el control de la babosa gris, Deroceras reticulatum
Desarrollo de una formulación alimenticia que permita la inmunización vía oral de salmones contra el virus de la necrosis pancreática infecciosa (IPN) mediante una vacuna de ADN
TRATAMIENTO DE AIRE CONTAMINADO CON ACIDO SULFIDRICO EN BIOFILTROS INOCULADOS CON THIOBACILLUS THIOPARUS

Review (1)

Computer-aided design of T-cell epitope-based vaccines: addressing population coverage
19
Patricio Oyarzún

Profesor Asociado

Facultad de Ingeniería y Tecnología

Universidad San Sebastián

Concepción, Chile

7
Varaprasad Kokkarachedu

Profesor Asistente

Facultad de Ingeniería y Tecnología

Universidad San Sebastián

Concepción, Chile, Chile

7
Dariela Núñez

investigador

Centro de Investigación de polímeros avanzados

Concepción, Chile

3
Elizabeth Elgueta

Investigadora

Centro de Investigación de Polímeros Avanzados, CIPA

Concepción, Chile

2
Walther Ide

Ingeniero de Proyecto

Investigación

Centro de Investigación de Polímeros Avanzados

Concepción, Chile

2
Braulio Contreras

Investigador

Ingeniería en Biotecnología

Universidad San Sebastián

Concepción, Chile

2
German Aroca

Profesor Titular

Escuela de Ingeniería Bioquímica

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

2
Sebastian Godoy

Associate Professor

Electrical Engineering

UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

Concepción, Chile

1
Karthikeyan Chandrasekaran

Principal investigator of Fondcyet Postdoctroal project 3190029

nanomedicine

Centro de investigacion de polimeros Avanzados (CIPA),

Concepcion, Chile

1
Karlo Guerrero

Investigador posdoctoral

Escuela de Ingeniería Bioquímica

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

1
Ivan Nancucheo

Docente Investigador

Universidad San Sebastián

Concepción, Chile

1
Christian Canales

Académico

Facultad de Ingemiería y Tecnologia

Universidad San Sebastian

Concepcion, Chile

1
Alejandra Arancibia

Investigadora Postdoctoral

Escuela Ingenieria Bioquímica

Pontificia Universidad Católica de Valparaiso

Valparaiso, Chile

1
pablo coelho

Profesor asistente

Ingeniería y tecnología

Universidad San Sebastián

Concepción, Chile

1
Nathaly Ruiz-Tagle

Investigador

Centro de Biotecnología

UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN, CENTRO DE BIOTECNOLOGÍA

Concepción, Chile

1
Homero Urrutia

Profesor titular

Facultad de Ciencias Biológicas

UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

Concepción, Chile

1
Bernabe Rivas

Professor

Polymers

Universidad de Concepción

Concepción, Chile