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Victor Antonio Castañeda Zeman

Prof. Asistente

Universidad de Chile

Santiago, Chile

Computer Vision; Image processing; Sensor developing; Biomedical Informatics; Computational Image Processing; Membrane Biophysics

PhD Informatica, TECHNISCHE UNIVERSITAT MUNCHEN. Alemania, 2012
Ingeniero Civil Electricista, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2005
Licenciado en Ciencias de la Ingenieria mención Electrica, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2003

Profesor Ayudante, Curso Fisica Estadistica Other

UNIVERSIDAD DE CHILE

Facultad de Ciencias Fisicas y Matematicas

Santiago, Chile

2001 - 2001
Profesor Ayudante, Introduccion a la Fisica Other

UNIVERSIDAD DE CHILE

Ciencias Fisicas y Matematicas

Santiago, Chile

2001 - 2002
Asistente de Laboratorio de Electronica Other

UNIVERSIDAD DE CHILE

Ciencias Fisicas y Matematicas

Santiago, Chile

2003 - 2004
Profesor de Curso Practico, Kinect Programming for Computer Vision Other

TECHNISCHE UNIVERSITAT MUNCHEN

Matematica e Informatica

Munich, Alemania

2011 - 2011
Profesor de Curso, Vision Computacional 3D II, Other

TECHNISCHE UNIVERSITAT MUNCHEN

Matematica e Informatica

Munich, Chile

2011 - 2012
Profesor reemplazante, Fisica General Other

UNIVERSIDAD DE CHILE

Medicina

Santiago, Chile

2012 - 2016
Profesor de Fisica 2, Tecnologia Medica Other

UNIVERSIDAD DE CHILE

Medicina

Santiago, Chile

2013 - 2013
Profesor de Fisica Aplicada, carrera Tecnologia Medica Other

UNIVERSIDAD DE CHILE

Medicina

Santiago, Chile

2013 - 2013
Profesor de Curso de Magister, Image and Biosignal Processing I and II Other

UNIVERSIDAD DE CHILE

Medicina

Santiago, Chile

2012 - 2016
Profesor curso internacional, “Optics, Forces and Development” Other

UNIVERSIDAD DE CHILE

Medicina

Santiago, Chile

2014 - 2016
PROFESOR ASISTENTE Full Time

UNIVERSIDAD DE CHILE

MEDICINA

SANTIAGO, Chile

2018 - At present

Asistente de Mecanico Full Time

Autosummit

Santiago, Chile

2002 - 2002
Estudiante en Practica Full Time

Telefonica Movil S.A.

Santiago, Chile

2003 - 2003
Estudiante en Practica Full Time

Conecta Ingenieria

Santiago, Chile

2004 - 2004
Ingeniero de Proyecto Full Time

Telmex Chile

Santiago, Chile

2005 - 2006
Profesor de Capacitacion Other

Telmex Chile S.A.

Santiago, Chile

2007 - 2007
Asistente de Investigacion Other

Dpto. Ing. Electrica, FCFM, Universidad de Chile

Santiago, Chile

2005 - 2005
Asistente de Investigacion Full Time

Proyecto FONDEF D04I-1256, Dpto. Ing. Electrica, FCFM, Universidad de Chile

Santiago, Chile

2006 - 2008
Asistente de Investigacion Full Time

Proyecto FONDEF D07I1019, FMED, Universidad de Chile

Santiago, Chile

2012 - 2012
Asesor Tecnico Experto Other

Proyecto FONDEF D11I1096, FMED, Universidad de Chile

Santiago, Chile

2012 - 2015
PostDoc Full Time

Biomedical Neuroscience Institute

Santiago, Chile

2012 - 2013
Coordinador, Proyecto U-Redes BioMedHPC Other

FMED, Universidad de Chile

Santiago, Chile

2013 - At present
PostDoc FONDECYT 3140444 Full Time

FMED, Universidad de Chile

Santiago, Chile

2013 - 2016
Coordinador Proyecto FONDEQUIP EQM130051 Other

FMED, Universidad de Chile

Santiago, Chile

2013 - 2015
Subdirector TICs, Proyecto Telemedicina Part Time

Hospital Clinico, Universidad de Chile

Santiago, Chile

2016 - 2019
Asesor Tecnico, Proyecto CORFO, 14PIE-30560 Other

Fraunhofer Chile

Santiago, Chile

2016 - 2016

Miembro del comité de Memoria de Titulo, “Diseño e implementación de un Centro de Contacto IP economico y distribuido sin fines de lucro", Nikolai Tchernitchin Lapin, Agosto 2007, Facultad de Ciencias Fisicas y Matematicas, Universidad de Chile. Participo como docente en los cursos de formación del Magister de Informatica Medica de la Universidad de Chile (Procesamiento de bioseñales e imagenes I-II, Curso de Telemedicina I-II, y en cursos internacionales de Microscopia tales como “Optics, Forces and Development”, Santiago, Chile y “Processing and Analysis of Fluorescence Microscopy Images”, Montevideo, Uruguay.

He estado participando en la empresa CEDAI SpA como asesor tecnico, empresa spin off de la Universidad de Chile donde hemos transferido la tecnología desde la Universidad de Chile a la empresa CEDAI a a través de un licenciamiento y que ahora estamos explotando. Para ello, hemos participado en el CORFO Go-to-Market “Estrategia de comercialización internacional de herramienta TIC basada en análisis de Espermiogramas digitales vía Internet” 13GTM-22037. Participamos activamente en un proyecto CORFO SSAF con la incubadora Austral Incuba y en OpenBeaucheff, proyecto que impulsa emprendimientos dentro de la Universidad de Chile.

He asesorado al proyecto CORFO 14PIE-30560, “Video compression chip for mobile cell phones being 20 times more efficient compared to the actual methods” a través de la Fraunhofer Chile. Empresa que ha desarrollado un chip de alta tecnologia donde necesitaban asesoria en la estructura del software que se adecuara al nuevo chip.

Miembro representante de la Universidad de Chile en RUTE Chile (Red Universitaria de Telemedicina) www.rutechile.cl

Segundo Lugar, VI Olimpiadas del Conocimiento de Fisica

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Chile, 1998

Segundo lugar de las olimpiadas del conocimiento de la Universidad de Santiago de Chile, mención Física, para estudiantes de secundaria.
Carta de Reconociemiento

UNIVERSIDAD DE CHILE

Chile, 1999

Carta de reconocimiento del Decano de la Facultad por Exelencia Academica.
Ganador de Beca de Exelencia Academica

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Chile, 2000

Ganador de Beca de Exelencia Academica para hijos de funcionarios y empleados de la Universidad de Santiago de Chile.
Ganador de Beca DAAD-CONICYT

COMISION NACIONAL DE INVESTIGACION CIENTIFICA Y TECNOLOGICA

Chile, 2008

Ganador de Beca de Doctorado en la Universidad Tecnica de Munich, Alemania, entre 2008 a 2012.


3D Nuclei Segmentation through Deep Learning Rojas, Roberto; Navarro, Carlos F.; Orellana, Gabriel A.; Lemus, Carmen Gloria C.; Castaneda, Victor; IEEE Article ISI 2023 IEEE CONFERENCE ON ARTIFICIAL INTELLIGENCE, CAI (2023)
Adaptación de una metodología de especificaciones en la calificación y retroalimentación en la enseñanza de cursos de ciencias básicas en una carrera de la salud para mejorar los aprendizajes y la motivación Cerda, Mauricio; Gormaz, Karen; Vega, Hector; Castañeda, Víctor; Varela, Diego; Casas, Mariana; Dunstan, Jocelyn; De la Fuente, Milton; Kunakov, Natasha Article ARS MEDICA Revista de Ciencias Médicas (2021)
Content-Based Medical Image Retrieval and Intelligent Interactive Visual Browser for Medical Education, Research and Care Sotomayor, Camilo G.; Mendoza, Marcelo; Castaneda, Victor; Farias, Humberto; Molina, Gabriel; Pereira, Gonzalo; Hartel, Steffen; Solar, Mauricio; Araya, Mauricio Article ISI DIAGNOSTICS (2021)
Exergames and Telerehabilitation on Smartphones to Improve Balance in Stroke Patients Burgos, PI; LARA, O; Lavado, A; Rojas-Sepulveda, I; Delgado, C; Bravo, E; Kamisato, C; Torres, J; Castaneda, V; Cerda, M Article BRAIN SCIENCES (2020)
Mathematical modeling for 2D light-sheet fluorescence microscopy image reconstruction Cueva, Evelyn; Courdurier, Matias; Osses, Axel; Castañeda, Victor; Palacios, Benjamin; Härtel, Steffen Article Inverse Problems (2020)
Optimising adjacent membrane segmentation and parameterisation in multicellular aggregates by piecewise active contours JARA-WILDE, J.; CASTRO, I.; LEMUS, C. G.; PALMA, K.; VALDES, F.; CASTANEDA, V.; HITSCHFELD, N.; CONCHA, M. L.; HARTEL, S. Article ISI JOURNAL OF MICROSCOPY (2020)
Extra-embryonic tissue spreading directs early embryo morphogenesis in killifish Reig G, Cerda M; Sepúlveda N, Flores D; Castañeda V, Tada M; Härtel S, Concha ML Article Nature Communications (2017)
Sleep/wake disorders and the hypocretin/orexin system in a zebrafish model of Parkinson's Disease Izquierdo, Almudena Laliena; Castañeda, Víctor; Härtel, Steffen; Concha, Miguel Article ISI MECHANISMS OF DEVELOPMENT (2017)
Feasibility Study of Optical Spectroscopy as a Medical Tool for Diagnosis of Skin Lesions A. Safi; S. Ziauddin; A. Horsch; M. Ziai; V. Castañeda; T. Lasser; N. Navab Article SCOPUS International Journal of Advanced Computer Science and Applications (2016)
Computational Methods for Analysis of Dynamic Events in Cell Migration Castaneda, V; Cerda M, Santibanez F; Jara J., Pulgar; E, Palma; K., Lemus; CG, Osorio-Reich; M, Concha; ML, Hartel S Article CURRENT MOLECULAR MEDICINE (2014)
Gold-standard and improved framework for sperm head segmentation Chang V.; Saavedra, JM; Castaneda, V.; Sarabia L.; Hitschfeld, N; Hartel, S Article ISI SCOPUS COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE (2014)
Manejo de datos masivos en Biomedicina Computacional Article Revista Bits de Ciencia - Big Data (2014)
Stereo Time-of-Flight with Constructive Interference Castaneda, V.; Mateus, D; Navab, N Article ISI SCOPUS IEEE TRANSACTIONS ON PATTERN ANALYSIS AND MACHINE INTELLIGENCE (2014)


A new content-based image retrieval system for SARS-CoV-2 computer-aided diagnosis Molina, Gabriel; Mendiza, Marcelo; Loayza, Ignacio; Nuñez, Camilo; Araya, Mauricio; Castaneda, Victor; Solar, Mauricio; Su, Ruidan; Zhang, Yu-Dong; Liu, Han ConferencePaper (2022)
Evaluation of Human SCD Test by Digital Image Analysis Castañeda, V; Figueroa C.A.; Horta, Fabrizzio; Vargas, Susana; Garcia, Alejandra; Jara-Wilde, Jorge; Härtel, Steffen ConferencePaper (2022)
An Interoperable Repository of Clinical Data Solar, Mauricio; Araya, Mauricio; Cockbaine, Juan; Castaneda, Victor; Mendoza, Marcelo ConferencePaper (2020)
Manifold learning for dimensionality reduction and clustering of skin spectroscopy data A. Safi; V. Castañeda; T. Lasser; D. Mateus; N. Navab ConferencePaper (2011)
SLAM combining ToF and high-resolution cameras V. Castañeda; D. Mateus; N. Navab ConferencePaper (2011)
Stereo Time-of-Flight V. Castañeda; D. Mateus; N. Navab ConferencePaper (2011)
Manifold Learning for ToF-based Human Body Tracking and Activity Recognition L. Schwarz; D. Mateus; V. Castañeda; N. Navab ConferencePaper (2010)
Skin Lesions Classification with Optical Spectroscopy A. Safi; V. Castañeda; T. Lasser; N. Navab ConferencePaper (2010)
Reconstructing the Esophagus Surface from Endoscopic Image Sequences V. Castaneda; S. Atasoy; D. Mateus; N. Navab; A. Meining ConferencePaper (2009)
Characterizing Objectionable Image Content (Pornography and Nude Images) of Specific Web Segments: Chile as a Case Study J. Ruiz-del-Solar; V. Castañeda; R. Verschae; R. A. Baeza-Yates; F. Ortiz ConferencePaper (2005)


Towards dynamic ground glass opacity and consolidation voxel classification in COVID-19 CT using Gaussian Mixture Model Vásquez-Venegas, Constanza; Fuentealba, Valentina; Jara, Ricardo; Sotomayor, Camilo G; Castañeda, Victor; Pereira, Gonzalo; Härtel, Steffen; Cabrera-Vives, Guillermo ConferencePoster (2021)
Adjacent active contours for segmenting and quantifying aggregated cell membranes in fluorescence microscopy images. JARA-WILDE, J; Castro, I; Lemus, C. G.; Palma, K; Castañeda, V; Hitschfeld, N; Concha, M. L.; Härtel, S ConferencePoster (2019)
Caracterización de las propiedades mecánicas del biofilm de Proteus Mirabilis mediante el uso de un sistema de pinzas ópticas dentro de un Microscopio de Fluorescencia Light Sheet Chandia, K; Castañeda, V; Härtel, S ConferencePoster (2019)
Sleep/wake disorders and the hypocretin/orexin system in a zebrafish model of Parkinson’s disease A. Laliena; V. Castañeda; S. Hartel; ML. Concha ConferencePoster (2016)
“Mechanical coupling of random cell migration to epithelial surface expansion drives mesenchymal-like tissue spreading in annual killifish embryos G. Reig; M. Cerda; N. Sepúlveda; D. Flores; V. Castañeda; M. Tada; S. Hartel; ML. Concha ConferencePoster (2016)
Connecting the Faculty of Medicine, University Hospital and STI-UChile via REUNA to the National Laboratory for High Performance Computing (NLHPC); and performing High Speed 4- Lens Light Sheet Fluorescence Microscopy V. Castañeda ConferencePoster (2015)
Procesamiento de imágenes de microscopia: cálculo y almacenamiento con apoyo de redes de alta velocidad M. Cerda; V. Castañeda ConferencePoster (2015)
Progress state and challenges of project U-Redes BioMed-HPC V. Castañeda ConferencePoster (2014)
A novel approach for detection and segmentation of human sperm head characteristics V. Chang; J. Saavedra; V. Castañeda; L. Sarabia; N. Hitschfeld; S. Hartel ConferencePoster (2013)
Advanced Tools Applied to Frontier Astronomy, BioMedicine and Massive Data-driven Sciences V. Castañeda; M. Cerda; J. Jara; S. Hartel ConferencePoster (2013)
Digital image processing for applications in biomedical diagnosis A. Garcia; V. Castañeda; S. Vargas; C. Figueroa; R. Rojas; S. Hartel ConferencePoster (2013)
Gold Standards and expert driven calibrations for digital sperm analysis via internet: Motility, Vitality, DNA Fragmentation S. Hartel; A. Garcia; V. Castañeda ConferencePoster (2013)
Quality, Quantity, and Reproducibility: Biomedical Imaging at the Inter-face of Research and Development Photons, Borders, Flows S. Hartel; M. Cerda; J. Jara; V. Castañeda ConferencePoster (2013)
Caveolin-1-enhanced metastatic cancer cell migration is matrix dependent and requires tyrosine- 14 R. Ortiz; V. Torres; M. Diaz; J. Cooper-White; V. Castañeda; S. Hartel; L. Leyton; A. Quest ConferencePoster (2012)
Web-based platform for biomedical ground standard generation R. Pezoa; V. Castañeda; S. Hartel ConferencePoster (2012)


Manejo de datos masivos en Biomedicina Computacional V. Castañeda Monograph (2014)


Method of enhanced depth image acquisition Navab, Nassir; Castañeda, Victor; Mateus, Diana Patent grant patent (2017)


Inverse problems for waves and photon propagation arising in medical imaging and microscopy Osses, Axel; Courdurier, Matias; Castaneda, Victor Proyecto (2024)
Repositorio Interoperable Para Análisis Inteligentes De Imágenes Médicas Araya, Mauricio; Solar, Mauricio; Mendoza, Marcelo; Pereira R., Gonzalo; Solange Silva-Ruz; Castañeda, Víctor Proyecto (2022)
Early Risk Detection of Mental Deterioration by a Smartphone-based Auditory Screening Delano, Paul H.; Castaneda, Victor Proyecto (2021)
High Performance Microscopy and Medical Imaging: Forces, Data and Artificial Intelligence for Biomedical and Medical Research Pereira R., Gonzalo; Urra, Hery; Cerda, Mauricio; Concha, Miguel L.; Castañeda, Víctor Proyecto (2021)
Mejoramiento del segmentador de núcleos y membranas celulares LSFM Castañeda, Victor Proyecto (2021)
IA·TRAD CHILE: INTELIGENCIAARTIFICIAL PARA APOYO DIAGNÓSTICO Y PROCESOS DE ATENCIÓN EN RADIOLOGÍA Y TELE-RADIOLOGÍA CLÍNICA hartel, Steffen; Cabrera, Guillermo; Pereira, Gonzalo; Castaneda, Victor Proyecto (2020)
Remote analysis of sperm DNA fragmentation for salmon species farmed in Chile Pulgar, E; Castaneda, V Proyecto (2020)
Repositorios de Información Interoperables para la Minería de Datos en la Industria de la Salud Araya, Mauricio; Solar, Mauricio; Mendoza, Marcelo.; Castaneda, Victor Proyecto (2019)
5D Image Processing and Physical Models for the Quantification of Cell Migration and Multicellular Architecture with 4-Lens Light Sheet Fluorescence Microscopy FONDEF (1181823) Proyecto 2018-2021 Coinvestigador(a)
Deep-Learning Based Segmentation for the Analysis of Large Biomedical Imaging FONDECYT (11170475) Proyecto 2017-2020 Inv. Principal
Proyecto para el desarrollo de la telemedicina en el Hospital Clinico de la Universidad de Chile Universidad de Chile (Telemedicina) Proyecto 2017-2019 Coinvestigador(a)
Go to market of spin-Off=> Semen Analysis via Internet system. CORFO (14SSAF-27061-7) Proyecto 2016-2018 Investigador(a)
CEDAI SpA Garcia, Alejandra; Castaneda, Victor Proyecto (2015)
IMAGE PROCESSING AND PHYSICAL MODELS FOR THE INTERPRETATION OF CELL MIGRATION WITH 4-LENS LIGHT SHEET FLUORESCENCE MICROSCOPY FONDECYT (1151029) Proyecto 2015-2018 Personal técnico y/o de apoyo
BioMed-HPC=> Computational Biology and Medicine Network of High Performance Computing. U-Redes Universidad de Chile (BioMed-HPC) Proyecto 2013-2017 Postdoctorado
Estrategia de comercialización internacional de herramienta TIC basada en análisis de espermiogramas digitales vía Internet CORFO (13GTM-22037) Proyecto 2013-2014 Investigador(a)
Light Sheet=> a new vision of 3D fluorescence microscopy which combines high speed, resolution and versatility in applications FONDEQUIP (EQM130051) Proyecto 2013-2015 Postdoctorado
Particle filter based tracking and segmentation pipeline for the analysis of cell shape in large biomedical imaging data FONDECYT (3140444) Proyecto 2013-2016 Inv. Principal
Virtual Microscopy=> Internet assisted Digital Pathology Center FONDEF (D11I1096) Proyecto 2013-2015 Investigador(a)
Light sheet based microscopy and data processing for the analysis dynamics, multicellular events in large specimen Biomedical Neuroscience Institute Proyecto 2012-2013 Inv. Principal
Internet assisted Digital Spermiogram ED-AI FONDEF (D07I1019) Proyecto 2011-2012 Investigador(a)
Constructive interference for Multi-view Time-of-Flight acquisition PFCHA (A0771930) Proyecto 2008-2012 Inv. Principal
Biometry for Security by Video System=> Detection, Tracking, Identification and Behavior Determination FONDEF (D04I-1256) Proyecto 2006-2008 Investigador(a)