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Jorge Eduardo Tapia Farias

Profesor Asistente

Universidad Técnica Federico Santa María

Valparaiso, Chile

Líneas de Investigación


SISTEMAS AVANZADOS DE MICROSCOPIA ÓPTICA ADAPTATIVA SENSADO DE FRENTE DE ONDA

Educación

  •  Ciencias Físicas, UNIVERSIDAD DE CONCEPCION. Chile, 2016
  •  Ingeniero Físico, UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE. Chile, 2011
  •  Ciencias Físicas, UNIVERSIDAD DE CONCEPCION. Chile, 2020
  •  Física Aplicada, UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE. Chile, 2009

Experiencia Académica

  •   ASISTENTE DE INVESTIGACIÓN Part Time

    UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

    CIENCIAS FÍSICAS Y MATEMÁTICA

    SANTIAGO, Chile

    2007 - 2009

  •   AYUDANTE DE LABORATORIO DE DOCENCIA Part Time

    UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

    CIENCIAS FÍSICAS Y MATEMÁTICAS

    SANTIAGO, Chile

    2006 - 2010

  •   AYUDANTE DE DOCENCIA Part Time

    UNIVERSIDAD DIEGO PORTALES

    INGENIERIA

    SANTIAGO, Chile

    2009 - 2010

  •   ALUMNO TESISTA Other

    UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

    CIENCIAS FÍSICAS Y MATEMÁTICAS

    SANTIAGO, Chile

    2009 - 2011

  •   AYUDANTE DE LABORATORIO DE DOCENCIA Part Time

    UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

    CIENCIAS FÍSICAS Y MATEMÁTICAS

    CONCEPCIÓN, Chile

    2014 - 2014

  •   Profesor Asistente Full Time

    UNIVERSIDAD TECNICA FEDERICO SANTA MARIA

    Valparaiso, Chile

    2024 - At present

  •   Postdoctorado Full Time

    PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO

    Valparaiso, Chile

    2021 - 2025

  •   Postdoctorado Full Time

    UNIVERSIDAD SAN SEBASTIAN

    Concepción, Chile

    2020 - 2021

Experiencia Profesional

  •   ASISTENTE DE PROYECTO ÁREA MINERÍA Full Time

    TECNOLOGÍA INTEGRAL S.A.

    SANTIAGO, Chile

    2011 - 2013

  •   INGENIERO DE PROYECTOS ÁREA MINERÍA Full Time

    TECNOLOGÍA INTEGRAL S.A.

    SANTIAGO, Chile

    2012 - 2013

  •   ALUMNO PRACTICANTE Full Time

    AURA INC./ GEMINI OBSERVATORY

    LA SERENA, Chile

    2010 - 2010

  •   ALUMNO INVESTIGADOR DE DOCTORADO Full Time

    UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

    CONCEPCIÓN, Chile

    2016 - 2020

  •   ALUMNO INVESTIGADOR DE MAGÍSTER Full Time

    UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

    Concepción, Chile

    2013 - 2016

Difusión y Transferencia


1.- ADJUDICACIÓN 13° CONVOCATORIA DE INNOVACIÓN EMPRENDEDORA
CÓDIGO DE ADJUDICACIÓN DE PROYECTO: 15.185-EM.CIE
TÍTULO DE PROYECTO: DISEÑO, DESARROLLO E IMPLEMENTACIÓN DE HERRAMIENTAS ANALÍTICAS INTEGRADAS PARA VIDEO-MICROSCOPÍA DE ORGANISMOS VIVOS.
CATEGORÍA: DISEÑO PROTOTIPO

PATROCINADOR: INCUBA-UDEC UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN
RUT: 81.494.400-k
RAZÓN SOCIAL: UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN
REPRESENTANTE LEGAL: SERGIO LAVANCHY MERINO.
PERIODO DE DESARROLLO: 2016-2017
ESTADO DEL PROYECTO: COMPLETADO-CERRADO

El problema o desafío que se enfrentaba y que justificó la ejecución del proyecto:

En microscopía, los equipos comerciales de análisis se han estandarizado para aplicaciones muy específicas de identificación y caracterización de muestras biológicas. Por ejemplo, el costo mínimo para los equipos basados en técnicas de fluorescencia y super-resolución óptico/digital es del orden de US500 mil. Si bien sus capacidades son notables, son instrumentos limitados a muestras/especímenes fijos y a un segmento de resolución espacial [1-200 nm] (1nm = 1 mil millonésimo de metro) que está sobre-dimensionado para la observación tradicional de células, bacterias y pequeños especímenes [500 nm-1cm]. Luego, la microscopía óptica tradicional ha quedado relegada a un instrumento de observación e identificación humano, sin mayores prestaciones cuantitativas para el rango de observación de 500 nm a 1cm. En esta propuesta pretendemos ocuparnos de este vacío instrumental a fin proveer la video-microscopía con herramientas analíticas integradas.
En el contexto educacional, tanto a nivel escolar como universitario, se estudian, para fines docentes, elementos biológicos dentro del rango de 500 nm a 1cm (polen, microorganismos, células, etc.). A fin de ocuparnos del déficit en la capacidad instrumental para el rango de 500 nm a 1cm en el contexto educacional, se justifica el desarrollo de una herramienta óptica/digital para una caracterización cuantitativa en comparación a una herramienta de microscopía óptica tradicional. Con esto se busca incrementar los rendimientos académicos en la asignatura de ciencias naturales de séptimo a cuarto medio en los establecimientos que adquieran este prototipo.

Objetivos técnicos del proyecto:

Objetivo General

Diseñar, desarrollar e implementar un programa virtual, basado en procesamiento de imágenes digitales, con prestaciones analíticas integrables a un video-microscopio óptico tradicional (básico).

Objetivos Específicos

1. Construcción de equipo de análisis capaz de identificar muestras biológicas en la micro escala [500nm a 1cm], de las cuales obtendremos información cuantitativa y cualitativa, como ejemplo, representar numéricamente la densidad, el tamaño y la morfología de una muestra de glóbulos rojos, cultivos bacterianos y elementos vegetales, principalmente.
2. Validar técnicamente nuestro prototipo, mediante pruebas en laboratorio docente en el espectro educativo de séptimo a cuarto medio. La validación tiene por objetivo mejorar el software de análisis biológico, la unidad de procesamiento y el formato de integración de sus subunidades, en base a la retroalimentación con el usuario.

2. Concurso de I+D+i Ciencia+ “Impulsando la Investigación y Desarrollo desde la Ciencia– 2025”:
Nombre proyecto: Microscopía holográfica sin lentes asistida por visión computacional inteligente para certificación de monofloralidad de miel endémica chilena.
Monto financiamiento: $16.000.000
Los objetivos específicos que permiten el logro del objetivo especifico se divide en 3 aspectos fundamentales y son descritos a continuación:
1. Diseñar y poner en marcha un sistema de microscopía holográfica compacto y sin lentes, mecánicamente optimizado y con la resolución óptica adecuada para la identificación automatizada de partículas en muestras de miel.
2. Implementar y entrenar modelos de aprendizaje profundo, y encontrar el que mejor clasifique la composición botánica de la miel chilena a partir de imágenes de polen reconstruidas desde un microscopio holográfico sin lentes.
3. Integrar el sistema de microscopia holográfica sin lentes con el modelo de aprendizaje profundo y validar la clasificación automática de pólenes de manera que se opere en línea sin la necesidad de usuarios expertos.

3. Miembro de OPTICA, Sociedad de óptica de america
ID de miembro: 962477
Activo desde 2009 a la fecha
Entre otras actividades, cumplo funciones de Advisor de "Optoval Society Student Chapter", capitulo estudiantil que realiza difusión de la Ciencia

4. Miembro de SPIE
SPIE ID#: 4374584
Activo desde 2022



 

Article (10)

Blending salmon gelatin with polyvinylidene fluoride using coaxial electrospinning
Boosting microparticle tracking with neuromorphic cameras by optical modulation
Phase retrieval by designed Hadamard complementary coded apertures
YOLOv8-based on-the-fly classifier system for pollen analysis of Guindo Santo (Eucryphia glutinosa) honey and assessment of its monoflorality
Deep optics preconditioner for modulation-free pyramid wavefront sensing
Transformer neural networks for closed-loop adaptive optics using nonmodulated pyramid wavefront sensors
Hyperspectral Microscopy Technology to Detect Syrups Adulteration of Endemic Guindo Santo and Quillay Honey Using Machine-Learning Tools
Correlated flickering of erythrocytes membrane observed with dual time resolved membrane fluctuation spectroscopy under different d-glucose concentrations
Antioxidant effect of resveratrol in single red blood cells measured by thermal fluctuation spectroscopy
Infrared light field imaging system free of fixed-pattern noise

ConferencePaper (10)

Closed-loop experimental validation using neural networks in a non-modulated pyramidal wavefront sensor
Deep learning assisted Axicon Wavefront Sensor for wavefront estimation without optical modulation requirements
Phase Retrieval of Elongated Laser Guide Star by Sphere Packing Coded Apertures
High-speed wavefront reconstruction of a Gaussian beam propagating through controlled optical turbulence
Design and training of a deep neural network for estimating the optical gain in pyramid wavefront sensors
Enhanced Pyramid Wavefront Sensor via End-to-End trained diffractive optical layer
Exploration of Convolutional Neural Networks to handle non-linearity estimation issues in pyramid wavefront sensors
PULPOS: A multi-purpose adaptive optics test bench for testing advanced wavefront sensing concepts
PULPOS: A multi-purpose adaptive optics test bench in Chile
Thermal fluctuation spectroscopy apply to red blood cells membrane: The effect of glucose on the micro rheological properties

Patent (2)

Process allowing the removal through digital refocusing of fixed-pattern noise in effective images formed by electromagnetic sensor arrays in a light field
UN PROCESO QUE PERMITE ELIMINAR EL RUIDO DE PATRON FIJO EN IMAGENES EFECTIVAS FORMADAS POR ARREGLOS DE SENSORES ELECTROMAGNETICOS DE UN CAMPO DE LUZ MEDIANTE UN REENFOQUE DIGITAL.
2
Dario Perez

Profesor Titular

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

Placilla, Chile

1
Javier Enrione

Profesor Titular

Facultad de Medicina

Universidad de Los Andes

Santiago, Chile

1
Susana Sanchez

Assistant Professor

Polimeros

Universidad de Concepcion

Concepcion, Chile

2
Juan Staforelli

Académico

Ciencias Físicas

Universidad de Concepción

concepción, Chile

2
Esteban Vera

Associate Professor

School of Electrical Engineering

Pontificia Universidad Catolica de Valparaiso

Valparaiso, Chile

2
pablo coelho

Profesor asistente

Ingeniería, arquitectura y diseño

Universidad San Sebastián

Concepción, Chile

22
Jorge Tapia

Profesor Asistente

Física

Universidad Técnica Federico Santa María

Valparaiso, Chile

2
Mauricio Rondanelli

Profesor Asociado

Ciencias y Tecnología Vegetal

Universidad de Concepción

Los Angeles, Chile

2
Aarón Cofré

Investigador Postdoctoral

Facultad de Ciencias

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso , Chile

1
Anselmo Jara

Investigador en Tecnología de la Información

Ingeniería Eléctrica

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

1
Francisco Pérez

Postdoc

Ingeniería Eléctrica

Universidad de Concepción

Conncepción, Chile

2
Guillermo Machuca

Académico

Facultad de Ingeniería

Universidad de Atacama

Copiapo, Chile

1
Benjamín Sepúlveda

Personal técnico

Química inorgánica

Universidad de Concepción

Concepcion, Chile