Breeding improvement of fish and animals/statistical modelling and bioinformatics; QTL mapping and Marker assisted selection; Conservation Genetics; Patología Animal; Disease resistance. Pisicirickettsiosis

Profesor Tutor en tesis de Doctorado.

- Dettleff, P. DETERMINACIÓN DE LAS DIFERENCIAS TRANSCRIPCIONALES EN LA RESISTENCIA AL DESAFÍO EXPERIMENTAL CON PISCIRICKETTSIA SALMONIS EN EL SALMÓN DEL ATLÁNTICO (SALMO SALAR).” UNIVERSIDAD DE CHILE, Doctorado/PhD, 2015

- Paola Mujica. "Variabilidad y estructura genética del terrier Chileno",Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Doctorado/PhD, 2016

- Cristian Bravo. "RESPUESTA TRANSCRIPCIONAL DE P. SALMONIS A DESAFIOS MEDIANTE SECUENCIAMIENTO A GRAN ESCALA ", UNIVERSIDAD DE CHILE, Doctorado/PhD, 2016

- ALVARO MACHUCA. RESPUESTA DE P- SALMONIS A FIERRO DISPONIBLE IN VITRO", Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Doctorado/PhD, 2015

- KAREN NEUMANN. "RESISTENCIA GENETICA A CALIGUS ROGERCRESSEYI MEDIANTE LA RESPUESTA TRANSCRIPCIONAL DE SALMON ",UNIVERSIDAD DE CHILE, Doctorado/PhD, 2017.

- JESSICA DÖRNER. "NUTRIGENOMICA EN SERIOLA LALANDI ASOCIADA A LA SUPLEMENTACIÓN LIPIDICA", UNIVERSIDAD DE CHILE, Doctorado/PhD, 2017.

Profesor Consejero de tesis de Doctorado.

Rocio Gambra. Genomic architecture of bovine kappa-casein and beta-lactoglobulin. DOCTORADO/PUC. 2017.

Juan C. Leiva. Desarrollo de vectores bacterianos para la expresio?n de protei?nas por bactofeccio?n en ce?lulas de peces: Caracterizacio?n de la expresio?n de Hormona de crecimiento de Seriola lalandi en hepatocitos de Rachycentron canadum. 2016. DOCTORADO/UNIVERSIDAD DE ANTOFAGASTA.

Cesar Toledo. “EFECTO DE LA CONCENTRACION EPA + DHA EN LA DIETA, SOBRE CRECIMIENTO, SOBREVIVENCIA Y MALFORMACIONES OSEAS EN LARVAS DE Seriola lalandi CULTIVADAS EN CHILE”. en proceso. DOCTORADO/UNIVERSIDAD CATOLICA DE TEMUCIO.

Pablo Oyarzun. FILOGENIA Y DELIMITACIO?N DE LAS ESPECIES DEL COMPLEJO Mytilus edulis (MOLLUSCA:BIVALVIA) DE LAS COSTAS DE AMERICA DEL SUR. DOCTORADO/UNIVERSIDAD AUSTRAL DE CHILE.

Patrocinante en proyectos de postdoctorado.

- Escobar, S. 3160370. GENERACIÓN DE UNA ESTRATEGIA A TRAVÉS DE CRISPR/CAS9 PARA EL ESTUDIO DE LOS FACTORES ASOCIADOS A LA RESISTENCIA GENÉTICA A P. SALMONIS EN SALMÓN DEL ATLÁNTICO. Programa: FONDECYT. Rol: Inv. Patrocinante | Folio/N°: | 2015 - 2018

- PALOMINO, J. 3120211. Gene expression during early embryonic development of yellow-tail kingfish Seriola lalandi 01-10-2011 01-09-2014 / V. Martinez UCH / Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias, Departamento de Fomento de la Producción Animal, Departamento de Fomento de la Producción Animal FONDECYT Postdoctorado

- Patel, Alok. PDA11. Desarrollo de las capacidades en genomica para la generacion de nuevas estrategias de mejoramiento genetico animal, mejorando la rentabilidad de la Produccion Animal Nacional. Programa: PAI. Rol: Director(a) | Folio/N°: pda11 | 2009 - 2015

Profesor guia en tesis de Pregrado.

- Hernández Zúñiga, Eric Andrés Determinación de variabilidad genética en la subregión IIA del complejo principal de histocompatibilidad ovino (OVAR MHC,) en las razas Criollo Chilote y Suffolk Down Departamento de Fomento de la Producción Animal 2015 . Guía.

- Molina Carvajal, Yasna Evaluación de la expresión del gen rpoS en Piscirickettsia salmonis en individuos susceptibles infectados experimentalmente Departamento de Fomento de la Producción Animal 2015 . Guía.

- Montecinos Rojas, Felipe Andrés Identificación y expresión del gen constitutivo sdhA, de Piscirickettsia salmonis cepa LF-89 en salmones del Atlántico (Salmo salar) desafiados y en cultivo celular infectado Departamento de Fomento de la Producción Animal 2015. Guía.

- Barra Valdebenito, Verónica Expresión de genes durante el desarrollo larval en Seriola lalandi Departamento de Fomento de la Producción Animal 2014 . Guía.

- Cichero Molina, Daniela. Validación de ocho marcadores microsatélites para el análisis genético de Mytilus chilensis Departamento de Fomento de la Producción Animal 2013 . Guía.

- Dettleff Faúndes, Phillip. Determinación del grado de desequilibrio de ligamiento en el cromosoma asociado con resistencia a necrosis pancreática infecciosa en el Salmón del Atlántico (Salmo salar) Departamento de Fomento de la Producción Animal 2012. Guía.

- López López, Paulina Fabiola. Determinación del nivel y extensión del desequilibrio de ligamiento en el grupo de ligamiento XI asociado a peso corporal en cuatro poblaciones del salmón del Atlántico Departamento de Fomento de la Producción Animal 2013 . Guía.

- Neumann Oyarzo, Karen Flora. Estructura genómica del cromosoma asociado al Complejo Mayor de Histocompatibilidad en poblaciones comerciales chilenas de Salmón del Atlántico (Salmo salar) Departamento de Fomento de la Producción Animal 2012. Guía.

Consejero

- Jofré Herrera, María Soledad. Dinámica del aparato de Golgi durante la maduración in vitro e in vivo de ovocitos de perra y su relación con el desarrollo meiótico Departamento de Fomento de la Producción Animal 2013. Consejero

- Pacheco Fuentes, Héctor Arturo. Cambios morfológicos en el ala de Drosophila melanogaster, asociados a la inhibición de la síntesis de la proteína CoREST por medio de RNA interferente Departamento de Ciencias Biológicas Animales 2013 . Consejero

- González Rubio, Alvaro Andrés. Uso de atributos de calidad para evaluar la vigilancia de enfermedades respiratorias de denuncia obligatoria en aves en el año 2004 Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias 2012 . Consejero

- Vergara Madrid, Javiera Francisca. Descondensación del núcleo espermático en ovocitos de perra inmaduros y madurados in vitro e in vivo y su relación con el desarrollo meiótico Departamento de Fomento de la Producción Animal 2012. Consejero.

- Rodríguez Limidoro, Javiera Ignacia Expresión de enzimas involucradas en la adquisición de la flotabilidad de huevos y embriones de Seriola lalandi Departamento de Fomento de la Producción Animal 2016 Consejero.

During the last 5 years, we have been working together with the salmon industry, such as INTESAL, the technological branch of the salmon producers, AQUAGEN breeding company; and Blue genomics, an applied biotechnology company in order to understand the genetic and genomic bases of disease resistance in both Atlantic and Coho salmon. To this end major QTL have been found and implemented in the breeding of this species for SRS, our major bacterial disease. The coho salmon case is interesting, by my grant FONDEF, I have been developed a coho salmon array using different sources of genomic information in order to develop a comprehensive tool for disease resistance screening. Using disease challenge test, we have discovered a QTL of major effect explaining more than 50 % of the genetic variance. The gene involved and its use is considered for patenting. Th results have been validated in practice.

We have initiated together ACUINOR the long term program for the diversification of the Chilean aquaculture. To this end we have developed several tools using genomic information that are now used for developing the national breeding program for this species. A genome draft was obtained which has served as a precompetitive tool for developing a Seriola array that is going to be used for the industry, both within Chile and abroad in Mexico and the US. We further discover haploptypes within a gen involved in sexual differentiation, that is now implemented using HRM, in order to screen individuals for several purposes, such breeding, nutrigenomics, and reproduction. The tool has been validated using information from Seriola lalandi obtained form Australia.

So far in dogs we have developed the basis for the recognition of the Chilean terrier as a international breed. The genetic variability has been thoroughly screened and the results support the idea of an isolated terrier breed.