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Victor Antonio Castañeda Zeman

Prof. Asistente

Universidad de Chile

Santiago, Chile

Líneas de Investigación


Computer Vision; Image processing; Sensor developing; Biomedical Informatics; Computational Image Processing; Membrane Biophysics

Educación

  •  PhD Informatica, TECHNISCHE UNIVERSITAT MUNCHEN. Alemania, 2012
  •  Ingeniero Civil Electricista, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2005
  •  Licenciado en Ciencias de la Ingenieria mención Electrica, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2003

Experiencia Académica

  •   Profesor Ayudante, Curso Fisica Estadistica Other

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Facultad de Ciencias Fisicas y Matematicas

    Santiago, Chile

    2001 - 2001

  •   Profesor Ayudante, Introduccion a la Fisica Other

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Ciencias Fisicas y Matematicas

    Santiago, Chile

    2001 - 2002

  •   Asistente de Laboratorio de Electronica Other

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Ciencias Fisicas y Matematicas

    Santiago, Chile

    2003 - 2004

  •   Profesor de Curso Practico, Kinect Programming for Computer Vision Other

    TECHNISCHE UNIVERSITAT MUNCHEN

    Matematica e Informatica

    Munich, Alemania

    2011 - 2011

  •   Profesor de Curso, Vision Computacional 3D II, Other

    TECHNISCHE UNIVERSITAT MUNCHEN

    Matematica e Informatica

    Munich, Chile

    2011 - 2012

  •   Profesor reemplazante, Fisica General Other

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Medicina

    Santiago, Chile

    2012 - 2016

  •   Profesor de Fisica 2, Tecnologia Medica Other

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Medicina

    Santiago, Chile

    2013 - 2013

  •   Profesor de Fisica Aplicada, carrera Tecnologia Medica Other

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Medicina

    Santiago, Chile

    2013 - 2013

  •   Profesor de Curso de Magister, Image and Biosignal Processing I and II Other

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Medicina

    Santiago, Chile

    2012 - 2016

  •   Profesor curso internacional, “Optics, Forces and Development” Other

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Medicina

    Santiago, Chile

    2014 - 2016

  •   PROFESOR ASISTENTE Full Time

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    MEDICINA

    SANTIAGO, Chile

    2018 - A la fecha

Experiencia Profesional

  •   Asistente de Mecanico Full Time

    Autosummit

    Santiago, Chile

    2002 - 2002

  •   Estudiante en Practica Full Time

    Telefonica Movil S.A.

    Santiago, Chile

    2003 - 2003

  •   Estudiante en Practica Full Time

    Conecta Ingenieria

    Santiago, Chile

    2004 - 2004

  •   Ingeniero de Proyecto Full Time

    Telmex Chile

    Santiago, Chile

    2005 - 2006

  •   Profesor de Capacitacion Other

    Telmex Chile S.A.

    Santiago, Chile

    2007 - 2007

  •   Asistente de Investigacion Other

    Dpto. Ing. Electrica, FCFM, Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2005 - 2005

  •   Asistente de Investigacion Full Time

    Proyecto FONDEF D04I-1256, Dpto. Ing. Electrica, FCFM, Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2006 - 2008

  •   Asistente de Investigacion Full Time

    Proyecto FONDEF D07I1019, FMED, Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2012 - 2012

  •   Asesor Tecnico Experto Other

    Proyecto FONDEF D11I1096, FMED, Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2012 - 2015

  •   PostDoc Full Time

    Biomedical Neuroscience Institute

    Santiago, Chile

    2012 - 2013

  •   Coordinador, Proyecto U-Redes BioMedHPC Other

    FMED, Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2013 - A la fecha

  •   PostDoc FONDECYT 3140444 Full Time

    FMED, Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2013 - 2016

  •   Coordinador Proyecto FONDEQUIP EQM130051 Other

    FMED, Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2013 - 2015

  •   Subdirector TICs, Proyecto Telemedicina Part Time

    Hospital Clinico, Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2016 - 2019

  •   Asesor Tecnico, Proyecto CORFO, 14PIE-30560 Other

    Fraunhofer Chile

    Santiago, Chile

    2016 - 2016

Formación de Capital Humano


Miembro del comité de Memoria de Titulo, “Diseño e implementación de un Centro de Contacto IP economico y distribuido sin fines de lucro", Nikolai Tchernitchin Lapin, Agosto 2007, Facultad de Ciencias Fisicas y Matematicas, Universidad de Chile. Participo como docente en los cursos de formación del Magister de Informatica Medica de la Universidad de Chile (Procesamiento de bioseñales e imagenes I-II, Curso de Telemedicina I-II, y en cursos internacionales de Microscopia tales como “Optics, Forces and Development”, Santiago, Chile y “Processing and Analysis of Fluorescence Microscopy Images”, Montevideo, Uruguay.


Difusión y Transferencia


He estado participando en la empresa CEDAI SpA como asesor tecnico, empresa spin off de la Universidad de Chile donde hemos transferido la tecnología desde la Universidad de Chile a la empresa CEDAI a a través de un licenciamiento y que ahora estamos explotando. Para ello, hemos participado en el CORFO Go-to-Market “Estrategia de comercialización internacional de herramienta TIC basada en análisis de Espermiogramas digitales vía Internet” 13GTM-22037. Participamos activamente en un proyecto CORFO SSAF con la incubadora Austral Incuba y en OpenBeaucheff, proyecto que impulsa emprendimientos dentro de la Universidad de Chile.

He asesorado al proyecto CORFO 14PIE-30560, “Video compression chip for mobile cell phones being 20 times more efficient compared to the actual methods” a través de la Fraunhofer Chile. Empresa que ha desarrollado un chip de alta tecnologia donde necesitaban asesoria en la estructura del software que se adecuara al nuevo chip.

Miembro representante de la Universidad de Chile en RUTE Chile (Red Universitaria de Telemedicina) www.rutechile.cl


Premios y Distinciones

  •   Segundo Lugar, VI Olimpiadas del Conocimiento de Fisica

    UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

    Chile, 1998

    Segundo lugar de las olimpiadas del conocimiento de la Universidad de Santiago de Chile, mención Física, para estudiantes de secundaria.

  •   Carta de Reconociemiento

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Chile, 1999

    Carta de reconocimiento del Decano de la Facultad por Exelencia Academica.

  •   Ganador de Beca de Exelencia Academica

    UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

    Chile, 2000

    Ganador de Beca de Exelencia Academica para hijos de funcionarios y empleados de la Universidad de Santiago de Chile.

  •   Ganador de Beca DAAD-CONICYT

    COMISION NACIONAL DE INVESTIGACION CIENTIFICA Y TECNOLOGICA

    Chile, 2008

    Ganador de Beca de Doctorado en la Universidad Tecnica de Munich, Alemania, entre 2008 a 2012.


 

Article (12)

Adaptación de una metodología de especificaciones en la calificación y retroalimentación en la enseñanza de cursos de ciencias básicas en una carrera de la salud para mejorar los aprendizajes y la motivación
Content-Based Medical Image Retrieval and Intelligent Interactive Visual Browser for Medical Education, Research and Care
Exergames and Telerehabilitation on Smartphones to Improve Balance in Stroke Patients
Mathematical modeling for 2D light-sheet fluorescence microscopy image reconstruction
Optimising adjacent membrane segmentation and parameterisation in multicellular aggregates by piecewise active contours
Extra-embryonic tissue spreading directs early embryo morphogenesis in killifish
Sleep/wake disorders and the hypocretin/orexin system in a zebrafish model of Parkinson's Disease
Feasibility Study of Optical Spectroscopy as a Medical Tool for Diagnosis of Skin Lesions
Computational Methods for Analysis of Dynamic Events in Cell Migration
Gold-standard and improved framework for sperm head segmentation
Manejo de datos masivos en Biomedicina Computacional
Stereo Time-of-Flight with Constructive Interference

ConferencePaper (10)

A new content-based image retrieval system for SARS-CoV-2 computer-aided diagnosis
Evaluation of Human SCD Test by Digital Image Analysis
An Interoperable Repository of Clinical Data
Manifold learning for dimensionality reduction and clustering of skin spectroscopy data
SLAM combining ToF and high-resolution cameras
Stereo Time-of-Flight
Manifold Learning for ToF-based Human Body Tracking and Activity Recognition
Skin Lesions Classification with Optical Spectroscopy
Reconstructing the Esophagus Surface from Endoscopic Image Sequences
Characterizing Objectionable Image Content (Pornography and Nude Images) of Specific Web Segments: Chile as a Case Study

ConferencePoster (15)

Towards dynamic ground glass opacity and consolidation voxel classification in COVID-19 CT using Gaussian Mixture Model
Adjacent active contours for segmenting and quantifying aggregated cell membranes in fluorescence microscopy images.
Caracterización de las propiedades mecánicas del biofilm de Proteus Mirabilis mediante el uso de un sistema de pinzas ópticas dentro de un Microscopio de Fluorescencia Light Sheet
Sleep/wake disorders and the hypocretin/orexin system in a zebrafish model of Parkinson’s disease
“Mechanical coupling of random cell migration to epithelial surface expansion drives mesenchymal-like tissue spreading in annual killifish embryos
Connecting the Faculty of Medicine, University Hospital and STI-UChile via REUNA to the National Laboratory for High Performance Computing (NLHPC); and performing High Speed 4- Lens Light Sheet Fluorescence Microscopy
Procesamiento de imágenes de microscopia: cálculo y almacenamiento con apoyo de redes de alta velocidad
Progress state and challenges of project U-Redes BioMed-HPC
A novel approach for detection and segmentation of human sperm head characteristics
Advanced Tools Applied to Frontier Astronomy, BioMedicine and Massive Data-driven Sciences
Digital image processing for applications in biomedical diagnosis
Gold Standards and expert driven calibrations for digital sperm analysis via internet: Motility, Vitality, DNA Fragmentation
Quality, Quantity, and Reproducibility: Biomedical Imaging at the Inter-face of Research and Development Photons, Borders, Flows
Caveolin-1-enhanced metastatic cancer cell migration is matrix dependent and requires tyrosine- 14
Web-based platform for biomedical ground standard generation

Monograph (1)

Manejo de datos masivos en Biomedicina Computacional

Patent (1)

Method of enhanced depth image acquisition

Proyecto (21)

Repositorio Interoperable Para Análisis Inteligentes De Imágenes Médicas
Early Risk Detection of Mental Deterioration by a Smartphone-based Auditory Screening
High Performance Microscopy and Medical Imaging: Forces, Data and Artificial Intelligence for Biomedical and Medical Research
IA·TRAD CHILE: INTELIGENCIAARTIFICIAL PARA APOYO DIAGNÓSTICO Y PROCESOS DE ATENCIÓN EN RADIOLOGÍA Y TELE-RADIOLOGÍA CLÍNICA
Remote analysis of sperm DNA fragmentation for salmon species farmed in Chile
Repositorios de Información Interoperables para la Minería de Datos en la Industria de la Salud
5D Image Processing and Physical Models for the Quantification of Cell Migration and Multicellular Architecture with 4-Lens Light Sheet Fluorescence Microscopy
Deep-Learning Based Segmentation for the Analysis of Large Biomedical Imaging
Proyecto para el desarrollo de la telemedicina en el Hospital Clinico de la Universidad de Chile
Go to market of spin-Off=> Semen Analysis via Internet system.
CEDAI SpA
IMAGE PROCESSING AND PHYSICAL MODELS FOR THE INTERPRETATION OF CELL MIGRATION WITH 4-LENS LIGHT SHEET FLUORESCENCE MICROSCOPY
BioMed-HPC=> Computational Biology and Medicine Network of High Performance Computing.
Estrategia de comercialización internacional de herramienta TIC basada en análisis de espermiogramas digitales vía Internet
Light Sheet=> a new vision of 3D fluorescence microscopy which combines high speed, resolution and versatility in applications
Particle filter based tracking and segmentation pipeline for the analysis of cell shape in large biomedical imaging data
Virtual Microscopy=> Internet assisted Digital Pathology Center
Light sheet based microscopy and data processing for the analysis dynamics, multicellular events in large specimen
Internet assisted Digital Spermiogram ED-AI
Constructive interference for Multi-view Time-of-Flight acquisition
Biometry for Security by Video System=> Detection, Tracking, Identification and Behavior Determination
43
Victor Castañeda

Prof. Asistente

Tecnologia Medica

Universidad de Chile

Santiago, Chile

4
Steffen Härtel

Full Professor

Instituto de Ciencias Biomédicas

University of Chile

Santiago, Chile

2
Nancy Hitschfeld

Full Professor

Computer Science

UNIVERSIDAD DE CHILE , DEPTO CIENCIAS COMPUTACION

Santiago, Chile

1
Violeta Chang

Profesora asistente

Ingeniería Informática

Universidad de Santiago de Chile

Santiago, Chile

1
Gonzalo Pereira

Médico radiólogo

Radiología

Hospital Clinico Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Mauricio Solar

Full time professor

Informatic

Universidad Técnica Federico Santa María

Santiago, Chile

1
Karina Palma

Postdoctorado

Instituto de Neurociencia Biomédica BNI

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Miguel Concha

Full Professor

Anatomy and Developmental Biology

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Jorge Jara

Investigador Posdoctoral

ICBM, Facultad de Medicina

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Marcelo Mendoza

Académico

Ciencias de la Computación

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Mauricio Araya

Assistant Professor

Electronic Engineering

UNIVERSIDAD TECNICA FEDERICO SANTA MARIA

Valparaíso, Chile

1
Carmen Lemus

Post Doc

Laboratorio de Estudios Ontogénicos - Universidad de CHile

Santiago, Chile