Mecanismos moleculares de patogenicidad bacteriana; Interacción patógeno-hospedero; Genética microbiana; Genómica funcional microbiana

Dirección de Postdoctorados (2)

• Roberto Molina Quiroz. Chileno, Bioquímico (UNAB) y Doctor en Microbiología (USACH). Proyecto de postdoctorado: "Modulación de la virulencia de Salmonella mediada por cefotaxima" (Octubre, 2012 - Octubre, 2014).

• Fernando Baisón Olmo. Español, Licenciado en Biología (U. de Sevilla, España), Máster Universitario en Genética Molecular y Biotecnología (U. de Sevilla, España) y Doctor en Biología Molecular y Biomedicina (U. de Sevilla, España). Proyecto de postdoctorado: "Interacción de efectores de los sistemas de secreción de tipo III de Salmonella enterica con proteínas de Dictyostelium discoideum y su efecto en el desarrollo social del hospedador" (Marzo, 2018 - Marzo, 2021).

Dirección de Tesis de Doctorado (10)

• Carlos Blondel Buijuy. "Caracterización del Sistema de Secreción de Proteínas del Tipo VI (T6SS) codificado en la isla genómica SPI-19 de Salmonella enterica y su papel en la patogenicidad de los serotipos Gallinarum y Enteritidis". Tesis para optar al grado de Doctor en Bioquímica, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Septiembre, 2008 - Mayo, 2011). Dirección conjunta con la Dra. Inés Contreras (U. de Chile).

• Cecilia Silva Valenzuela. "Identificación de los genes involucrados en la colonización preferente y localización de Salmonella Typhimurium en tejido tumoral mamario murino". Tesis para optar al grado de Doctor en Ciencias Biomédicas, Facultad de Medicina, U. de Chile (Septiembre, 2010 - Mayo, 2014). Dirección conjunta con la Dra. Inés Contreras (U. de Chile) y el Dr. Michael McClelland (U. of California Irvine).

• David Pezoa Aros. "Sistemas de Secreción de tipo VI codificados en las islas SPI 6 y SPI 19 y su participación en la patogenicidad de Salmonella enterica serovares Typhimurium y Dublin". Tesis para optar al grado de Doctor en Ciencias Biomédicas, Facultad de Medicina, U. de Chile (Octubre, 2010 - Enero, 2014). Dirección conjunta con la Dra. Inés Contreras (U. de Chile).

• Rodrigo Espinoza Toledo. "Contribución de las islas de patogenicidad SPI-13 y SPI-8 en la interacción de Salmonella Enteritidis y Salmonella Typhi con macrófagos murinos y monocitos humanos". Tesis para optar al grado de Doctor en Bioquímica, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Agosto, 2013 - Mayo, 2017). Dirección conjunta con la Dra. Inés Contreras (U. de Chile).

• Macarena Varas Poblete. "Caracterización del proceso infectivo de mutantes de Salmonella enterica serovar Typhimurium deficientes en la síntesis de los polifosfatos inorgánicos en Dictyostelium discoideum, Danio rerio y macrófagos murinos". Tesis para optar al grado de Doctor en Ciencias con mención en Microbiología, Facultad de Ciencias, U. de Chile (Diciembre, 2013 - Noviembre, 2016). Dirección conjunta con el Dr. Francisco Chávez (U. de Chile).

• Ítalo Urrutia Henríquez. "Contribución de los factores de virulencia SopB, SptP y PphB de Salmonella enterica serovar Typhimurium en la modulación del proceso de autofagia en la ameba Dictyostelium discoideum y en macrófagos murinos". Tesis para optar al grado de Doctor en Bioquímica, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Agosto, 2015 - Agosto, 2019).

• Paulina Fernández Oyarzún. "Participación de los factores transcripcionales Fnr y ArcA en la regulación de la síntesis y modificación del lipopolisacárido en respuesta a la disponibilidad de oxígeno y su impacto sobre la virulencia de Salmonella enterica serovar Enteritidis". Tesis para optar al grado de Doctor en Bioquímica, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Agosto, 2015 - Agosto, 2019). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Ana Millanao Balboa. "Búsqueda de potenciales nuevos blancos de susceptibilidad a antimicrobianos mediante screening fenotípico de mutantes Salmonella Typhi zxx::EZ-Tn5: Inactivación del gen glnA y su relación con el aumento de la susceptibilidad a ciprofloxacino". Tesis para optar al grado de Doctor en Ciencias Farmacéuticas, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Septiembre, 2015 - Abril, 2020). Dirección conjunta con el Dr. Guido Mora y el Dr. Alejandro Hidalgo (U. Andrés Bello).

• Camila Valenzuela Montenegro. "Rol de los efectores SopB y SifA de Salmonella enterica serovar Typhimurium en la supervivencia intracelular y en la modificación de un compartimento que contiene a Salmonella en Dictyostelium discoideum". Tesis para optar al grado de Doctor en Ciencias con mención en Microbiología, Facultad de Ciencias, U. de Chile (Abril, 2016 - Enero, 2019).

• Fernando Amaya Inzunza. "Participación de los efectores GtgE y SopD2 de Salmonella Typhimurium en la inhibición del reclutamiento de Rab32A hacia la vacuola contenedora de Salmonella en Dictyostelium discoideum y su contribución a la supervivencia intracelular y virulencia bacteriana". Tesis para optar al grado de Doctor en Ciencias con mención en Microbiología, Facultad de Ciencias, U. de Chile (Julio, 2020 - En curso).

Dirección de Tesis de Magíster (17)

• Cecilia Silva Valenzuela. "Identificación de genes codificados en islas genómicas que contribuyen a la virulencia de Salmonella enterica serovar Enteritidis". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Bioquímica de Proteínas y Biotecnología), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Noviembre, 2007 - Enero, 2009). Dirección conjunta con la Dra. Inés Contreras (U. de Chile).

• Carolina Quezada Bustos. "Caracterización de la Isla Genómica IG-asnT de Salmonella enterica y su papel en la interacción del serovar Enteritidis con macrófagos murinos". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Bioquímica de Proteínas y Biotecnología), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Septiembre, 2008 - Diciembre, 2009). Dirección conjunta con la Dra. Inés Contreras (U. de Chile).

• Paula Velozo Hermosilla. "Construcción de vacunas de ADN de Salmonella enterica serovar Enteritidis y evaluación de la respuesta inmune generada en un modelo murino". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Bioquímica Ambiental), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Junio, 2009 - Diciembre, 2010). Dirección conjunta con la Dra. Inés Contreras (U. de Chile).

• Bernardo Pinto Anwandter. "Participación de los Sistemas de Secreción Tipo VI codificados en el genoma de Salmonella enterica serovar Dublin en la interacción con células eucarióticas". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Bioquímica de Proteínas y Biotecnología), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Abril, 2011 - Noviembre, 2012). Dirección conjunta con la Dra. Inés Contreras (U. de Chile).

• Camila Valenzuela Montenegro. "Identificación de genes comunes requeridos para la colonización sistémica de Salmonella enterica serovares Typhi, Typhimurium y Enteritidis mediante un análisis global de mutantes bajo selección negativa in vivo". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Toxicología y Diagnóstico Molecular), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Mayo, 2011 - Marzo, 2013). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Lorenzo Leiva Araya. "Contribución del sistema de secreción tipo VI codificado en la isla genómica SPI-6 a la virulencia de Salmonella enterica serovar Typhimurium". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Bioquímica de Proteínas y Biotecnología), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Septiembre, 2011 - Enero, 2013). Dirección conjunta con la Dra. Inés Contreras (U. de Chile).

• Sebastián Riquelme Barrios. "Identificación a escala genómica de genes involucrados en la supervivencia intracelular de Salmonella enterica serovar Typhimurium en el protozoo Dictyostelium discoideum". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Bioquímica de Proteínas y Biotecnología), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Junio, 2014 - Enero 2016). Dirección conjunta con el Dr. Francisco Chávez (U. de Chile).

• Eduardo Tobar Calfucoy. "Cambio de especificidad por dinucleótido de la 6-fosfogluconato deshidrogenasa de Escherichia coli". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Bioquímica de Proteínas y Biotecnología), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Junio, 2014 - Enero 2016). Dirección conjunta con el Dr. Ricardo Cabrera (U. de Chile).

• Andrea Sabag Matilla. "Análisis comparativo de los genes involucrados en la supervivencia intracelular de Salmonella enterica serovar Typhimurium en macrófagos murinos y en la ameba Dictyostelium discoideum". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Bioquímica Clínica), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Agosto, 2015 - Diciembre, 2017). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Beatriz Salas Valenzuela. "Caracterización de las proteínas PphA, PphB y SteC como efectores de Salmonella enterica serovar Typhimurium que interfieren con la autofagia en la ameba Dictyostelium discoideum". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Bioquímica de Proteínas y Biotecnología), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Junio, 2016 - Abril, 2019). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Fernando Amaya Inzunza. "Efecto de la hidroxilación del lípido A de Salmonella enterica serovar Enteritidis sobre la interacción con macrófagos murinos y la virulencia in vivo". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Toxicología y Diagnóstico Molecular), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Julio, 2016 - Agosto, 2018). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Jaime Ortega Berríos. "Contribución de los efectores SipA, SseF y SseG en la supervivencia intracelular de Salmonella enterica serovar Typhimurium en Dictyostelium discoideum". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Toxicología y Diagnóstico Molecular), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Agosto, 2017 - Junio, 2021). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Constanza Morgado Ruiz. "Participación del efector SseJ en la supervivencia intracelular de Salmonella Typhimurium en Dictyostelium discoideum y caracterización de los mecanismos moleculares involucrados". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Toxicología y Diagnóstico Molecular), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Enero, 2018 - Diciembre, 2021). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Marcela Zabner Espinoza. "Contribución del efector SopB en la supervivencia intracelular de Salmonella enterica serovar Typhimurium en Dictyostelium discoideum y su rol en el remodelamiento de la vía endocítica del hospedero". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Toxicología y Diagnóstico Molecular), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Julio, 2020 - Noviembre, 2022). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Daniel Escobar Araya. "Desarrollo y caracterización microbiológica de una cepa mutante de Streptococcus agalactiae knockout para el gen sip". Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Bioquímica de Proteínas y Biotecnología), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Octubre, 2020 - Noviembre, 2022). Dirección conjunta con el Dr. Abel Vásquez (ISP Chile).

• Camila Espinoza Grez. "Rol de la dinámica estructural del lipopolisacárido en la supervivencia de Salmonella enterica serovar Typhimurium frente a péptidos antimicrobianos de Dictyostelium discoideum". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Toxicología y Diagnóstico Molecular), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Octubre, 2020 - Julio, 2023). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Carolina Rubilar Leyton. "Participación del efector SopF de Salmonella Typhimurium en la inhibición de la xenofagia en Dictyostelium discoideum". Memoria para optar al Título de Bioquímico y Tesis para optar al grado de Magíster en Bioquímica (área de especialización en Toxicología y Diagnóstico Molecular), Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Agosto, 2023 - En curso). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

Dirección de Memorias de Título (6)

• Paula Mardones Acuña. "Identificación global de genes de Salmonella enterica serovar Gallinarum requeridos para la colonización sistémica de un hospedero murino". Memoria para optar al Título de Bioquímico, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Abril, 2012 - Diciembre, 2013). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Felipe Velásquez Salinas. "Efecto de la disponibilidad de oxígeno sobre las modificaciones covalentes del lipopolisacárido de Salmonella Enteritidis: participación de los reguladores globales ArcA y Fnr". Memoria para optar al Título de Bioquímico, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Mayo, 2014 - Junio, 2016). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Nicolás Chahin Doussoulin. "Participación de la islas de patogenicidad SPI-1 y SPI-2 en la interacción de Salmonella enterica serovar Typhimurium con la ameba social Dictyostelium discoideum". Memoria para optar al Título de Bioquímico, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Junio, 2014 - Enero, 2019). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Bayron Labra Labra. "Identificación de un conjunto de genes que permiten a Salmonella enterica serovar Typhimurium sobrevivir dentro del protozoo Dictyostelium discoideum". Memoria para optar al Título de Bioquímico, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Junio, 2015 - En curso). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Gabriel Vera Sánchez. "Contribución de la proteína efectora SopF en la supervivencia intracelular y virulencia de Salmonella enterica serovar Typhimurium en Dictyostelium discoideum". Memoria para optar al Título de Bioquímico, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Abril, 2018 - Septiembre, 2020). Dirección conjunta con el Dr. Sergio Álvarez (U. de Chile).

• Carolina Calquín Bahamondes. "Construcción de plasmidios recombinantes para la expresión, purificación y evaluación de la actividad proteolítica in vitro del efector GtgE de Salmonella Typhimurium sobre la proteína Rab32A de Dictyostelium discoideum". Memoria para optar al Título de Bioquímico, Facultad de Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile (Octubre, 2023 - En curso). Dirección conjunta con el Dr. Carlos Blondel (U. Andrés Bello).