Microbial Genomics; Genome plasticity; Applied bioinformatics and Computational Biology

Supervisions of students
Undergraduate degree
• 2023 “Genómica y metagenómica de bacterias en muestras de residuos de salmonicultura”. Biochemistry. Universidad de La Frontera. Student Carol Andrea Jerez Quezada
• 2020 “Diseño de gRNA eficientes para biomonitoreo de alta especificidad y sensibilidad mediante Cas13”. Biotechnology. Universidad de La Frontera. Student Benjamín Durán.
• 2020 “The Resistome of the emerging pathogen Corynebacterium striatum” Biochemistry, Universidad de La Frontera, Chile. Student Benjamín Leyton.
• 2020 “Identificación y caracterización genómica de bacteriófagos de Neisseria meningitidis en Chile”. Biochemistry, Universidad de La Frontera, Chile. Student David Madariaga.
• 2019 “Caracterización Genómica de Neisseria meningitidis en Chile y su relación evolutiva en el contexto de Latinoamérica”. Biochemistry, Universidad de La Frontera, Chile. Student Matías García
• 2014 “Caracterização da diversidade de espécies de Vibrio na ressurgência de Arraial do Cabo.” Biotechnology, Centro Universitário da Zona Oeste, RJ, Brazil. Student Caio Landim
• 2014 “Exploração da diversidade de lipases encontradas em ambientes aquáticos através da abordagem metagenômica.” Biotechnology, Centro Universitário da Zona Oeste, Brazil. Student Mayla Costa.
Graduate degree
• 2014. Co-Supervisor “Epidemiologia genômica de Bordetella pertussis no Brasil” MSc Computational Biology and Systems, Oswaldo Cruz Foundation, FIOCRUZ, Brazil. Student Diego Cambuy.
• 2014. Co-Supervisor “Caracterização da resistência aos Beta-lactâmicos e taxonomia de isolados do gênero Klebsiella.”, MSc Parasite Biology Oswaldo Cruz Foundation, FIOCRUZ, Brazil. Student Nilceia Ramos.
• 2017. Co-Supervisor “Taxonomia Genômica e Resistoma de Mycobacterias isoladas da Mata Atlântica.” MSc Computational Biology and Systems, Oswaldo Cruz Foundation, FIOCRUZ, Brazil. Student Sergio Mascarenhas.

Participation as an evaluator of students and research projects
• Participation in the Evaluation Commission (Lead Teacher) of Matías García's Graduation Project “Genomic Characterization of Neisseria meningitidis in Chile and its evolutionary relationship in the Latin American context”, Biochemistry Career. University of La Frontera, Temuco, Chile. February 28, 2020.
• Participation in the Evaluation Commission of the Graduation Project of Katherine Altamirano Sarabia (Lead Teacher: Dr. Milko Jorquera), of the Biochemistry Degree. University of La Frontera, Temuco, Chile. February 28, 2020.
• Participation in the Evaluation Commission of the Degree Project of Tamara Valenzuela Bórquez (Lead Teacher: Dr. Milko Jorquera), of the Biochemistry Career. University of La Frontera, Temuco, Chile. February 28, 2020.
• Evaluator of the Graduation Activity of Claudio Fernando Reyes Quiroz, student of the Biotechnology Career (Lead Teacher: Claudio Vásquez). University of La Frontera, Temuco, Chile. March 26, 2020.
• Evaluator in the 2020 Contest of the COVID-19 Multidisciplinary Research Projects Program for Research Groups of UNMSM. Lima, Peru. July 2020.
• Evaluator of the Preliminary Project in the framework of the Graduation Activity of the Student Abdiel Barra, student of the Biochemistry Degree (Teacher Guide: Priscilla Brebi). University of La Frontera, Temuco, Chile. July 28, 2020.
• Evaluator of the Doctoral Thesis Project of the student of the Doctorate in Sciences, mention in Applied Cellular and Molecular Biology, Ms. Elizabeth Carrazana Pérez (Lead Professor: Dr. Milko Jorquera). University of La Frontera, Temuco, Chile. September 14, 2020.
• Evaluator of the PhD Thesis Project in Computational Biology and Systems "Analysis of genetic diversity among representatives of the genus Mycobacterium and its contribution to the parasite-host relationship" by Edson Silva Machado Filho. Oswaldo Cruz Foundation, Rio de Janeiro, Brazil. September 21, 2020.
• Evaluator of the PhD Thesis Project in Computational Biology and Systems "Genômica de Mansonella ozzardi e Mansonella perstans da Amazônia Brasileira" by Carlos Aguiar Costa. Oswaldo Cruz Foundation, Rio de Janeiro, Brazil. September 22, 2020.

Teaching
Undergraduate Course
ICQ451 – Bioinformática Aplicada (Coordinator)
ICQ418 – Genómica
ICQ506 – Unidad de Investigación

Posgraduate Course
BRN701 – Proteogenómica: del diseño experimental al análisis bioinformático
BRN601 – Técnicas de Análisis Avanzado en Biorecursos
PBM010 – Biología Celular y Molecular

Other
• Participation in the virtual class "Assembly of microbial genomes", of the Bioinformatics Course. Master's in Molecular Biology. Universidad Nacional Mayor de San Marcos. August 17, 2020 (7-9pm).
• Participation in the virtual class "Annotation and comparison of genomes", of the Bioinformatics Course. Master's in Molecular Biology Universidad Nacional Mayor de San Marcos. August 24, 2020 (7-9pm).

Revisor
• Infection and drug resistance
• Microbiology Spectrum
• Microbial Genomics

Presentaciones en Eventos Científicos Nacionales y Internacionales
Nacional
• Participation in the organization of the CCCT – UFRO Culture Collections Symposium. September 29-30, 2020.

Internacional
• Abanto M.
“Abordajes bioinformáticos aplicados a la genómica microbiana” (Presentación Oral)
Jornada internacional: Herramientas Bioinformáticas aplicadas a la Biotecnología
18-19 noviembre 2022 La Paz, Bolivia
• Abanto M.
“Abordajes metagenómicos en la descubierta y caracterización de virus” (Presentación Oral)
Seminario Internacional de Genómica aplicada a infecciones virales
10-11 septiembre 2020 La Paz, Bolivia
• Abanto M.
“Genómica de Vibrio parahaemolyticus” (Presentación Oral)
Segundo Simposio Red Vibrio 2020
1-2 de Julio de 2020 Chile (online)
• Abanto M.
“Bioinformática aplicada a la investigación y diagnóstico de infecciones virales” (Presentación Oral)
I Jornada Macroregional del Norte sobre Investigación en Virología Clínica
04 de diciembre del 2020 Perú (online)

Participación en Fiestas y Ferias de Ciencia
• XV Feria de Investigación de la Universidad de La Frontera. Realizada 25 de octubre de 2022 en el frontis del Aula Magna, UFRO, Temuco, Chile.
• XIII Feria de Investigación de la Universidad de La Frontera. Realizada 05 de septiembre de 2019 en el Salón Siete Cumbres del Centro de Eventos Dreams - Temuco, Chile.
• XII Feria de Investigación de la Universidad de La Frontera. Realizada 05 de septiembre de 2018 en el Salón Siete Cumbres del Centro de Eventos Dreams - Temuco, Chile.
• III FIESTA DE LA CIENCIA Y LA TECNOLOGÍA 2018. Realizada 29 de septiembre en el Parque Estadio Germán Becker de Temuco, Chile.
• XII Feria de Investigación de la Universidad de La Frontera. Realizada 06 de septiembre de 2018 en el Salón Siete Cumbres del Centro de Eventos Dreams - Temuco, Chile.
• XI Feria de Investigación de la Universidad de La Frontera. Realizada 07 de septiembre de 2017 en el Salón Siete Cumbres del Centro de Eventos Dreams - Temuco, Chile.

Charlas
• Expositor en la Charla “Una breve mirada a la genómica” a estudiantes de enseñanza media del colegio InnovArte. Organizado por PROMUEVE-BIOREN. Jueves 27 de agosto 2020.

Entrevistas
https://www.noticias.ucn.cl/destacado/investigador-especialista-en-genomica-microbiana-expuso-en-la-casa-central-de-la-ucn-en-antofagasta/
https://www.diarioantofagasta.cl/regional/130467/antofagasta-proyecto-ucn-busca-reducir-el-riesgo-de-amputacion-de-pie-diabetico/
• Participación en la entrevista “El rol de la bioinformática desde la identificación hasta la generación de tratamientos para COVID-19”. Divulgación Científica BIOREN-UFRO. Abril 2020.