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Tomás Alberto Norambuena Arenas

Group Lead del equipo de Data Science y Bioinformática

Meristem SpA

Santiago, Chile

Bioinformática; Bioquímica; Biotecnología

Doctorado en Ciencias Biológicas mencion Genética Molecular y Microbiología, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE. Chile, 2011
Magister en Gobierno y Gerencia Pública, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2022
Bioquímico, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE. Chile, 2007
Magister en Innovación Tecnológica y Emprendimiento, UNIVERSIDAD TECNICA FEDERICO SANTA MARIA. Chile, 2023

Tesista de Pregrado Full Time

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

Ciencias Biológicas

Santiago, Chile

2005 - 2007
Research Assistant Full Time

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY

Heidelberg, Alemania

2007 - 2007
Tesista de doctorado Full Time

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

Ciencias Biológicas

Santiago, Chile

2007 - 2011
Postdoctorado Full Time

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

Ciencias Biológicas

Santiago, Chile

2011 - 2013
Tesista de Magister Part Time

UNIVERSIDAD DE CHILE

Gobierno

Santiago, Chile

2020 - 2022

Investigador Científico Asociado de la División de Biocómputo Full Time

Fraunhofer Chile Research Foundation

Santiago, Chile

2013 - 2016
Bioinformático Senior / Analista de Propiedad Intelectual Full Time

uBiome Inc

Santiago, Chile

2017 - 2019
Investigador Postdoctoral Full Time

Universidad Adolfo Ibáñez / Instituto Milenio de Fundamentos de los Datos

Santiago, Chile

2019 - 2020
Perito de Patentes Part Time

Instituto Nacional de Propiedad Industrial

Santiago, Chile

2015 - A la fecha
Evaluador Externo Programa de Becas y Ciencia Pública Part Time

Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo

Santiago, Chile

2019 - A la fecha

Beca Doctorado Nacional

COMISION NACIONAL DE INVESTIGACION CIENTIFICA Y TECNOLOGICA

Chile, 2007

Beca para estudios de doctorado en Chile
Premio Padre Hurtado

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

Chile, 2000

Estudios gratuitos en la P. Unniversidad Católica de Chile


Viroscope: Plant viral diagnosis from high-throughput sequencing data using biologically-informed genome assembly coverage Valenzuela, Sandro L.; Norambuena, Tomas; Morgante, Veronica; Garcia, Francisca; Jimenez, Juan C.; Nunez, Carlos; Fuentes, Ignacia; Pollak, Bernardo Article ISI FRONTIERS IN MICROBIOLOGY (2022)
Novel loci and mapuche genetic ancestry are associated with pubertal growth traits in Chilean boys Vicuna, Lucas; Norambuena, Tomas; Miranda, Jose Patricio; Pereira, Ana; Mericq, Veronica; Ongaro, Linda; Montinaro, Francesco; Santos, Jose L.; Eyheramendy, Susana Article ISI HUMAN GENETICS (2021)
Postadmixture Selection on Chileans Targets Haplotype Involved in Pigmentation, Thermogenesis and Immune Defense against Pathogens Vicuna, Lucas; Klimenkova, Olga; Norambuena, Tomas; Martinez, Felipe, I; Fernandez, Mario, I; Shchur, Vladimir; Eyheramendy, Susana Article ISI GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION (2020)
ProNA2020 predicts protein–DNA, protein–RNA, and protein–protein binding proteins and residues from sequence Qiu J.; Bernhofer M.; Heinzinger M.; Kemper S.; Norambuena, T; Melo F.; Rost B. Article SCOPUS Journal of Molecular Biology (2020)
WebRASP: a server for computing energy scores to assess the accuracy and stability of RNA 3D structures Norambuena, T; Cares, JF; Capriotti, E; Melo F. Article ISI SCOPUS Bioinformatics (2013)
Computer-Based Annotation of Putative AraC/XylS-Family Transcription Factors of Known Structure but Unknown Function Schuller, A; Slater, A.W.; Norambuena, T; Cifuentes J.J.; Almonacid, L.I.; Melo F. Article ISI SCOPUS Journal of Biomedicine and Biotechnology (2012)
All-atom knowledge-based potential for RNA structure prediction and assessment Capriotti, E; Norambuena, T; Marti-Renom, MA; Melo F. Article ISI SCOPUS Bioinformatics (2011)
Expression of Transposable Elements in Neural Tissues during Xenopus Development Faunes, Fernando; Sánchez, Natalia; Moreno, Mauricio; Olivares, Gonzalo H.; Lee-Liu, Dasfne; Almonacid,Leonardo.; Slater, Alex W.; Norambuena, Tomas; Taft, Ryan J.; Mattick, John S.; Melo, Francisco; Larrain, Juan; Veenstra, Gert Jan C. Article ISI SCOPUS PLOS ONE (2011)
The Protein-DNA Interface database Norambuena, T; Melo F. Article ISI SCOPUS BMC Bioinformatics (2010)
Proteome Organization in a Genome-Reduced Bacterium Kuhner, S; van Noort, V; Betts, MJ; Leo-Macias, A; Batisse, C; Rode, M; Yamada, T; Maier, T; Bader, S; Beltran-Alvarez, P; Castano-Diez, D; Chen, WH; Devos D.; Guell, M; Norambuena, T; Racke, I; Rybin, V; Schmidt, A; Yus, E; Aebersold R.; Herrmann, R; Bottcher, B; Frangakis, AS; Russell, RB; Serrano L.; Bork, P; Gavin, AC Article ISI SCOPUS SCIENCE (2009)
StAR: a simple tool for the statistical comparison of ROC curves Vergara IA; Norambuena, T; Ferrada E.; Slater AW; Melo F. Article ISI SCOPUS BMC BIOINFORMATICS (2008)
SAGExplore: a web server for unambiguous tag mapping in serial analysis of gene expression oriented to gene discovery and annotation Norambuena, T; Malig, R; Melo F. Article ISI SCOPUS NUCLEIC ACIDS RESEARCH (2007)
dnaMATE: A consensus melting temperature prediction server for short DNA sequences Panjkovich A.; Norambuena, T; Melo F. Article ISI SCOPUS NUCLEIC ACIDS RESEARCH (2005)


A method for integrating visual comfort criteria in daylighting design of school Piderit, B; Bodart M.; Norambuena, T ConferencePaper SCOPUS PLEA 2011 - Architecture and Sustainable Development, Conference Proceedings of the 27th International Conference on Passive and Low (2011)


Chile's research planning falls short Astudillo, P; Blondel, C. J.; Norambuena, T; Soto K. Letter ISI SCOPUS Science (2012)


Control processes for microorganism-related characterization processes Apte, Zachary S.; Richman, Jessica; Almonacid, Daniel; Vera, Patricia; Bik, Elisabeth M.; Morton, Amanda; Ortiz, Rodrigo; Norambuena, Tomás Patent
Método de identificación de entidades biológicas que comprende secuenciación masiva, asignación taxonómica, ensamblaje genómico y anotación funcional Pollak, Bernardo; Valenzuela, Sandro L.; Morgante, Verónica; Jiménez, Juan C.; Norambuena, Tomás Patent
Compositions and methods for combinatorial assembly and screening for functional site-directednucleotide modifiers Pollak, Bernardo; Lagos-Susaeta, Diego; Norambuena, Tomás Patent


COMPARATIVE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE MODELING OF PROTEIN-DNA COMPLEXES FONDECYT (1110400) Proyecto 2011-2014 Postdoctorado
Structure-based consensus DNA binding motif prediction for sequence-based complete genome scanning of transcription factor binding sites FONDECYT (3120007) Proyecto 2011-2013 Inv. Principal
INVESTIGACION Y DESARROLLO DE POTENCIALES ESTADISTICOS Y ALGORITMOS GENETICOS PARA EL ESTUDIO DE LOS DETERMINANTES CLAVES EN EL PROCESO DE RECONOCIMIENTO MOLECULAR ENTRE ADN Y PROTEINAS FONDECYT (1080158) Proyecto 2008-2011 Tesista
DESARROLLO DE ALGORITMOS GENETICOS Y POTENCIALES ESTADISTICOS FAMILIA-ESPECIFICOS PARA LA PREDICCION DE LA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DE PROTEINAS EN GENOMAS COMPLETOS. FONDECYT (1051112) Proyecto 2005-2008 Tesista