Man

Francisco Javier Melo Ledermann

Profesor Titular

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

Santiago, Chile

Líneas de Investigación


Analysis of protein-DNA interactions; Bioinformatics; Biochemistry ; Computational Biology

Educación

  •  Licenciado en Bioquimica, Pontificia Universidad Catolica de Chile. Chile, 1993
  •  Bioquimico, Pontificia Universidad Catolica de Chile. Chile, 1994
  •  Magister en Bioquimica, Pontificia Universidad Catolica de Chile. Chile, 1994
  •  Doctor en Ciencias Biologicas, Universidad Notre Dame de la Paix. Bélgica, 1998
  •  Postdoctorado en Bioinformatica, The Rockefeller University. Estados Unidos, 2001

Experiencia Académica

  •   Profesor Asistente Full Time

    Pontificia Universidad Catolica de Chile

    Ciencias Biológicas

    Santiago, Chile

    2001 - 2007

  •   Profesor Asociado Full Time

    Pontificia Universidad Catolica de Chile

    Ciencias Biológicas

    Santiago, Chile

    2007 - 2014

  •   Profesor Titular Full Time

    PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

    Ciencias Biológicas

    Santiago, Chile

    2014 - A la fecha

Experiencia Profesional

  •   Socio Fundador y Director de Investigacion y Desarrolllo

    TAAG Genetics S.A.

    Santiago, Chile

    2001 - 2011

Formación de Capital Humano


UNDERGRADUATE

Ongoing

Constanza Guerra San Martín, "Estudio de la especificidad del factor de transcripción MarA", Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile (Fecha eventual defensa: Mayo 2022).

Finsihed

Natalia Rodriguez Muxica, “Desarrollo de un nuevo modelo de flexibilidad de ADN”, Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile (Octubre 2018).

Judemir Ribeiro Vega, “Investigación y desarrollo de potenciales estadísticos basados en superficie de contacto para complejos proteína-ADN”, Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile (Sep 2018).

Felipe Melis Arcos, “Análisis de los determinantes de especificidad claves en el reconocimiento de ADN por parte de los factores de transcripción MarA, Rob SoxS en Enterobacterias”, Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Valparaíso (16 Marzo 2015).

Ignacio Ibarra del Río, “Modelamiento comparativo a nivel atómico de ADN doble hebra”, Título Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile. Fecha Defensa: 7 Agosto, 2013.

Camilo Navarrete Lineros, “Bases moleculares de la modulación alostérica por cobre del receptor p2x”, Título Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile. Fecha Defensa: 2 Mayo 2012.

Jaime Riquelme Salamé, “Implementacio?n de una nueva metodologi?a de representacio?n y visualizacio?n de interfases tridimensionales de complejos moleculares (protei?na-ADN)”, Título Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile. Fecha Defensa: 25 Enero 2012.

Felipe Rodriguez Valenzuela, “Desarrollo de una base de datos de fragmentos perptídicos no redundantes”, Título Ingeniero Civil en Bioinformática, Universidad de Talca, 22 Diciembre 2011.

Javier Castellanos Vuletich, “Modelado comparativo de la estructura tridimensional de ADN doble hebra a nivel atómico”, Título de Bioquímico, Universidad de Chile, 13 Septiembre 2011.

Jorge Cares Gálvez, “Diseño de oligos para PCR anidado múltiple a dos temperaturas y su aplicación para discriminar un gran número de especies bacterianas”, Título Ingeniero Civil en Bioinformática, Universidad de Talca, 26 Agosto 2011.

Fernando Gutiérrez Espinosa, “Desarrollo de un modelo estadi?stico para la comparacio?n de electroferogramas complejos”, Título Ingeniero Civil en Bioinformática, Universidad de Talca, 26 Agosto 2011.

Leonardo Almonacid Cárdenas, “Desarrollo de una plataforma Bioinforma?tica para la obtencio?n de informacio?n a partir de libreri?as de ARNs pequen?os secuenciadas con Solexa/Illumina”, Título Ingeniero Civil en Bioinformática, Universidad de Talca, 5 Abril 2011.

O’car Campos Campos, “Disen?o de partidores para PCR repetitivo mu?ltiple por medio de herramientas computacionales y su aplicacio?n para discriminar un gran nu?mero de especies y cepas bacterianas”, Título Ingeniero Civil en Bioinformática, Universidad de Talca, 5 Abril 2011.

Rodrigo Malig, “Nueva metodología de análisis de datos de SAGE dirigida hacia el descubrimiento de nuevos genes y transcritos importantes durante la fermentación alcohólica en Saccharomyces cerevisiae”. Título de Ingeniero en Biotecnología Molecular, Universidad de Chile. Mayo 2007.

Tomás Norambuena, “Predicción de marcos de lectura abiertos mediante potenciales estadísticos”. Título de Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile. Marzo 2007.

Francisco Ossandón, “Clasificación de grupos de riesgo de Cáncer Gástrico según perfil de metilación génica por análisis de clusters”. Título de Bioquímico, Universidad de Chile. (tesis co-dirigida con el Profesor Alejandro Corvalán de la Facultad de Medicina, PUC). Septiembre 2006.

Juanita Larraín, “Análisis de recombinación plasmidial en Ralstonia eutropha JMP134 (pJP4) por presión selectiva en 3-clorobenzoato y 2-metilfenoxiacetato”. Título de Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile. (tesis co-dirigida con el Profesor Bernardo González de la Facultad de Ciencias Biológicas, PUC). Agosto 2006.

Evandro Ferrada, “Diseño y evaluación de un nuevo potencial estadístico multidimensional a nivel atómico“. Título de Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile. Abril 2006.

Alejandro Panjkovich, “Desarrollo de potenciales estadísticos pliegue-específicos y su aplicación en la evaluación de la calidad de modelos tridimensionales de proteínas en genomas completos”. Título de Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile. Enero 2006.

Verónica Martínez, “Estudio de los determinantes estructurales de unión a ATP en Proteínas”. Título de Bioquímico, Pontificia Universidad Católica de Chile. Agosto 2005.

Peter Pollak, “Algoritmos genéticos: comparación de las técnicas de minería de datos. Evaluación de la calidad de estructuras tridimensionales de proteínas”. Título de Ingenierio Civil, Pontificia Universidad Católica de Chile. (memoria co-dirigida con el Profesor Juan Carlos Ferrer de la Facultad de Ciencias de la Ingeniería, PUC. Abril 2005.

GRADUATE (PhD, Master Thesis)

Ongoing

Juan José Cifuentes Huerta, “Estudio de la relación secuencia/estructura/función de la enzima MutS de la vía DNA mismatch repair (MMR). Análisis de los aspectos que determinan su eficiencia diferencial en la reparación de los diversos tipos de bases nitrogenadas mal apareadas”. Programa Doctorado en Ciencias Biológicas, Mención Genética Molecular y Microbiología. Pontificia Universidad Católica de Chile (fecha eventual defensa: acaba de obtener su candidatura a Doctor).

Finished

Felipe Aceituno Flores, “Systemic characterization of the oxygen response of the wine yeast Saccharomyces cerevisiae EC1118 in oenological conditions”. Programa Doctorado en Ciencias Biológicas, Mención Genética Molecular y Microbiología, Pontificia Universidad Católica de Chile. Fecha Defensa: 26 Agosto 2013 (co-tutoría con el Prof. Eduardo Agosín de la Facultad de Ingeniería de la Pontificia Universidad Católica de Chile).

Alex Slater Morales, “Estudio de la relación secuencia-estructura-función del domino catalítico de las polimerasas de ADN”. Programa Doctorado en Ciencias Biológicas, Mención Genética Molecular y Microbiología, Pontificia Universidad Católica de Chile. Fecha Defensa: 20 Junio 2013.

Juan José Cifuentes Huerta, “Estudio de los componentes estructurales que median el proceso de reconocimiento del ADN dañado”, Magíster en Bioquímica y Bioinformática, Universidad de Concepción, 12 Agosto 2011.

Tomás Norambuena Arenas, “Desarrollo de potenciales estadísticos efectivos para el estudio de los determinantes involucrados en el reconocimiento molecular entre ADN y proteínas”, Doctor en Ciencias Biológicas, Mención Genética Molecular y Microbiología, P. Universidad Católica de Chile, 8 Junio 2011.

Fernando Faunes, “Identificación de nuevos genes que participan en el establecimiento del patrón dorso-ventral durante el desarrollo embrionario de Xenopus”. Programa de Doctorado en Ciencias Biológicas, Mención Biología Celular y Molecular, Facultad de Ciencias Biológicas, Pontificia Universidad Católica de Chile. (co-dirección en conjunto con el Dr. Juan Larraín). Octubre 2009

Ismael Vergara, “Construcción de un clasificador óptimo de la calidad de modelos de estructuras tridimensionales de proteínas”. Magíster en Computación, Facultad de Ingeniería, Universidad de Chile. (co-dirección en conjunto con el Dr. Gonzalo Navarro, Departamento de Ciencias de la Computación, Facultad de Ingeniería, Universidad de Chile). Julio 2007.

José Tomás Eterovic, “Diseño óptimo de nuevos microarreglos de ADN con alta sensibilidad y especificidad que permitan la comparación simultánea y cuantitativa de los niveles de expresión de un gran número de genes humanos”. Magíster en Ingeniería, Pontificia Universidad Católica de Chile. (co-dirección en conjunto con el Dr. Yadran Eterovic, Departamento de Ciencias de la Computación, Facultad de Ingeniería, Pontificia Universidad Católica de Chile). Agosto 2006.

Juan Conrads, “Minería de datos: algoritmos Genéticos y su aplicación en la fermentación vínica”. Magíster en Ingeniería, Pontificia Universidad Católica de Chile. (co-dirección en conjunto con el Dr. Alvaro Soto, Departamento de Ciencias de la Computación, Facultad de Ingeniería, Pontificia Universidad Católica de Chile). Noviembre 2004.

Leonardo Almonacid Cárdenas, ""Quasispecies diversity abd its role in the virulence of the human influenza A virus", Doctorado en Ciencias Biológicas, Mención Genética Molecular y Microbiología, P. Universidad Católica de Chile. Co-tutoría Rafael Medina, Facultad de Medicina, Pontificia Universidad Católica de Chile). 9 Enero 2020).

Consuelo Geoffroy Jarpa, “Estudio del rol funcional del segundo dominio HTH en las proteínas MarA y Rob en la determinación de la especificidad y afinidad de unión por ADN”, Doctorado en Ciencias Biológicas, Mención Genética Molecular y Microbiología, Pontificia Universidad Católica de Chile. 3 Marzo 2021.

Fernando Gutiérrez, "Derivando relaciones evolutivas entre las proteínas de cubierta de membrana mediante comparaciones estructurales". Doctorado en Ciencias Biológicas, Mención Genética Molecular y Microbiología, Pontificia Universidad Católica de Chile. 14 Septiembre 2021.

POST-DOCTORAL TRAINING

Ongoing

Gonzalo Riadi, “Prediction and analysis of piRNAs derived from class II mobile elements in Xenopus species genomes”, post-doctorado, Octubre 2012 – Octubre 2014.

Alex Slater Morales, “Caracterización in vitro e in silico de sitios de unión a ADN en factores de transcripción de la familia ARF (Auxin Response Factor) en Arabidopsis thaliana”, post-doctorado, Noviembre 2013 – Noviembre 2016 (co-tutor; tutor Prof. Rodrigo Gutiérrez).

José Miguel Alvarez Herrera, “Mapping transcriptional regulatory networks in response to N in plants”, post-doctorado, Noviembre 2013 – Noviembre 2016 (tutor; co-tutor Prof. Rodrigo Gutiérrez).

Finished

Tomás Norambuena Arenas, “Structure-based consensus DNA binding motif prediction for sequence-based complete genome scanning of transcription factor binding sites”, post-doctorado, Octubre 2011 – Octubre 2013.

Andreas Schueller, “Modeling of protein-DNA interactions by adaptive optimization”, post-doctorado, Diciembre 2010 – Diciembre 2012.


Difusión y Transferencia


DESARROLLO DE SOFTWARE Y BASES DE DATOS BIOINFORMATICAS

•MOMA2: Software para la comparación flexible y búsqueda eficiente de estructuras de proteínas relacionadas estructuralmente pero altamente divergentes a nivel de secuencia en la base de datos PDB. Libremente disponible bajo solicitud (no publicado aún, artículo en revisión). Autores: Gutiérrez, F., Devos, D. and Melo, F. (artículo en preparación, 2022)

•DrSASA: Software para el cálculo y visualización tridimensional de la superficie de interacciones intra e intermoleculares a nivel atómico. Libremente disponible bajo solicitud. Autores: Ribeiro, J., Ríos-Vera, C. Melo, F. y Schüller, A. (publicado en 2019)

•MOMA: Software para la comparación flexible y búsqueda eficiente de estructuras de proteínas relacionadas estructuralmente pero altamente divergentes a nivel de secuencia en la base de datos PDB. Libremente disponible bajo solicitud. Autores: Gutiérrez, F., Rodriguez, F., Devos, D. and Melo, F. ( publicado 2016)

•DNAVIZ: Software para la visualización tridimensional de las interacciones proteína-ADN. Libremente disponible bajo solicitud. Autores: Ribeiro, J., Schuller, A. y Melo, F. (publicado 2015)

•DNA-3D: Software para el modelado comparativo de la estructura tridimensional de ADN doble hebra. Libremente disponible bajo solicitud (no publicado aún). Autores: Ibarra, I. y Melo, F. (2014)

•TOPSEARCH: Servidor web para la búsqueda y comparación en tiempo real de estructuras de proteínas contra toda la base de datos PDB. Libremente disponible en Internet http://www.came.sbg.ac.at. Autores: Wiederstein, M., Gruber, M., Frank, K., Melo, F. y Sippl, M.J. (2014)

•WEBRASP: Software y servidor web para la evalaución de la calidad y estabilidad de estructuras tridimensionales de ARN. Libremente disponible en Internet http://melolab.org/webrasp. Autores: Norambuena, T., Cares, J.F., Capriotti, E. y Melo, F. (2013)

•STOVCA: Software educativo para el aprendizaje del algoritmo de programación dinámica aplicado al alineamiento de secuencias de proteínas y de ácidos nucleicos. Libremente disponible en Internet http://melolab.org/sat. Autores: Slater, A.W., Castellanos, J., Sippl, M.J. y Melo, F. (2013)

•SAT: Software educativo para el aprendizaje del algoritmo de programación dinámica aplicado al alineamiento de secuencias de proteínas y de ácidos nucleicos. Libremente disponible en Internet http://melolab.org/sat. Autores: Ibarra, I. y Melo, F. (2010)

•PDIdb: Base de datos de interfaces tridimensionales de complejos proteína-ADN. Libremente disponible en Internet http://melolab.org/pdidb. Autores: Norambuena, T. y Melo, F. (2009)

•StAR: Software y servidor web para el análisis estadístico de clasificadores binarios. Libremente disponible en Internet http://melolab.org/star.html. Autores: Vergara, I.A., Norambuena, T., Ferrada, E., Slater, A.W. y Melo, F. (2007)

•SAGExplore versión 1.0: Base de datos y servidor web para la asignación precisa de tags experimentales a genes en levadura. Libremente disponible en Internet http://melolab.org/sagexplore.html. Autores: Norambuena, T., Malig, R. y Melo, F. (2006)

•dnaMATE versión 1.0: Software y servidor web para la predicción en gran escala de la temperatura de hibridización de secuencias cortas de ADN. Libremente disponible en Internet http://melolab.org/tm.html y en versiones compiladas para sistemas Windows, Macintosh y LINUX: Autores: Panjkovich, A., Norambuena, T. y Melo, F. (2004)

•Multiplex-Type: Software para el diseño y selección de partidores de PCR que coamplifiquen de manera específica y eficiente, otorgando un patrón discriminante, una serie de cepas virales o bacterianas altamente homólogas a partir de una mezcla de ADN compleja. Autores: Melo, F. (2004)

•Contact_order: Software para la obtención del orden de contactos (relativos y absolutos) de la estructura tridimensional de una proteína. Autores: Melo, F. (2003)

•Contact_Map: Software para la obtención de mapas de contacto bidimensionales (output gráfico y numérico) entre aminoácidos a partir de la estructura tridimensional de una o más proteínas. Autores: Melo, F. (2003)

•DNA_spider: Software para la predicción de marcos de lectura abiertos (ORFs) a partir de secuencias de ADN genómico. Software para la predicción del marco de lectura correcto (y de la traducción de la secuencia proteica) a partir de secuencias de ESTs. Autores: Melo, F. (2003)

•Multiplex-RT: Software para el diseño y selección de partidores de PCR que coamplifiquen de manera específica y eficiente una serie de genes (transcritos) a partir de ADN complementario total. Autores: Melo, F. (2003)

•Histo, Spectrum: Softwares para la generación automática de miles de histogramas o gráficos de distribución de variables para una serie de datos observados. Libremente disponible en Internet: http://melolab.org/. Autores: Melo, F. (2002)

•Sup2res, Sup2resList: El primero es un software para la superposición óptima en tres dimensiones de dos moléculas según una tabla de equivalencia atómica. El segundo permite realizar la superposición óptima de cientos o miles de moléculas, generando clustering y dendrograma basados en la similitud estructural observada. Libremente disponible en Internet: http://melolab.org/. Autores: Melo, F. (2002)

•GDAR: un software para la obtención (gráfica y numérica) de las distribuciones de todos los ángulos dihedros de cuatro átomos observados en una serie de moléculas a partir de sus coordenadas tridimensionales. Libremente disponible en Internet: http://melolab.org/. Autores: Melo, F. (2002)

•GAR: un software para la obtención (gráfica y numérica) de las distribuciones de todos los ángulos de tres átomos observados en una serie de moléculas a partir de sus coordenadas tridimensionales. Libremente disponible en Internet: http://melolab.org/. Autores: Melo, F. (2002)

•GDR: un software para la obtención (gráfica y numérica) de las distribuciones de todas las distancias interatómicas observadas en una serie de moléculas a partir de sus coordenadas tridimensionales. Libremente disponible en Internet: http://melolab.org/. Autores: Melo, F. (2002)

•ProBiSite: una base de datos con interface www para la obtención de constelaciones tridimensionales de átomos proteicos que forman parte de los sitios de unión en proteínas a diversos ligandos. Libremente disponible en Internet: http://melolab.org/. Autores: Melo, F., Santander, V, y Portales, M.A. (2002)

•Plot3D: un software para la generación de superficies tridimensionales de calidad de publicación a partir de datos numéricos crudos en formato X,Y,Z. Libremente disponible en Internet: http://melolab.org/. Autores: Melo, F. (2001)

•Multiplex-STR: Software para el diseño y selección de partidores de PCR que coamplifiquen de manera específica y eficiente una serie de varios loci de STRs (short tandem repeats) cromosomales a partir de ADN genómico total. Autores: Melo, F. (2000)

•Multiplex: Software para el diseño y selección de partidores de PCR que coamplifiquen de manera específica y eficiente una serie de varios locus cromosomales a partir de ADN genómico total. Autores: Melo, F. (2000)


Premios y Distinciones

  •   Director Electo del Board of Directors de la ISCB (International Society for Computational Biology)

    International Society for Computational Biology

    Estados Unidos, 2014

    Unico Director Latinoamericano durante el período 15 Enero 2015 – 15 Enero 2021.


 

Article (55)

Assessment of Mutations Associated With Genomic Variants of SARS-CoV-2: RT-qPCR as a Rapid and Affordable Tool to Monitoring Known Circulating Variants in Chile, 2021
ProNA2020 predicts protein–DNA, protein–RNA, and protein–protein binding proteins and residues from sequence
Calculation of accurate interatomic contact surface areas for the quantitative analysis of non-bonded molecular interactions
Exploring DNA dynamics within oligonucleosomes with coarse-grained simulations: SIRAH force field extension for protein-DNA complexes
Efficient and automated large-scale detection of structural relationships in proteins with a flexible aligner
Towards the bridging of molecular genetics data across Xenopus species
Andrographolide activates the canonical Wnt signalling pathway by a mechanism that implicates the non-ATP competitive inhibition of GSK-3 beta: autoregulation of GSK-3 beta in vivo
PDIviz: analysis and visualization of protein-DNA binding interfaces
Effects of Tetrahydrohyperforin in Mouse Hippocampal Slices: Neuroprotection, Long-term Potentiation and TRPC Channels
Effects of Tetrahydrohyperforin in Mouse Hippocampal Slices: Neuroprotection, Long-term Potentiation and TRPC Channels
Genome-wide expression profile of the response to spinal cord injury in Xenopus laevis reveals extensive differences between regenerative and non-regenerative stages
Metabolic and transcriptomic response of the wine yeast Saccharomyces cerevisiae strain EC1118 after an oxygen impulse under carbon- sufficient, nitrogen-limited fermentative conditions
Structure-Based Characterization of Multiprotein Complexes
Towards the development of standardized methods for comparison, ranking and evaluation of structure alignments
WebRASP: a server for computing energy scores to assess the accuracy and stability of RNA 3D structures
Characterization of small RNAs in Xenopus tropicalis gastrulae
Computer-Based Annotation of Putative AraC/XylS-Family Transcription Factors of Known Structure but Unknown Function
Oxygen Response of the Wine Yeast Saccharomyces cerevisiae EC1118 Grown under Carbon-Sufficient, Nitrogen-Limited Enological Conditions
The Internal Region Leucine-rich Repeat 6 of Decorin Interacts with Low Density Lipoprotein Receptor-related Protein-1, Modulates Transforming Growth Factor (TGF)-beta-dependent Signaling, and Inhibits TGF-beta-dependent Fibrotic Response in Skeletal Muscles
Transcriptomics using next generation sequencing technologies
All-atom knowledge-based potential for RNA structure prediction and assessment
Expression of Transposable Elements in Neural Tissues during Xenopus Development
A new multiplex PCR assay for the simultaneous detection of vancomycin-resistant enterococci from rectal swabs
Interactive software tool to comprehend the calculation of optimal sequence alignments with dynamic programming
Novel alpha-ketoglutarate dioxygenase tfdA-related genes are found in soil DNA after exposure to phenoxyalkanoic herbicides
The Protein-DNA Interface database
Effective knowledge-based potentials
Identification of novel transcripts with differential dorso-ventral expression in Xenopus gastrula using serial analysis of gene expression
Evolutionary potentials: structure specific knowledge-based potentials exploiting the evolutionary record of sequence homologs
StAR: a simple tool for the statistical comparison of ROC curves
A knowledge-based potential with an accurate description of local interactions improves discrimination between native and near-native protein conformations
Cloning and characterization of the genes encoding the high-affinity iron-uptake protein complex Fet3/Ftr1 in the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
Fold assessment for comparative protein structure modeling
Nonbonded terms extrapolated from nonlocal knowledge-based energy functions improve error detection in near-native protein structure models
SAGExplore: a web server for unambiguous tag mapping in serial analysis of gene expression oriented to gene discovery and annotation
A composite score for predicting errors in protein structure models
Accuracy of sequence alignment and fold assessment using reduced amino acid alphabets
Accurate and unambiguous tag-to-gene mapping in serial analysis of gene expression
MODBASE: a database of annotated comparative protein structure models and associated resources
Molecular and population analyses of a recombination event in the catabolic plasmid pJP4
Adaptive evolution of the insulin gene in caviomorph rodents
Comparison of different melting temperature calculation methods for short DNA sequences
dnaMATE: A consensus melting temperature prediction server for short DNA sequences
Quantitative analysis of wine yeast gene expression profiles under winemaking conditions
A novel extracellular multicopper oxidase from Phanerochaete chrysosporium with ferroxidase activity
A tool to assist the study of specific features at protein binding sites
Statistical potentials for fold assessment
Comparative protein structure modeling of genes and genomes
Protein structure modeling for structural genomics
Assessing protein structures with a non-local atomic interaction energy
Novel knowledge-based mean force potential at atomic level
Extracellular matrix is required for skeletal muscle differentiation but not myogenin expression
Synthesis and processing of glypican during differentiation of skeletal muscle cells
DECORIN IS SPECIFICALLY SOLUBILIZED BY HEPARIN FROM THE EXTRACELLULAR-MATRIX OF RAT SKELETAL-MUSCLES
PROCESSING AND SUBCELLULAR-DISTRIBUTION OF THE SCHWANN-CELL LIPID-ANCHORED HEPARAN-SULFATE PROTEOGLYCAN AND IDENTIFICATION AS GLYPICAN

Abstract (1)

SAGE analysis of dorsal and ventral transcriptome of Xenopus tropicalis gastrula

Errata (1)

Characterization of Small RNAs in X. tropicalis Gastrulae (vol 50, pg 260, 2012)

Letter (1)

Autosomal STR allele frequencies for the CODIS system from a large random population sample in Chile

Proyecto (29)

Study of protein-DNA binding specificity through the in vivo directed co-evolution of a transcription factor and its promoter target site
The epidemiology of Bacterial Kidney Disease in farmed salmon in Chile
Evaluación del efecto de Renibacterium salmoninarum en la modulación de la respuesta inmune de Salmo salar
Métodos transcriptómicos y metagénomicos para evaluar dietas contra AHPND
REFRACT: Repeat protein Function Refinement, Annotation and Classification of Topologies
Desarrollo de un test pronóstico para LMA interrogando por primera vez al estroma tumoral
Desarrollo de una variante mejorada de la proteína MutS para su aplicación en la industria biotecnológica
Patogénesis molecular de virus emergentes
TOWARDS A BETTER UNDERSTANDING OF THE KEY DETERMINANTS AT THE MOLECULAR LEVEL THAT MEDIATE THE RECOGNITION PROCESS BETWEEN PROTEINS AND DNA
Towards a better understanding of the key determinants at the molecular level that mediate the recognition process between proteins and DNA
Assessment of rationally designed small molecule inhibitors targeting the human respiratory syncytial virus matrix protein
Investigación y desarrollo de herramientas bioinformáticas para el diseño costo‐efectivo de biosensores y biointerruptores moleculares
Research and development of bioinformatics tools for the cost-effective design of molecular biosensors and bioswitches
COMPARATIVE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE MODELING OF PROTEIN-DNA COMPLEXES
Comparative three-dimensional structure modeling of protein-DNA complexes
Insituto Milenio en Inmunología e Inmunoterapia
MODELING OF PROTEIN-DNA INTERACTIONS BY ADAPTIVE OPTIMIZATION
STRUCTURE-BASED CONSENSUS DNA BINDING MOTIF PREDICTION FOR SEQUENCE-BASED COMPLETE GENOME SCANNING OF TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITES
INVESTIGACION Y DESARROLLO DE POTENCIALES ESTADISTICOS Y ALGORITMOS GENETICOS PARA EL ESTUDIO DE LOS DETERMINANTES CLAVES EN EL PROCESO DE RECONOCIMIENTO MOLECULAR ENTRE ADN Y PROTEINAS
ANALISIS MEDIANTE SAGE DEL TRANSCRIPTOMA INVOLUCRADO EN EL ESTABLECIMIENTO DEL PATRON DORSO-VENTRAL DEL EMBRION DE XENOPUS TROPICALIS
EVOLUCION DE LA INFECCION GENITAL POR VIRUS PAPILLOMA HUMANO (VPH) EN UNA COHORTE DE MUJERES CHILENAS ESTUDIADAS EN EL AÑO 2000
III CONCURSO DE INSERCIÓN DE PERSONAL ALTAMENTE CALIFICADO EN LA INDUSTRIA DESARROLLO DE MARCADORES MOLECULARES DE IMPORTANCIA PARA EL MEJORAMIENTO GENÉTICO DE ESPECIES FORESTALES Programa de Investigación Asociativa / PBCT
Consorcio tecnológico de la industria ortofrutícula de exportación=> Programa de investigación, desarrollo e innovación en fruticultura
Consorcio tecnológico empresarial de investigación para la vid y el vino
DESARROLLO DE ALGORITMOS GENETICOS Y POTENCIALES ESTADISTICOS FAMILIA-ESPECIFICOS PARA LA PREDICCION DE LA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DE PROTEINAS EN GENOMAS COMPLETOS
FISIOLOGIA CUANTITATIVA DE FERMENTACIONES A BAJA TEMPERATURA=> LA VINIFICACION EN BLANCO COMO MODELO DE ESTUDIO
I Concurso Inserción de Personal Altamente Calificado en la Industria - IPI19 Implementación de un programa de mejoramiento genético para salmones del Atlántico Programa de Investigación Asociativa / PBCT / Fomento de la Vinculación Ciencia-Empresa
Estudios genómicos y de expresión génica en vides=> respuesta a la infección viral y desarrollo de sistemas de diagnóstico
INVESTIGACION Y DESARROLLO DE DESCRIPTORES DIFUSOS TRIDIMENSIONALES DE LA RELACION ESTRUCTURA/FUNCION EN PROTEINAS Y SU APLICACION A LA PREDICCION DE FUNCION EN GENOMA COMPLETOS
95
Francisco Melo

Profesor Titular

Genetica Molecular y Microbiologia

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

Santiago, Chile

9
Eduardo Agosin

Full Professor

Chemical and Bioprocess Engineering

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

Santiago, Chile

7
Alex Slater

Profesor Asistente

Escuela de Biotecnología

Universidad Mayor

Santiago, Chile

6
Juan Agustín Larraín

Profesor Titular

Biologia Celular y Molecular

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE

Santiago, Chile

5
Andreas Schüller

Assistant Professor

Genética Molecular y Microbiología

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE

Santiago, Chile

5
Fernando Faunes

Profesor Asistente

Universidad Andrés Bello

Viña del Mar, Chile

4
Bernardo González

Full Professor

UNIVERSIDAD ADOLFO IBAÑEZ

Santiago, Chile

3
Rubén Polanco

Associate Professor

Biological Sciences

UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO (UNAB)

SANTIAGO, Chile

2
Luis Larrondo

Associate Professor

Genetica Molecular y Microbiologia

Pontificia Universidad Catolica de Chile

Santiago, Chile

2
Dasfne Lee-Liu

Postdoctoral Researcher

Biology

Universidad de Chile

Santiago, Chile

2
Marcelo Orellana

Gestor de Innovación en áreas prioritarias

Universidad Católica de la Santísima Concepción

Concepción, Chile

1
Pamela Villouta

Profesional Asistente Laboratorio Bioinformática Molecular de

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Gonzalo Olivares

ASSISTANT PROFESSOR

NEUROCIENCIA

Universidad de Chile

SANTIAGO, Chile

1
Nibaldo Inestrosa

Full Professor

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE

Santiago, Chile

1
Rodrigo De la Iglesia

Profesor Asociado

Genética Molecular y Microbiología

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE

Santiago, Chile

1
María Acuña

Directora de Investigación, académico e investigador

Universidad Bernardo O´Higgins

Santiago, Chile

1
Paulo Canessa

Assistant Professor

Facultad de Ciencias de la Vida

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Ramon Palma

Full Professor

Ecología

Pontificia Universidad Católica de Chile; Facultad de Ciencias Biológicas

Santiago, Chile

1
Enrique Brandan

Profesor Titular

Biología Celular y Molecular

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

Santiago, Chile

1
Fernando Gutiérrez

Personal Técnico

Genética Molecular y Microbiología

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Gonzalo Riadi

Assistant Professor

Bioinformatics

Universidad de Talca

Talca, Chile

1
Jenniffer Angulo

Asistente de Investigación

Pediatría e Inmunologia Pediátrica

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Marcela Ferres

Head of Department

Pediatric Infectious Diseases and Immunology

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Rafael Medina

Associate Professor

Pediatrics

Pontificia Universidad Catolica de Chile

Santiago, Chile

1
Monique Le Corre

Assistant Professor

Faculty of medicine, Pediatric division

Pontificia Universidad Catolica de Chile

Santiago, Chile