Man

Mabel Angélica Vidal Miranda

Directora Magíster en Data Science

Universidad San Sebastián

Concepcion, Chile

Líneas de Investigación


Artificial Intelligence; Bioinformatics; Genomics; Computational Biology

Educación

  •  Bioinformatic Engineer, UNIVERSIDAD DE TALCA. Chile, 2013
  •  Computer Science, UNIVERSIDAD DE CONCEPCION. Chile, 2022

Experiencia Académica

  •   Lecturer Part Time

    UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

    Faculty of Engineering

    Chile

    2019 - 2020

  •   Lecturer Part Time

    Universidad San Sebastián

    Faculty of Engineering

    Chile

    2021 - 2023

  •   Directora Programa Magíster en Data Science Full Time

    UNIVERSIDAD SAN SEBASTIAN

    Ingeniería, Arquitectura y Diseño

    Chile

    2023 - At present

Experiencia Profesional

  •   International Scientific Stay (5 months) Full Time

    University of Helsinki

    Helsinki, Finlandia

    2019 - 2019

  •   Teaching Assistant Part Time

    Universidad de Concepción

    Concepción, Chile

    2017 - 2020

  •   Software Engineer Part Time

    Universidad de Talca

    Talca, Chile

    2016 - 2017

  •   Researcher Full Time

    The Ohio State University

    Columbus, Estados Unidos

    2013 - 2014

Formación de Capital Humano


- Pedro González Paulsen
ANÁLISIS DE EXPRESION GENÉTICA EN DISTINTOS TEJIDOS DE CORVINA, SOMETIDOS A CUADRO ESTRESOR
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the student.
2023-2024

- Pablo Lillo Altamirano, Patricio Herrera Gutiérrez
Clasificación del Ausentismo en Citas Médicas para Pacientes en Situación de Discapacidad: Un Enfoque con Machine Learning en el Centro Teletón San Pedro de la Paz.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the students.
2023-2024

- Alexis Rivera Reyes, Daniela Peña Orellana
Análisis de expresión génica diferencial y metatranscriptómico de muestras infestadas y no infestadas de Salmo salar en diferentes centros y estaciones del año en la región de Aysen.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the students.
2023-2024

- Rodrigo Manríquez Salas, Rodrigo Vallejos Jara
Análisis de la severidad de accidentes de tránsito en la Provincia de Concepción: un enfoque basado en modelos de machine learning y optimización bayesiana.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the students.
2023-2024

- Cristian García Gutiérrez
CONSTRUCCIÓN DE UN MODELO DE RECONOCIMIENTO Y CONTEO DE VARROA EN PANALES DE ABEJAS
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the student.
2023-2024

- Almeira Sampson Sandía
Deep learning to classify chaotic systems: analysis of strange tractors.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the student.
2023-2024

- Ricardo Rodríguez Díaz
EVALUACIÓN DE MODELOS CON REDES CONVOLUCIONES QUE PERMITA AISLAR LA VOZ HUMANA.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the student.
2023-2024

- Marcos Campos Aguilar
Predictive model of finished product yield for the salmon industry.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the student.
2023-2024

- Nicole Lastra Quiroz
IMPLEMENTACIÓN DE MODELO DE CLASIFICACIÓN MORFOLÓGICA DE GALAXIAS MEDIANTE ALGORITMOS DE APRENDIZAJE PROFUNDO BASADO EN TRANSFORMADORES.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the student.
2022-2023

- Ari Romero Garrido, Karen Romero Garrido
Predicción y extrapolación de rutas de vehículos en faenas forestales.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the students.
2022-2023

- Rafael Pavez Fernández, Marcos Zavala López
Análisis Texto para Reportes de Calidad en Contexto de Call Center.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the students.
2022-2023

- Carlos Gajardo Arratia
AUTOMATIZACIÓN DE LA GENERACIÓN DE MODELO DE CAMINOS DE GRAN MINERÍA PARA SOFTWARE TIMINING AWARE A PARTIR DE TOPOGRAFÍA Y DATOS GPS DE EQUIPOS DE TRANSPORTE UTILIZANDO TÉCNICAS DE DEEP LEARNING.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the student.
2022-2023

- Braulio Torres Santibáñez, Jorge Gutiérrez Soto
Evaluación de la eficiencia de modelos predictivos para estimar la demanda de consultas de urgencias respiratorias del Hospital de Castro.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the students.
2022-2023

- Israel Naranjo Retamal
APLICACIÓN DE ANÁLISIS DE TEXTO A PREGUNTAS ABIERTAS DE LOS COMENTARIOS DE ENCUESTAS DOCENTES DEL INSTITUTO PROFESIONAL DUOC UC.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the student.
2022-2023

- Ivette Fernández Barrera, Sebastián Bravo Bustos
Análisis multimodal de publicaciones de flickr para clasificación de estado depresivo.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the students.
2021-2022

- Daniel Ramírez Quintana
EVALUACIÓN DE COMPROMISOS DE PAGO EN COBRANZA MEDIANTE ALGORTIMOS DE CLASIFICACIÓN.
MSc Degree in Data Science, Universidad San Sebastián.
Supervisor of the students.
2021-2022


Premios y Distinciones

  •   L’Oréal Chile – UNESCO For Women in Science

    L'Oréal - UNESCO

    Chile, 2020

    Premio destinado a científicas de excelencia que cursan estudios doctorales y post doctorales en Ciencias de la Vida, de la Materia y Matemáticas

  •   Doctorado Nacional

    Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo

    Chile, 2020

    Beca destinada a alumnos regulares de Programas de Doctorado

  •   UCO Project 1866 scholarship

    UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

    Chile, 2020

    Beca de Fortalecimiento de la Internacionalización del Postgrado y la Investigación de la Universidad de Concepción”. El proyecto se enmarca en un Fondo de Internacionalización de Universidades financiado por el Ministerio de Educación de Chile.

  •   International Research Stay scholarship

    UNIVERSITY OF HELSINKI

    Finlandia, 2019

    European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme.

  •   Mujer destacada en Ciencia y Tecnología

    Gobierno de Chile

    Chile, 2019

    Distinción entregada por el Ministerio de la Mujer y Equidad de Género.

  •   Grace Hopper Celebration Scholar

    Facebook, Inc.

    Estados Unidos, 2018

    Fellowship to attend The Grace Hopper Conference 2018, Houston, Texas.

  •   Favorite Speaker at the X Annual Congress of Biomedical Engineering

    UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

    Chile, 2017

    Mejor expositora en Congreso Anual de Ingeniería Civil Biomédica

  •   University of Concepción Fellow

    UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

    Chile, 2017

    Beca de doctorado 2017-2019

  •   Santander Scholarships Language

    UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA

    Estados Unidos, 2022

    English to Boost your Career. University of Pennsylvania.

  •   Best Doctoral Thesis

    UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

    Chile, 2023

    Applied Sciences and Technology category


 

Article (16)

A retrospective study suggests 55 days of persistence of SARS-CoV-2 during the first wave of the pandemic in Santiago de Chile
An ecological study on reinfection rates using a large dataset of RT-qPCR tests for SARS-CoV-2 in Santiago of Chile
Clinical and pulmonary function analysis in long-COVID revealed that long-term pulmonary dysfunction is associated with vascular inflammation pathways and metabolic syndrome
Co-Expression of Immunohistochemical Markers MRP2, CXCR4, and PD-L1 in Gallbladder Tumors Is Associated with Prolonged Patient Survival
Evaluating the effect of different types of vacutainer blood collection tubes on the viability of salmonid leukocytes populations.
Long-Term Water Level Forecasting for El Yeso Reservoir using Time-Series Data and Satellite Images
Transcriptomic profile of the gills with complex gill disease (CGD) lesions in Atlantic salmon (Salmo salar) farmed in a marine environment
Analysis of Tumor-Infiltrating T-Cell Transcriptomes Reveal a Unique Genetic Signature across Different Types of Cancer
Description of Symptoms Caused by the Infection of the SARS-CoV-2 B.1.621 (Mu) Variant in Patients With Complete CoronaVac Vaccination Scheme: First Case Report From Santiago of Chile
First Identification of Reinfection by a Genetically Different Variant of SARS-CoV-2 in a Homeless Person from the Metropolitan Area of Santiago, Chile
Genomic Evidence Suggests Viral Persistence of SARS-CoV-2 for 386 Days in Health Worker: A Case Report from Santiago of Chile
Secretome from Human Mesenchymal Stem Cells-Derived Endothelial Cells Promotes Wound Healing in a Type-2 Diabetes Mouse Model
Immunomodulation of T Helper Cells by Tumor Microenvironment in Oral Cancer Is Associated With CCR8 Expression and Rapid Membrane Vitamin D Signaling Pathway
Whole Genome Sequence, Variant Discovery and Annotation in Mapuche-Huilliche Native South Americans
Core Promoter Plasticity between Maize Tissues and Genotypes Contrasts with Predominance of Sharp Transcription Initiation Sites.
Large-scale transcriptional profiling of lignified tissues in Tectona grandis.

ConferencePaper (2)

Evaluating the Social Media Users’ Mental Health Status During COVID-19 Pandemic Using Deep Learning
Niñas Pro: an initiative to educate, inspire and empower women

ConferencePoster (6)

An unsupervised deep learning framework for single cell RNA-seq to infer the cell-type in glioblastoma
Analysis of population Regulatory T cells in tumor tissue
Maize Gene Regulatory Grid: Mapping and analysis of core promoter regions.
Exome capture sequencing strategy for the identification of genetic risk factors of cholesterol gallstone disease in Chilean families with early onset disease.
Identification of Copy Number Variants (CNV) from exome-capture sequencing in Chilean families with early-onset cholesterol gallstone disease.
Identification of Transcriptional Regulation that Control Phenolic Biosynthesis in Maize

Proyecto (7)

BÚSQUEDA E IDENTIFICACIÓN DE LA CORRELACIÓN ENTRE CARGA VIRAL DE SARS-COV-2, COINFECCIÓN DE PATÓGENOS RESPIRATORIOS, Y TRANSCRIPTOMA DE FENOTIPOS SINTOMÁTICOS Y ASINTOMÁTICOS PARA EL DESARROLLO DE ESTRATEGIAS COMPLEMENTARIAS DE PREVENCIÓN
EL EFECTO COLATERAL DE LA DEFENSA FRENTE AL COVID-19: ANALISIS DE LA RESPUESTA INFLAMATORIA Y SU ASOCIACION CON UN POTENCIAL DAÑO PULMONAR EN PACIENTES RECUPERADOS QUE CURSARON COVID-19 SEVERO, MODERADO Y ASINTOMATICO
BIRDS project (Bioinformatics and Information Retrieval Data Structures Analysis and Design)
Servicio de implementación de plataforma web, para proyecto FIA PYT- 2015- 0213 que relaciona clima con calidad de fruta.
Systems Approaches to Identify Gene Regulatory Networks in the Grasses
TEMPORAL AND SPATIAL NITROGEN REGULATORY NETWORKS IN ARABIDOPSIS THALIANA
Centro de regulación del genoma
26
Mabel Vidal

Directora Magíster en Data Science

Universidad San Sebastián

Concepcion, Chile

4
Eva Vallejos

Profesor Asociado

Facultad de Medicina Veterinaria y Agronomía

Universidad de Las Américas

Santiago, Chile

4
Ana Sandino

Profesor Titular

Biología

Universidad de Santiago de Chile

Santiago, Chile

4
Claudio Acuña

Profesosr Asociado

Biología

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Santiago, Chile

2
Estefania Nova

Assistant Professor

Clinical Biochemistry & Immunology

University of Concepcion

Concepción , Chile

2
Mauricio Hernandez

Subdirector Cientifico

Proteogenomica

MELISA Institute

San Pedro de la Paz, Chile

2
Guillermo Cabrera

Associate Professor

Department of Computer Science

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

2
Rodrigo Vera

Coordinador de Investigación

Departamento de Formación, Investigación y Docencia

Hospital de Urgencia de Asitencia Pública

Santiago, Chile

2
Gonzalo Labarca

Assistant Profesor in Medicine

Medicina interna

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Eleodoro Riveras

Investigador postdoctoral

Instituto de Biologia Integrativa, Ibio

Santiago, Chile

1
Andrés Tittarelli

Profesor Asociado

Instituto Universitario de Investigación y Desarrollo Tecnológico (IDT)

Universidad Tecnológica Metropolitana

Santiago, Chile

1
Felipe Reyes

Assistant professor

Universidad de S

Santiago de Chile, Chile

1
César Rivera

Académico

Departamento de Estomatología

Universidad de Talca

Talca, Chile

1
Carlos Barrera

Funcionario

Biología

Universidad de Santiago de Chile

Santiago, Chile

1
Felipe Zuñiga

Profesor Asistente

Bioquimica Clinica e Inmunologia

UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

Concepcion, Chile

1
Carmen Imarai

Profesor Titular

Biología

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Santiago, Chile

1
Maria-Isabel Yuseff

Associate Professor

Cellular and Molecular Biology

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Carlos Escudero

Full Professor

Basic Sciences Department

Universidad del Bio Bio

Chillan, Chile

1
Alejandro Escobar

assistant professor

Institute for Research in Dental Sciences

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Iván Flores

Post Doc

Progama de Inmunología

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Mario Henríquez

Investigador

CIBERES

CIBER

Lleida / Lérida, España

1
Alex Di Genova

Associate professor

Engineering sciences

Universidad de O'Higgins

Rancagua, Chile

1
Mauricio Gonzalez

Profesor Titular

INTA

UNIVERSIDAD DE CHILE - INSTITUTO DE NUTRICION Y TECNOLOGIA DE ALIMENTOS

Santiago, Chile

1
Eduardo Pérez

Profesor Investigador Asociado

Centro de Genética y Genómica, Facultad de Medicina Clínica Alemana

Universidad del Desarrollo

Santiago, Chile

1
Luis Quinones

PROFESOR TITULAR

ONCOLOGIA BASICO-CLINICA

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Miguel Allende

Director

Biología

FACULTAD DE CIENCIAS, UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Angelica Reyes

Profesor Asociado

INTA UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Veronica Cambiazo

Profesora titular

Unidad de Nutrición Básica

UNIVERSIDAD DE CHILE - INTA

Santiago, Chile

1
Dante Travisany

Profesor Asociado

Facultad de Ingeniería y Negocios

Universidad de Las Américas

Santiago, Chile

1
Claudia Muñoz

Investigadora

Biotecnología

Instituto de Investigaciones Agropecuarias INIA-La Platina

Santiago, Chile

1
Susana Eyheramendy

Full Professor

Universidad Adolfo Ibánez

Santiago, Chile

1
Mauricio Moraga

Profesor Asociado

Programa de Genética Humana

FACULTAD DE MEDICINA, UNIVERSIDAD DE CHILE

SANTIAGO, Chile

1
Ariel Orellana

Profesor Titular

Centro de Biotecnologia Vegetal

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Santiago, Chile

1
Martín Montecino

Director

Institute of Biomedical Sciences

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Santiago, Chile

1
Christian Hodar

ASSISTANT PROFESSOR

BIOINFORMATICS & GENEXPRESSION LAB - INTA

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Klaus Puschel

Full Professor

Family Medicine

FACULTAD MEDICINA PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

Santiago, Chile

1
Carol Moraga

Assistant professor

Instituto Ciencias de la Ingeniería

Universidad de O'Higgins

Rancagua, Chile

1
Elena Vidal

Directora Programas de Doctorado

Centro de Genomica y Bioinformatica

Universidad Mayor de Chile

Santiago, Chile