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Julio Berrios

Académico Full-time

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

Valparaíso, Chile

Líneas de Investigación


Ingeniería metabólica; Proteínas recombinantes y metabolitos; Modelación bioprocesos y metabolismo. Biorreactor. Pichia pastoris Cell culture & Metabolic engineering, recombinant protein production, bioprocess modelling, fermentation

Educación

  •  DSc in Biochemical Engineering, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO. Chile, 2008
  •  MSc in Biochemical Engineering, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO. Chile, 2002
  •  Biochemistry, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO. Chile, 1996
  •  Biochemist, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO. Chile, 1996

Experiencia Académica

  •   Académico Full Time

    Universidad San Sebastián

    Ingeniería y Tecnología

    Concepción, Chile

    2002 - 2004

  •   Académico Full Time

    PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO

    School of Biochemical Engineering

    Valparaíso, Chile

    2008 - A la fecha

Experiencia Profesional

  •   Académico Full Time

    Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

    Chile

    2008 - A la fecha

Formación de Capital Humano


Tesis de Postgrado:

-Camilo Mahnert. Implementation of a model predictive control to improve the productivity and performance of a recombinant protein from an integrated model of cell growth - Director - En curso
-Johan Quezada. Development of a recombinant protein production process based on the metabolic mutant of Pichia (Komagataela) pastoris Mut+ with increased carbon flux through the assimilative pathway of methanol - Director: Julio Berríos - PhD in Biotechnology En curso
-Rhonda Veas. Production of complex recombinant proteins in Pichia pastoris: Presence of the pro-domain and its influence on RER stress - Co-director: Julio Berríos - PhD in Biotechnology En curso
-Cristina Bustos Metabolic Engineering strategies in Pichia pastoris for methanol requirements reduction based on cellular response to non-repressing compounds of PAOX1 promoter - Director - PhD in Biotechnology En curso
-Velastegui, E: Estudio de la segregación fenotípica de una población de Pichia pastoris recombinante y su influencia sobre la producción de proteínas heterólogas en curso Director
-Latorre, Y. Evaluación de factores de regulación globales en la expresión de proteínas recombinantes en células CHO. Doc. en Biotecnología 2019 Co-director
-Rigual, Y. Caracterización del metabolismo de células NS0 en condiciones de cultivo con hipotermia moderada y su influencia en la producción de AcMs Doc. en Ingeniería Bioquímica en curso Co-director
-Arraño, N Influencia de la tasa de dilución y concentración de sustratos sobre el comportamiento dinámico de un cultivo continuo de Pichia pastoris y su productividad de proteína recombinante Mag. en Ingeniería Bioquímica 2016 Director
-Canales, C. Desarrollo de un proceso de producción de lipasa heteróloga con la levadura metilotrófica Pichia pastoris utilizando la estrategia de sustratos mezclados metanol-glicerol. Doc. en Ingeniería Bioquímica 2015 Director
-Flores, M.-O. Influencia del uso de sustratos mixtos y temperatura de cultivo sobre la producción heteróloga de lipasa de Rizhopuz oryzae en la levadura metilotrófica Pichia pastoris. Mag. en Ingeniería Bioquímica 2013 Director

Tesis de Pregrado:
-Carvajal, T. & Rodríguez, N. Evaluación de la factibilidad técnico-económica de una planta de producción de Interferón ? Bovino Recombinante (rBo-IFN-?). Ingeniería Civil Bioquímica En desarrollo Prof Guía
-Olivares, J.L. Redistribución de flujos metabólicos de Pichia pastoris en respuesta a modificaciones del metabolismo de metanol y condiciones operacionales Ingeniería Civil Bioquímica En desarrollo Prof Guía
-Zamorano, A. Desarrollo de una estrategia de producción de Interferón Alfa bovino en Escherichia coli en cultivo por lote alimentado Ingeniería Civil Bioquímica En desarrollo Prof Guía
-Urra, F. & Nuñez, P. Desarrollo de un proceso de producción de rh-FSH en cultivo por lote de células mamíferas Ingeniería Civil Bioquímica 2017 Co-Guía
-Arraño, N Desarrollo de una estrategia de operación en cultivos de Pichia pastoris para la producción de lipasa recombinan Ingeniería Civil Bioquímica 2015 Prof Guía
-Cataldo M Influencia de la temperatura y la velocidad específica de crecimiento sobre la producción de proteína recombinante en cultivo continuo de Pichia pastoris Ingeniería Civil Bioquímica 2014 Prof Guía
-Gerding, G. & Muller, A. Evaluación de la factibilidad técnico-económica de una planta productora de rhBMP-2 producida en células CHO. Ingeniería Civil Bioquímica 2014 Co-Guía
-Silva, C. Caracterización de la producción de GM-CFS en cultivo por lote de células CHO en condiciones de hipotermia suave Ingeniería Civil Bioquímica 2013 Co-Guía


Difusión y Transferencia


N.A.



 

Article (26)

Advances in Cell Engineering of the Komagataella phaffii Platform for Recombinant Protein Production
Role of Dissimilative Pathway of Komagataella phaffii (Pichia pastoris): Formaldehyde Toxicity and Energy Metabolism
Recombinant protein production in Pichia pastoris: From transcriptionally redesigned strains to bioprocess optimization and metabolic modelling
Surface Immunogenic Protein of Streptococcus Group B is an Agonist of Toll-Like Receptors 2 and 4 and a Potential Immune Adjuvant
Downregulation by organic nitrogen of AOX1 promoter used for controlled expression of foreign genes in the yeast Pichia pastoris
Expression of recombinant enhanced green fluorescent protein provides insight into foreign gene-expression differences between Mut plus and MutS strains of Pichia pastoris
Metabolic flux analysis during galactose and lactate co-consumption reveals enhanced energy metabolism in continuous CHO cell cultures
High glucose and low specific cell growth but not mild hypothermia improve specific r-protein productivity in chemostat culture of CHO cells
Mild hypothermia upregulates myc and xbp1s expression and improves anti-TNF alpha production in CHO cells
The growth of Pichia pastoris Mut(+) on methanol-glycerol mixtures fits to interactive dual-limited kinetics: model development and application to optimised fed-batch operation for heterologous protein production
Impact of sodium butyrate and mild hypothermia on metabolic and physiological behaviour of CHO TF 70R cells
Application of a new model based on oxygen balance to determine the oxygen uptake rate in mammalian cell chemostat cultures
Batch production of coenzyme Q10 by recombinant Escherichia coli containing the decaprenyl diphosphate synthase gene from Sphingomonas baekryungensis
Effect of Dilution Rate and Methanol-Glycerol Mixed Feeding on Heterologous Rhizopus oryzae Lipase Production with Pichia pastoris Mut(+) Phenotype in Continuous Culture
Endoplasmic Reticulum-Associated rht-PA Processing in CHO Cells: Influence of Mild Hypothermia and Specific Growth Rates in Batch and Chemostat Cultures
Differential Effect of Culture Temperature and Specific Growth Rate on CHO Cell Behavior in Chemostat Culture
Nutrient media for cell culture technology
Simultaneous environmental manipulations in semi-perfusion cultures of CHO cells producing rh-tPA
Simultaneous environmental manipulations in semi-perfusion cultures of CHO cells producing rh-tPA
Continuous CHO cell cultures with improved recombinant protein productivity by using mannose as carbon source: Metabolic analysis and scale-up simulation
Continuous cultures for alginate production by Azotobacter vinelandii growing at different oxygen uptake rates
Gibberellic acid extraction from aqueous solutions and fermentation broths by using emulsion liquid membranes
Manipulating the molecular weight of alginate produced by Azotobacter vinelandii in continuous cultures
Relationship between tissue plasminogen activator production and specific growth rate in Chinese Hamster Ovary cells cultured in mannose at low temperature
Spectrophotometric method for determining gibberellic acid in fermentation broths
Permeability changes induced by polylysines in rat spermatids

Abstract (5)

Temperature effect on recombinant protein production in continuous cultures of methylotrophic yeast Pichia pastoris: a comparative study of sorbitol and glycerol as a co-substrate
Galactose and lactate as nutrients in continuous cultures of CHO cells producing rh-tPA
Metabolic behavior of CHO cells cultured in perfusion with handling simultaneous of low temperature and source of carbon
Simultaneus effect of low temperatures and mannose concentration on CHP cells cultures producing rh-tPA
Effect of low temperatures on metabolism of CHO cells cultured on different carbon and energy sources

ConferencePaper (1)

Effect of nutrient supplementation on the biological quality of tPA produced by CHO cells on serum-free medium

Proyecto (11)

Design and production of completely human recombinant monoclonal antibodies through a multidisciplinary approach based on the development of optimized strategies
Metabolic engineering of Pichia (Komagataella) pastoris for improving recombinant protein production: Modification of methanol metabolism, developing and scaling-up of a culture strategy
Desarrollo de un proceso de producción en biorreactores de enzimas de interés para la industria agro-alimentaria.
Developing and scaling-up of a bioprocess for producing bovine recombinant Interferon-alpha
Improving the production of recombinant protein in CHO cells through cell engineering=> overexpression of global regulatory factors for tweaking glucose metabolism and recombinant protein processing
Fortalecimiento de la investigación en cultivos celulares EIBPUCV=>Escalamiento de fermentaciones en un biorreactor piloto
Developing of culture strategy of Pichia pastoris for enhanced productivity of recombinant Rhizopus oryzae lipase
Efecto de la velocidad específica de crecimiento y la velocidad de transferencia de oxígeno sobre la producción y expresión génica de una proteína recombinante en condiciones constantes de aireación y agitación
Desarrollo de un agente biológico para su aplicación industrial en el proceso de blanqueamiento de la pulpa de celulosa.
Bioingeniería Aplicada y Fundamental (BINAF)
Desarrollo de un proceso biotecnológico para la revalorización de descartes de la industria de procesamiento de berries

Review (3)

Integrating metabolic modeling and population heterogeneity analysis into optimizing recombinant protein production by Komagataella (Pichia) pastoris
Advances in improving mammalian cells metabolism for recombinant protein production
Exploring the effect of mild hypothermia on CHO cell productivity
41
Julio Berrios

Académico Full-time

Facultad de Ingeniería

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

Valparaíso, Chile

19
Claudia Altamirano

Profesor Titular

Facultad de Ingeniería

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO

Valparaíso, Chile

15
CLAUDIA ALTAMIRANO

PROFESOR TITULAR

FACULTAD DE INGENIERÍA

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

VALPARAISO, Chile

10
Mauricio Vergara

Researcher

Escuela Ingenieria Bioquimica

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaiso, Chile

10
Alvaro Diaz

Profesor titular

P. UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

valparaiso, Chile

5
Silvana Becerra

Jefe de Desarrollo Tecnológico

Dirección de Innovación

Universidad de los Andes

Santiago, Chile

3
Nelson Osses

Associated Professor

Institute of Chemistry

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

Valparaíso, Chile

3
Flavio Carrion

Director Departamento de Investigación, Postgrado y Educación Continua

Facultad de Ciencias de la Salud

Universidad del Alba

Santiago, Chile

2
Nelson Osses

Profesor Titular

Instituto de Química

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

2
Irene Martínez

Associate Professor

Departamento de Ingeniería Química, Biotecnología y Materiales

Universidad de Chile

Santiago, Chile

2
German Aroca

Profesor Titular

Escuela de Ingeniería Bioquímica

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

2
Christian Canales

Académico

Facultad de Ingemiería y Tecnologia

Universidad San Sebastian

Concepcion, Chile

2
Verónica Avello

Investigadora

Departamento de oceanografía

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

1
RICARDO MANZO

PROFESIONAL

SALUD AMBIENTAL

INSTITUTO SALUD PUBLICA DE CHILE

SANTIAGO, Chile

1
Diego Díaz

Jefe (s)

ANDID

Instituto de Salud Pública de Chile

Santiago, Chile

1
MARIA MOLINA

Director

Instituto de Ciencias Biomédicas

Universidad de Chile

INDEPENDENCIA, Chile

1
JUAN AGUILLON

PROFESSOR

IMMUNOLOGY PROGRAM

UNIVERSIDAD DE CHILE

SANTIAGO, Chile

1
Matias Gutiérrez

Investigador

Programa Disciplinario de Inmunología

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Ramon Jorquera

Assistant Professor

Facultad de Medicina

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Cristian Acevedo

Researcher

Biotechnology

UNIVERSIDAD TÉCNICA FEDERICO SANTA MARÍA

Valparaiso, Chile

1
Yesenia Latorre

Investigador

Laboratorio cultivo células animales

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

1
Alexis Kalergis

Full Professor

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE. FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS

Santiago, Chile

1
Roberto Zúñiga

Investigador Asociado a Proyectos

Programa Disciplinario de Inmunologia

Universidad de Chile/ Facultad de Medicina

Santiago, Chile

1
Daniel Escobar

PROFESIONAL

SALUD AMBIENTAL

INSTITUTO DE SALUD PÚBLICA DE CHILE

SANTIAGO, Chile

1
Norberto Collazo

Business Developer

Center for Sustainable Biotechnology

Fraunhofer Chile Research

Santiago, Chile

1
Cecilia Vergara

Profesor Asociado

Biología

DEPARTAMENTO BIOLOGIA, FACULTAD DE CIENCIAS, U. DE CHILE

Santiago, Chile