Man

Mauricio Andres Baez Larach

Assistant Professor

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

Líneas de Investigación


Biophysics of Protein Folding; Folding of Knotted Proteins at single molecule level; Protein degradation by molecular motors of the AAA+ family; Allosteric regulation of enzymes.

Educación

  •  Bioquímica, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2008
  •  Biochemistry, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2008

Experiencia Académica

  •   Profesor Asistente Full Time

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Facultad de Ciencias Químicas y Farmaceuticas

    Santiago, Chile

    2011 - A la fecha

  •   Profesor Adjunto Full Time

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Facultad de Ciencias

    Santiago, Chile

    2008 - Sin Información

Experiencia Profesional

  •   Adjunct instructor Professor Full Time

    Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2008 - 2011

  •   Research assistant Full Time

    Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2000 - 2011

  •   Scientific Grant Reviewer Part Time

    FONDECYT

    Santiago, Chile

    2016 - 2018

Formación de Capital Humano


Undergraduate thesis tutorship

1. Author:Alejandro Esteban Blanco Muñoz, Title: "DETERMINACIÓN DEL EFECTO Y PREFERENCIA DE LOS IONES MONOVALENTES Cs+, K+ y Na+ EN LA INHIBICIÓN ALOSTÉRICA DE FOSFOFRUCTOQUINASA-2 DE E. coli MEDIANTE DINÁMICA MOLECULAR Y CÁLCULOS DE ENERGÍA LIBRE.", Institution: UNIVERSIDAD DE TALCA, 2012.
2. Author: Francisco Soto Arratia, Title: "Rol de la lLisina 27 en la inhibición alostérica de la fFosfofructoquinasa-2 de Escherichia coli", Institution: PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE VALPARAISO, 2013

Ms Thesis tutorship
1. Author:Andres Bustamante, Title: "Caracterización del mecanismo de plegamiento de factores de transcripción de la superfamilia RHH con topologías anudadas mediante espectroscopia de fuerza de trampa óptica.", Institution: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2014
2. Author:Gabriel Vallejos, Title: "Mecanismo de dimerización de la proteína del estrés por frío de Bacillus caldolyticus. Implicancia de la unión de ADN de hebra simple en su mecanismo de plegamiento y asociación", Institution: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2014
3. Author:Álvaro San Martin, Title: "Mecanismo de degradación de proteínas con topologías anudadas mediado por la proteasa dependiente de ATP ClpXP de Escherichia coli: una aproximación in multiplo e in singulo.", Institution: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2016
4. Author:José Alejandro Molina. Title: "Determinación de la estructura tridimensional y caracterización del mecanismo de plegamiento del factor TraY de Escherichia coli: una proteína con una probable topología anudada", Institution: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2014

Ms Thesis Co-tutorship
1 Author:Paulina Fernandez Title: "Caracterización de Programa de Magister en Bioquímica la Estabilidad de las Bacteriocinas Gicina A y Microcina N en Condiciones Extremas.", Institution: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2014
2. Author:Martin Floor, Title: "DISEÑO DE UNA TEOZIMA PARA EL REORDENAMIENTO DE OXI-COPE", Institution: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2016.

PhD thesis tutorship
1. Author. Maira Rivera . Análisis cinético y termodinámico del mecanismo de plegamiento de proteínas anudadas mediante el uso de agentes caotrópicos y estudios a nivel de molécula individual: Papel de las interacciones no nativas en el mecanismo de enhebrado de MJ0366 de Methanocaldococcus jannaschii. Institution. Doctorado Bioquímica, Facultad de ciencias Químicas y Farmacéuticas. In progress.
2. Author. Andres Bustamante. Impacto de topologías no-triviales sobre el mecanismo de plegamiento de proteínas. Estudios en proteína anudada kHP0242 y el dímero de Domain Swapping de BcCSP. Institution. Doctorado en Ciencias Mención: Biología Celular, Molecular y Neurociencia. Facultad de ciencias Quimicas y Farmaceuticas. In progress.


Difusión y Transferencia


2015. Participation in the creation of the course “Laboratorios Portatiles” in protein structure and function for high school teachers.
2016-2017: Classroom and laboratory professor for modules I and II for the course “Laboratorios Portatiles” in protein structure and function for high school teachers.


Premios y Distinciones

  •   Doctoral Scholarship

    CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGIA

    Chile, 2003

    Scholarship CONICYT, to pursue Doctoral studies

  •   PABMB/ASBMB PROLAB

    Panamerican Association for Biochemistry and Molecular Biology

    Chile, 2011

    PABMB/ASBMB PROLAB, Graduate/Postdoctoral award to carry out experiments in the Bustamante Lab of single molecule Biophysics at the University of California, Berkeley. 2011.

  •   Scholarship Universidad de Chile

    Vicerrectoría de Asuntos Académicos,

    Chile

    Scholarship Universidad de Chile, Vicerrectoría de Asuntos Académicos, Departamento de Postgrado y Postítulo de la Universidad de Chile. Award to carry out biophysics measuraments at the Institute of Biophysics of Sao Carlos, Universidad de Sao Paulo, Sao Carlos, Brazil


 

Article (19)

N-Glycosylation of mollusk hemocyanins contributes to their structural stability and immunomodulatory properties in mammals
Knots can impair protein degradation by ATP-dependent proteases
Single molecule force spectroscopy reveals the effect of BiP chaperone on protein folding
The energy cost of polypeptide knot formation and its folding consequences
Regulatory network of the allosteric ATP inhibition of E.?coli phosphofructokinase-2 studied by hybrid dimers
The Folding Unit of Phosphofructokinase-2 as Defined by the Biophysical Properties of a Monomeric Mutant
A Ribokinase Family Conserved Monovalent Cation Binding Site Enhances the MgATP-induced Inhibition in E. coli Phosphofructokinase-2
Effect of mutation at the interface of Trp-repressor dimeric protein: a steered molecular dynamics simulation
Observation of Solvent Penetration during Cold Denaturation of E. coli Phosphofructokinase-2
Expanded Monomeric Intermediate upon Cold and Heat Unfolding of Phosphofructokinase-2 from Escherichia coli
Folding kinetic pathway of phosphofructokinase-2 from Escherichia coli: A homodimeric enzyme with a complex domain organization
The Crystal Complex of Phosphofructokinase-2 of Escherichia coli with Fructose-6-phosphate KINETIC AND STRUCTURAL ANALYSIS OF THE ALLOSTERIC ATP INHIBITION
Reversible unfolding of dimeric phosphofructokinase-2 from Escherichia coli reveals a dominant role of inter-subunit contacts for stability
Uncoupling the MgATP-induced inhibition and aggregation of Escherichia coli phosphofructokinase-2 by C-terminal mutations
Unfolding pathway of the dimeric and tetrameric forms of phosphofructokinase-2 from Escherichia coli
Evidence for a catalytic Mg2+ ion and effect of phosphate on the activity of Escherichia coli phosphofructokinase-2: Regulatory properties of a ribokinase family member
Role of Cys-295 on subunit interactions and allosteric regulation of phosphofructokinase-2 from Escherichia coli
Frog oocyte glycogen synthase: enzyme regulation under in vitro and in vivo conditions
Structural and functional roles of Cys-238 and Cys-295 in Escherichia coli phosphofructokinase-2

Abstract (8)

Allosteric communication between subunits of the dimeric phosphofructokinase-2 of E. coli analyzed by hybrid enzymes and molecular simulations
Dimer-tetramer conversion induced by MgATP is coupled with the binding of K plus to phosphofructokinase-2 of E. coli: implications for the allosteric regulation by the nucleotide
Direct Observation Of Solvent Penetration During Cold Denaturation Of Pfk-2 By Amide Hydrogen/Deuterium (H/H-2) Exchange Mass Spectrometry
Structural and kinetic basis for the enhanced allosteric ATP inhibition induced by monovalent cations in phosphofructokinase-2 from E. coli
Thermal unfolding of the dimeric wild-type and a monomeric mutant phosphofructokinase-2 from E-coli
Dimer-tetramer transition and the allosteric regulation of phosphofructokinase-2 from E-coli
Reversible unfolding of dimeric phosphofructokinase-2 from E. coli
Allosteric control of the oligomerization of phosphofructokinase-2 from E-coli.

Proyecto (11)

The effect of macromolecular crowding and molecular chaperones on the spontaneous knot formation in a polypeptide chain and on the folding landscape of knotted proteins
Equipo de microscopia de fluorescencia confocal acoplado a pinzas ópticas para la manipulación y visualización simultánea de sistemas moleculares
Mechanochemical mechanism of BiP protein and its role in proteostasis and protein translocation
Folding and degradation of proteins with knotted topologies: implications for folding of proteins and unfolding and translocation mechanism of ATP-dependent proteases (ClpXP)
Fortalecimiento de la Biología estructural mediante la adquisición de un Dicroísmo Circular para el estudio de Macromoléculas Biológicas, su encapsulación en micro/nano vehículos y desarrollo de compuestos farmacológicos y toxicológicos
Folding of proteins assisted by dna binding: role of electrostatic interactions in the domain swapping mechanism of the foxp and csp families
Equipo de cristalización High-Troughput de proteínas
Integración de la Biología Estructural al Desarrollo de la Bionanotecnología
Folding mechanism of knotted proteins: insights from single molecule and classic biophysical studies
BioMed-HPC: Red de biología y medicina computacional de alto rendimiento
Red de estudios en Bioquímica/Biofísica por medio de manipulación y visualización de moléculas individuales
38
Mauricio Baez

Assistant Professor

Bioquímica y Biología Molecular

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

19
Jorge Babul

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

8
Victoria Guixé

Titular Profesor

Biology

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

8
Ricardo Cabrera

Assitant Pofessor

Biology

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

5
CESAR RAMIREZ

Assistant Professor

Institute for Biological and Medical Engineering

Pontificia Universidad Catolica de Chile

Santiago, Chile

5
Christian Wilson

Associate professor

Bioquimica y Biologia Molecular

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Gonzalo Gutierrez

Associate Professor

Fisica

FACULTAD DE CIENCIAS, UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Diego Quiroga

Investigation assistant at Biochemistry Lab (Chem and Pharm Sciences Fac, Dr. Christian AM Wilson)

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
María Becker

Scientific Director, President

Research and Development

FUNDACIÓN CIENCIA Y TECNOLOGÍA PARA EL DESARROLLLO

Santiago, Chile

1
Michelle Salazar

Asistente de Investigación

Fundación Ciencia y Tecnología para el Desarrollo (FUCITED)

Santiago, Chile

1
German Miño

Profesor

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
José Jiménez

Postdoc

Investigación

Fundacion Ciencia y Vida

Santiago, Chile

1
Ricardo Zamora

Postdoctoral Research

Institute for Bioengineering of Catalonia (IBEC)

Barcelona, España

1
Maira Rivera

Investigadora Postdoctoral

Chemistry

McGill University

Montreal, Canada