Man

Elena Alejandra Vidal Olate

Directora Centro de Genomica y Bioinformatica

Universidad Mayor de Chile

Santiago, Chile

Líneas de Investigación


Respuesta a nutrientes en plantas - Biologia de sistemas vegetales - Desarrollo vegetal - RNAs pequeños en plantas

Educación

  •  Ciencias Biologicas, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE. Chile, 2010
  •  Ciencias Biologicas, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE. Chile, 2007
  •  Bioquimica, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE. Chile, 2006

Experiencia Académica

  •   Investigador Adjunto Full Time

    PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

    Ciencias Biológicas

    Santiago, Chile

    2010 - 2016

  •   Profesor asistente Full Time

    UNIVERSIDAD MAYOR

    Ciencias

    Santiago, Chile

    2016 - A la fecha

Experiencia Profesional

  •   Profesora asistente Full Time

    Universidad Mayor

    Chile

    2016 - A la fecha

  •   Directora Centro de Genómica y Bioinformática Full Time

    Universidad Mayor

    Santiago, Chile

    2019 - A la fecha

  •   Investigadora Asociada Part Time

    Instituto Milenio de Biología Integrativa iBio

    Chile

    2017 - A la fecha

Formación de Capital Humano


Tesis de pregrado terminadas
1.Sofía Bustos Molina, 2016-2017, “Función de proteínas tipo tetraspanin en el crecimiento y respuesta a nutrientes de la raíz de Arabidopsis thaliana”, Licenciatura en Biología, Facultad de Ciencias Biológicas-PUC Chile, co-tutora
2.Fernando Riquelme, 2017-2018, "Identificación de módulos miRNA/blanco diferencialmente expresados en raíz durante el desarrollo vegetativo de Arabidopsis thaliana", Biotecnologo, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor, tutora
3.Valentina Wood, 2017-2018, "Función de módulos regulatorios miR156/SPL y miR172/AP2 durante el déficit de nitrógeno en la raíz de Arabidopsis thaliana", Biotecnologo, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor, tutora
4.Luis Larrain, 2018- 2020, "Identificación de hongos endófitos de raíz aislados de especies Solanáceas del Desierto de Atacama y evaluación de su efecto en la promoción del crecimiento y la tolerancia a estrés salino en tomate (Solanum lycopersicum cv. Moneymaker)", Biotecnologo, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor, tutora

Tesis de Doctorado terminadas
1. Carol Moraga, 2016-2020, “Development of algorithms to predict microRNA regulatory networks at genome scale”, Ecole doctorale d’Evolution, Ecosystemes, Microbiologie et Modelisation”, Universite Claude Bernard Lyon 1, co-director

Tesis de Doctorado en curso
1. Evelyn Sanchez, 2019- "Role of Trichoderma atroviride small RNAs in the control of lateral root growth in Arabidopsis thaliana.”, Doctorado en Genomica Integrativa, Universidad Mayor, tutora
2. Diego Pérez, 2019- "“Unraveling the modulation of the immune response mediated by small RNAs on macrophage-like cells of S. salar infected by P. salmonis”, Doctorado en Genomica Integrativa, Universidad Mayor, co-tutora
3. José David Fernández, 2021- "Identification of Gene regulatory networks controlling sulfate starvation response in Solanum lycopersicum", Doctorado en Genómica Integrativa Universidad Mayor, tutora


Difusión y Transferencia


Charlas invitadas
Genomica al rescate de las plantas, Academia de Biotecnologia Agricola, Enero de 2019
ADN: ¿Por qué tan iguales y tan distintos a la vez?, Ciencia al Parque, Octubre 2018
Nutrient controlled gene regulatory networks in plant growth and development, Seminario Instituto de Ciencias Biologicas, Universidad de Talca, Octubre 2018
Gene networks controlling root system remodeling in response to changes in nitrate availability, I seminario iberoamericano de nutricion en plantas, Universidad Austral, Diciembre 2018
“Identification of development- and nutrient-dependent regulatory networks shaping root system architecture in Arabidopsis thaliana”, II Molecular Biosystems Conference, Puerto Varas, Chile, Octubre 2019
Genómica y Biología de Sistemas para comprender la respuesta de las plantas a la disponibilidad de nutrientes, webinar invitado por el International Society for Computational Biology Student Council Chile, 26 Junio 2020
ADN: ¿Por qué tan iguales y tan distintos a la vez?, Festival de la Ciencia, PAR Explora RM Sur Poniente, Noviembre 2020
Conversatorio "Mujeres bakanas en bioinformática", ISCB Student Council Chile, 12 Marzo 2021

Talleres
Academia de Biotecnologia Agricola, Enero de 2019. Asesor cientifico
Academia de Biotecnologia Agricola, Enero de 2021. Asesor cientifico
Taller de restauración y conservación de Orquídeas, proyecto de Proyección al Medio Externo – Iniciativa Científica Milenio, organizadora, Septiembre 2020.
Tutorías Colegio St Joseph Huechuraba. Organización y preparación de mentorías académicas y talleres para el colegio St. Joseph de Huechuraba, Marzo-Diciembre 2020.

TV
Superhongos, Futuro 360,CNN Chile, 2019
Superalimentos, Futuro 360, CNN Chile, 2019
"¿Cómo puede aportar la genómica a los desafíos que enfrenta la agricultura?" Centro de Genomica y Bioinformatica Universidad Mayor, Exploradores, del átomo al cosmos, 24 horas TVN, 2018
"Alimentos del Futuro", la Proxima Estacion, Canal 13 Cable, 2019

Radio
"Ola de calor y su efecto en las plantas", La invencion del futuro, Radio Pauta, Enero 2019
"Genomica al rescate de las plantas", Rockstars, TXS Radio, Septiembre 2019

Diario
"Uso de hongos aislados de plantas del desierto de Atacama para generar cultivos tolerantes a estrés salino", El Mercurio, 2018
"Cambio climático favorece la aparición de nuevas amenazas sanitarias en avellanos europeos", Revista del Campo, 2019
"Incendios en el amazonas", El Mercurio, Agosto 2019
“Inscripciones abiertas para taller gratuito sobre conservación y restauración de orquídeas chilenas vía online”, El Mostrador, 5 Agosto 2020
“Bioquímica especialista en genómica y biología de sistemas de plantas: “En el caso chileno, hay mucha flora endémica, tenemos una biodiversidad gigante”, El Mostrador, 27 Agosto 2020

Medios digitales
Qué es el ADN? Biotec a tu casa https://www.youtube.com/user/ongsustentate
Genomica al rescate de las plantas, revista Heureka, Noviembre 2018
"Científicas dedicadas a la bioinformática en Instituto Milenio de Biología Integrativa iBio cuentan sobre la especialidad", Ciencia en Chile, Marzo 2021


Premios y Distinciones

  •   Beca de Doctorado Nacional

    CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGIA

    Chile, 2006

    Beca de Doctorado Nacional CONICYT

  •   Beca de apoyo a la tesis Doctoral

    CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGIA

    Chile, 2008

    Beca de apoyo a la realizacion de tesis Doctoral CONICYT

  •   Apoyo complementario - eventos y cursos cortos

    CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGIA

    Chile, 2010

    Beca para participacion en el International Conference on Arabidopsis Research, Yokohama, Japon 2010


 

Article (19)

Mating induces early transcriptional response in the rat endosalpinx: the role of TNF and RA
Nitrate 2020: Thirty years from transport to signaling networks
TGA class II transcription factors are essential to restrict oxidative stress in response to UV-B stress in Arabidopsis
Transcriptomic analysis at organ and time scale reveals gene regulatory networks controlling the sulfate starvation response of Solanum lycopersicum
Whole Genome Sequence, Variant Discovery and Annotation in Mapuche-Huilliche Native South Americans
MicroRNA Profiling and Bioinformatics Target Analysis in Dorsal Hippocampus of Chronically Stressed Rats=> Relevance to Depression Pathophysiology.
GENIUS: web server to predict local gene networks and key genes for biological functions
SMZ/SNZ and Gibberellin Signaling Are Required for Nitrate-Elicited Delay of Flowering Time in Arabidopsis Thaliana
Members of BTB Gene Family of Scaffold Proteins Suppress Nitrate Uptake and Nitrogen Use Efficiency
The calcium ion is a second messenger in the nitrate signaling pathway of Arabidopsis
Transcriptional networks in the nitrate response of Arabidopsis thaliana
Nitrate regulation of AFB3 and NAC4 gene expression in Arabidopsis roots depends on NRT1.1 nitrate transport function
Nitrogen control of developmental phase transitions in Arabidopsis thaliana
Systems approach identifies TGA1 and TGA4 transcription factors as important regulatory components of the nitrate response of Arabidopsis thaliana roots
Integrated RNA-seq and sRNA-seq analysis identifies novel nitrate-responsive genes in Arabidopsis thaliana roots
Systems approaches map regulatory networks downstream of the auxin receptor AFB3 in the nitrate response of Arabidopsis thaliana roots
Gene networks for nitrogen sensing, signaling, and response in Arabidopsis thaliana
Nitrate-responsive miR393/AFB3 regulatory module controls root system architecture in Arabidopsis thaliana
An extensive survey of CK2 alpha and beta subunits in Arabidopsis: Multiple isoforms exhibit differential subcellular localization

BookWhole (1)

Constructing simple biological networks for understanding complex high-throughput data in plants

Proyecto (17)

Epigenetic control of sulfate-starvation responsive genes in Solanum lycopersicum
Network for Organismal Interaction Research (NOIR)
Identification of endogenous root small RNA-controlled regulatory networks expressed during Arabidopsis vegetative development
Instituto Milenio de Biologia Integrativa iBio
Millennium Institute for Integrative Biology iBio
Núcleo Milenio de Biología Sintética y de Sistemas Vegetales
Nucleo Milenio en Biologia Sintetica y Biologia de Sistemas Vegetales
Desarrollo de nuevas variedades de Oryza sativa con mejor eficiencia de uso de nitrógeno.
GENE REGULATORY NETWORKS UNDERLYING DEVELOPMENTAL ADAPTATIONS IN RESPONSE TO CHANGES IN NUTRIENT AVAILABILITY IN ARABIDOPSIS THALIANA
Centro FONDAP de Regulacion del Genoma
Spatial-temporal networks inference for the regulation of root Nitrogen uptake in Arabidopsis thaliana
TEMPORAL AND SPATIAL NITROGEN REGULATORY NETWORKS IN ARABIDOPSIS THALIANA
Nucleo Milenio en Genomica Funcional de Plantas
Role of small RNAs in the Carbon and Nitrogen response of Arabidopsis thaliana
BIOLOGIA DE SISTEMAS Y GENOMICA FUNCIONAL PARA ENTENDER LOS MECANISMO MOLECULARES DE LA RESPUESTA A NITROGENO EN ARABIDOPSIS.
FUNCTIONAL GENOMICS TO IMPROVE N-USE EFFICIENCY IN PLANTS
ESTUDIOS SOBRE EL MECANISMO DE ACTIVACION TRANSCRIPCIONAL DE GENES CON ACTIVIDAD, ANTIOXIDANTE Y DETOXIFICANTE POR ACIDO SALICILICO EN ARABIDOPSIS THALIANA

Review (2)

Integration of local and systemic signaling pathways for plant N responses
A systems view of nitrogen nutrient and metabolite responses in Arabidopsis
25
Elena Vidal

Directora Centro de Genomica y Bioinformatica

Centro de Genomica y Bioinformatica

Universidad Mayor de Chile

Santiago, Chile

13
Rodrigo Gutierrez

Full Professor

Molecular Genetics & Microbiology

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE

Santiago, Chile

2
Jose Alvarez

Profesor Asistente

Facultad de Ciencias

Universidad Mayor de Chile

SANTIAGO, Chile

1
Maria Holuigue

Profesor Titular

Departamento de Genética Molecular y Microbiología

FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE

Santiago, Chile

1
Elena Vidal

Profesor asistente

Universidad Mayor

Santiago, Chile

1
Erika Araus

Postdoctorado

Facultad de Ciencias

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Paula Salinas

Profesor asociado

Facultad de Ciencias Básicas

Universidad Santo Tomás

Santiago, Chile