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Alex Humberto Di Genova Bravo

Assistant professor

Universidad de O'Higgins

Rancagua, Chile

Líneas de Investigación


Bioinformatics, computational biology, algorithms, and cancer genomics

Educación

  •  Bioinformatics, UNIVERSIDAD ADOLFO IBANEZ. Chile, 2017
  •  Engineer in Bioinformatics, UNIVERSIDAD DE TALCA. Chile, 2008

Experiencia Académica

  •   postdoctoral research Full Time

    INRIA

    Lyon, Francia

    2017 - 2019

  •   Assistant professor Full Time

    Universidad de O'Higgins

    Engineering sciences

    Rancagua, Chile

    2021 - A la fecha

  •   postdoctoral research Full Time

    IARC

    Lyon, Francia

    2020 - 2021

Experiencia Profesional

  •   Research engineer Full Time

    Universidad de Chile

    SAntiago, Chile

    2008 - 2013


 

Article (32)

Development of a small panel of SNPs to infer ancestry in Chileans that distinguishes Aymara and Mapuche components
Efficient hybrid de novo assembly of human genomes with WENGAN
Identification of SNPs and InDels associated with berry size in table grapes integrating genetic and transcriptomic approaches
Mycoplasma hyopneumoniae J elicits an antioxidant response and decreases the expression of ciliary genes in infected swine epithelial cells
The relevance of enzyme specificity for coenzymes and the presence of 6-phosphogluconate dehydrogenase for polyhydroxyalkanoates production in the metabolism of Pseudomonas sp. LFM046
Comparing genomic signatures of domestication in two Atlantic salmon (Salmo salar L.) populations with different geographical origins
RNA-Seq analysis and transcriptome assembly of raspberry fruit (Rubus idaeus "Heritage") revealed several candidate genes involved in fruit development and ripening
Whole Genome Sequence, Variant Discovery and Annotation in Mapuche-Huilliche Native South Americans
Fast-SG: an alignment-free algorithm for hybrid assembly
Genomic variation underlying complex life-history traits revealed by genome sequencing in Chinook salmon
The genome sequence of the soft-rot fungus Penicillium purpurogenum reveals a high gene dosage for lignocellulolytic enzymes
Genome wide association study for resistance to Caligus rogercresseyi in Atlantic salmon (Salmo salar L.) using a 50K SNP genotyping array
Global gene expression analysis provides insight into local adaptation to geothermal streams in tadpoles of the Andean toad Rhinella spinulosa
Reconstruction of the microalga Nannochloropsis salina genome-scale metabolic model with applications to lipid production
Genomewide single nucleotide polymorphism discovery in Atlantic salmon (Salmo salar): validation in wild and farmed American and European populations
The Atlantic salmon genome provides insights into rediploidization
The bioleaching potential of a bacterial consortium.
Transcriptome profiling of grapevine seedless segregants during berry development reveals candidate genes associated with berry weight
Genome-wide association analysis reveals loci associated with resistance against Piscirickettsia salmonis in two Atlantic salmon (Salmo salar L.) chromosomes
The BioMart community portal: an innovative alternative to large, centralized data repositories
Transcriptome sequencing of Prunus sp rootstocks roots to identify candidate genes involved in the response to root hypoxia
A new genome of Acidithiobacillus thiooxidans provides insights into adaptation to a bioleaching environment
Whole genome comparison between table and wine grapes reveals a comprehensive catalog of structural variants
Bioinformatic survey for new physiological substrates of Cyclin-dependent kinase 5
Cdk5 regulates Rap1 activity
Construction of Reference Chromosome-Scale Pseudomolecules for Potato: Integrating the Potato Genome with Genetic and Physical Maps
Identification of two putative reference genes from grapevine suitable for gene expression analysis in berry and related tissues derived from RNA-Seq data
Draft Genome Sequence of the Sulfobacillus thermosulfidooxidans Cutipay Strain, an Indigenous Bacterium Isolated from a Naturally Extreme Mining Environment in Northern Chile
Genome wide identification of Acidithiobacillus ferrooxidans (ATCC 23270) transcription factors and comparative analysis of ArsR and MerR metal regulators
BioMart Central Portal: an open database network for the biological community
Genome sequence and analysis of the tuber crop potato
SalmonDB: a bioinformatics resource for Salmo salar and Oncorhynchus mykiss

Proyecto (7)

Genómica de la población Chilena=> Obtención de perfiles genéticos necesarios en investigación clínica, salud publica y medicina forense.
Centro de Regulación del Genoma
The International Collaboration to Sequence the Atlantic Salmon Genome (ICSASG), Chile, Canada and Norway.
Potato Genome Sequencing Consortium (PGSC).
Genómica de Salmónidos=> Identificación de genes asociados al uso de proteínas y aceites vegetales en la nutrición de Salmón del Atlántico y Trucha Arcoiris
Identificación de genes relacionados con el desarrollo y crecimiento de bayas apirenas de vid mediante genómica funcional.
Laboratorio de información en biomineria=> Organización y procesamiento estadísticos de datos biomineros, anotación de genomas y desarrollo de plataformas.
32
Alex Di Genova

Assistant professor

Engineering sciences

Universidad de O'Higgins

Rancagua, Chile

23
Alejandro Maass

Director

Center for Mathematical Modeling

Universidad de Chile

Santiago, Chile

9
Dante Travisany

Scientist

CMM

Universidad de Chile

Santiago, Chile

6
Ariel Orellana

Profesor Titular

Centro de Biotecnologia Vegetal

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Santiago, Chile

5
Mauricio Gonzalez

Profesor Titular

INTA

UNIVERSIDAD DE CHILE - INSTITUTO DE NUTRICION Y TECNOLOGIA DE ALIMENTOS

Santiago, Chile

5
Patricio Hinrichsen

Investigador

INIA CENTRO REGIONAL LA PLATINA

Santiago, Chile

4
Boris Sagredo

INIA-RAYENTUÉ

Rengo, Chile

3
Katharina Correa

Asistente

Desarrollo Genético

Aquainnovo

Puerto Montt, Chile

3
Jose Yañez

Profesor Asistente

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

3
Pilar Parada

Executive Director

Centre for Systems Biotechnology

Fraunhofer Chile Research

Santiago, Chile

3
Christian Hodar

ASSISTANT PROFESSOR

BIOINFORMATICS & GENEXPRESSION LAB - INTA

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

3
Veronica Cambiazo

Associate Professor

Unidad de Nutrición Básica

UNIVERSIDAD DE CHILE - INTA

Santiago, Chile

3
Angelica Reyes

Profesor Asociado

INTA UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

3
Liane Ney

Profesor asistente

Producción animal

Universidad Andrés Bello

santiago, Chile

3
Claudia Muñoz

Investigadora

Biotecnología

Instituto de Investigaciones Agropecuarias INIA-La Platina

Santiago, Chile

2
Christian Gonzalez

Full Professor

Biology

Universidad de Chile

Santiago, Chile

2
Manuel Pinto

ACADÉMICO

INSTITUTO DE CIENCIAS AGRONOMICAS Y VETERINARIAS

Universidad de O'Higgins

San Fernando, Chile

2
Nilo Mejia

Investigador

Producción Vegetal

INSTITUTO DE INVESTIGACIONES AGROPECUARIAS

Santiago, Chile

2
Maria Cortés

Ingeniero de proyectos

Universidad de Chile

Santiago, Chile

2
Nicolas Loira

CTO AlicantoLabs

Escuela de Negocios

Universidad Adolfo Ibáñez

Santiago, Chile

2
Miguel Allende

Director

Biología

FACULTAD DE CIENCIAS, UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Paula Pimentel

Coordinator of Plant Stress Physiology laboratory

Centro de Estudios Avanzados en Fruticultura

Rengo, Chile

1
PAULA VIZOSO

Researcher

Universidad Mayor

SANTIAGO, Chile

1
Sergio Alvarado

Académico

Bioestdística

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Pamela Rojas

Investigador postdoctoral

INIA Rayentue

Instituto de Investgaciones Agropecuarias

Rengo, Chile

1
carol moraga

phd student

biologie

universite claude bernard lyon 1

lyon, Francia

1
Maria Bustamante

Profesora Asistente

Facultad de Medicina

Universidad de Chile

Santiago , Chile

1
Klaus Puschel

Full Professor

Family Medicine

FACULTAD MEDICINA PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

Santiago, Chile

1
Ariel Salvatierra

Investigador

Genómica Vegetal

Centro de Estudios Avanzados en Fruticultura

Rengo, Chile

1
Martín Montecino

Director

Institute of Biomedical Sciences

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Santiago, Chile

1
Gonzalo Ruz

Full Professor

Engineering and Sciences

Universidad Adolfo Ibáñez

Santiago, Chile

1
Juan-Pablo Martinez

Investigador

INSTITUTO DE INVESTIGACIONES AGROPECUARIAS (INIA-LA CRUZ)

La Cruz, Chile

1
Lida Fuentes

Researcher

Centro Regional de Estudios en Alimentos Saludables

Valparaiso, Chile

1
Andrea Miyasaka

Profesor Asociado

Facultad de Ciencias

Universidad Mayor

Huechuraba, Chile

1
Daniel Bórquez

Profesor asistente

Centro de Investigación Biomédica

Universidad Diego Portales

Santiago, Chile

1
Elias Utreras

Profesor Asistente

Biologia

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Luis Zapata

Postdoc

Bioinformatics and genomics

Center for genomic regulation

Barcelona, España

1
Ruben Vidal

Profesor Asociado

Biologia

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Santiago, Chile

1
Adriana Bastias

DOCENTE

FAC. CS. SALUD

UNIVERSIDAD AUTONOMA DE CHILE

Santiago, Chile

1
Ruben Almada

PRINCIPAL INVESTIGATOR

GENOMICS

CENTRO DE ESTUDIOS AVANZADOS EN FRUTICULTURA

Rengo, Chile

1
Maria López

Postdoc

Department of Animal Breeding and Genetics

Swedish University of Agricultural Sciences

Uppsala, Suecia

1
Mauricio Gonzalez

Researcher

INSTITUTO DE INVESTIGACIONES AGROPECUARIAS - CRI LA PLATINA

SANTIAGO, Chile

1
Daniel Henriquez

Director Ciencia Transversal

Fundación Centro MERI

Santiago, Chile

1
Eduardo Pérez

Profesor Investigador

Centro de Genética y Genómica, Facultad de Medicina Clínica Alemana

Universidad del Desarrollo

Santiago, Chile

1
Luis Pastenes

Profesor Auxiliar

Departamento de Biología y Química

Universidad Católica del Maule

Talca, Chile

1
Luisa Herrera

Profesor Asociado

Incstituto de Ciencias Biomédicas, Programa de Genética Humana

UNIVERSIDAD DE CHILE, FACULTAD DE MEDICINA-ICBM

Santiago, Chile

1
José Suazo

Profesor Asociado

Instituto de Investigación en Ciencias Odontológicas

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
Emmanuelle Barozet

Profesora titular

DEPARTAMENTO DE SOCIOLOGÍA, UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Patricia Iturra

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
DANTE CACERES

Académico

Programa de Salud Ambiental

ESCUELA DE SALUD PUBLICA, FACULTAD DE MEDICINA, UNIVERSIDAD DE CHILE

SANTIAGO, Chile

1
Claudio Meneses

Profesor Titular

Facultad de Ciencias de la Vida

UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO

Santiago, Chile

1
Mabel Vidal

Estudiante de doctorado

Ciencias de la Computación

Universidad de Concepción

Concepcion, Chile

1
Ricardo Verdugo

Asistant Professor

Facultad de Medicina

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile