Genética y Genómica Acuícola (GWAS, Genomic prediction, RNA-Seq); Bioinformática ; Estadística para las Ciencias Animales

Tesis de Doctorado

Katharina Correa Orphanópoulos. Disección genómica de la resistencia a Caligus rogercresseyi y Piscirickettsia salmonis y evaluación de métodos estadísticos de predicción genómica en Salmón del Atlántico (Salmo salar L.). Tesis para obtener el grado de Doctor en Ciencias Silvoagropecuarias y Veterinarias, Universidad de Chile. (Finalizada marzo 2017). Profesor Guía.

* Premio Excelencia Tesis Doctoral en Ciencias Biológicas 2017 otorgado por la Fundación Allende-Connelly.

María Eugenia López. Determinación de huellas de selección en poblaciones comerciales de salmón del Atlántico utilizando información genómica de alta densidad. Tesis para obtener el grado de Doctor en Ciencias Silvoagropecuarias y Veterinarias, Universidad de Chile. (Finalizada agosto 2017). Profesor co-guía.

Agustín Barría. Identificación de variantes genómicas asociadas a estrategias de defensa frente a Piscirickettsia salmonis en salmón coho (Oncorhynchus kisutch). Tesis para obtener el grado de Doctor en Ciencias de la Acuicultura, Programa cooperativo, Universidad de Chile, Universidad Católica del Norte, Pontificia Universidad Católica de Valparaíso. (Finalizada diciembre 2018). Director de Tesis.

Giovanna Cáceres. Detección de regiones genómicas implicadas en la determinación de sexo y crecimiento corporal en tilapia del Nilo (Oreochromis niloticus). Tesis para obtener el grado de Doctor en Ciencias Silvoagropecuarias y Veterinarias, Universidad de Chile. (Finalizada marzo 2020). Profesor Guía.

David Tapia. Susceptibilidad y respuesta transcriptómica diferencial frente a la infección con virus de la necrosis pancreática infecciosa del genogrupo 1 y 5 en trucha arcoíris. Tesis para obtener el grado de Doctor en Ciencias de la Acuicultura, Programa cooperativo, Universidad de Chile, Universidad Católica del Norte, Pontificia Universidad Católica de Valparaíso. (En Curso, Examen de Calificación y proyecto aprobado 14 junio 2017). Director de Tesis.

Angel Parra. Edición genómica en células de trucha arco iris (Oncorhynchus mykiss), para el incremento de su resistencia a Piscirickettsia salmonis. Tesis para obtener el grado de Doctor en Ciencias de la Acuicultura, Programa cooperativo, Universidad de Chile, Universidad Católica del Norte, Pontificia Universidad Católica de Valparaíso. (En Curso, Examen de Calificación y proyecto aprobado 11 octubre 2017). Director de Tesis.

Jousepth Gallardo. Estudio de asociación de todo el genoma del rasgo tasa de crecimiento bajo estrés térmico crónico en trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss). Tesis para obtener el grado de Doctor en Ciencias de la Acuicultura, Programa cooperativo, Universidad de Chile, Universidad Católica del Norte, Pontificia Universidad Católica de Valparaíso. (En Curso, Examen de Calificación y proyecto aprobado 11 octubre 2017). Director de Tesis.

María Ignacia Cádiz. Identificación de regiones del genoma asociadas a selección en poblaciones comerciales de tilapia del Nilo (Oreochromis niloticus). Tesis para obtener el grado de Doctor en Ciencias Silvoagropecuarias y Veterinarias, Universidad de Chile. (En Curso, Examen de Calificación y proyecto aprobado 15 noviembre 2018). Profesor Guía.

Reyes López-Ordáz. Programa de Doctorado en Ciencias Agropecuarias. Universidad Autónoma Metropolitana (UAM), Xochimilco, México. Co-Director

Thania Medrano Mendoza. Estudio de asociación genómica para resistencia al Sindrome Mancha Blanca en camarón del Pacífico (Litopenaeus Vannamei). Programa de Doctorado en Ciencias Agropecuarias. Universidad Autónoma Metropolitana (UAM), Xochimilco, México. Co-Director

Tesis de Magister

Cristian Larrondo. Determinación de la variación genética aditiva de la resistencia a patógenos causantes de mastitis en ovejas lecheras de la raza Valle del Belice. Tesis para obtener el grado de Magister en Ciencias Animales y Veterinarias, Universidad de Chile. (Finalizado 14 noviembre 2016). Profesor Guía.

Raúl Flores-Mara. Evaluación de la la co-variación genética de la resistencia al virus de la Necrosis Pancreáctica Infecciosa y peso a cosecha en truchas arcoíris (Oncorhynchus mykiss). Tesis para obtener el grado de Magister en Ciencias Animales y Veterinarias, Universidad de Chile. (Finalizado 22 noviembre 2016). Profesor Guía.

Halley Rodríguez. Estudio de asociación genómica para la resistencia frente al virus de la Necrosis Pancreáctica Infecciosa en trucha arcoíris. Tesis para obtener el grado de Magister en Ciencias Animales y Veterinarias, Universidad de Chile. (Finalizado Marzo 2017). Profesor Guía.

Pablo Dufflocq. Precisión en la predicción genómica utilizando diferentes niveles de error de imputación en programas de mejoramiento genético acuícolas. Tesis para obtener el Título Profesional de Médico Veterinario y grado de Magister en Ciencias Animales y Veterinarias, Universidad de Chile. (Finalizado 4 enero 2018). Profesor Guía.

Claudina González. Evaluación de interacción genético por ambiente (G*E) para crecimiento corporal en dos poblaciones independientes de salmón del Atlántico (Salmo salar), criados en agua de mar y agua dulce, bajo sistema de producción controlado. Tesis para obtener el grado de Magíster en Acuicultura, Universidad de Chile. (Finalizado 19 enero 2018). Profesor Guía.

Daniel Arriagada. Parámetros genéticos y respuesta a la selección del carácter crecimiento y supervivencia en un programa de mejoramiento del chorito gallego (Mytilus galloprovincialis). Tesis para obtener el grado de Magister en Acuicultura, Universidad de Chile. (Finalizado 19 enero 2018). Profesor Guía.

Pablo Cáceres Refusta. Determinación de genes candidatos para resistencia al piojo de mar (Caligus reogercresseyi) utilizando genómica comparativa en salmón del Atlántico (Salmo salar) y trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss). Tesis para obtener el grado de Magister en Ciencias Animales y Veterinarias, Universidad de Chile. (Finalizado 18 junio 2019). Profesor Guía.

Carolina Araya. Estimación de parámetros genéticos para sobrevivencia bajo estrés térmico crónico en trucha arcoíris (Oncorhynchus mykiss). Tesis para obtener el grado de Magister en Ciencias Animales y Veterinarias, Universidad de Chile. (Proyecto aprobado el 5 junio 2018). Profesor Guía.

Zavala Marín, Sebastián Elías Evaluación de la precisión de imputación de genotipos utilizando diferentes densidades para un panel de SNP (single nucleotide polymorphisms) de Cobia (Rachycentron canadum) 2022 Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias Yanez Lopez, Jose Manuel Genética animal.; Genética veterinaria.

Marín Nahuelpi, Rodrigo Ignacio Detección de señales de selección a nivel genómico del salmón Chinook (Oncorhynchus tshawytscha) en Sudamérica, nueva Zelanda y Norteamérica 2022 Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias

B. MEMORIAS Y PRÁCTICAS DIRIGIDAS COMO PROFESOR RESPONSABLE CONDUCENTES A GRADO O TÍTULO

Karen Solís Parra. Análisis in silico de secuencias de tilapia (Oreochromis niloticus) para el desarrollo de marcadores moleculares. Práctica profesional obligatoria para obtener el grado de Ingeniera Civil Bioquímica. Universidad Católica de Valparaíso. Ene – Feb 2012. Supervisor.

Liane Ney Bassini. Development of a microsatellite multiplex PCR for genetic studies in coho salmon (Oncorhynchus kisutch) and tilapia (Oreochromis niloticus). Estadía obligatoria para obtener el grado de Médico Veterinario, Universidade Federal de Pelotas, Rio Grande do Sul, Brasil. Ene - Jul 2012. Supervisor.

Ángel Proboste. Determinación del tamaño efectivo poblacional (Ne) en poblaciones comerciales de salmón coho cultivadas a en Chile. Práctica profesional obligatoria para obtener el grado de Médico Veterinario, Universidad Católica de Temuco. Ene - Mar 2013.Supervisor.

Katharina Correa Orphanópoulos. Efecto de la triploidia en la expresión génica de moléculas del sistema inmune en salmón del coho desafiados con Piscirickettsia salmonis. Memoria de título para obtener el grado de Médico Veterinario. Universidad de Chile. (Finalizado agosto 2013). Profesor Guía.

Catalina Lida González Canepa. Determinación del componente genético de variables productivas y conductuales, y la influencia de éstas sobre el precio de las pieles en un criadero de chinchillas (Chinchilla lanígera) en la comuna de Pirque, Chile. Memoria de título para obtener el grado de Médico Veterinario. Universidad de Chile. (Finalizado enero 2017). Profesor Guía.

Pablo Dufflocq. Precisión en la predicción genómica utilizando diferentes niveles de error de imputación en programas de mejoramiento genético acuícolas. Tesis para obtener el Título Profesional de Médico Veterinario y grado de Magister en Ciencias Animales y Veterinarias, Universidad de Chile. (Finalizado 4 enero 2018). Profesor Guía.

Dicran Baloian. Diferenciación genética en poblaciones de delfín nariz de botella (Tursiops truncatus) del sureste del Océano Pacífico. Memoria de título para obtener el grado de Médico Veterinario. Universidad de Chile. (Finalizado octubre 2018). Profesor Guía.

Marcelo Olivares Lanas. Variabilidad, diversidad y diferenciación genética entre dos poblaciones comerciales de tilapia del Nilo (Oreochromis niloticus) utilizandomarcadores de polimorfismos de nucléotido único (SNPs). Memoria de título para obtener el grado de Médico Veterinario. Universidad de Chile. (Proyecto aprobado 2 mayo 2018). Profesor Guía.

Isadora Mendoza Navarro. Determinación de consanguinidad molecular mediante marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNPs) en dos poblaciones de reproductores de Tilapia del Nilo, Oreochromis niloticus, cultivados en Costa Rica. Memoria de título para obtener el grado de Médico Veterinario. Universidad de Chile. (Proyecto aprobado 2 mayo 2018). Profesor Guía.

Ruiz Ramírez, Bruno Enrique Comparación de la diversidad y estructura genética poblacional del salmón Coho (Oncorhynchus kisutch) cultivado y de vida libre en Chile 2025 Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias

Nilo Hernández, Ana María Evaluación de la eficacia de productos comerciales no tradicionales (Supratect ™ y Cleanmix) como tratamiento en ovas de S. salar desafiadas con Saprolegnia spp. 2022 Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias