Análisis de la interacción patógeno-hospedero mediante tecnologías genómicas de alto rendimiento enfocados en el desarrollo y regulación de la respuesta inmune en modelos de mamíferos y de salmónidos.

Tesis pregrado finalizadas:
1. Paulina Bastías Riveros , Efecto de Inmunoglobulinas en la respuesta immune de células de salmónidos contra Piscirickettsia salmonis. Carrera de Bioquímica, Facultad de Química y Biología, Universidad de Santiago de Chile, Finalizada Primer Semestre 2015, Tutor: Sebastián Reyes Cerpa.

2. Cristian Andrade Madrigal, Identificación y clonamiento del transcrito de IFN? de Salmón coho y evaluación de la expresión del transcrito frente a la infección de Virus ISA en comparación a los de Salmón del Atlántico y Trucha arcoíris in vitro Carrera de Bioquímica, Facultad de Química y
Biología, Universidad de Santiago de Chile, Finalizada Primer semestre 2015. Tutor: Sebastián Reyes Cerpa.

3. Valentina Soto Herrera, Estudio de la infección de macrófagos de Salmo salar con Piscirickettsia salmonis, carrera de Bioquímica, Facultad de Química y Biología, Universidad de Santiago de Chile, Finalizada Primer Semestre 2016. Tutor: Sebastián Reyes Cerpa.

4. Camila Álvarez Reyes, El uso de TIC’s en el estudio de célula eucarionte animal, carrera de Pedagogía en Química y Biología, Facultad de Química y Biología, Universidad de Santiago de Chile, Finalizada Primer Semestre 2016. Tutor: Sebastián Reyes Cerpa.

5. Carola Valdés Barrueto, Uso de learning objects y laboratorios virtuales como recurso para la enseñanza de inmunología en enseñanza media científico – humanista, carrera de Pedagogía en Química y Biología, Facultad de Química y Biología, Universidad de Santiago de Chile, Finalizada Primer Semestre 2016. Tutor: Sebastián Reyes Cerpa.

6. Sebastián Tapia Pastene, Evaluación del efecto de anticuerpos no específicos sobre la respuesta inmune de macrófagos de Salmo salar infectados por Piscirikettsia salmonis, carrera de Bioquímica, Facultad de Química y Biología, Universidad de Santiago de Chile, Finalizada Primer Semestre 2017. Tutor: Sebastián Reyes Cerpa.

7. Diego Pérez Stuardo, Evaluación de la funcionalidad de lisosomas de macrófagos de Salmo salar infectados por Piscirikettsia salmonis, carrera de Bioquímica, Facultad de Química y Biología, Universidad de Santiago de Chile, Finalizada Segundo Semestre 2017. Tutor: Sebastián Reyes
Cerpa.

8. Allison Espinoza Vergara, Evaluación del efecto de complejos inmunes en la respuesta inmune intracelular de macrófagos de salmón del Atlántico infectados con Piscirickettsia salmonis, carrera de Bioquímica, Facultad de Química y Biología, Universidad de Santiago de Chile, Finalizada Primer Semestre 2018. Tutor: Sebastián Reyes Cerpa.

9. Bernado Brianson, Rol de los genes del Sistema de Secreción de tipo III en la infección de Piscirickettsia salmonis en células tipo macrófagos de salmón del Atlántico (SHK-1). Carrera de Biotecnología, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor. Finalizada Primer Semestre 2020. Rol: Tutor

10. Valentina Ibaceta, Rol de los genes del Sistema de Secreción de tipo VI de Piscirickettsia salmonis cuando infecta células tipo macrófagos de salmón del Atlántico (SHK-1). Carrera de Biotecnología, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor. Finalizada Primer Semestre 2021. Rol: Tutor.

11. Fernanda Guajardo y Daniel Iturrieta, Inducción de una respuesta pro-inflamatoria durante la replicación de VIH-1 en células de la microglía: Impacto de la infección viral sobre la maquinaria de m6A. Carrera de Tecnología médica, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor. Finalizada Primer Semestre 2021. Rol: Tutor.

12. Viviana Dumuihual y Scarlett Cuadra, El VIH-1 produce cambios en la expresión de componentes de la maquinaria m6A aumentando la replicación viral en microglía humana. Carrera de Tecnología médica, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor. Finalizada Primer Semestre 2022. Rol: Tutor.

13. Mateus Frazao De Souza, Detección in situ de Piscirickettsia salmonis mediante uso de LAMP. Carrera de Biotecnología, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor. Finalizada Segundo Semestre 2022. Rol: Tutor.

14. Héctor Vasquez Aguirre, Desarrollo de un sistema de detección de Piscirickettsia salmonis mediante el uso de anticuerpos monoespecíficos para proteínas de superficie. Carrera de Biotecnología, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor. Finalizada Segundo Semestre 2023. Rol: Tutor.

Dirección de tesis pregrado en curso
1. Arturo Diez, Desarrollo de nanosistemas para disminuir la carga bacteriana de Piscirickettsia salmonis en macrófagos de salmón del Atlántico infectados. Carrera de Biotecnología, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor, Comienzo Segundo semestre 2022. Rol: Tutor.

2. Isidora Pittet, Caracterización del comportamiento de LncRNA en microglías infectadas con VIH-1. Carrera de Biotecnología, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor, Comienzo Segundo semestre 2023. Rol: Co-Tutor.

3. Josefa Ormeño, Screening de compuestos inmunomoduladores para Salmo salar, provenientes de hongos del desierto de Atacama. Carrera de Biotecnología, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor, Comienzo Segundo semestre 2023. Rol: Tutor

4. Felipe Villegas, Evaluación del impacto de la administración de nanosistemas basados en PLGA sobre la activación de la ruta endocítica, como también en la carga bacteriana intracelular, cuando macrófagos de salmón del Atlántico son infectados por P. salmonis. Carrera de Biotecnología, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor, Comienzo Segundo semestre 2023. Rol: Tutor.

Dirección de tesis de doctorado finalizadas
1. Diego Pérez-Stuardo, Unraveling the modulation of the immune response mediated by small RNAs on macrophage-like cells of Salmo salar by P. salmonis. Programa de Doctorado en Genómica Integrativa, Vicerrectoría de Investigación, Universidad Mayor. Finalizada ocutbre 2023

Vinculción:
1. Miembro Comité Científico Evaluador del “XIV Congreso Regional Escolar de las Ciencias y la Tecnología Explora Región Metropolitana Sur Poniente” organizado por el Proyecto Asociativo Regional Explora de CONICYT Región Metropolitana Zona Sur Poniente.
2. Participación Festival de las Ciencias PAR Explora Región Metropolitana Sur Poniente. Noviembre 2020. Grupo de vinculación Centro de Genómica y Bioinformática.
3. Asesor Científico “Programa Protagonistas de la Ciencia”. PAR Explora Región Metropolitana Sur Poniente. Año 2020. Liceo Hospital de Paine.
4. Asesor Científico “Programa Protagonistas de la Ciencia”. PAR Explora Región Metropolitana Sur Poniente. Año 2020. Colegio Boston College Maipú.
5. Asesor científico empresa Maqui New Life. Área de investigación, desarrollo e innovación. Asesoría en área de Análisis de la respuesta inmune en salmónidos (2018 - a la fecha).
6. Miembro Comité Científico Evaluador del “Congreso Regional Explora de Investigación e Innovación Escolar” organizado por el Proyecto Asociativo Regional Explora de CONICYT Región Metropolitana Zona Sur Poniente AÑO 2021.
7. Asesor Científico “Programa Protagonistas de la Ciencia”. PAR Explora Región Metropolitana Sur Poniente. Año 2022. Colegio Forjadores de Peñaflor.
8. Participación Festival de las Ciencias PAR Explora Región Metropolitana Sur Poniente. Octubre 2022. Grupo de vinculación Centro de Genómica y Bioinformática y Doctorado en Genómica Integrativa.

Publicación en medios de difusión no indexados:
1. Reyes-Cerpa S., Valenzuela B., Maisey K., Toro-Ascuy D., Imarai M. Marcadores celulares. Herramientas para el estudio del sistema inmune en peces. Revista Versión Diferente Salmón – Acuícola 2011. 8 (15):74-77
2. Pérez C., Reyes-Cerpa S., Toro-Ascuy D., Cappelli C., González MJ., Guajardo S., Jashés M., Mlynarz G., Sandino AM., Imarai M. Immunetrack®I e Immunetrack®A. Kits para evaluar la respuesta innata y adaptativa de peces salmónidos. Revista Versión Diferente Salmón – Acuícola 2014.
11(20):76-77.
3. 3. Pérez-Stuardo D, Morales-Reyes J, Tapia S, Ahumada DE, Espinoza A, Soto-Herrera V, Brianson B, Ibaceta V, Sandino AM, Spencer E, Vallejos-Vidal E, Reyes-L.pez FE, Vald.s J, Reyes-Cerpa S. Piscirickettsia salmonis interfiere con la respuesta lisosomal de macrófagos de salmón del Atlántico. Revista Versión Diferente Salmón – Acuícola 2020. 80:40-49.

Reportajes:
1. Nota de difusión en RedBionova (Octubre 2018): Universidad Mayor lanza quinta convocatoria de su programa de formación de científicos especializados en genómica. Link:
http://www.redbionova.com/universidad-mayor-lanza-quinta-convocatoria-de-su-programa-deformacion-de-cientificos-especializados-en-genomica/
2. Nota de diffusion en revista Heureka (Noviembre 2018): “Tras la pista genómica del salmón” http://heureka-online.com/outreach/tras-la-pista-genomica-del-salmon-universidad mayor