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Víctor Hugo Castro Fernández

Profesor Asistente

UNIVERSIDAD DE CHILE

Ñuñoa, Chile

Biología Estructural, Evolución Molecular; Bioinformática Estructural; Biofísica de proteínas; Estabilidad térmica en proteínas, Evolución de especificidad en enzimas.

Licenciatura en Bioquímica, UNIVERSIDAD DE CONCEPCION. Chile, 2009
Doctorado en Ciencias, Mención Biología Molecular, Celular y Neurociencias, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2015
Bioquímico, UNIVERSIDAD DE CONCEPCION. Chile, 2010

Profesor Asistente Full Time

UNIVERSIDAD DE CHILE

Facultad de Ciencias

Santiago, Chile

2018 - A la fecha

Profesor Asistente Full Time

Universidad de Chile

Santiago, Chile

2018 - A la fecha

Pregrado:
• Felipe Alfonso Bravo Moraga, memoria para optar al título de Ingeniero en Bioinformática, Universidad de Talca, Talca-Chile, 2013. Co-director de tesis.
• Evelin Valeria González Feliú, memoria para optar al título de Ingeniero en Bioinformática, Universidad de Talca, Talca-Chile, 2015. Co-director de tesis.
• Macarena Andrea Kern Mikkels, seminario de título para optar al título de Ingeniero en Biotecnología Molecular, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago-Chile, 2016. Co-director
• Pablo Cea Medina, seminario de título para optar al título de Ingeniero en Biotecnología Molecular, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago-Chile. Director.
• Sebastian Manuel Muñoz Muñoz, seminario de título para optar al título de Ingeniero en Biotecnología Molecular, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago-Chile. 2020 Director.
• Nicolas Andres Fuentes Ugarte , seminario de título para optar al título de Ingeniero en Biotecnología Molecular, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago-Chile. 2020, Co-director.
• Sixto Herrera Morales, seminario de título para optar al título de Ingeniero en Biotecnología Molecular, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago-Chile. 2021, Co-director.
• Isaac Cortés Rubilar, seminario de título para optar al título de Ingeniero en Biotecnología Molecular, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago-Chile. 2024, Director.

Magíster:
• Felipe González Órdenes, tesis para optar al título de Bioquímico y Magister en Bioquímica, Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas, Universidad de Chile, Santiago-Chile, 2017. Co-tutor.
• Amparo Núñez. Tesis para optar al título de Bioquímico y Magister en Bioquímica, Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas, Universidad de Chile, Santiago-Chile, 2020. Co-tutor.
• Sebastian Manuel Muñoz Muñoz, Tesis de Magíster en Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago-Chile. 2020 Co-Director.
• Nicolas Andres Fuentes Ugarte, Tesis de Magíster en Ciencias Biológicas, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago-Chile. 2020, Director.

Doctorado:
• Gabriel Vallejos, Tesis para optar al grado de Doctor en Ciencias, mención Biología Molecular, Celular y Neurociencias. Universidad de Chile. Co-tutor.
• Felipe Gonzalez Ordenes, Tesis para optar al grado de Doctor en Ciencias, mención Biología Molecular, Celular y Neurociencias. Universidad de Chile. Co-tutor.


Deciphering Structural Traits for Thermal and Kinetic Stability across Protein Family Evolution through Ancestral Sequence Reconstruction Fuentes-Ugarte, Nicolas; Coche-Miranda, Jose; Maturana, Pablo; Guixe, Victoria Article ISI MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION (2024)
Glycogen metabolism in methanogens: A key pathway for metabolic response to nutrient availability Herrera-Soto, Nicolas; Aravena-Valenzuela, Ignacio; Urrutia-Santana, Andres; Guixe, Victoria Article ISI BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS (2024)
Metal Ions Can Modulate the Self-Assembly and Activity of Catalytic Peptide Amyloids Araya-Secchi, Raul; Soto-Bustamante, Eduardo Arturo; Monasterio, Octavio Article ISI LANGMUIR (2024)
Structural insights into a functional unit from an immunogenic mollusk hemocyanin Nascimento, Andrey F. Z.; Ambrosio, Andre L. B.; Guixe, Victoria Article ISI STRUCTURE (2024)
Kinetic characterization and phylogenetic analysis of human ADP-dependent glucokinase reveal new insights into its regulatory properties Cid, Dixon; Maturana, Pablo; Guixe, Victoria Article ISI ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS (2023)
Unraveling the folding and dimerization properties of the human FoxP subfamily of transcription factors Villalobos, Pablo; Babul, Jorge Article ISI FEBS LETTERS (2023)
Characterisation of kinetics, substrate inhibition and product activation by AMP of bifunctional ADP-dependent glucokinase/phosphofructokinase from Methanococcus maripaludis Guixe, Victoria Article ISI FEBS JOURNAL (2022)
The Emergence of New Catalytic Abilities in an Endoxylanase from Family GH10 by Removing an Intrinsically Disordered Region Rojas, Maximiliano; Guixe, Victoria; Vaca, Inmaculada; Levican, Gloria; Chavez, Renato Article ISI INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES (2022)
Crystal structure and molecular dynamics simulations of a promiscuous ancestor reveal residues and an epistatic interaction involved in substrate binding and catalysis in the ATP-dependent vitamin kinase family members Hernandez-Cabello, Leslie; Guixe, Victoria Article ISI PROTEIN SCIENCE (2021)
Crystal Structure of Escherichia coli Agmatinase: Catalytic Mechanism and Residues Relevant for Substrate Specificity Maturana, Pablo; Orellana, Maria S.; Herrera, Sixto M.; Figueroa, Maximiliano; Uribe, Elena Article ISI INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES (2021)
Characterization of hydroxymethylpyrimidine phosphate kinase from mesophilic and thermophilic bacteria and structural insights into their differential thermal stability Vallejos, Gabriel; Babul, Jorge; Guixe, Victoria Article ISI ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS (2020)
Free radicals derived from ?-radiolysis of water and AAPH thermolysis mediate oxidative crosslinking of eGFP involving Tyr-Tyr and Tyr-Cys bonds: the fluorescence of the protein is conserved only towards peroxyl radicals Zamora R.A.; Mura F.; Rojas, T Article ISI SCOPUS Free Radical Biology and Medicine (2020)
Single-Nucleotide Polymorphisms (SNP) Mining and Their Effect on the Tridimensional Protein Structure Prediction in a Set of Immunity-Related Expressed Sequence Tags (EST) in Atlantic Salmon (Salmo salar) Reyes-LÃ³pez F.E. Article ISI SCOPUS FRONTIERS IN GENETICS (2020)
Tuning of Conformational Dynamics Through Evolution-Based Design Modulates the Catalytic Adaptability of an Extremophilic Kinase Villalobos, Pablo; Maturana, Pablo; Guixe, Victoria Article ISI ACS CATALYSIS (2020)
ADP-dependent kinases from the archaeal order Methanosarcinales adapt to salt by a non-canonical evolutionarily conserved strategy Gonzalez-Ordenes, Felipe; Cea, Pablo; Fuentes, Nicolas; Muñoz, Sebastian; Zamora, Ricardo=> Leonardo; Diego, Garratt; Richard C, Castro-Fernandez; Victor*, Guixe Article FRONTIERS IN MICROBIOLOGY (2018)
Protein topology determines substrate-binding mechanism in homologous enzymes Merino F.; RamÃrez-Sarmiento C.A.; GuixÃ© V. Article ISI SCOPUS Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects (2018)
ADP-dependent phosphofructokinases from the archaeal order Methanosarcinales display redundant glucokinase activity Zamora, RA; Gonzalez-Ordenes, F; Castro-Fernandez, V; Guixe, V Article ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS (2017)
Reconstructed ancestral enzymes reveal that negative selection drove the evolution of substrate specificity in ADP-dependent kinases Castro-Fernandez, V.; Herrera-Morande, A.; Zamora, R.; Merino, F.; Gonzalez-Ordenes, F.; Padilla-Salinas, F.; Pereira, H.M.; Brandão-Neto, J.; Garratt, R.C.; Guixe, V. Article JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY (2017)
Unusual dimerization of a BcCsp mutant leads to reduced conformational dynamics Carvajal, Alonso I.; Komives, Elizabeth A.; Castro-Fern?ndez, V?ctor; Leonardo, Diego A.; Garratt, Richard C.; Ram?rez-Sarmiento, C?sar A. Article ISI SCOPUS FEBS JOURNAL (2017)
Structural and functional analysis of the ASM p.Ala359Asp mutant that causes acid sphingomyelinase deficiency Latorre, M; Castro, J.; Schuchman EH; Zanlungo S. Article ISI SCOPUS BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS (2016)
Bifunctional ADP-dependent phosphofructokinase/ glucokinase activity in the order Methanococcales biochemical characterization of the mesophilic enzyme from Methanococcus maripaludis Castro-Fernandez, Victor; Bravo-Moraga, Felipe; Herrera-Morande, Alejandra; Guixe, Victoria Article The FEBS Journal (2014)
Bifunctional ADP-dependent phosphofructokinase/ glucokinase activity in the order Methanococcales biochemical characterization of the mesophilic enzyme from Methanococcus maripaludis Castro-Fernandez, Victor; Bravo-Moraga, Felipe; Herrera-Morande, Alejandra; Guixe, Victoria Article ISI SCOPUS FEBS JOURNAL (2014)
Emergence of pyridoxal phosphorylation through a promiscuous ancestor during the evolution of hydroxymethyl pyrimidine kinases Castro-Fernandez, Victor; Bravo-Moraga, Felipe; Ramirez-Sarmiento, Cesar A; Guixe, Victoria Article ISI SCOPUS FEBS LETTERS (2014)
Emergence of pyridoxal phosphorylation through a promiscuous ancestor during the evolution of hydroxymethyl pyrimidine kinases Castro-Fernandez, Victor; Bravo-Moraga, Felipe; Ramirez-Sarmiento, Cesar A; Guixe, Victoria Article FEBS Letters (2014)
Crystal Structure, SAXS and Kinetic Mechanism of Hyperthermophilic ADP-Dependent Glucokinase from Thermococcus litoralis Reveal a Conserved Mechanism for Catalysis Rivas-Pardo, JA; Herrera-Morande, A; Castro-Fernandez, V; Fernandez, FJ; Vega, MC; Guixe, V Article PLOS ONE (2013)
Crystal structure, SAXS and kinetic mechanism of hyperthermophilic ADP-dependent glucokinase from Thermococcus litoralis reveal a conserved mechanism for catalysis. Rivas-Pardo, Jaime Andrés; Herrera-Morande, Alejandra; Castro-Fernandez, Victor; Fernandez, Francisco J; Vega, M Cristina; Guixé, Victoria Article PloS one (2013)
Evidence for an inhibitory LIM domain in a rat brain agmatinase-like protein Castro, V; Fuentealba P.; Henríquez Á.; Vallejos A.; Benitez, J.; Lobos, M.; Diaz, B; Carvajal N.; Uribe, E Article ISI SCOPUS Archives of Biochemistry and Biophysics (2011)
Expression and localization of an agmatinase-like protein in the rat brain Mella C.; Martinez F.; Garcia, MD; Nualart, F.; Castro, V; Bustos, P.; Carvajal N.; Uribe, E Article ISI SCOPUS Histochemistry and Cell Biology (2010)


Cold-Adapted ADP-Dependent Sugar Kinase: Biophysical and Evolutionary Study of its Flexibility. Abstract ISI PROTEIN SCIENCE (2017)
Biophysical and evolutionary study of the structural flexibility of ADP-dependent sugar kinases from mesophilic and psychrophilic archaea Abstract ISI FEBS JOURNAL (2016)
Biochemical and immunohistochemical analysis of an unusual rat brain agmatinase Uribe, EA; Mella C.; Castro, V; Martinez F.; Garcia, MD; Bustos, P.; Carvajal N. Abstract ISI FASEB JOURNAL (2009)


Evolution, Metabolism and Molecular Mechanisms Underlying Extreme Adaptation of Euryarchaeota and Its Biotechnological Potential Guixe, Victoria BookSection (2017)


Estudio evolutivo de la resistencia mecánica de pilinas y generación de péptidos inhibidores generalistas diseñados a partir de sus secuencias ancestrales. Villalobos, Pablo Proyecto (2023)
Structural and functional characterization of LIMCH1: a critical enzyme for regulation of agmatine levels in mammals Uribe, Elena Amparo Proyecto (2023)
Unveiling the allosteric regulation of central carbon metabolism in Archaea through kinetic, structural, and evolutive studies of key enzymes Vallejos, Gabriel Proyecto (2023)
Using computational multiscale methods and spectrofluorimetric/X-ray experiments in the search for enhanced inhibitors for protein kinases and HMP-kinases: The phosphoryl transfer as a model reaction to fight antibiotic resistance and cancer Alzate, Jans Proyecto (2023)
Structural and evolutionary relationships in vitamin kinases: functional novelty, catalytic mechanism and thermal stability Guixe, Victoria; Vallejos, Gabriel Proyecto (2022)
Spreading the "resolution revolution" across Latin American through cryo-EM studies of a mollusk hemocyanin, with substantial biomedical impact Guixe, Victoria Proyecto (2020)
Estudio de adaptaciones estructurales y funcionales en enzimas mediante reconstrucción de proteínas ancestrales y cristalografía de rayos X. Proyecto (2018)
Paleoenzymology=> Unraveling structural and catalytic adaptations in enzymes that opens new biotechnological opportunities. FONDECYT (11181133) Proyecto 2018-2020 Inv. Responsable
RED DE APOYO PARA EL DESARROLLO DE LA CRISTALOGRAFIA DE PROTEINAS EN CHILE PCI (REDI170497) Proyecto 2018-2019 Inv. Responsable
Unraveling structural and catalytic adaptations in enzymes that opens new biotechnological opportunities. Proyecto (2018)
X-ray diffractions of proteins from a Chilean crystallization facility 2018 LNLS (Brazil) (20170963) Proyecto 2018-2018 Inv. Principal
Effect of ionic strength on oligomerization state of ADP-dependent kinases from Methanosarcinales Archaeas. LNLS (Brazil) (20160372) Proyecto 2016-2016 Inv. Principal
EVOLUCIÓN DE LA CINÉTICA DE DESPLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS=> EFECTO DE CAMBIOS TOPOLÓGICOS Y DE ESTABILIDAD DURANTE LA EVOLUCIÓN DE PROTEÍNAS CON ARQUITECTURA RIBOQUINASA. FONDECYT (3160332) Proyecto 2015-2018 Inv. Responsable
Evolutionary trace of ligand-induced dimerization in ADP-dependent kinases from Methanosarcinales Archaeas LNLS (Brazil) (20150198) Proyecto 2015-2015 Inv. Principal
Tracing the evolution of the ADP-dependent kinase family: Structural determinants for catalytic properties and thermal adaptations. Guixe, Victoria Proyecto (2015)
TRACING THE EVOLUTION OF THE ADP-DEPENDENT KINASE FAMILY=> STRUCTURAL DETERMINANTS FOR CATALYTIC PROPERTIES AND THERMAL ADAPTATIONS FONDECYT (1150460) Proyecto 2015-2019 Coinvestigador(a)
Training in optical tweezers methodology at Bustamante Group, University of California, Berkeley, USA. 2014 Promoting Research Opportunities for Latin American Biochemists. American Society for Biochemistry and Molecular Biology (161547107) Proyecto 2014-2014 Inv. Responsable
Apoyo de tesis de doctorado=> Resurrección de enzimas ancestrales=> historia evolutiva de la especificidad por sustratos en la familia de quinasas de azúcares dependientes de ADP de arqueas. PFCHA (24121448) Proyecto 2012-2014 Inv. Responsable
Protein crystallization trials with ancestral protein at IFSC, USP. Brazil. AMSUD-PASTEUR (161547107) Proyecto 2011-2011 Inv. Responsable

Elena Uribe

Associate Professor

Biochemistry and Molecular Biology

UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

Concepción, Chile

Jorge Babul

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

Victoria Guixé

Titular Profesor

Biology

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

Camilo López

prof. Asociado

Química Física

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE

Santiago, Chile

FRANCISCO NUALART

Full Professor and Scientific Director

Cellular Biology and Center for Advanced Microscopy CMA BIO-BIO

UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

Concepcion, Chile

María García

Profesor Titular

Biología Celular

UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

Concepción, Chile

Inmaculada Vaca

Associate Professor

Chemistry Department

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

Jans Alzate

Associate Professor

Departamento de Bioinformática

UNIVERSIDAD DE TALCA

Talca, Chile

Gloria Levican

Académica Profesora Titular

Departamento de Biología

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Santiago, Chile

Carmen Imarai

Profesor Titular

Biología

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Santiago, Chile

Maximiliano Figueroa

Profesor Asociado

Bioquímica y Biología Molecular

UNIVERSIDAD DE CONCEPCIÓN

Concepción, Chile

ALEXIS ASPEE

Profesor Titular

Ciencias del Ambiente

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Santiago, Chile

Mauricio Gonzalez

Profesor Titular

INTA

UNIVERSIDAD DE CHILE - INSTITUTO DE NUTRICION Y TECNOLOGIA DE ALIMENTOS

Santiago, Chile

Andrea Rivas

Investigadora

Universidad San Sebastián

Santiago, Chile

Fernando Gonzalez

Titular Professor

Facultad de Ciencias de la Vida

Universidad Andres Bello

Santiago, Chile

Felipe Reyes

Assistant professor

Universidad de S

Santiago de Chile, Chile

Claudio Meneses

Profesor Asociado

Facultad de Agronomía y Sistemas Naturales

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

Silvana Zanlungo

Full Professor

Gastroenterology

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

Fernando Martinez

Assistant Professor

Cell Biology

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

Víctor Castro

Profesor Asistente

Departamento de Biología

UNIVERSIDAD DE CHILE

Ñuñoa, Chile

Alejandra Herrera

PROFESORA ASISTENTE

QUÍMICA Y FISICA

Universidad Autónoma de Chile

TALCA, Chile

Francisco Mura

Investigador postdoctoral

Química y Biología

Universidad de Santiago de Chile

Santiago, Chile

Ricardo Zamora

Researcher Assistant

Universidad de Talca

Talca, Chile

Pablo Fuentealba

Investigador Post Doctoral

Ingeniería

University of South Florida

Tampa, Estados Unidos

CESAR RAMIREZ

Assistant Professor

Institute for Biological and Medical Engineering

Pontificia Universidad Catolica de Chile

Santiago, Chile

Jaime Rivas

Profesor Asociado

Facultad de Ciencias

Universidad Mayor

Santiago, Chile

Adolfo Henríquez

Profesor Asistente

Departamento de Química Analítica e Inorgánica

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

Pablo Villalobos

Investigador postdoctoral

Biología

Universidad de Chile

Santiago, Chile

Pablo Barrías

Profesor por hora

Ciencias del Ambiente

Universidad de Santiago de Chile

Santiago, Chile

Eduardo Fuentes

Profesor Asistente

Química Física

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

Eva Vallejos

Profesor Asociado

Facultad de Medicina Veterinaria y Agronomía

Universidad de Las Américas

Santiago, Chile

Ana Sandino

Profesor Titular

Biología

Universidad de Santiago de Chile

Santiago, Chile

Raul Araya

Profesor Asistente

Facultad de Ingenieria y Tecnologia

Universidad San Sebastián

Santiago, Chile

Carlos Gil

Coordinador del area de Biotecnología

Spora SPA

Santiago de Chile, Chile

Gabriel Vallejos

Investigador postdoctoral

Departamento de Biología

Universidad de Chile

Santiago, Chile

Romina Sepúlveda

Profesor Investigador

Facultad de Ciencias Biológicas

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

Víctor Hugo Castro Fernández

Líneas de Investigación

Educación

Licenciatura en Bioquímica, UNIVERSIDAD DE CONCEPCION. Chile, 2009

Doctorado en Ciencias, Mención Biología Molecular, Celular y Neurociencias, UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2015

Bioquímico, UNIVERSIDAD DE CONCEPCION. Chile, 2010

Experiencia Académica

Profesor Asistente Full Time

Experiencia Profesional

Profesor Asistente Full Time

Formación de Capital Humano

Article (28)

Abstract (3)

BookSection (1)

Proyecto (19)

Paleoenzymology=> Unraveling structural and catalytic adaptations in enzymes that opens new biotechnological opportunities.

RED DE APOYO PARA EL DESARROLLO DE LA CRISTALOGRAFIA DE PROTEINAS EN CHILE

X-ray diffractions of proteins from a Chilean crystallization facility 2018

Effect of ionic strength on oligomerization state of ADP-dependent kinases from Methanosarcinales Archaeas.

EVOLUCIÓN DE LA CINÉTICA DE DESPLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS=> EFECTO DE CAMBIOS TOPOLÓGICOS Y DE ESTABILIDAD DURANTE LA EVOLUCIÓN DE PROTEÍNAS CON ARQUITECTURA RIBOQUINASA.

Evolutionary trace of ligand-induced dimerization in ADP-dependent kinases from Methanosarcinales Archaeas

TRACING THE EVOLUTION OF THE ADP-DEPENDENT KINASE FAMILY=> STRUCTURAL DETERMINANTS FOR CATALYTIC PROPERTIES AND THERMAL ADAPTATIONS

Training in optical tweezers methodology at Bustamante Group, University of California, Berkeley, USA. 2014 Promoting Research Opportunities for Latin American Biochemists.

Apoyo de tesis de doctorado=> Resurrección de enzimas ancestrales=> historia evolutiva de la especificidad por sustratos en la familia de quinasas de azúcares dependientes de ADP de arqueas.

Protein crystallization trials with ancestral protein at IFSC, USP. Brazil.