Man

Romina Victoria Sepúlveda Sepúlveda

Profesor Investigador

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

Líneas de Investigación


Mis lineas de investigación están dedicadas a resolver problemas biológicos con estrategias computacionales para el entendimiento de fenómenos biofísicos y moleculares.

Educación

  •  Bioinformática, UNIVERSIDAD ANDRES BELLO. Chile, 2018
  •  Ingeniero en Bioinformática, UNIVERSIDAD DE TALCA. Chile, 2011

Experiencia Académica

  •   FONDECYT Postdoctorado Full Time

    UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

    Ciencias Biologicas

    Santiago, Chile

    2020 - 2022

  •   Profesor asistente Full Time

    UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

    Ciencias Biologicas

    Santiago, Chile

    2022 - A la fecha

Experiencia Profesional

  •   PostDoc FONDEF ID19I10160 Full Time

    UNAB

    Santiago, Chile

    2020 - 2020

  •   Senior Bioinformatician Full Time

    uBiome

    Santiago, Chile

    2018 - 2019

  •   Tesista doctoral Full Time

    Universidad Andres Bello

    Santiago, Chile

    2013 - 2018

  •   PostDoc Full Time

    Universidad Andres Bello

    Chile

    2020 - 2022

Formación de Capital Humano


Dirección de tesis:

Licenciatura en Biología, Universidad Andrés Bello
2024 "Diseño de moléculas moduladores del canal TRPV1 con Inteligencia Artificial" Javier Roumaeu

Ingeniería en Bioinformática, Universidad Andrés Bello
2022 "Despliegue en la nube del software AgroIA implementando la infraestructura con los servicios de Amazon Web Services" Juan Pablo Calderon Soto
2022 "Caracterización de las diferencias en especificidad de transportadores de nucleotidos de azúcar URGT2 y UXT1 de Arabidopsis thaliana a traves de simulación molecular" Maricarmen Osses

Ingeniería en Biotecnología Universidad Andrés Bello
2022 “Análisis y elaboración de un modelo in silico para 2 proteasas romboides (AtRBL10 Y AtRBL13) de Arabidopsis thaliana para el estudio de la relación entre secuencia y función”, Luis Cifuentes Ahumada.


Premios y Distinciones

  •   Travel fellowship from Centro Latinoamericano de Formación Interdisciplinaria (CELFI) to attend the international course Curso de Simulación computacional avanzada en Química, Bioquímica y Ciencias de Materiales, Universidad de Buenos Aires (UBA), Buenos

    UNIVERSIDAD DE BUENOS AIRES

    Argentina, 2015

    Travel fellowship

  •   Escuela Complutense de Verano ECV Bioinformática y Biología Computacional

    FUNDACION CAROLINA

    España, 2014

    Travel fellowship from Fundacion Carolina to attend Escuela Complutense de Verano ECV Bioinformática y Biología Computacional, Universidad Complutense de Madrid, Madrid, Spain

  •   Beca Doctoral CONICYT 2013

    CONICYT

    Chile, 2013

    Beca formación de capital humano avanzado

  •   FONDECYT INICIACIÓN

    ANID

    Chile, 2025

    FONDECYT INICIACION 2025

  •   FONDECYT POSTDOCTORADO

    ANID

    Chile, 2020

    FONDECYT POSTDOCTORADO ANID-3200951


 

Article (23)

MET Exon 14 Skipping and Novel Actionable Variants: Diagnostic and Therapeutic Implications in Latin American Non-Small-Cell Lung Cancer Patients

Rivas, Solange; Tapia, Ignacio; Estay, Catalina

Article ISI
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES  (2024)

Unveiling Novel Urease Inhibitors for Helicobacter pylori: A Multi-Methodological Approach from Virtual Screening and ADME to Molecular Dynamics Simulations

Bustos, Daniel

Article ISI
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES  (2024)

WS-YOLO: An Agronomical and Computer Vision-Based Framework to Detect Drought Stress in Lettuce Seedlings Using IR Imaging and YOLOv8

Wolter-Salas, Sebastian; OPAZO-DELGADO, MARIA CECILIA

Article SCOPUS
Communications in Computer and Information Science  (2024)

Insights into Early Steps of Decanoic Acid Self-Assemblies under Prebiotic Temperatures Using Molecular Dynamics Simulations

Gonzalez-Nilo, Fernando

Article ISI
MEMBRANES  (2023)

The Emergence of New Catalytic Abilities in an Endoxylanase from Family GH10 by Removing an Intrinsically Disordered Region

Rojas, Maximiliano; Guixé, Victoria; Vaca, Inmaculada; Levican, Gloria; Chavez, Renato

Article ISI
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES  (2022)

A method for characterizing the thermal stability and antimicrobial binding to Lipopolysaccharides of Gram-negative isogenic mutant strains

Navarro, Belen; Alarcon, Mackarenna; Osees, Maricarmen

Article ISI
METHODSX  (2021)

A rationally designed orthogonal synthetase for genetically encoded fluorescent amino acids

Nasir, Gibran; Gonzalez-Nilo, Fernando; Brauchi, Sebastian E.

Article ISI
HELIYON  (2020)

Novel TRPV1 Channel Agonists With Faster and More Potent Analgesic Properties Than Capsaicin

Arriagada, Diego; Olivares, Pedro; Stehberg, Jimmy; Gonzalez-Nilo, Fernando

Article ISI
FRONTIERS IN PHARMACOLOGY  (2020)

The molecular nature of the 17 beta-Estradiol binding site in the voltage- and Ca2+-activated K+ (BK) channel beta 1 subunit

Sepúlveda R.V.; Lorenzo-Ceballos Y.

Article ISI SCOPUS
SCIENTIFIC REPORTS  (2019)

Heterologous expression, purification and characterization of three novel esterases secreted by the lignocellulolytic fungus Penicillium purpurogenum when grown on sugar beet pulp

Oleas, G; Callegari, E.; Sepúlveda R.V., and Eyzaguirre J.

Article
CARBOHYDRATE RESEARCH  (2017)

Increasing the intracellular isoprenoid pool in Saccharomyces cerevisiae by structural fine-tuning of a bifunctional farnesyl diphosphate synthase

Rubat, Sebastián; Varas, Ignacio; Sepúlveda, Romina

Article ISI
FEMS YEAST RESEARCH  (2017)

MOLECULAR DETERMINANTS OF BK CHANNEL FUNCTIONAL DIVERSITY AND FUNCTIONING

Castillo, Karen; Carrasquel-Ursulaez, Willy; Sepulveda, Romina V.

Article ISI SCOPUS
PHYSIOLOGICAL REVIEWS  (2017)

Structural determinants of 5 ',6 '-epoxyeicosatrienoic acid binding to and activation of TRPV4 channel

Berna-Erro, Alejandro; Izquierdo-Serra, Mercè; Rubio-Moscardo, Fanny; Doñate-Macián, Pau; Serra, Selma A.; Carrillo-Garcia, Julia; Perálvarez-Marín, Alex; Fernández-Fernández, José M.; Valverde, Miguel A.

Article ISI SCOPUS
SCIENTIFIC REPORTS  (2017)

beta 1-subunit-induced structural rearrangements of the Ca2+- and voltage-activated K+ (BK) channel

Aguayo, D; Sepúlveda R.V.; Luk L.Y.P.; Kent S.B.H.; Gonzalez-Nilo, F. D.; Bezanilla, F; Latorre R.

Article ISI SCOPUS
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA  (2016)

Structure-Driven Pharmacology of Transient Receptor Potential Channel Vanilloid 1

Caceres-Molina, J.; Sepulveda, R. V.

Article ISI SCOPUS
Molecular Pharmacology  (2016)

Effects of the Accessory Subunit gamma 1 on the External Architecture of BK Channel

Castillo, Juan P.; Lorenzo, Yenisleidy; Bezanilla, Francisco

Article ISI
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2015)

Hydrophobic interaction between contiguous residues in the S6 transmembrane segment acts as a stimuli integration node in the BK channel

Carrasquel-Ursulaez, W; Contreras G.F.; Sepúlveda R.V.; Aguayo, D; Gonzalez-Nilo, F; ., González, C.; Latorre R.

Article ISI SCOPUS
JOURNAL OF GENERAL PHYSIOLOGY  (2015)

Interaction between the Linker, Pre-S1, and TRP Domains Determines Folding, Assembly, and Trafficking of TRPV Channels

Garcia-Elias, A; Berna-Erro, A; Rubio-Moscardo, F; Pardo-Pastor, C; Mrkonjic, S; Vicente R.; Gonzalez-Nilo, F; Valverde, MA

Article ISI SCOPUS
Structure  (2015)

Molecular Determinants of Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate (PI(4,5)P-2) Binding to Transient Receptor Potential V1 (TRPV1) Channels

Poblete, H.; Oyarzun, I; Olivero P.; Comer, J.; Zúñiga M; Sepúlveda R.V.; Baez-Nieto, D; Gonzalez-Nilo, F; Latorre R.

Article ISI SCOPUS
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY  (2015)

Pore dimensions and the role of occupancy in unitary conductance of Shaker K channels

Diaz-Franulic, I; Navarro-Quezada, N; Gonzalez-Nilo, F; Naranjo, D

Article ISI SCOPUS
Journal of General Physiology  (2015)

Substitutions at F380 in S6 by Small Hydrophobic Amino Acids Makes the Opening Transition in BK Channels Rate Limiting

Contreras, Gustavo F.

Article ISI
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2014)

Turning a Small into Large Conductance K-Channel - How Far Can We Go?

Navarro, Nieves; Gonzalez-Nilo, Fernando; Naranjo, David

Article ISI
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2014)

K+ Conduction and Mg2+ Blockade in a Shaker Kv-Channel Single Point Mutant with an Unusually High Conductance

Moscoso, C.; Vergara-Jaque, A; Marquez-Miranda, V; Sepúlveda R.V.; Valencia I.; Diaz-Franulic, I; Gonzalez-Nilo, F; Naranjo, D

Article ISI SCOPUS
Biophysical Journal  (2012)

Abstract (4)

Thermal Diffusion Pathways of TRPV1

Gomez-Becerra, FA; Mino-Galazi, G

Abstract ISI
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2018)

17 beta-Estradiol Binds and Modulates BK Channel through its beta 1 Auxiliary Subunit



Abstract ISI
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2016)

Structural Characterization of Ligand-Specific Interactions in TRPV1 Channel: Gating Mechanism by Capsaicin and Capsazepine



Abstract ISI
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2016)

Rational discovery of new capsaicin analogues as TRPV1 activators

Caceres J.; sepulveda, r; Navas C.; Latorre R.; Gonzalez-Nilo, F

Abstract ISI SCOPUS
BMC Bioinformatics  (2015)

1
Victoria Guixé

Titular Profesor

Biology

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

6
ramon latorre

Profesor

Instituto de Neurociencia

Universidad de Valparaíso

5, Chile

1
Ricardo Armisen

Associate Professor

Centro de Genética y Genómica

Universidad del Desarrollo

Santiago, Chile

1
Inmaculada Vaca

Associate Professor

Chemistry Department

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Karen Castillo

Académica Investigadora

,Centro de Investigación de Estudios Avanzados del Maule (CIEAM)

Universidad Catolica del Maule

Talca, Chile

1
Jimmy Stehberg

Associate Professor

Biological Sciences

UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO

SANTIAGO, Chile

1
Gloria Levican

Académica Profesora Titular

Departamento de Biología

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Santiago, Chile

2
David Naranjo

Profesor titular

Neurociencia

Universidad de Valparaíso

VALPARAISO, Chile

2
Maria Opazo

Profesor Asociado

Universidad de Las Américas

Santiago, Chile

13
Fernando Gonzalez

Titular Professor

Facultad de Ciencias de la Vida

Universidad Andres Bello

Santiago, Chile

4
Daniel Aguayo

Associate Professor

ITISB

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Viña del Mar, Chile

1
Ricardo Castro

investigador

Instituto de ciencias químicas aplicadas

Universidad Autonomade Chile

Talca, Chile

1
GUSTAVO CONTRERAS

Centro Interdisciplinario de Neurociencias de Valparaíso

Valparaiso, Chile

1
Víctor Castro

Profesor Asistente

Departamento de Biología

UNIVERSIDAD DE CHILE

Ñuñoa, Chile

3
Ignacio Diaz

Profesor asistente

Centro e Bioinformatica y Biologia Integrativa

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Bruna Benso

Profesora Asistente

Facultad de Medicina

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Horacio Poblete

Profesor Conferenciante

Universidad de Talca

Talca, Chile

1
YORLEY DUARTE

profesor Asistente

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
ximena steinberg

Colaborador Docente

Bioquímica y Biologpia Molecular

Universidad de Concepción

Concepcion, Chile

1
Víctor Rojas

PhD Student in Traslational Biotechnology

Universidad Católica del Maule

Talca, Chile

1
Daniel Bustos

Auxiliar Professor

Vicerrectoría de Investigación y Postgrado

Universidad Católica del Maule

Talca, Chile

1
Matías Zúñiga

Postdoctorado

Centro de Bioinformática y Simulación Molecular

Universidad de Talca

TALCA, Chile

1
VALERIA MARQUEZ

Profesor Asistente

Centro de Nanotecnologia Aplicada

Universidad Mayor de Chile

SANTIAGO, Chile

1
Melissa Alegría

Académico Asociado

Facultad de Ingeniería y Negocios

Universidad de Las Américas

Santiago, Chile

1
Carlos Gil

Coordinador del area de Biotecnología

Spora SPA

Santiago de Chile, Chile

1
Juan Castillo

lecturer

physics department

Universidad de Santiago de Chile

santiago, Chile

26
Romina Sepúlveda

Profesor Investigador

Facultad de Ciencias Biológicas

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Nieves Navarro

Lab Manager

Biología Molecular

Centro interdisciplinario de neurociencia de Valparaíso

Valparaíso, Chile