Sistemas biomoleculares fotoactivos. Aplicación de métodos teórico-computacionales para estudiar sistemas biomoleculares. Fotosensibilización y fotoabsorción. Diseño de fármacos asistido por computadoras. Investigación traslacional

Tesis de Postgrado: 4.

Tesis Doctorales (2):

1) Autor de Tesis Doctoral: Lic. José L. Velázquez Libera.
Título de Tesis Doctoral: "Identificación de Mecanismos de Catálisis de la Arginasa I del Humano".
Programa Doctoral: "Doctorado en Ciencias".
Institución del Programa Doctoral: Universidad de Talca.
Año: 2020.
Ciudad: Talca.
Rol en la Tesis Doctoral: Co-tutor.

2) Autor de Tesis Doctoral: Ing. Daniel M. Bustos Guajardo.
Título de Tesis Doctoral: "Structural study of K2P channels: from the intracellular gating to the CAP".
Programa Doctoral: "Doctorado en Ciencias Aplicadas".
Institución del Programa Doctoral: Universidad de Talca.
Año: 2019.
Ciudad: Talca.
Rol en la Tesis Doctoral: Co-tutor.

Tesis de Especialidad Médica (2):

3) Autor de Especialidad Médica: Dr. Raidel Correa Aguila..
Título de Especialidad Médica: "Evaluación de la estructura y de la disponibilidad del oxígeno molecular en rodopsinas humanas mutantes".
Programa de Especialidad Médica: Bioquímica Clínica.
Institución del Programa de Especialidad Médica: Universidad de Ciencias Médicas de La Habana.
Año: 2016.
Ciudad: La Habana.
Rol en la Tesis de Especialidad Médica: Tutor.

4) Autor de Especialidad Médica: Dr. Carlos Manuel González Casimiro.
Título de Especialidad Médica: "Relación de la evolución de rodopsinas con requerimientos para la generación foto-inducida del oxígeno singlete".
Programa de Especialidad Médica: Bioquímica Clínica.
Institución del Programa de Especialidad Médica: Universidad de Ciencias Médicas de La Habana.
Año: 2016.
Ciudad: La Habana.
Rol en la Tesis de Especialidad Médica: Tutor.

Tesis de Grado (3):

5) Autor de Tesis de Grado: Maira Vidal Valenzuela.
Título de Tesis de Grado: "Asignación de estados de protonación en rodopsina bovina mediante métodos de modelado molecular".
Programa de Grado: Ingeniería en Biotecnología.
Institución del Programa de Grado: Universidad Católica del Maule.
Año: 2021.
Ciudad: Talca.
Rol en la Tesis de Grado: Tutor.

6) Autor de Tesis de Grado: Julio C. Vieyto Núñez.
Título de Tesis de Grado: "Implementación de una metodología teórico-computacional para modelar estructuras sacáridas del serotipo 5 del Streptococcus pneumoniae".
Programa de Grado: Química.
Institución del Programa de Grado: Universidad de La Habana.
Año: 2016.
Ciudad: La Habana.
Rol en la Tesis de Grado: Co-tutor.

7) Autor de Tesis de Grado: Roy González Alemán.
Título de Tesis de Grado: "Efectos de sustituyentes en la conformación de la unidad repetida del serotipo 18C del Streptococcus pneumoniae".
Programa de Grado: Química.
Institución del Programa de Grado: Universidad de La Habana.
Año: 2015.
Ciudad: La Habana.
Rol en la Tesis de Grado: Co-tutor.

Prácticas Profesionales (2):

8) Estudiante: Camila A. Fuentes Chamorro.
Actividad Curricular: "IBI-413 (Práctica III)".
Título de Práctica: "Modelamiento molecular para racionalizar y predecir propiedades de la rodopsina bovina".
Programa de Grado: Ingeniería en Biotecnología.
Institución del Programa de Grado: Universidad Católica del Maule.
Año: 2020.
Ciudad: Talca.
Rol en la Práctica Profesional: Tutor.

9) Estudiante: Lic. José L. Velázquez Libera.
Actividad Curricular: "Unidad de Investigación I".
Programa Doctoral: "Doctorado en Ciencias con Mención en Modelado de Sistemas Químicos y Biológicos".
Institución del Programa Doctoral: Universidad de Talca.
Año: 2019.
Ciudad: Talca.
Rol en la Práctica de Investigación: Supervisor.

- Director Fundador del Laboratorio de Bioinformática y Química Computacional de la Facultad de Medicina de la Universidad Católica del Maule. 2020 - hasta la fecha.

- Director Fundador del Departamento de Medicina Traslacional de la Facultad de Medicina de la Universidad Católica del Maule. 2022 - hasta la fecha.

- Encargado de la Comisión para la Creación de la Carrera de Bioingeniería Médica de la Facultad de Medicina de la Universidad Católica del Maule. 2019-2021.

- 2021 IEEE International Conference on Automation/XXIV Congress of the Chilean Association of Automatic Control, 2021, Valparaíso, Chile. Brief tutorial to evaluate molecular cavities in large conformational ensembles: a K2P channel study case (Co-autor).

- Webinar: "I Simposio Online de Bioinformática de la Universidad Católica del Maule, Bioinformática en una Mirada Multidisciplinaria", 2020, Talca, Chile. Conferencia: "Introducción a los métodos QM/MM para sistemas biomoleculares" (Autor).

- Third International Conference in Bioinformatics, Simulations and Modeling (iC-BSM) 2019, 2019, Talca, Chile. An amino acid substitution improves photosensitization conditions in the rhodopsin binding pocket (Autor).

- Third International Conference in Bioinformatics, Simulations and Modeling (iC-BSM) 2019, 2019, Talca, Chile. Molecular dynamics simulations provide insights into the enzyme-substrate complex structure of human Arginase I (Co-autor).

- 9th International Symposium on OMICS and Bioinformatics, 2019, La Habana, Cuba. BitClust: Fast conformational clustering of long Molecular Dynamics simulations (Co-autor).

- XLII Annual Meeting of the Chilean Biochemistry and Molecular Biology Society. XIV Annual Meeting of the Chilean Society of Plant Biologists, 2019, Iqui-que, Chile. Molecular dynamics simulations provide insights into the enzyme-substrate complex structure of human Arginase I (Co-autor).

- XLI Reunión Anual de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular, 2018, Iquique, Chile. A synchronized mechanism for extracellular pH-sensing in TASK-2 K2P channel (Co-autor).

- 11th Seminars of Advanced Studies on Molecular Design and Bioinformatics (SEADIM), 2017, La Habana-Varadero, Cuba. Computing Dioxygen Migration Pathways in Bovine Rhodopsin (Autor).

- Second International Conference in Bioinformatics, Simulations and Modeling (iC-BSM) 2017, 2017, Talca, Chile. Modelling Starting Enzyme-Substrate Complexes from Human Arginase I by Satisfaction of Spatial Restraints (Co-autor).

- Conferencia para estudiantes de postgrado: “Aplicación de híbridos de mecánica cuántica/mecánica molecular para calcular propiedades espectrales de proteínas fotoactivas”. Curso: "Tópicos de Bioinformática". Programa: "Doctorado en Ciencias con Mención en Modelado de Sistemas Químicos y Biológicos", 2017, Universidad de Talca, Talca, Chile (Autor).

- Conferencia para estudiantes de pregrado: “Modelación computacional de propiedades estructurales y espectrales de rodopsinas, mediante esquemas híbridos de mecánica cuántica/mecánica molecular”. Curso: "Biofísica". Programa: "Ingeniería Civil en Bioinformática", 2017, Universidad de Talca, Talca, Chile (Autor).