Man

VALERIA OLIVIA MARQUEZ MIRANDA

Profesor Asistente

Universidad Mayor de Chile

SANTIAGO, Chile

Líneas de Investigación


BIOLOGIA COMPUTACIONAL, QUIMICA COMPUTACIONAL, BIOINFORMATICA, NANOMEDICINA

Educación

  •  DOCTORADO EN BIOTECNOLOGIA, UNIVERSIDAD ANDRES BELLO. Chile, 2017
  •  INGENIERO EN BIOINFORMATICA, UNIVERSIDAD DE TALCA. Chile, 2009
  •  LICENCIADO EN BIOINFORMATICA, UNIVERSIDAD ANDRES BELLO. Chile, 2008

Experiencia Profesional

  •   Investigadora encargada de Diseño de Dendrimeros in silico Full Time

    FRAUNHOFER CHILE RESEARCH

    talca, Chile

    2011 - 2012

  •   ASISTENTE DE INVESTIGACION PROYECTO ANILLO CIENTIFICO Full Time

    UNIVERSIDAD DE TALCA

    TALCA, Chile

    2009 - 2010

  •   ASISTENTE DE INVESTIGACION DISEÑO DE NANOPARTICULAS Full Time

    UNIVERSIDAD DE TALCA

    TALCA, Chile

    2010 - 2011

  •   Profesor ayudante ramo Bioinformatica Estructural Other

    UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

    SANTIAGO, Chile

    2014 - 2014

  •   Investigadora Postdoctoral Proyecto Neuromorphic Inspired Science Full Time

    PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

    SANTIAGO, Chile

    2016 - 2017

  •   Lider de Equipo de Desarrollo de Farmacos Full Time

    UBIOME SPA

    SANTIAGO, Chile

    2017 - 2019

  •   Investigador Postdoctoral Full Time

    Centro Interdisciplinario de Neurociencia de Valparaiso

    Chile

    2020 - 2021

  •   Profesor Asistente Full Time

    Universidad Mayor

    Santiago, Chile

    2021 - A la fecha

Formación de Capital Humano


1. Profesor Co-Guía. Título de la Tesis: “Estudio de la vía de ingreso de hierro
en ferritina de Chlorobium tepidum”. Tesis para optar al título de Ingeniero
en Bioinformática. Universidad de Talca. Estudiante: Vanessa Maraboli
Boutaud. Estudio consiste en una caracterización estructural de la ferritina
de Chlorobium tepidum, por métodos de biología computacional y estudios
experimentales, proponiendo una nueva ruta de entrada de hierro en este
tipo de proteínas. http://dspace.utalca.cl/handle/1950/8999

2. Profesor Co-Guía. Título de la Tesis: “Caracterización estructural de
proteínas de transferencia de lípidos no específica (nsLTPS) asociadas a
respuestas contra estrés en Lotus japonicus”. Tesis para optar al título de
Ingeniero en Bioinformática. Universidad de Talca. Estudiante: Carolina
Parra Palma.


Premios y Distinciones

  •   Premio Beca de Excelencia Acade?mica por dos an?os de la carrera de Ingenieri?a en Bioinforma?tica

    UNIVERSIDAD DE TALCA

    Chile, 2003

    Premio Beca de Excelencia Academica por dos anios de la carrera de Ingenieria en Bioinformatica (2003-2004).

  •   Beca de asistencia al 59th Biophysical Society Meeting

    UNIVERSIDAD DE TALCA

    Chile, 2015

    Beca de asistencia al 59th Biophysical Society Meeting, otorgado por International Relations Committee de la Biophysical Society USA.


 

Article (23)

Anionic Carbosilane Dendrimers Destabilize the GP120-CD4 Complex Blocking HIV-1 Entry and Cell to Cell Fusion

Guerrero-Beltran, C; Rodriguez-Izquierdo, I; Serramia, MJ; Araya-Duran, I; Marquez-Miranda, V; Gomez, R; de la Mata, FJ; Leal, M; Gonzalez-Nilo, F; Munoz-Fernandez, MA

Article ISI SCOPUS
BIOCONJUGATE CHEMISTRY  (2018)

Experimental and Computational Characterization of the Interaction between Gold Nanoparticles and Polyamidoamine Dendrimers

Camarada, M. B.; Comer, J.; Poblete, H.; Azhagiya Singam, E. R.; Marquez-Miranda, V.; Morales-Verdejo, C.; Gonzalez-Nilo, F. D.

Article ISI SCOPUS
LANGMUIR  (2018)

Self-Assembly Behavior of Amphiphilic Janus Dendrimers in Water: A Combined Experimental and Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulation Approach

Elizondo-Garciia, ME; Maarquez-Miranda, V; Araya-Duraan, I; Valencia-Gallegos, JA; Gonzaalez-Nilo, FD

Article ISI SCOPUS
MOLECULES  (2018)

Intracellular trafficking and cellular uptake mechanism of PHBV nanoparticles for targeted delivery in epithelial cell lines

Peñaloza, Juan Pablo; Márquez-Miranda, Valeria; Cabaña-Brunod, Mauricio; Reyes-Ramírez, Rodrigo; Llancalahuen, Felipe M.; Maldonado-Biermann, Fernanda; Velásquez, Luis A.; Fuentes, Juan A.; González-Nilo, Fernando D.; Rodríguez-Díaz, Maité; Otero, Carolina

Article ISI SCOPUS
JOURNAL OF NANOBIOTECHNOLOGY  (2017)

Molecular determinants for cyclooligosaccharide-based nanoparticle-mediated effective siRNA transfection

Manzanares, Darío; Araya-Durán, Ingrid; Gallego-Yerga, Laura; Játiva, Pablo; Márquez-Miranda, Valeria; Canan, Jonathan; Jiménez Blanco, José Luis; Mellet, Carmen Ortiz; González-Nilo, Fernando Danilo; García Fernández, José Manuel; Ceña, Valentín

Article ISI SCOPUS
NANOMEDICINE  (2017)

Multiscale molecular simulations applied to nucleic acid- dendrimer interactions studies.

Márquez-Miranda, Valeria; Araya-Durán, Ingrid; González-Nilo, Fernando Danilo

Article
Current pharmaceutical design  (2017)

Structural analysis of binding functionality of folic acid-PEG dendrimers against folate receptor

Sampogna-Mireles, Diana; Araya-Durán, Ingrid D.; Márquez-Miranda, Valeria; Valencia-Gallegos, Jesús A.; González-Nilo, Fernando D.

Article ISI SCOPUS
JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING  (2017)

Structure and application of antifreeze proteins from Antarctic bacteria

Muñoz, Patricio A.; Márquez, Sebastián L.; González-Nilo, Fernando D.; Márquez-Miranda, Valeria; Blamey, Jenny M.

Article ISI SCOPUS
MICROBIAL CELL FACTORIES  (2017)

The complex of PAMAM-OH dendrimer with Angiotensin (1-7) prevented the disuse-induced skeletal muscle atrophy in mice

Márquez-Miranda V.; Abrigo J.; Rivera J.C.; Araya-Durán I.; Aravena J.; Simon F.; Pacheco N.; González-Nilo F.D.; Cabello-Verrugio C.

Article ISI SCOPUS
INTERNATIONAL JOURNAL OF NANOMEDICINE  (2017)

Effect of Several HIV Antigens Simultaneously Loaded with G2-NN16 Carbosilane Dendrimer in the Cell Uptake and Functionality of Human Dendritic Cells

Sepúlveda-Crespo, Daniel; Vacas-Córdoba, Enrique; Márquez-Miranda, Valeria; Araya-Durán, Ingrid; Gómez, Rafael; Mata, Francisco Javier de la; González-Nilo, Fernando Danilo; Muñoz-Fernández, M Ángeles

Article ISI SCOPUS
BIOCONJUGATE CHEMISTRY  (2016)

Effect of Terminal Groups of Dendrimers in the Complexation with Antisense Oligonucleotides and Cell Uptake

Márquez-Miranda V.; Peñaloza J.P.; Araya-Durán I.; Reyes, R; Vidaurre S.; Romero, V; Fuentes, J; Ceric F.; Velasquez L.; Gonzalez-Nilo, F. D.; Otero, C.

Article ISI SCOPUS
Nanoscale Research Letters  (2016)

Mechanistic Studies on the Self-assembly of PLGA Patchy Particles and their Potential Applications in Biomedical Imaging

Salvador Morales, Carolina; Brahmbhatt, Binal; Márquez-Miranda, Valeria; Araya-Duran, Ingrid; Canan, Jonathan; Gonzalez-Nilo, Fernando; Vilos, Cristian; Cebral, Juan; Mut, Fernando; Lohner, Rainald; Leong, Brian; Sundaresan, Gobalakrishnan ; Zweit, Jamal

Article ISI SCOPUS
LANGMUIR  (2016)

Self-Assembly of Amphiphilic Dendrimers: The Role of Generation and Alkyl Chain Length in siRNA Interaction

Márquez-Miranda, Valeria; Araya-Durán, Ingrid; Camarada, María Belén; Comer, Jeffrey; Valencia-Gallegos, Jesús A.; González-Nilo, Fernando Danilo

Article ISI SCOPUS
SCIENTIFIC REPORTS  (2016)

Biomimetics: From Bioinformatics to Rational Design of Dendrimers as Gene Carriers

Marquez-Miranda, V; Camarada, MB; Araya-Duran, I; Varas-Concha, I; Almonacid, DE; Gonzalez-Nilo, FD

Article ISI SCOPUS
PLOS ONE  (2015)

Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulations of the Self-Assembly of Amphiphilic Dendrimers as Gene Carriers

Marquez-Miranda, Valeria; Araya, Iingrid; Belen Camarada, Maria; Ratjen, Lars; Carolina Otero, Maria; Danilo Gonzalez-Nilo, Fernando

Article ISI
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2015)

PAMAM G4 dendrimers as inhibitors of the iron storage properties of human L-chain ferritin

Camarada, MB; Marquez-Miranda, V; Araya-Duran, I; Yevenes A.; Gonzalez-Nilo, F

Article ISI SCOPUS
Physical Chemistry Chemical Physics  (2015)

Block Copolymers in the Synthesis of Gold Nanoparticles. Two New Approaches: Copolymer Aggregates as Reductants and Stabilizers and Simultaneous Formation of Copolymer Aggregates and Gold Nanoparticles

Leiva A.; Fuentes, I.; Bossel, E; Urzua, M.; Méndez M.; Pino M.; Radic D.; Marquez, V; Gonzalez-Nilo, FD

Article ISI SCOPUS
JOURNAL OF POLYMER SCIENCE PART A-POLYMER CHEMISTRY  (2014)

Insights into the Ion Permeation Process of High and Low Conductance K-Channels using Non-Equilibrium Molecular Dynamics

Gonzalez-Nilo, Fernando D.; Sepulveda, Romina; Naranjo, David; Aguayo, Daniel; Araya, Ingrid; Varas, Ignacio; Bravo, Felipe; Diaz-Franulic, Ignacio; Marquez-Miranda, Valeria

Article ISI
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2014)

The crystal structure of ferritin from Chlorobium tepidum reveals a new conformation of the 4-fold channel for this protein family

Arenas Salinas, Mauricio; Townsend, Philip D.; Brito, Christian; Marquez, Valeria; Marabolli, Vanessa; Gonzalez Nilo, Fernando; Matias, Cata; Watt, Richard K.; Lpez-Castro, Juan D.; Domnguez-Vera, Jos; Pohl, Ehmke; Yvenes, Alejandro

Article ISI SCOPUS
BIOCHIMIE  (2014)

K+ Conduction and Mg2+ Blockade in a Shaker Kv-Channel Single Point Mutant with an Unusually High Conductance

Moscoso, C.; Vergara-Jaque, A; Marquez-Miranda, V; Sepúlveda R.V.; Valencia I.; Diaz-Franulic, I; Gonzalez-Nilo, F; Naranjo, D

Article ISI SCOPUS
Biophysical Journal  (2012)

Cloning and characterization of Chlorobium tepidum ferritin

Yevenes A.E.; Marquez, V; Watt R.K.

Article ISI SCOPUS
Biochimie  (2011)

Gating of a pH-Sensitive K-2P Potassium Channel by an Electrostatic Effect of Basic Sensor Residues on the Selectivity Filter

Zuniga, L.; Cid, L. P.; Sepulveda, F. V.; Niemeyer M.I.; Marquez, V; Gonzalez-Nilo F.D.; Chipot, C

Article ISI
PLOS ONE  (2011)

Ion Conduction in a Shaker Potassium Channel Mutant Having an Unusually High Single Channel Conductance

Naranjo, David; Valencia, Ignacio; Moscoso, Cristian; Stack, Katherine; Márquez, Valeria; Vergara, Ariela; Sotomayor, Marcos; González-Nilo, Fernando

Article
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2011)

Abstract (1)

Mg2+ Blockade in a Kv Potassium Channel Mutant having an Unusually High Conductance

Naranjo, D; Moscoso, C.; Vergara A.; Marquez, V; sepulveda, r; Valencia I.; Diaz-Franulic, I; Gonzalez-Nilo, F

Abstract ISI
BIOPHYSICAL JOURNAL  (2012)

Proyecto (1)

Diseño Racional de Nanopartículas basadas en Dendrímeros como Agentes de Transfección. Tesis de Doctorado en la Empresa, tercera convocatoria 2014

PAI (781413007)

Proyecto
2014-2016
Inv. Principal

Review (1)

Integration of target discovery, drug discovery and drug delivery: A review on computational strategies

Duarte Y.; Márquez-Miranda V.; Miossec M.J.; González-Nilo F.

Review ISI SCOPUS
Wiley Interdisciplinary Reviews: Nanomedicine and Nanobiotechnology  (2019)

24
VALERIA MARQUEZ

Profesor Asistente

Centro de Nanotecnologia Aplicada

Universidad Mayor de Chile

SANTIAGO, Chile

20
Fernando Gonzalez

Titular Professor

Facultad de Ciencias de la Vida

Universidad Andres Bello

Santiago, Chile

3
David Naranjo

Profesor titular

Neurociencia

Universidad de Valparaíso

VALPARAISO, Chile

2
Juan Fuentes

Académico

Ciencias Biológicas

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

2
Cristian Vilos

Académico Jornada Completa

Medicina

Universidad de Talca

Talca, Chile

2
Alejandro Yévenes

Profesor Asistente

Química-Física

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE

Santiago, Chile

1
María Camarada

Director/Profesor Asistente

Centro de Nanotecnología Aplicada

Universidad Mayor

Santiago, Chile

1
Maria Otero

Profesor Asociado

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Santiago, Chile

1
Johanna Ábrigo

Bioquímico

Centro de Bioinformática y Biología Integrativa

Santiago, Chile

1
Christian Brito

Postdoc

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
VANESSA MARABOLI

Ingeniera Bioinformática

Facultad de Ciencias de la Vida

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Felipe Bravo

Profesor Asistente

Departamento de Ciencias de la Computación

Universidad de Chile

Santiago, Chile

1
SEBASTIÁN MÁRQUEZ

Investigador

Fundación Biociencia

Santiago, Chile

1
YORLEY DUARTE

profesor Asistente

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Cesar Morales

Associate Professor

Universidad Bernardo O'Higgins

Santiago, Chile

1
Jenny Blamey

Director Científico

Research and Development

FUNDACIÓN CIENTÍFICA Y CULTURAL BIOCIENCIA

Santiago, Chile

1
Nicolas Pacheco

PROFESOR ADJUNTO

CIENCIAS BIOLOGICAS

Universidad Andrés Bello

Santiago centro, Chile

1
Maite Rodriguez

Profesor Jornada

Farmacia

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Santiago, Chile

1
Ariela Vergara

Assistant Professor

Bioinformatics

UNIVERSIDAD DE TALCA

Talca, Chile

1
Francisco Sepúlveda

Research

Laboratorio Biología Molecular

CENTRO DE ESTUDIOS CIENTÍFICOS (CECS)

Valdivia, Chile

1
Maria Niemeyer

Research

Laboratorio Biología Molecular

CENTRO DE ESTUDIOS CIENTIFICOS CECS

Valdivia, Chile

1
Claudio Cabello

Full Professor

Ciencias Biologicas

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Santiago, Chile

1
Mauricio Arenas

Profesor Asistente

Bioinformática

UNIVERSIDAD DE TALCA

talca, Chile

1
Juan Rivera

Investigador

Instituto Milenio de Inmunología e Inmunoterapia

Santiago, Chile

1
Maximiliano Pino

Propietario

Biorefinería Química SpA

Santiago, Chile

1
Irma Fuentes

ACADÉMICO ASISTENTE

Universidad Autónoma de Chile

TEMUCO , Chile

1
Luis Velasquez

Director and Full Professor

Medicine

Universidad SEK

Santiago, Chile

1
Francisco Ceric

Jefe Laboratorio

Laboratorio de Neurociecia Afectiva

Facultad de Psicologia/Universidad del Desarrollo

Santiago, Chile

1
Marcela Urzúa

Associate Professor

Chemistry

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Ignacio Diaz

Profesor asistente

Centro e Bioinformatica y Biologia Integrativa

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Leandro Zuñiga

Profesor Asociado

Medicine

Universidad de Talca

Talca, Chile

1
Romina Sepúlveda

Profesor Investigador

Facultad de Ciencias Biológicas

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Luis Cid

Principal Research

Laboratorio Biología Molecular

CENTRO DE ESTUDIOS CIENTIFICOS CECs

Valdivia, Chile

1
Daniel Aguayo

Associate Professor

ITISB

UNIVERSIDAD ANDRES BELLO

Viña del Mar, Chile