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Jorge Andrés Olivares Pacheco

Profesor Asociado

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

Líneas de Investigación


Microbiology, Antibiotic Resistance, Antibiotic development, environmental microbiology, one-health

Educación

  •  Biology, Pontificia Universidad Católica de Valparaíso. Chile, 2003
  •  Magister en Biología Molecular y Celular, Universidad Autónoma de Madrid. España, 2009
  •  Doctor en Biología Molecular y Celular, Universidad Autónoma de Madrid. España, 2013

Experiencia Académica

  •   Profesor Asociado Full Time

    -

    Science

    Valparaíso, Chile

    2014 - A la fecha

  •   Profesor Contratado Part Time

    PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

    Science

    Valparaíso, Chile

    2005 - 2008

Experiencia Profesional

  •   Post-doctorado Other

    Centro Nacional de Biotecnología

    Madrid, España

    2013 - 2013

  •   Investigador Asociado a Proyectos Full Time

    Pontificia Universidad Catolica de Valparaíso

    Valparaíso, Chile

    2003 - 2008

Formación de Capital Humano


PhD
Co-director: Caracterización, expresión heterologa y optimización de la actividad antimicrobiana de bacteriocinas producidas por cepas antárticas de Pseudomonas fluorescentes. Alumna: María Soledad Pavlov Padró. Programa conjunto PUCV-UTFSM Doctorado en biotecnología (En curso).

Master
Co-director: Efecto de la sobreproducción de las bombas MDR sobre el “Quorum sensing” de Pseudomonas aeruginosa. Alumno: Manuel Alcalde Rico. Máster interuniversitario en Genética y Biología Celular. Universidad Autónoma de Madrid, Universidad Complutense de Madrid, Universidad de Alcalá. Finalizada en septiembre de 2013.

Licenciatura
Director: Búsqueda de determinantes a la resistencia a los antibióticos betalactámicos en bacterias aisladas en la Antártida. Alumno: Felipe Vásquez Ponce. Licenciatura en Biología. Pontificia Universidad Católica de Valparaíso (En curso).


Premios y Distinciones

  •   Sobresaliente Cum Laude

    Universidad Autónoma de Madrid

    España, 2013

    Award to best PhD thesis at the Molecular BioloGy department, Universidad Autónoma de Madrid


 

Article (32)

A whole-cell hypersensitive biosensor for beta-lactams based on the AmpR-AmpC regulatory circuit from the Antarctic Pseudomonas sp. IB20



Article ISI
MICROBIAL BIOTECHNOLOGY  (2024)

Ceftazidime/avibactam resistance is associated with PER-3-producing ST309 lineage in Chilean clinical isolates of non-carbapenemase producing Pseudomonas aeruginosa

Soto, Katherine D.; Quiroz, Valeria

Article ISI SCOPUS
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology  (2024)

Detection of SARS-CoV-2 in Wastewater Associated with Scientific Stations in Antarctica and Possible Risk for Wildlife

Barriga, Gonzalo P.; Neira, Victor

Article ISI SCOPUS
Microorganisms  (2024)

Genomic characterisation of the population structure and antibiotic resistance of Salmonella enterica serovar Infantis in Chile, 2009-2022

Alvarez-Espejo, Diana M.; Constenla-Albornoz, Rodrigo; Toro, Magaly; Bell, Rebecca L.

Article ISI SCOPUS
The Lancet Regional Health - Americas  (2024)

Editorial: Antimicrobial resistance in aquatic environments, volume II



Article ISI SCOPUS
Frontiers in Microbiology  (2023)

Heavy Metal Pollution From a Major Earthquake and Tsunami in Chile Is Associated With Geographic Divergence of Clinical Isolates of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus in Latin America

Jara-Videla, Estefania; Rios, Rafael; Moustafa, Ahmed M.; Quesille-Villalobos, Ana; Araos, Rafael

Article ISI
bioRxiv  (2023)

Mobile genetic elements drive the multidrug resistance and spread of Salmonella serotypes along a poultry meat production line

Galleguillos, Nicolas; Suarez, Marcia; Valdés, Jorge H.; Saavedra, Claudia P.

Article ISI SCOPUS
Frontiers in Microbiology  (2023)

Ongoing diversification of the global fish pathogen Piscirickettsia salmonis through genetic isolation and transposition bursts

Schober, I; Bunk, B; Carril, G; Freese, HM; Ojeda, N; Riedel, T; Meier-Kolthoff, JP; Göker, M; Spröer, C; Flores-Herrera, PA; et al.

Article ISI SCOPUS
ISME Journal  (2023)

Acquisition of resistance to ceftazidime-avibactam during infection treatment in Pseudomonas aeruginosa through D179Y mutation in one of two bla(KPC-2) gene copies without losing carbapenem resistance

Quiroz, Valeria; Wozniak, Aniela

Article ISI
FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY  (2022)

Detecci�n y cuantificaci�n de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de Chile: hacia la implementaci�n de una vigilancia centinela permanente

Jorge Olivares-Pacheco; Aiko D. Adell; Mat�as I. Hepp; Andressa S. Reis; C�sar Echeverr�a; Claudia Ibacache-Quiroga; Paulina Assmann; Aldo Gaggero

Article SCIELO SCOPUS
 (2022)

Editorial: Antimicrobial Resistance in Aquatic Environments

Calero-Caceres, William; Marti, Elisabet; Rodriguez-Rubio, Lorena

Article ISI
Frontiers in Microbiology  (2022)

Genetic characterization of clinically relevant class 1 integrons carried by multidrug resistant bacteria (MDRB) isolated from the gut microbiota of highly antibiotic treated Salmo salar



Article ISI
JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE  (2022)

Humans and Hoofed Livestock Are the Main Sources of Fecal Contamination of Rivers Used for Crop Irrigation: A Microbial Source Tracking Approach

Barria, Carla; Weller, Daniel L.; Estrada, Erika M.; Vera, Leonardo

Article ISI
Frontiers in Microbiology  (2022)

Isolation of an Extensively Drug-Resistant Pseudomonas aeruginosa exoS(+)/O4 Strain Belonging to the "High-Risk" Clone ST654 and Coproducer of NDM-1 and the Novel VIM-80

Jerez, Christian; Cardenas-Arias, Adriana; Illesca, Vijna

Article ISI
MICROBIOLOGY SPECTRUM  (2022)

Qualitative Risk Assessment for Antimicrobial Resistance among Humans from Salmon Fillet Consumption Due to the High Use of Antibiotics against Bacterial Infections in Farmed Salmon



Article ISI
ANTIBIOTICS-BASEL  (2022)

Real-World Performance of Susceptibility Testing for Ceftolozane/Tazobactam against Non-Carbapenemase-Producing Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa



Article ISI
ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY  (2022)

Role of the multi-drug efflux systems on the baseline susceptibility to ceftazidime/avibactam and ceftolozane/tazobactam in clinical isolates of non-carbapenemase-producing carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa

Jose Contreras-Gomez, Maria

Article ISI
FRONTIERS IN PHARMACOLOGY  (2022)

Isolation of Ciprofloxacin and Ceftazidime-Resistant Enterobacterales From Vegetables and River Water Is Strongly Associated With the Season and the Sample Type

Diaz-Gavidia, Constanza; Barria, Carla; Araos, Rafael

Article ISI
Frontiers in Microbiology  (2021)

Pseudomonas fildesensis sp. nov., a psychrotolerant bacterium isolated from Antarctic soil of King George Island, South Shetland Islands

Pavlov, Maria S.; Marshall, Sergio H.

Article ISI
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY  (2020)

The impaired quorum sensing response of MexAB-OprM efflux pump overexpressing mutants is not due to non-physiological efflux of 3-oxo-C12-HSL



Article ISI
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY  (2020)

The impaired quorum sensing response ofPseudomonas aeruginosaMexAB-OprMefflux pump overexpressing mutants is not due to non-physiological efflux of3-oxo-C12-HSL



Article ISI
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY  (2020)

Analysis of the Pseudomonas aeruginosa Aminoglycoside Differential Resistomes Allows Defining Genes Simultaneously Involved in Intrinsic Antibiotic Resistance and Virulence

Sanz-García F.; Hernando-Amado, S

Article ISI SCOPUS
ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY  (2019)

Alginate overproduction and biofilm formation by psychrotolerant Pseudomonas mandelii depend on temperature in Antarctic marine sediments

Vásquez-Ponce, F; Higuera-Llantén S.; Ramírez-Orellana R.

Article ISI SCOPUS
ELECTRONIC JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY  (2017)

Draft Genome Sequence of Antarctic Pseudomonas sp. Strain KG01 with Full Potential for Biotechnological Applications

Pavlov, Maria S.; Olivares, Jorge; Marshall, Sergio

Article SCOPUS
Genome Announcements  (2015)

Metabolic Compensation of Fitness Costs Associated with Overexpression of the Multidrug Efflux Pump MexEF-OprN in Pseudomonas aeruginosa

Olivares, J; Alvarez-Ortega, C.; Martínez, JL

Article ISI SCOPUS
Antimicrobial Agents and Chemotherapy  (2014)

Characterization of the Polymyxin B Resistome of <i>Pseudomonas aeruginosa</i>

Fernandez, Luca; Wiegand, Irith; Olivares, Jorge; Kocncova, Dana; Lam, Joseph S.

Article ISI
ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY  (2013)

Overproduction of the multidrug efflux pump MexEF-OprN does not impair Pseudomonas aeruginosa fitness in competition tests, but produces specific changes in bacterial regulatory networks

Olivares, Jorge; Linares, Juan F.; Rojo, Fernando; Koehler, Thilo

Article ISI
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY  (2012)

The intrinsic resistome of <i>Pseudomonas aeruginosa</i> to β-lactams

Wiegand, Irith; Olivares, Jorge

Article ISI
VIRULENCE  (2011)

Determination of minimal concentration of Piscirickettsia salmonis in water columns to establish a fallowing period in salmon farms

Olivares, J

Article ISI SCOPUS
Journal of Fish Diseases  (2010)

Genetic Determinants Involved in the Susceptibility of <i>Pseudomonas aeruginosa</i> to β-Lactam Antibiotics

Wiegand, Irith; Olivares, Jorge

Article ISI
ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY  (2010)

Characterization of a novel and genetically different small infective variant of Piscirickettsia salmonis

Rojas, MV; Olivares, J; Del Rio, R

Article ISI SCOPUS
MICROBIAL PATHOGENESIS  (2008)

Immunological characterization of a bacterial protein isolated from salmonid fish naturally infected with Piscirickettsia salmonis

Conejeros, P; Zahr, M; Olivares, J; Gómez, F; Cataldo, P; Henriquez, V

Article ISI SCOPUS
VACCINE  (2007)

Letter (1)

El poder de un litro de agua servida: Epidemiolog�a basada en aguas residuales

Jorge Olivares-Pacheco; Aiko D. Adell; Mat�as Hepp; Andressa S. Reis; C�sar Echeverr�a; Claudia Ibacache-Quiroga; Aldo Gaggero

Letter SCIELO SCOPUS
 (2022)

Proyecto (13)

Antimicrobial resistance (AMR) in the marine aquaculture-human interface, knowledge gaps and possible interventions: A One Health approach

Nachiket, Marathe

Proyecto
 (2025)

Understanding the cold shock proteinmediated adaptation mechanisms in psychrophilic and psychrotolerant bacteria using Antarctic Pseudomonas as a model

Tribelli Paula

Proyecto
 (2025)

Comprehensive longitudinal assessment of antimicrobial resistance (AMR) in wastewater: Unveiling the dynamics of multidrug-resistant bacteria (MRDB), antibiotic resistance genes (ARG), and antibiotic residues across hospital and community settings

Jorge Olivares Pacheco; Jose M Munita

Proyecto
 (2024)

Antimicrobial resistance (AMR) surveillance system based on qPCR quantification of the genes that encode the carbapenemases KPC and VIM and the extended spectrum beta-lactamase (ESBL) CTX-M in the wastewater of the cities of Antofagasta , Copiapó, Valparaíso, Santiago and Concepción

Gaggero Aldo

Proyecto
 (2023)

Elucidating bacteria-phage infection networks (BPINs) in Antarctic marine environments



Proyecto
 (2023)

Integrative Approaches to Assess the Microbiome in the Built Environment (MicroBE) in the COVID era: The School-MicroBE Initiative

Saavedra Claudia; Gaggero Aldo

Proyecto
 (2023)

Establishing a long-term observatory of the urban microbiome and antimicrobial resistance in Chile

Eduardo Castro-Nallar; Jorge Olivares Pacheco

Proyecto
 (2022)

Public health risk and environmental factors associated with the presence of clinically relevant antimicrobial resistant Enterobacterales in rivers in central Chile

Eduardo Castro-Nallar; Jorge Olivares Pacheco

Proyecto
 (2022)

Monitoring of SARS-CoV-2 in Wastewater



Proyecto
 (2021)

Pfizer medical grants for testing novel compounds. Characterization of the activity of two new antibiotics against non-carbapenemase producing, carbapenem-resistant P. aeruginosa (non-CP-CR-PAE) and determination of the molecular mechanisms involved in their resistance



Proyecto
 (2021)

Caracterización molecular y epidemiológica de aislados clínicos multirresistentes de Pseudomonas aeruginosa procedentes de hospitales chilenos y análisis del papel que los Clones de Alto Riesgo tienen en la prevalencia y dispersión de carbapenemasas.

Manuel Alcalde-Rico; Jorge Olivares Pacheco

Proyecto
 (2020)

SARS-COV-2 en aguas servidas: Vigilancia ambiental complementaria para territorios con diferentes tasas de incidencia de COVID-19 en la región Metropolitana de Santiago

Jorge Olivares Pacheco; Manuel Alcalde Rico; Pamela Thomson M.; Francisco Moya-Flores

Proyecto
 (2020)

Description and characterization of genetic elements involved in the resistance to florfenicol and oxytetracycline in natural bacterial populations, associated with the intense use of antibiotics in salmon farms

Jorge Olivares Pacheco

Proyecto
 (2016)

Review (2)

RND multidrug efflux pumps: what are they good for?

Olivares, Jorge

Review ISI
Frontiers in Microbiology  (2013)

The intrinsic resistome of bacterial pathogens

Olivares, Jorge; Bernardini, Alejandra; Corona, Fernando

Review ISI
Frontiers in Microbiology  (2013)

2
Jaime Figueroa

Profesor Titular

Bioquimica y Microbiologia

UNIVERSIDAD AUSTRAL DE CHILE

Valdivia, Chile

1
Vitalia Henríquez

Profesor Titular

Instituto deBiología

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

2
Gerardo Gonzalez

Full Professor

Microbiology

UNIVERSIDAD DE CONCEPCION

Concepcion, Chile

1
Jorge González

Jefe de Departamento

Departamento Científico

INSTITUTO ANTÁRTICO CHILENO

Punta Arenas, Chile

5
Sergio Marshall

PROFESSOR

BIOLOGY INSTITUTE

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

Valparaíso, Chile

5
Patricia García

Jefe de Laboratorio de Microbiologia

Escuela de Medicina

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE, LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA

Santiago, Chile

1
Claudia Saavedra

Full Professor

Departmento de Ciencias de la Vida

UNIVERSIDAD ANDRÉS BELLO

Santiago, Chile

4
Aniela Wozniak

Coordinador de Investigación

Dept Laboratorios Clínicos

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE

Santiago, Chile

1
María Rojas

Profesor adjunto

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

Valparaíso, Chile

2
Rodrigo del Rio

associate professor

inorganic chemistry

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE, FACULTAD DE QUIMICA, DPTO QUIMICA INORGANICA

santiago, Chile

1
Constanza Cárdenas

Associate Researcher

Nucleo Biotecnologia Curauma

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

Valparaíso, Chile

2
Fernando Gómez

Associate Proffesor

Instituto de Biologia

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE VALPARAÍSO

Valparaíso, Chile

1
Angelica Reyes

Profesor Asociado

INTA UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Jorge Valdes

PROFESOR ASOCIADO

CENTRO DE BIOINFORMÁTICA Y BIOLOGÍA INTEGRATIVA

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
SANDRA CORTES

ASSOCIATED PROFESSOR

PUBLIC HEALTH

PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE

SANTIAGO, Chile

1
Victor Neira

Associate Professor

Medicina Preventiva

Universidad de Chile, Facultad de Ciencias Veterinarias

Santiago, Chile

48
Jorge Olivares

Profesor Asociado

Biology

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

1
LINA CORTES

Investigadora Postdoctoral

Facultad de Medicina

Universidad del Desarrollo

Santiago, Chile

3
Andres Opazo

Profesor Asistente

Microbiología

Universidad de Concepción

Concepción, Chile

1
Fernando Mardones

Profesor Asistente

Medicina

Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Magaly Toro

Associate Research Professor

JIFSAN

University of Maryland, College Park

College Park, Estados Unidos

1
Cristóbal Galbán

Profesor Titular

Centro de Genómica, Ecología y Medio Ambiente

Universidad Mayor de Chile

Santiago de Chile, Chile

6
Aiko Adell

Profesor Asociado

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

5
Jose Munita

Profesor Asociado

Internal Medicine

FACULTAD DE MEDICINA CLINICA ALEMANA- UNIVERSIDAD DEL DESARROLLO

Santiago, Chile

1
Eduardo Castro

Associate Professor

Departamento de Microbiología

Universidad de Talca

Talca, Chile

1
Claudia Ibacache

Academic

Universidad de Valparaíso

Valparaíso, Chile

1
Pablo Conejeros

Profesor Adjunto

Universidad de Valparaiso

Valparaiso, Chile

1
Marcela Zahr

Academico

Instituto de Biología

Universidad de Valparaiso

Valparaíso, Chile

1
Vitalia Henriquez

DIrectora

Facultad de Ciencias

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

1
Nicolas Ojeda

Investigador Post-Doctoral

Instituto de Biología

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

1
Gonzalo Barriga

Profesor Asistente

Instituto de Ciencias Biomedicas

Universidad de Chile

Santiago, Chile

3
Andrea Moreno

Profesor Asociado

Pontificia Universidad Católica de Chile

SANTIAGO, Chile

1
Mario Tello

Académico

Biología

Universidad de Santiago de Chile

Santiago, Chile

1
Manuel Alcalde

Investigador Doctor

Laboratorio de Genética e Inmunología Molecular,Instituto de Biología, Facultad de Ciencias.

Pontificia Universidad Católica de Valparaíso

Valparaíso, Chile

3
Juan Ugalde

Assistant Professor

Facultad de Ciencias de la Vida

Universidad Andrés Bello

Santiago, Chile

1
Luis Piña

Investigador Postdoctoral

Genética Molecular y Microbiología

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago, Chile

1
Rafael Araos

Principal Investigator

Universidad del De

Santiago, Chile

1
Coral Pardo

Investigador postdoctoral

Universidad Católica del Norte

antofagasta, Chile

1
Gabriel Krüger

Investigador Doctoral

Universidad Andrés Bello

Santiago Centro, Chile

1
DIANA ALVAREZ

Profesora Asistente

Pontificia Universidad Católica de Chile

Santiago de Chile, Chile

1
Ramón Ramírez

Encargado del área de Microscopía

Centro de Biología Integrativa

Universidad Mayor de Chile

Santiago, Chile

4
Jose Martínez

Investigador

ICIM

Universidad del Desarrollo

LAS CONDES, Chile

1
Juan Castro

Post-Doctorante

Universidad Católica del Norte

Antofagasta, Chile

1
Lucas Krüger

Researcher

Instituto Antártico Chileno

Punta Arenas, Chile

1
Paulina González

Asistente investigación

Microbiología

Universidad de Concepción

Concepcion, Chile

2
Sebastian Higuera

4
Felipe Vasquez