Microbiology of Acidic Biomes; Population and Community Genomics; Ecophysiology of Extremophiles; Mineral Processing Biotechnologies

Doctorate Thesis Direction

* Gustavo Alejandro Castro Toro. Estudio de la diversidad genética, estructural y funcional de los sistemas de Restricción-Modificación en la clase Acidithiobacillia. Doctorado en Inmunología y Microbiología, Universidad San Sebastián. September 2025 – ongoing.

* Celia Larrea Duharte. Diseño racional de consorcios de Acidithiobacillia para aplicaciones en industria biohidrometalúrgia. Doctorado en Biotecnología y Bioemprendimiento, Universidad San Sebastián. September 2025 – ongoing.

* Alejandro Nicolás Pinilla Ojeda. Estrategia biotecnológica combinada de fagoterapia y probióticos para el control de Salmonella enterica en pollos Broiler. Doctorado en Biotecnología y Bioemprendimiento, Universidad San Sebastián. August 2025 – ongoing.

* Daniela Jara Henríquez. Control del drenaje ácido mediante una estrategia microbiana basada en el uso de microorganismos heterótrofos. Doctorado en Ingeniería, Facultad de Ingeniería, Universidad San Sebastián. Cede Concepción. November, 2024 – ongoing.

* Abraham Isaac Zapata Araya. Caracterización espacio-temporal de la virósfera del sistema hidrogeotermal Acídico CVCC y estudio de su rol en el ensamble comunitario de comunidades de interés biotecnológico. Doctorado en Biotecnología y Bioemprendimiento, Universidad San Sebastián. September 2024 - ongoing.

* Sofía Valentina Reyes Impellizzeri. Estudio del rol de los diazótrofos como elementos keystone en el ensamble de comunidades microbianas de ambientes acídicos extremos. Doctorado en Biotecnología y Bioemprendimiento, Universidad San Sebastián. September 2024 - ongoing.

* Camila Rojas-Villalobos. Estudio de microorganismos y genes ecológicamente importantes para el ensamblaje y estabilidad de comunidades nativas del complejo hidrogeotermal Copahue-Caviahue-ChanchoCó. Doctorado en Biología Computacional (DRBC), Universidad San Sebastián. Completed, 2026.

* Fernando Andrés Díaz González. Estudio del rol del pH en el ensamble de comunidades microbianas vinculadas al ciclo del hierro en el Drenaje Ácido de Roca del sistema hidrogeotermal volcánico Copahue-Caviahue-ChanchoCó. Doctorado en Biotecnología y Bioemprendimiento, Universidad San Sebastián. Completed, 2025.

* Dilanaz Arisan. Study of the effect of selection pressure strength (chloride salt concentrations) in adaptive evolution of the extreme acidophile Igneacidithiobacillus copahuensis. Doctorado en Biotecnología y Bioemprendimiento, Universidad San Sebastián. Completed, 2025.

* Sebastián Pacheco Acosta. Estudio del plasmidoma y defensoma de poblaciones nativas de la bacteria acidófila `Fervidacidithiobacillus caldus´ y su rol en la adaptación de la especie al gradiente ambiental del sistema hidrogeotermal del Complejo Volcánico Caviahue-Copahue-ChanchoCó. Doctorado en Inmunología y Microbiología, Universidad San Sebastián. Completed, 2025.

* Juan Carlos Duarte Ramirez. Estudio de los ecotipos del clado thiooxidans del Complejo VolcánicoCopahue-Caviahue y su rol en el ensamblaje de microbiomas acídicos. Doctorado en Biotecnología y Bioemprendimiento, Universidad San Sebastián. Completed, 2025.

* Francisco Luciano Issotta Contardo. Estudio eco-evolutivo de comunidades extremófilas inherentes al gradiente ambiental de un sistema hídrico acídico de origen volcánico en el Norte de Patagonia. Doctorado en Biotecnología, Universidad Nacional Andrés Bello. Completed, 2021.

* Ana Rosa Moya Beltrán. Caracterización del pangenoma de los Acidithiobacillus: contribución del complemento génico esencial y accesorio a la diversificación y evolución del taxón. Doctorado en Biotecnología, Universidad Nacional Andrés Bello. Completed, 2020.

* Paulo Cesar Covarrubias Pizarro. Tipificación y caracterización genómica y morfológica de virus microbianos presentes en econichos de biolixiviación. Doctorado en Biociencias Moleculares, Universidad Andrés Bello. Completed, 2019.

* Rodrigo Andrés Flores Ríos. Caracterización del sistema TRA de Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 y su papel en la transferencia conjugativa del ICEAfe1. Doctorado en Microbiología, Universidad de Santiago de Chile. Completed, 2018.

* Juan Pablo Cárdenas Astudillo. Estudio genómico-comparativo de la respuesta a estrés oxidativo en microorganismos acidófilos: modelos de función, regulación y evolución. Doctorado en Biotecnología, Universidad Andrés Bello. Completed, 2015.

* Mauricio Arenas. Estudio de las propiedades estructurales del regulador transcripcional FUR de Acidithiobacillus ferrooxidans. Doctorado en Biotecnología, Universidad Nacional Andrés Bello. Completed, 2014.

* Lillian Acuña. Caracterización del Sistema de Inmunidad CRISPR/Cas en Acidithiobacillus caldus. Doctorado en Ciencias Biomédicas, Universidad Andrés Bello. Completed, 2013.

Masters Thesis Direction:

* Catalina López Keim. Identificación in silico de péptidos antimicrobianos en bacterias acidófilas a partir de genomas y metagenomas del sistema volcánico Copahue-Caviahue. Magíster en Biomedicina Molecular (MBIM), Universidad San Sebastián. March, 2025 – ongoing.

* Gustavo Alejandro Castro Toro. Estudio sistemático de los sistemas de restricción y modificación en bacterias de la clase Acidithiobacillia. Magíster en Biomedicina Molecular (MBIM), Universidad San Sebastián. Completed, 2024.

* Abraham Isaac Zapata Araya. Análisis de la abundancia y variabilidad genética de las poblaciones virales dominantes distribuidas a lo largo del sistema hidrogeotermal acídico Copahue-Caviahue-ChanchoCço usando estrategias metagenómicas. Magíster en Biomedicina Molecular, Universidad San Sebastián. Completed, 2024.

* Stefano Bueno Rossoni. Caracterización del vesículas secretorias de bacterias del género Acidithiobacillus. Magíster en Biotecnología, Universidad Nacional Andrés Bello. Completed, 2020.

* Cesar Manuel Valenzuela Alegría. Caracterización del plasmidoma de bacterias del género Acidithiobacillus. Magíster en Biotecnología, Universidad Nacional Andrés Bello. Completed, 2020.

* Karina Cordero Fernández. Análisis transcriptómico en un modelo de agregación de la proteína TDP-43. Magíster en Biotecnología, Universidad Nacional Andrés Bello. Completed, 2020. Co-tutor.

* Victor Andrés Alegría Mera. Papel del regulador transcripcional Saci1223 sobre la expresión de genes asociados a procesos de producción y conversión de energía en la arquea termoacidófila Sulfolobus acidocaldarius durante la formación de biopelículas. Magíster en Biotecnología, Universidad Nacional Andrés Bello. Completed, 2017. Co-tutor.

* Cristian Silva Fernandez. Mecanismos de inmunidad adquirida en Acidithiobacilli. Magíster en Biotecnología, Universidad Nacional Andrés Bello. Completed, 2011.

* Cristopher Andrés Oporto Alarcón. Estudio de métricas para clustering en redes de asociación funcional de proteínas para genomas microbianos. Magíster en Ingeniería Civil Informática, Universidad de Santago de Chile. Completed, 2009.

Undergraduate Thesis Direction:

* Catalina Fernanda Muñoz Sarmiento. Caracterización y descripción taxonómica de Ambacidithiobacillus chanchocoensis sp. nov.: una bacteria acidófila, quimiolitótrofa, oxidante de compuestos reducidos del azufre, diazotrofa y denitrificante. Seminario de Título en Bioquímica, Universidad San Sebastián. August 2025 -ongoing.

* Catalina López Keim. Evaluación de la funcionalidad y toxicidad de endonucleasas de sistemas CRISPR/Cas expresadas en Escherichia coli. Seminario de Título en Bioquímica, Universidad San Sebastián. Completed, 2026.

* Guillermo Eduardo Tapia Donoso. Estudio de la influencia de sistemas de restricción-modificación en la eficiencia de transformación de bacterias de la clase Acidithiobacillia con plásmidos nativos y exógenos. Seminario de Título en Bioquímica, Universidad San Sebastián. Completed, 2024.

* Gustavo Alejandro Castro Toro. Identificación y caracterización de metiltransferasas codificadas en genomas de miembros de la clase Acidithiobacillia y evaluación de su contribución a la diversidad fenotípica, control epigenético y en la reducción en la transferencia horizontal de genes. Seminario de Título en Bioquímica, Universidad San Sebastián. Completed, 2024.

* Abraham Isaac Zapata Araya. Análisis de la diversidad viral asociada a comunidades microbianas extremófilas hidrotermales del complejo volcánico Copahue usando estrategias metagenómicas. Pregrado en Bioquímica, Universidad San Sebastián. Completed, 2021.

* Ivette Natalia Olave Orellana. Estudio de cepas acidófilas mesotermófilas tipo Acidithiobacillus caldus aisladas del sistema geotermal acídico Copahue-Caviahue y su tolerancia a iones cloruro. Ingeniería en Biotecnología, Universidad Mayor. Completed, 2019.

* Yazna Tapia Cisternas. Estudio de los mecanismos de resistencia a cadmio en el genero Acidithiobacillus y propuesta de diseño de vector plasmidial potencialmente útil en la construcción de biosensores de cadmio aplicables a la minería. Ingeniería Civil en Biotecnología, Universidad San Sebastián. Completed, 2018.

* Rodolfo Alfredo Gomez Salinas. Contribución del complemento génico flexible al fitness biologico y la competitividad de bacterias del linaje 3 del genero Acidithiobacillus. Ingeniería Civil en Biotecnología, Universidad San Sebastián. Completed, 2018.

* Fernanda Sazo Pradenas. Análisis de la diversidad genómica a nivel intra-específico de bacteria acidófila y principal modelo en biominería, Acidithiobacillus ferrooxidans. Ingeniería en Biotecnología, Universidad Tecnológica Metropolitana. Frozen.

* María Ignacia von Unger. Estudio de los elementos integrativos conjugativos tipo 2 presentes en distintas cepas de Acidithiobacillus caldus, y su contribución a la formación de biopeliculas, desde una perspectiva transcripcional. Ingeniería en Biotecnología, Universidad Andrés Bello. Completed, 2016.

* María Isabel Yanquepe. Desarrollo de un pipeline integrativo para la identificación de elementos genéticos móviles en genomas microbianos. Ingeniería en Bioinformática, Universidad de Talca. Completed, September 2014.

* Francisco Luciano Issotta Contardo. Benchmarking de los métodos vigentes de asignación taxonómica y ensamblado de secuencias cortas utilizando metagenomas microbianos y virales sintéticos. Ingeniería en Bioinformática, Universidad de Talca. Completed, 2014.

* Ana Rosa Moya Beltrán. Análisis comparativo de metagenomas microbianos de ecosistemas acídicos y exploración del potencial metabólico común y diferencial. Ingeniería en Bioinformática, Universidad de Talca. Completed, 2014.

* Alfredo Hernán Monsalve Bustos. Análisis ecofisiológico del pangenoma de bacterias de biolixiviación del género Sulfobacillus spp. Pregrado en Ingeniería en Biotecnología, Universidad de Santiago de Chile. Completed, 2013.

* Pablo Tapia Salinas. Identificación y caracterización de un profago presente en el genoma de Acidithiobacillus caldus ATCC 51756. Pregrado en Bioquímica, Pontifícia Universidad Católica de Valparaíso. Completed, 2012

* Juan José Haristoy Lagos. Análisis genómico y funcional de plasmidos cripticos presentes en el genoma de Acidithiobacillus caldus ATCC 51756. Pregrado en Bioquímica, Pontifícia Universidad Católica de Chile. Completed, 2012

* David Loyola. Determinación de cambios en el perfil transcripcional de Escherichia coli expuesta a telurito/cefotaxima utilizando microarreglos de DNA. Pregrado en Ingeniería en Bioinformática, Universidad de Talca. October 2011. Co-advisor.

* Pamela Nieto Pacheco. La unión Fur:DNA in vivo y el efecto de su regulación transcripcional en Acidithiobacillus ferrooxidans. Pregrado en Bioquímica, Universidad de Chile. Completed, 2009. Co-advisor.

* Jorge Herrera. Unión de grupo hemo al regulador Fur de Acidithiobacillus ferrooxidans. Pregrado en Bioquímica, Universidad Católica de Chile. Completed, 2007. Co-advisor.

Teaching:

Doctorate Training:
- Advanced Molecular Microbiologyand Virology (B005), Doctorate Program in Immunology and Microbiology; Doctorate Program in Biotechnology and Bioentrepreneurship, Universidad San Sebastián, Santiago, Chile. Responsible
- Ecology of the Microbiome (ELEDRBI01), Doctorate Program in Immunology and Microbiology; Doctorate Program in Biotechnology and Bioentrepreneurship, Universidad San Sebastián, Santiago, Chile. Responsible
- Programable nucleases and genome editing Class, Biotecnología: Aplicaciones y oportunidades de Negocio en Chile y el Mundo Course (BIO 511), PhD. Program in Biotechnology, Universidad Nacional Andrés Bello. Guest lecturer
- Transcriptomics Class, Bioinformatics and Genome Biology Course (BIO 502) course, PhD. Program in Biotechnology, Universidad Nacional Andrés Bello. Guest lecturer

Undergraduate Training:
- Genomics and Proteomics (BIOQ1032), Undergraduate Program in Biochemistry, Universidad San Sebastián. Responsible
- Molecular Microbiology (BIOQ1046), Undergraduate Program in Biochemistry, Universidad San Sebastián. Collaborator
- Introduction to transcriptomics Class, Genetic Engineering and Biotechnology Course (BIT 230), Undergraduate Program in Biomedical Sciences, Universidad Nacional Andrés Bello. Guest lecturer
- Metabolic Reconstruction Class, Biotechnology of enzymes and metabolic pathways Course, Undergraduate Program in Biotechnology, Universidad de Chile. Guest lecturer

Non-Specialized audience

2026 January
Press note: Descubren mecanismo de adaptación evolutiva en bacterias del volcán Copahue. Press note on the thesis research of PhD student Dilanaz Arisan and her price at the SMBE congress. Available at:
https://www.elmostrador.cl/cultura/ciencia-cultura/2026/01/15/descubren-mecanismo-de-adaptacion-evolutiva-en-bacterias-del-volcan-copahue/ (Jan 15)
https://www.biobiochile.cl/noticias/ciencia-y-tecnologia/ciencia/2026/01/13/biologa-descubrio-como-una-bacteria-del-volcan-copahue-puede-sobrevivir-a-condiciones-letales.shtml (Jan 13)

2025 May
Documentary: “Copahue Extremo: A Journey to the Past and Future of the Planet”. Premiere: Tuesday, May 27 | 18:30 hrs | Centro Arte Alameda, Sala CEINA. "This 40-minute documentary follows a Chilean-Argentinian team of scientists on a unique expedition to the heart of the Copahue-Caviahue volcanic complex to study extreme acidophiles and their communities. Through breathtaking landscapes, cutting-edge science, and thoughtful reflections, Copahue Extremo invites viewers to understand the origins and resilience of life, while exploring how this knowledge can help us confront major global challenges such as climate change and the search for life beyond Earth. A production by the Eureka Program of Fundación Ciencia & Vida / Universidad San Sebastián, in collaboration with GVG Producciones and IMAGO Producciones.
Documentary
https://youtu.be/fKLmIxDInQU?si=AM3qG2s-BP-uOMYg
Trailers
https://www.youtube.com/watch?v=2x3aFA_mZ9A
https://www.youtube.com/watch?v=HisyqCrxu1w"

2025 May
Open Class: Studying Extremophiles and Their Use in Biomining - 27.06.2025. Broadcast of a radio interview by journalist Gabriel León for the program TXSPlus and press note by Rodrigo Bravo at the multimedia platform TXSPlus (https://txsplus.com).
Available at: https://on.soundcloud.com/OZ2VC2NpcmplQdDgcT
Available at: https://txsplus.com/2025/05/documental-narra-exploracion-copahue/

2025 May
Press note: Documental registró pionera exploración que rastreó microorganismos prehistóricos en el volcán Copahue.
Press notes on the documentary "" Copahue Extremo, un viaje al pasado y el futuro del planeta.
Available at:
https://www.24horas.cl/conciencia-24-7/sostenibilidad/exploran-volcan-copahue-vida-extrema
https://www.biobiochile.cl/noticias/ciencia-y-tecnologia/ciencia/2025/05/28/documental-registro-pionera-exploracion-que-rastreo-microorganismos-prehistoricos-en-el-volcan-copahue.shtml
https://www.uss.cl/noticias/documental-volcan-copahue/
https://cienciavida.org/2025/05/exploran-el-volcan-copahue-en-busca-de-vida-extrema-y-soluciones-verdes-para-la-mineria/"

2025 May
Social Media Presence: Copahue Extremo: Un viaje al pasado y el futuro del planeta. Traction across social media platforms, where press notes and highlights of the scientific expedition have been shared by participating institutions, production, and science communication teams.
Available at:
https://x.com/txsplus/status/1928164063843905676
https://www.instagram.com/p/DKK0qTxpOfU/
https://www.instagram.com/p/DKKTY4VRZ3Y/?utm_source=ig_web_copy_link
https://es.linkedin.com/posts/txsplus_el-documental-copahue-extremo-narra-activity-7333929324355481600-zhlF?utm_source=li_share&utm_content=feedcontent&utm_medium=g_dt_web&utm_campaign=copy"

2024 June
Noticias del Portal Digital de La Tercera - 25.06.2024. Interview and press note. Broadcast of a TV interview and press note for La Tercera Digital (https://www.latercera.com/).
Available at: https://www.latercera.com/laboratoriodecontenidos/formando-para-crear/video-explorando-el-pasado-prehistorico-de-la-tierra/#

2024 May
Noticias del Portal Cooperativa Ciencia - 15.05.2024. Press note of an interview by journalist Emilia Aguilar at Cooperativa Ciencia (www.cooperativaciencia.cl) on the scientific activities of the Microbial Ecophysiology Lab. under the context of Fondecyt Project 1221035.
Available at: https://www.cooperativaciencia.cl/ciencia/2023/05/15/la-prehistoria-en-extremofilos-del-volcan-copahue/.

2024 April
Noticias del Portal TSX plus - 22.04.2024/23.04.2024
Radio interview and press note. Broadcast of a radio interview by journalist Gabriel León for the program “Rockstars" and press note by Rodrigo Bravo at the multimedia platform TXSPlus (https://txsplus.com).
Available at: https://on.soundcloud.com/JkM1iJyENaL6LytQ8
Available at: https://txsplus.com/2024/04/raquel-quatrini-ecologia-microbiana/

2024 March
Participant in “Todo tiene su ciencia”, radio interview (06.03.2024). Broadcast of a radio interview by journalist Emilia Aguilar at the multimedia platform Cooperativa Ciencia for the program “Todo Tiene Su Ciencia". #CienciaConEllas: Raquel Quatrini. Microorganismos ancestrales y su potencial aporte a la minería.
Available at: https://www.youtube.com/live/fKGCPvXzZ8s?si=FIZJCSIrvH5aFzvt
Noticias del Portal USS - 04.03.2024
Press note. Brief interview by USS communication unit on the scientific activities of the Microbial Ecophysiology Lab. under the context of Fondecyt Project 1221035.
Available at: https://www.uss.cl/noticias/raquel-quatrini-pasado-prehistorico-tierra/

2024 February
Noticias del Portal MCH - 29.02.2024
Press note. Brief note on the scientific expedition to the Copahue Volcano and the applied interest of acidophiles recovered from this environment “Exploración científica en Volcán Copahue revela potencial de microorganismos extremófilos para la biominería verde”
Available at: https://www.mch.cl/negocios-industria/exploracion-volcan-copahue-potencial-microorganismos-biomineria-verde/

2023 July
Journey to Earth’s prehistoric past: scientific expedition explores extremophiles in Copahue Volcano
Press note. Brief interview by Belén Honores on the scientific activities of the Microbial Ecophysiology Lab. Under the context of Fondecyt Project 1221035.
Available at: https://cienciavida.org/2023/07/journey-to-earths-prehistoric-past-scientific-expedition-explores-extremophiles-in-copahue-volcano/
Available at: https://anid.cl/expedicion-cientifica-busca-extremofilos-en-volcan-copahue/

2022 June
Participant in the Exploradores: del átomo al cosmos, TV capsules. Brief interview on the scientific activities of the Microbial Ecophysiology Lab. Produced by Pablo Rosenblatt to be broadcasted by TVN´s Canal 24 Horas during the 2nd semester of 2022.

2020 October-to date.
Microalucinante, TV capsules. Animated series for school children produced by Pablo Rosenblatt, to be broadcasted during 2021. Production stage.
Funding: ANID ICM NCN17_093; Fondecyt 1181251

2020 May
Campo de géiseres El Tatio, el laboratorio geotérmico más alto del mundo para conocer virus. Brief interview by Lorenzo Palma, Ciencia en Chile, on the scientific activities taking place under the context of Fondecyt project 1190998.
Available at: https://www.cienciaenchile.cl/campo-de-geiseres-el-tatio-el-laboratorio-geotermico-mas-alto-delmundo-
para-conocer-virus/

2018 July
Participant in the Exploradores: del átomo al cosmos, TV capsules. Brief interview on the scientific activities of the Microbial Ecophysiology Lab. Produced by Pablo Rosenblatt to be broadcasted by TVN´s Canal 24 Horas during the 2nd semester of 2018.

2018 January
Scientific advisor in the ongoing production of “LocosLab”. Animated series for school children produced by DinoGorila (www.dinogorila.com) on diverse contingent scientific topics, including the revolutionary genomic edition tool, CRISPR/Cas9.

2016 August
Participant in the Ciencia para Todos, TV capsules. Brief interview on the scientific activities of the Microbial Ecophysiology Lab. Produced by Pablo Rosenblatt and broadcasted by TVN´s Canal 24 Horas during the 1st semester of 2017. Available at: https://www.youtube.com/watch?v=XfC6LlQTrWo&feature=youtu.be

2014 September
Scientific advisor in the production of Píldoras Científicas “Ursi y Magnogeek, Exploradores de Otro Mundo”, Temporada 2.
Six aimed videos for school-aged children were developed by Fundación Ciencia & Vida and Imago Productions as part of a series about microbial extremophiles and earth sciences. Author: Ulisse-Luz C; Creator: Rosemblat-Bono I; Science advisors: Quatrini R; Herve Allamand F; Funding: EPA20036. These videos were sponsored by Explora Conicyt and the Consejo Nacional de Televisión (CNTV) and are publicly available at Novasur.
www.novasur.cl/videos/el-inicio-del-viaje
www.novasur.cl/videos/avalancha
www.novasur.cl/videos/sofocante-aventura
www.novasur.cl/videos/congeladamente-vivos
www.novasur.cl/videos/profusas-profundidades
www.novasur.cl/videos/perdidos-por-accidente

Specialized audience

Conferences
1. Quatrini R. Sulfur Worlds on Earth: microbial succession and assembly in an extreme acidic volcanic river. XLVII Congreso Chileno de Microbiología. Viña del Mar, Chile. 24-27 November 2025.
2. Quatrini R. Eco-evolutionary divergence and population genomics in extremely acidic environments. Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE), Satellite Meeting on Molecular Mechanisms of Adaptation and Experimental Evolution, Puerto Varas, Chile. 6-8 October 2025.
3. Quatrini R. Bloque VI Salud: Medicina de precisión y terapias del futuro. Avances en genómica, terapias celulares y medicina de precisión. 1er Congreso Internacional de Córdoba, Córdoba, Argentina. 2-3 October 2025.
4. Quatrini R. Active participation in four structured breakout sessions delving into cutting-edge research opportunities in biomining critical minerals. International Workshop on BioMining of Critical Minerals and Elements organized by Society for Industrial Microbiology and Biotechnology and Novo Nordisk Foundation. Sitges, Barcelona, Spain. September 23-25, 2025
5. Quatrini R. Acidic microbiomes as model systems in eco-evolutionary studies. Global Microbiota Vault (GloMiNe-CHILE 2024). Zoom event. 9-10 January 2024
https://www.youtube.com/watch?v=_0dKN_NOyHc
6. Quatrini R. Microbial ecology of the Acidithiobacillia through the lens of population genomics. 2da Reunión Anual de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB_2023). Santa Cruz, Chile. 12-14 November 2023.
7. Quatrini R. Microbiología de ambientes acídicos extremos:una mirada desde la genómica, la ecología y la evolución. Coloquios SoMiCh, Copiapó, Chile. 26 October, 2022.
8. Quatrini R. Expanding and Exploring the Genetic Diversity of Acidithiobacillia Class Acidophiles From Known and Novel Niches Using Pangenomic Analysis. 2022 Astrobiology Science Conference – Atlanta, US. 15-20 May, 2022. Invited.
9. Quatrini R. Exploring the genetic diversity of Acidithiobacillia class acidophiles using pangenomics and genome-resolved metagenomics. CECs - Valdivia, Chile. 20 November, 2020.
10. Quatrini R. Expanding and exploring the catalogued diversity of Acidithiobacillia class acidophiles from novel niches.1st International Society for Microbial Ecology - Latin America (ISME-LA 2019). Valparaiso, Chile. 11-13 September, 2019.
11. Quatrini R. Quatrini R. Sulfur Worlds on Earth: microbial succession and assembly in an extreme acidic volcanic river. XLVII Congreso Chileno de Microbiolog??a. Vi?±a del Mar, Chile. 24-27 November 2025.
12. Quatrini R, Moya-Beltran A, Rojas C, Johnson DB. The Acidithiobacilli, genomics and evolution of the taxon. XXIV ALAM 2018 - XL SOMICH - II ASOCHIN - IX SLAMTB. Santiago, Chile. 13-16 November, 2018.
13. Quatrini R. A pangenomic approach to study species differentiation and niche adaptation of the Acidithiobacillae. BioSigma, Chile. 7 June, 2016.
14. Quatrini R, Holmes DS, Johnson DB. Genomic taxonomy of the Acidithiobacilli. 21st International Biohydrometallurgy Symposium. Bali, Indonesia. 5-9 October, 2015.
15. Quatrini R. The Acidithiobacilli´s Mobilome. XXXIII Congreso Chileno de Microbiología, Olmhué, Chile. 29 November – 3 December, 2011.
16. Quatrini R. Rampant genome shuffling revealed in extremely acidic econiches. VII International Symposium Science and Friendship – The North meets the South. 4-5 November, 2011.
17. Quatrini R, Covarrubias P, Silva C, Shmaryahu A, Acuña L, Holmes DS. CRISPRs on ICE: hints on the mobilization of these loci between genomes. International Plasmid Biology Conference, Bariloche, Argentina, 6-12 November, 2010.
18. Quatrini, R. Comparative genomics and ecophysiology of the biomining microbial consortium. Microbiology Coloquia. Santiago, Chile. 26 November, 2009.
19. Quatrini R, Lefimil C, Herrera J, Jedlicki E, Holmes DS. Chip-on-Chip Genomic Mapping of Fur Binding Sites in Acidithiobacillus ferrooxidans. XVIII Congreso Latinoamericano de Microbiología, Pucón, Chile. October, 2006.
20. Quatrini R. Microbial iron management mechanisms in extreme acidophiles. MIFAB – Santiago, Chile. October, 2005.
21. Quatrini R. Metabolic Reconstruction of the Iron Homeostasis response in the extreme acidophile Acidithiobacillus ferrooxidans. FCV – Santiago, Chile. August, 2004.
22. Quatrini R, Jedlicki E, Holmes DS. A Model of Iron Uptake and Homeostasis in Acidithiobacillus ferrooxidans Based upon Genome Analysis. CNRS – Marseille, France. March, 2004.
23. Quatrini R, Inostroza C, Veloso F, Jedlicki E, Holmes DS. Activación génica hierro dependiente por Fur en Acidithiobacillus ferrooxidans. XXIV Congreso Chileno de Microbiología. Punta de Tralca, Chile. Diciembre, 2002.

National Meetings (since 2010)
1. Issotta F, Rojas-Villalobos C, Arisan D, Díaz F, Sepulveda P, Carrasco H, Díez B, Quatrini R. Genomic diversity and concurrence of Acidithiobacillia class bacteria along a pH and electrochemical gradient. XLVII Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh). Viña del Mar, Chile. 24-27 Noviembre 2025.
2. Castro-Toro G, Sepúlveda Rebolledo P, Araya Sechi R, Quatrini R. Predicción in-silico de dominios transmembrana y señales de translocación en enzimas de sistemas de restricción-modificación: evidencia de una ADN-metiltransferasas orientadas hacia el periplasma. XLVII Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh). Viña del Mar, Chile. 24-27 Noviembre 2025.
3. Reyes-Impellizzeri S, Sepúlveda-Rebolledo P, Muñoz-Sarmiento C, Issotta F, Rojas-Villalobos C, Temporetti P, Quatrini R. Comparative genomics of Nitrogen metabolisms in Acidithiobacillia: patterns of diversity and evolution. XLVII Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh). Viña del Mar, Chile. 24-27 Noviembre 2025.
4. Tisalema Guanopatín E, Díaz Gonzalez F, Larrea Duharte C, Reyes Impellizzeri S, Rojas Villalobos C, Lobos DL, Moya Beltrán A, Quatrini R. Enfoque basado en rasgos para comprender la biología y ecología de Acidithiobacillia. XLVII Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh). Viña del Mar, Chile. 24-27 Noviembre 2025.
5. Larrea Duharte C, Gallardo Espíndola C, Moya-Beltrán A, Gallardo Y, Bucarey P, Johnson DB, Martinez P, Quatrini R. Caracterización ecofisiológica de Acidithiobacillus ferruginosus CF3: una cepa biominera hierro-oxidante altamente tolerante a metales. XLVII Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh). Viña del Mar, Chile. 24-27 Noviembre 2025.
6. Zapata-Araya A, Rojas-Villalobos C, Issotta F, Quatrini R. Hidden Realms in Acid Waters: uncovering viral diversity and biogeography along the Río Agrio gradient. IV Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2025). Santiago, Chile. 17 - 21 Noviember 2025.
7. Sepúlveda-Rebolledo P, Rojas-Villalobos C, Reyes-Impellizzeri S, Moya-Beltrán A, Martin AJM, Galán-Vasquez E, Pérez-Rueda E, Quatrini R. Lineage-level genomic blueprint of transcripcional regulation in Acidithiobacillia. IV Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2025). Santiago, Chile. 17 - 21 Noviember 2025.
8. Rojas-Villalobos C, Reyes-Impellizzeri S, Zapata-Araya A, Larrea-Duharte C, Issotta F, Lo?pez-Keim C, Vergara G, Castro M, Beard S, Quatrini R. From Natural Gradients to Controlled Reactors: A Genome-Resolved framework for applied bioleaching microbial ecology. IV Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2025). Santiago, Chile. 17 - 21 Noviember 2025.
9. López-Keim C, Jara Henríquez D, Issotta F, Sepúlveda-Rebolledo P, Rojas-Villalobos C, Ñancucheo I, Beard S, Quatrini R. De la Ecología a la Ingeniería: identificación, caracterización y distribución de AMPs en comunidades extremófilas de interés en biolixiviación y biorremediación. IV Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2025). Santiago, Chile. 17 - 21 Noviember 2025.
10. Issotta F, Rojas-Villalobos C, Arisan D, Díaz F, Duarte J, Reyes-Impellizzeri S, Pacheco S, Larrea C, Beard S, Castro M, Zapata-Araya A, Castro G, Gallardo Y, Carrasco H, Ulloa R, Johnson DB, Temporetti P, Giaveno A, Sepulveda P, Moya-Beltrán A, Díez B, Quatrini R. Genomic diversity and concurrence of Acidithiobacillia class bacteria along a pH and electrochemical gradient. IV Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2025). Santiago, Chile. 17 - 21 Noviember 2025.
11. Alegría Mera V, Lopéz-Tomasovic L, Sepúlveda Rebolledo P, Quatrini R, Vera M. In silico determination of components for carbohydrates uptake in chemolitotrophic bioleaching acidophile bacteria. IV Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2025). Santiago, Chile. 17 - 21 Noviember 2025.
12. Larrea C, Reyes-Impellizzeri S, Arisan D, Tisalema E, Muñoz-Sarmiento C, Gallardo C, Urrea N, Alarcón C, Carrasco H, Castro G, Bucarey P, Gallardo Y, Martínez-Bellange P, Quatrini R. Valoración funcional y patrimonial de un cepario de microorganismos de ambientes acídicos extremos. VII Simposio Valoración y Conservación de los Recursos Microbianos, Talca, Chile, 24-25 Septiembre 2025.
13. Beard S, Brain-Isasi S, López-Keim C, Morales-Valenzuela J, Acuña L, Quatrini R. Caracterización de promotores nativos de especies de la clase Acidithiobacillia utilizando vectores reporteros modulares basados en la plataforma pSEVA. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Coquimbo, Chile. 3-6 December 2024.
14. Duarte-Ramírez J, Issotta F, Rojas-Villalobos C, Arisan D, Gallardo Y, Carrasco H, Vera M, Castro M, Quatrini R. Dispersal and colonization dynamics of the Acidithiobacillus bacteria in microbial communities assembly in a natural extremely acidic environment. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Coquimbo, Chile. 3-6 December 2024.
15. Tapia G, Pacheco-Acosta S, Castro G, Gallardo Y, Castro M, Beard S, Quatrini R. Estudio de los sistemas de defensa y evaluación de la influencia de los sistemas de Restricción-Modificación (R-M) en la eficiencia de transformación en Fervidacidithiobacillus caldus ATCC 51756T. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Coquimbo, Chile. 3-6 December 2024.
16. Sofía Reyes-Impellizzeri, Francisco Issotta, Camila Rojas-Villalobos, Yasna Gallardo, Catalina Muñoz-Sarmiento, Pedro Temporetti, Raquel Quatrini. Nitrogen cycling in extreme acidic environments: Insights from the Copahue-Caviahue Volcanic Complex Poster. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Coquimbo, Chile. 3-6 December 2024.
17. Aguirre Ulloa A, Sepúlveda P, Fuentealba D, Quatrini R, Moya-Beltrán A. DNA sequence vectorization for bacterial species and subspecies delimitation using machine Learning classification methods. III Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2024). Concepción, Chile. 25 - 29 November 2024.
18. Issotta F, Rojas-Villalobos C, Arizan D, Toledo C, Alcorta J, Moya-Beltrán A, Díez B, Quatrini R. Microdiversity Driven by Temperature and pH Gradients in Hydrogeothermal Ecosystems: Insights from Genome-Resolved Metagenomics. III Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2024). Concepción, Chile. 25 - 29 November 2024.
19. Castillo-Vilcahuaman C, Rojas-Villalobos C, Sepúlveda-Rebolledo P, Ossandon FJ, Pacheco-Acosta S, Zapata A, Arisan D, Issotta F, Moya-Beltrán A, Quatrini R. MobHunter: A data integration platform for Mobile Genetic Elements prediction in microbial genomes. III Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2024). Concepción, Chile. 25 - 29 November 2024.
20. Díaz-González F, Rojas-Villalobos C, Sepúlveda-Rebolledo P, Issotta F, Temporetti P, Quatrini R. Community ecology: Exploring the iron-cycling microbial genes in a natural environmental pH gradient. III Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2024). Concepción, Chile. 25 - 29 November 2024.
21. Rojas-Villalobos C, Issotta F, Pérez-Acle T, Quatrini R. Development of a pipeline for binning and refinement of MAGs for improved genome-resolved metagenomic data analysis. III Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2024). Concepción, Chile. 25 - 29 November 2024.
22. Sepúlveda-Rebolledo P, Moya-Beltrán A, Beard S, Martin AJM, Quatrini R. Genome evolution of the Acidithiobacillia: mapping Structural Variations (SVs) and their contribution to diversification of the class. 3er Reunión Anual de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB_2024). Concepción, Chile. 26-29 November 2024.
23. Zapata-Araya A, Rojas-Villalobos C, Issotta F, Quatrini R. Revealing the unseen: Metagenomic co-assemblies illuminate the viral diversity in the Copahue-Caviahue Volcanic Complex. III Congreso de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB2024). Concepción, Chile. 25 - 29 November 2024.
24. Castro G, Beard S, Quatrini R. Identificación bioinformática y clasificación de Sistemas de Restricción-Modificación en bacterias de la clase Acidithiobacillia. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Pucón, Chile. 4 - 7 December 2023
25. Díaz-González F, Rojas-Villalobos C, Issotta F, Moya-Beltrán A, Gallardo Y, Carrasco H, Giaveno A, Temporetti P, Quatrini R. Exploring the biogeochemical cycle of iron in an extremely acidic natural environmental gradient. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Pucón, Chile. 4 - 7 December 2023
26. Duarte-Ramírez J, Issotta F, Rojas-Villalobos C, Moya-Beltrán A, Arisan D, Gallardo Y, Castro M, Quatrini R. Diversity of flagellar cluster in ecotypes of thiooxidans clade and the effect of pH on its motility phenotypes. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Pucón, Chile. 4 - 7 December 2023
27. Issotta F, Arisan D, Rojas-Villalobos C, Díaz-González F, Moya-Beltrán A, Temporetti P, Giaveno A, B Diez, Quatrini R. Microbial microdiversification of the Acidithiobacillia class members in a natural acidic watershed. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Pucón, Chile. 4 - 7 December 2023
28. Moya-Beltrán A, Beard S, Martin AJM, Quatrini R. Charting the structural variations landscape of Acidithiobacillia: insights into the diversification of the class from fully sequenced genomes. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Pucón, Chile. 4 - 7 December 2023
29. Pacheco-Acosta S, Castro G, Zapata A, Rojas-Villalobos C, Issotta F, Beard S, Moya-Beltrán A, Quatrini R. Population genomic analysis of Defense Systems Against Mobile Genetic Elements in the focal species Fervidacidithiobacillus caldus. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Pucón, Chile. 4 - 7 December 2023
30. Reyes-Impellizzeri S, Moya-Beltrán A, Rojas-Villalobos C, Issotta F, Gallardo Y, Degli-Esposti M, Quatrini R. Exploring the phylogenetic origins of the denitrification and nitrogen fixation pathways in the Ambacidithiobacillus genus. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Pucón, Chile. 4 - 7 December 2023
31. Rojas-Villalobos C, Issotta F, Díaz-González F, Reyes-Impellizzeri S, Zapata A, Ulloa R, Levicán G, Martin A, Pérez-Acle T, Diez B, Temporetti P, Giaveno A, Quatrini R. Structure and lifestyle of the native microbial communities across the Copahue-Caviahue-ChanchoCó geothermal system. XLV Congreso Chileno de Microbiología. Pucón, Chile. 4 - 7 December 2023
32. Quatrini R, Moya-Beltrán A, Issotta F, Rojas-Villalobos C, Arisan D, Díaz-González F, Beard S, Duarte JC, Pacheco S, Zapata A, Reyes-Impellizzeri S, Carrasco H, Gallardo Y. Microbial ecology of the Acidithiobacillia through the lens of population genomics. 2da Reunión Anual de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB_2023). Santa Cruz, Chile. 12-14 November 2023.
33. Moya-Beltrán A, Rojas-Villalobos C, Silva-Gacía D, Beard S, Quatrini R. A Pangenome-Centric Workflow for Mobile Genetic Elements Prediction in Draft Genomes. 2da Reunión Anual de la Sociedad Chilena de Bioinformática (SCB_2023). Santa Cruz, Chile. 12-14 November 2023.
34. Castro M, Rossoni S, Kirhman F, Segura I, Martínez-Bellange P, Beard S, Vera M, Quatrini R. Membrane Vesicles (MVs) produced by Acidithiobacillus biofilms as mediators in substrate colonization. XLIV Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2022). La Serena, Chile. 29 November – 2 Diciembre, 2022.
35. Beard S, Silva D, Moya-Beltrán A, Loyola A, Pérez-Acle T, Quatrini R. Phylogenomic and pangenomic analysis of the Acidithiobacillia class reveals a conserved signature set of Nucleoid-Associated Proteins (NAPs). XLIV Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2022). La Serena, Chile. 29 November – 2 Diciembre, 2022.
36. Moya-Beltrán A, Quatrini R. Caracterización del pangenoma del género Acidithiobacillus: contribución del complemento génico esencial y accesorio a la diversificación y evolución del taxón. XLIV Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2022). La Serena, Chile. 29 November – 2 Diciembre, 2022.
37. Issotta F, Cuevas M, Zapata A, Díaz M, Rojas-Villalobos C, Temporetti P, Quatrini R. Diversity of pelagic and sediment microbial communities from natural extreme-acidic Andean Lake Caviahue. XLIV Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2022). La Serena, Chile. 29 November – 2 Diciembre, 2022.
38. Arisan D, Moya-Beltran A, Rojas-Villalobos C, Issotta F, Gallardo Y, Carrasco H, Quatrini R. Intraspecific genetic variation of a novel extreme acidophilic bacterial species, Igneacidithiobacillus copahuensis, along the environmental gradient of Andean Geothermal System. XLIV Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2022). La Serena, Chile. 29 November – 2 Diciembre, 2022.
39. Rojas-Villalobos C, Moya-Beltrán A, Valenzuela C, Díaz-Yáñez F, Álvarez R, Castro M, Gil F, Paredes-Sabja D, Quatrini R. Antimicrobial resistance and persistence determinants in revised linages of the human gut commensal Faecalibacterium prausnitzii.XLI Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2019). Puerto Varas, Chile. 5-8 November, 2019.
40. Issotta F, Rojas-Villalobos C, Ulloa R, Giaveno A, Quatrini R. Benchmarking of taxonomy assignment methods for metagenomic analysis using acidic microbiomes as test case. XLI Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2019). Puerto Varas, Chile. 5-8 November, 2019.
41. Moya-Beltrán A, Quatrini R. Novel configurations of Type IV CRISPR-Cas system emerging from the Acidithiobacillusspecies complex as a study model. XLI Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2019). Puerto Varas, Chile. 5-8 November, 2019.
42. Arisan D, Valenzuela C, Rojas-Villalobos C, Issotta F, Gallardo Y, Carrasco H, Moya-Beltrán A, Castro M, Quatrini R. Integrative Conjugative Elements of the ICE.2 Family contribute to genetic plasticity in the Class Acidithiobacillia. XLI Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2019). Puerto Varas, Chile. 5-8 November, 2019.
43. Valenzuela C, Rojas-Villalobos C, Arisan D, Gallardo Y, Carrasco H, Moya-Beltrán A, Castro M, Quatrini R. Reconstrucción, identificación y comparación de elementos genéticos móviles episomales e integrativos del complejo específico Acidithiobacillus. XLI Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2019). Puerto Varas, Chile. 5-8 November, 2019.
44. Rossoni S, Castro M, Arisan D, Gallardo Y, Varas-Godoy M, Martínez-Bellange P, Quatrini R. Caracterización de vesículas de membrana en bacterias acidófilas del género Acidithiobacillus. XLI Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2019). Puerto Varas, Chile. 5-8 November, 2019.
45. Mena C, Moya-Beltran A, Issotta F, Quatrini R, Vera M. Genome analysis of species of the new bioleaching acidophilic bacterial genus Acidiferrobacter. . XXXIX Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2017). La Serena, Chile. 14-17 November, 2017.
46. Issotta F, Moya-Beltrán A, Ulloa R, Chiacchiarini P, Johnson DB, Giaveno A, Quatrini R.Mapping Acidithiobacilluspopulations with high resolution onto a natural environmental gradient. XXXIX Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2017). La Serena, Chile. 14-17 November, 2017.
47. Moya-Beltrán A, Issotta F, Acuña LG, Johnson DB, Quatrini R. Molecular systematics of the genus Acidithiobacillus: insights into the phylogenetic structure and diversification of the taxon. XXXIX Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2017). La Serena, Chile. 14-17 November, 2017.
48. Flores-Ríos R,Acuña LG, Orellana O, Quatrini R.Type IV secretion systems in Integrative Conjugative Elements of the genus Acidithiobacillus. XXXIX Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2017). La Serena, Chile. 14-17 November, 2017.
49. Cordero KA, Moya-Beltrán A, Ormeño F, Riquelme, Quatrini R, Budini M. Transcriptomic analysis by RNA-Seq in a TDP-43 aggregation model. XXXI Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile. Puerto Varas, Chile. 22-26 October, 2017.
50. Castro M, Pagliai F, Lorca G, Guiliani N, Quatrini R. Functional evaluation of proteins involved in metabolism and transduction of c-di-GMP coded in the integrative conjugative element ICEAcaTY.2 of Acidithiobacillus caldus. XXXVIII Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh 2016). Valdivia, Chile. 22-25 November, 2016.
51. María Ignacia von Unger1,2, Lillian Acuña1, Ana Moya1, Paulo Covarrubias1,2, Nicolás Guiliani3, Raquel Quatrini1,2, Matías Castro1.The Integrative and Conjugative Element ICEAcaTY.2 and its contribution to adhesion and biofilm development. XXXVII Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh-2015). La Serena, Chile. 1-4 December, 2015.
52. Harold Nuñez, Juan Pablo Cardenas, Ana Moya, Francisco Issotta, Mónica Gonzalez, D. Barrie Johnson, Raquel Quatrini. Targeted metagenomic analysis of Mynydd Parys Acid Mine Drainage microbial communities. XXXVII Congreso Chileno de Microbiología (SoMiCh-2015). La Serena, Chile. 1-4 December, 2015.
53. Fortt J, Ossandón FJ, Cardenas JP, Quatrini R, Remonsellez F. Possible mechanisms of salt stress response in the halotolerant bacterial strain Exiguobacterium sp. SH31 isolated from Salar de Huasco. XXXVI Congreso Chileno de Microbiología: SoMiCh 2014. La Serena, Chile. 2-5 Diciembre, 2014.
54. Flores R, Acuña L, Castillo A, Quatrini R, OrellanaO. Caracterización del T4SS presente en el ICEAfe1, un elemento genético móvil de la bacteria acidófila Acidithiobacillus ferrooxidans. XXXVI Congreso Chileno de Microbiología: SoMiCh 2014. La Serena, Chile. 2-5 Diciembre, 2014.
55. Castro M, Guiliani N,Quatrini R. Reconstrucción bioinformática de la vía del c-di-GMP en el genoma flexible de bacterias del género Acidithiobacillus. XXXV Congreso Chileno de Microbiología. Marbella, Chile. 26-30 November, 2013.
56. Flores R, Tello M, Quatrini R, Orellana O. Análisis de la expresión y del uso de codones del sistema tracodificado en el elemento integrativo conjugativo ICEAfe1 de Acidithiobacillus ferrooxidansATCC 23270. XXXV Congreso Chileno de Microbiología. Marbella, Chile. 26-30 November, 2013.
57. Acuña LA, Quatrini R. Variantes atípicas del sistema de interferencia génica CRISPR-Cas en la bacteria acidófila de biominería Acidithiobacillus caldus. XXXV Congreso Chileno de Microbiología. Marbella, Chile. 26-30 November, 2013.
58. Nuñez H, Cardenas JP, Loyola D, Quatrini R. Microbial diversity of bioleaching industrial samples using a multilocus sequence typing scheme for Acidithiobacillus caldus. 20th International Biohydrometallurgy Symposium. Antofagasta, Chile. 8-11 October, 2013.
59. Moya F, Álamos P, Cárdenas JP, Loyola D, Smaryahu A, Orellana O, Quatrini R, Levicán G Functional insights into the stress response caused by hydrogen peroxide in Acidithiobacillus ferrooxidans. 20th International Biohydrometallurgy Symposium. Antofagasta, Chile. 8-11 October, 2013.
60. Acosta M, Salazar CN, Quatrini R, Shmaryahu A, Holmes DS, Velásquez A, Espoz C, Pinilla C, Demergasso CS..Temporal dynamics of genes involved in metabolic pathways of C and N of Leptospirillum ferriphilum, in the industrial bioleaching process of Escondida mine, Chile. 20th International Biohydrometallurgy Symposium. Antofagasta, Chile. 8-11 October, 2013.
61. Salazar CN, Acosta M, Galleguillos PA, Shmaryahu A, Quatrini R, Holmes DS, Demergasso CS. Analysis of gene expression in response to stress induced by copper in Acidithiobacillus ferrooxidans strain D2, an isolated from a copper bioleaching operation. 20th International Biohydrometallurgy Symposium. Antofagasta, Chile. 8-11 October, 2013.
62. Covarrubias P, Haristoy JJ, Tapia P, Acuña L, Cárdenas JP, Riadi G, Shmaryahu A, Ossandon F, Holmes DS, Quatrini R. Whole genome comparison of Acidithiobacillus caldusstrains: insights into the core and the varaible genome.XXXIII Congreso Chileno de Microbiología, Olmhué, Chile. 29 November – 3 December, 2011.
63. Acuña L, Covarrubias P, Quatrini R. ¿What is the relation between the CRISPR/Cas system and biofilm formation in Acidithiobacillus caldus? XXXIII Congreso Chileno de Microbiología, Olmhué, Chile. 29 November – 3 December, 2011.
64. Bustamante P, Levicán G, Quatrini R, Holmes DS, Orellana O. ICEAfe1, an active integrative-conjugative element from Acidithiobacillus ferrooxidans. XXXIII Congreso Chileno de Microbiología, Olmhué, Chile. 29 November – 3 December, 2011.
65. Salinas K, Galleguillos P, Quatrini R, Demergasso C. Bioinformatic comparative analysis of Nitrogen fixation genes in Leptospirillumspecies. XXXIII Congreso Chileno de Microbiología, Olmhué, Chile. 29 November – 3 December, 2011.
66. Salinas K, Galleguillos P, Acosta M, Quatrini R, Demergasso C. Genomic analysis and response to osmotic stress in two Acidithiobacillus thiooxidansstrain. XXXIII Congreso Chileno de Microbiología, Olmhué, Chile. 29 November – 3 December, 2011.
67. Molina-Quiroz RC, Loyola D, Muñoz C, Quatrini R, Vásquez CC, Pérez-Donoso JM. Transcriptional changes that would explain the synergistic effect of tellurite and cefotaxime on E. coli. XXXIII Congreso Chileno de Microbiología, Olmhué, Chile. 29 November – 3 December, 2011.
68. Arenas M, Marques de Souza Neto N, Gonzales-Nilo D, Holmes DS, Pohl E, Quatrini R. Structural and Biophysical Characterization of Fur (Ferric Uptake Regulator) from an Extreme Acidophile Thriving in an Iron Rich Environment. XXXIV Reunión Anual Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular de Chile, Valdivia, Chile. 27-30 September, 2011.
69. Tapia P, Covarrubias P, Haristoy JJ, Cárdenas JP, Acuña L, Silva C, Shmaryahu A, Holmes DS, Demergasso C, Quatrini R. Ocurrence and diversity of horizontal gene transfer systems in bioleaching genomes. XXXII Congreso Chileno de Microbiología, Antofagasta, Chile, 30 November - 3 December, 2010.
70. Garcés K, Cárdenas JP, Núñez H, Covarrubias P, Shmaryahu A, Acosta M, Galleguillos P, Demergasso C, Holmes DS, Quatrini R. Biofilm Formation Capabilities in the Bioleaching Microbial Consortium: A Comparative Genomics Approach. XXXII Congreso Chileno de Microbiología, Antofagasta, Chile, 30 November - 3 December, 2010.
71. Cárdenas JP, Arenas M, Demergasso C, Galleguillos P, Acosta M, Holmes DS, Levicán G, Quatrini R. Comparative genomics of the oxidative stress response in acidophilic microorganisms. XXXII Congreso Chileno de Microbiología, Antofagasta, Chile, 30 November - 3 December, 2010.
72. Norambuena J, Flores R, Cárdenas JP, Quatrini, R, Levicán G. Analysis of the thioprotector system of Leptospirillum ferriphilum DSM14647. XXXII Congreso Chileno de Microbiología, Antofagasta, Chile, 30 November - 3 December, 2010.
73. Acosta M, Galleguillos P, Salinas K, Holmes DS, Quatrini R, Demergasso C. Aerobic production of copper sulfide by Acidithiobacillus thiooxidans strain CL. XXXII Congreso Chileno de Microbiología, Antofagasta, Chile, 30 November - 3 December, 2010.
74. Arias D, Galleguillos P, Holmes DS, Quatrini R, Demergasso C. Protemic study of Lesptospirillum ferriphilum, response to osmotic stress of strain IESL25. XXXII Congreso Chileno de Microbiología, Antofagasta, Chile, 30 November - 3 December, 2010.

International Meetings (Since 2010)
1. Arisan D, Tisalema Guanopatín D, Vergara G, Vera M, Quatrini R. Salt-enhanced growth and aggregation in novel acidophile Igneacidithiobacillus copahuensis relevant to saline bioleaching. 26th International Biohydrometallurgy Symposium (IBS2026) Oreláns, France. 28-30 September, 2026.
2. Arisan D, Moya-Beltrán A, Rojas-Villalobos C, Issotta F, Quatrini R. Genomic signatures of selection in Igneacidithiobacillus copahuensis populations along an environmental gradient. Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE), Satellite Meeting on Molecular Mechanisms of Adaptation and Experimental Evolution. Puerto Varas, Chile. 6-8 October 2025
3. Rojas-Villalobos C, Díaz-González F, Reyes-Impellizzeri S, Zapata-Araya A, Larrea-Duharte C, López-Kleim C, Muñoz C, Gallardo Y, Carrasco H, Castro M, Issotta F, Beard S, Quatrini R. Semisynthetic microbial consortia for the study of bioleaching community assembly under controlled conditions. FEMS Micro, Milan, Italy 14-17 July, 2025.
4. Issotta, F; Rojas-Villalobos, C; Arisan, D; Diaz, F; Duarte, J; Reyes-Impellizzeri, S; Pacheco, S; Larrea C; Beard, S., Castro, M; Zapata-Araya, A; Castro, G; Gallardo, Y; Carrasco, H., Ulloa, R; Johnson, DB; Temporetti, P; Giaveno, A; Sepulveda P; Moya-Beltrán, A; Quatrini, R. Genomic diversity and concurrence of Acidithiobacillia class bacteria along a pH and electrochemical gradient. FEMS Micro, Milan, Italy 14-17 July, 2025.
5. Beard S, Brain-Isasi S, López-Keim C, Tapia-Donoso G, Morales-Valenzuela J, Gallardo Y, Carrasco H, Castro M, Quatrini R. Development of a liposome-based delivery system for the manipulation of Acidithiobacillia bacteria and their communities in extreme environments and industrial settings. ASM Microbe 2025, Los Angeles, June 19-23, 2025.
6. Sepúlveda-Rebolledo P, Rojas-Villalobos C, Reyes-Impellizzeri S, Moya-Beltrán A, Issotta F, Temporetti P, Pérez-Rueda E, Quatrini R. Imprints on gene regulation at the class scale: a lineage-level study of Acidithiobacillia Transcription Factors. 4th Congreso Latinoamericano de Ecología Microbiana (ISME Lat 2025). Mérida, México. 4-9 August 2025.
7. Pacheco-Acosta S, Moya-Beltrán A, Sepulveda P, Castro G, Zapata A, Rojas-Villalobos C, Issotta F, Beard S, Diez B, Quatrini R. Interplay Between Type IV-A CRISPR-Cas Systems and Plasmid Dynamics in Fervidacidithiobacillus caldus. CRISPR Meeting 2025. Christchurch, New, Zealand. 16-20 February, 2025.
8. Issotta F, Rojas-Villalobos C, Arisan D, Toledo C, Alcorta J, Moya-Beltrán A, Diez B, Quatrini R. Diversity within species in South American terrestrial hydrothermal systems. 14th International Congress on Extremophiles, Loutraki, Greece, 22-26 September, 2024.
9. Arisan D, Moya-Beltrán A, Rojas-Villalobos C, Issotta F, Quatrini R. Uncultured bacteria from terrestrial geothermal regions expand the contours of the Acidithiobacillia class. 19th International Society for Microbial Ecology. Cape Town, South Africa, 18-23 August, 2024.
10. Arisan D, Moya-Beltrán A, Duarte J, Issotta F, Rojas-Villalobos C, Quatrini R. The effect of fluctuating selection on salt stress tolerance and plasticity in novel species Igneacidithiobacillus copahuensis. 3rd International Society for Microbial Ecology - Latin America (ISME-LA 2023). Buenos Aires, Argentina. 7-10 August, 2023.
11. Issotta F, Rojas-Villalobos C, Moya-Beltrán A, Arisan D, Duarte J, Quatrini R. Ecotypes of extremely acidophilic bacteria of the Acidithiobacillia class along a natural pH gradient. 8th Congress of European Microbiologists - FEMS2023. Hamburg, Germany. 9-13 July, 2023.
12. Castro M, Rossoni S, Osorio-Kirhman F, Segura I, Martínez-Bellange P, Beard S, Vera M, Quatrini R. Membrane Vesicles (MVs) produced by Acidithiobacillus biofilms as mediators in substrate colonization. 3rd International Symposium on Extreme Environments and Extremophile Organisms (ISEO3). Santo Domingo, República Dominicana. 21-23 November, 2022.
13. Quatrini R, Moya-Beltrán A, Issotta F, Arisan D, Rojas-Villalobos C, Beard S, Castro M. Expanding and exploring the genetic diversity of Acidithiobacillia class acidophiles from known and novel niches using pangenomic analysis. Astrobiology Science Conference (AbSciCon 2022). 15-20 May. Atlanta, US
14. Godoy-Morán R, Moya-Beltrán A, Schlömann M, Vargas IT, Quatrini R, Vera M. Genomic and physiologic characterization of new mixotrophic arsenic oxidizing Ancylobacterisolated from high Andean sediments near Tacora volcano. 1st International Society for Microbial Ecology - Latin America (ISME-LA 2019). Valparaiso, Chile. 11-13 September, 2019.
15. Lima MA, Issotta FA, Moya-Beltrán A, Urbieta MS, Quatrini R, Donati E. Evaluación de perfil taxonómico y funcional de consorcios autótrofos y heterótrofos arsénico-tolerantes recuperados de Salto del Agrio (Neuquén, Argentina). 1st International Society for Microbial Ecology - Latin America (ISME-LA 2019). Valparaiso, Chile. 11-13 September, 2019.
16. Castro M, Rossoni S, Gallardo Y, Varas M, Martínez-Bellange P, Quatrini R. Vesiculation is a common phenomenon in extreme acidophilic bioleaching bacteria of the Acidithiobacillus genus. 1st International Society for Microbial Ecology - Latin America (ISME-LA 2019). Valparaiso, Chile. 11-13 September, 2019.
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