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Francisco Pablo Chávez Espinosa

Profesor Asistente

Universidad de Chile

Santiago, Chile

Líneas de Investigación


Systems Biology and Live cell imaging approaches for host-pathogen-microbiome interaction studies. Development of novel anti-virulence using surrogate host models for bacterial infections.

Educación

  •  Microbiología , UNIVERSIDAD DE CHILE. Chile, 2006
  •  Bioquímico, Universidad de la Habana. Cuba, 1995

Experiencia Académica

  •   Profesor Asistente Full Time

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Facultad de Ciencias

    Santiago, Chile

    2010 - A la fecha

  •   Instructor Full Time

    UNIVERSIDAD DE CHILE

    Facultad de Ciencias

    Santiago, Chile

    2007 - 2010

Experiencia Profesional

  •   Investigador Full Time

    Centro de Ingeniería Genética y Biotecnología

    Ciudad Habana, Cuba

    1995 - 2000

  •   Profesor Asistente Full Time

    Universidad de Chile

    Santiago, Chile

    2008 - A la fecha

  •   Investigador Jr. Other

    Instituto Milenio Biología Celular y Biotecnología (CBB)

    Santiago, Chile

    2007 - 2010

Formación de Capital Humano


1. Julieta Delfin
Título: "Aislamiento y caracterizacion del represor Mig1 de la levadura Candida utilis",
Institución: UNIVERSIDAD DE LA HABANA, Licenciatura/Bachillerato/Bachelor, 2000

2. Cristian Varela
Título: "Estudios de proteómica diferencial de bacterias con niveles deficientes de los polifosfatos inorgánicos",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2009

3. Cecilia Mauriaca
Título: "Estudio del mecanismo de acción de los polifosfatos inorgánicos en la resistencia al cobre mediante mutaciones en la bacteria Escherichia coli ",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2007

4. Cecilia Mauriaca
Título: "Caracterización de la bacteria Pseudomonas sp. B4 con niveles deficientes de los polifosfatos inorgánicos",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Licenciatura/Bachillerato/Bachelor,

5. Camilo Valdivieso
Título: "Estudios de proteomica cuantitativa en mutantes de Escherichia coli deficientes en las enzimas relacionadas con el metabolismo de los polifosfatos inorganicos",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Licenciatura/Bachillerato/Bachelor, 2011

6. Javiera Ortiz Severín
Título: "Análisis de los cambios proteómicos y fenotípicos de los mutantes en la síntesis de los polifosfatos en Pseudomonas aeruginosa PAO1",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2013

7. Macarena Varas Poblete
Título: "Estudio de microarreglos fenotípicos en mutantes del metabolismo de los polifosfatos en Escherichia coli",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Licenciatura/Bachillerato/Bachelor, 2016

8. Constanza Lecaros Peillard
Título: "Estudio de la virulencia de mutantes de la síntesis de los polifosfatos y pigmentos toxicos en Pseudomonas aeruginosa en el pez cebra (Danio rerio)",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Licenciatura/Bachillerato/Bachelor, 2016

9. Javiera Alvarez Moran
Título: "Síntesis, purificación y caracterización de la enzima polifosfato quinasa 1 (PPK1) de Pseudomonas aeruginosa expresada en Escherichia coli",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Licenciatura/Bachillerato/Bachelor, 2015

10. Macarena Varas Poblete
Título: "Caracterización del proceso infectivo de mutantes de Salmonella enterica serovar Typhimurium deficientes en la síntesis de los polifosfatos inorgánicos en D. discoideum, Danio rerio y macrófagos marinos.",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Doctorado/PhD, 2016

11. Francisca Campos Urrutia
Título: "Desarrollo de un protocolo de sobreexpresión y purificación, y una metodología enzimática a gran escala (high-throughput) para medir la actividad de la proteína polifosfato quinasa 1, (PPK1) de Escherichia coli.",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Licenciatura/Bachillerato/Bachelor, 2016

12. Sebastian Riquelme
Título: "Identificación a escala genómica de genes involucrados en la supervivencia intracelular de Salmonella Typhimurium en el protozoo Dictyostelium discoideum",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2016

13. Francisco Díaz Pascual
Título: "Estudio de proteómica comparativa de modelos de infección por inyección e inmersión estática de Pseudomonas aeruginosa PAO1 en Danio rerio (pez cebra)",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Licenciatura/Bachillerato/Bachelor, 2015

14. Catalina Bravo Toncio
Título: "Estudios fenotípicos de la virulencia de Pseudomonas aeruginosa PAO1 utilizando como modelo de infección la ameba Dictyostelium discoideum.",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2015

15. Javiera Ortíz Severín
Título: "Elementos Genéticos Extracromosomales en Piscirickettsia salmonis: estudios de los factores de virulencia y su rol durante la infección in vivo e in vitro.",
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Doctorado/PhD, 2018

16. Javiera de la Paz
Título: "Identificación de las proteínas presentes en el Líquido Perivitelino (LPV) y determinación de su función defensiva en Danio rerio",
Institución: UNIVERSIDAD ANDRES BELLO, Doctorado/PhD, 2019.

17. Marcos Joel Hernández
Título: "Uso de la ameba Dictyostelium discoideum para la búsqueda de moléculas antimicrobianas contra cepas virulentas y/o multiresistentes de Klebsiella pneumoniae"
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2019

18. Andrés Romero
Título: "Ingeniería reversa de Switches Optogenéticos: hacía la identificación de módulos versátiles para el control de la expresión génica"
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2020

19. Daniel Salinas
Título: "Estudio de la microbiotamas de Venus antiqua (almeja) expuestos a Alexandrium catenella"
Institución: UNIVERSIDAD DE CHILE, Magíster/Master/DEA, 2021


Difusión y Transferencia


2011 - Participación en Programa Radio “Quiero ser Científico” de la Facultad de Ciencias, Radio Universidad de Chile. https://radio.uchile.cl/2012/08/30”-ser-cientifico”-recuerda-sus-dos-temporadas-al-aire-en-radio-universidad-de-chile/).
2012 - Participación en el Programa Radial “Quiero ser Científico” de la Facultad de Ciencias, Radio Universidad de Chile. https://radio.uchile.cl/2012/08/30”-ser-cientifico”-recuerda-sus-dos-temporadas-al-aire-en-radio-universidad-de-chile/)
2013 - Participación en el Programa Radial “Quiero ser Científico” de la Facultad de Ciencias, Radio Universidad de Chile. (https://www.uchile.cl/noticias/89360/la-ciencia-debe-ser-abordada-en-forma-multidisciplinaria)

2014 - Participación en la iniciativa 1000 Científicos 1000 Aulas. Charla: Bacterias buenas y malas. Colegio Nehuen, Talagante, Región Metropolitana.
- Visita de alumnos de Educación Media al Laboratorio de Ecología Microbiana. Colegio Elena Rojas de La Florida.
- Participación en las capsulas científicas de la Facultad de Ciencias “Ciencia para todos”, producido por la Productora Nanuk, auspiciado por Santillana y transmitido por CNN-Chile.
- Visita Profesor Antonio Lazcano a Chile. Conferencia “El origen de la vida” conmemorando los 50 años de la Facultad de Ciencias, visita al programa de Radio Quiero ser científico con estudiantes del Colegio Leonardo da Vinci (Talagante).

2015 - Participación en la feria científica “El científico va a la calle" de la Facultad de Ciencias, Universidad de Chile. Plaza de Armas, Santiago, Chile.
- Participación del comité organizador de la visita de los Premios Nobel y Medalla Fields por el Aniversario 50 de la Facultad de Ciencias. Facultad de Ciencias, Universidad de Chile
- Participación en el Programa Radial “Quiero ser Científico” de la Facultad de Ciencias, Universidad de Chile. Conductora: Prof. Hortensia Morales (http://radio.uchile.cl/programas/a/quiero-ser-cientifico).
- Participación en la iniciativa 1000 Científicos 1000 Aulas. Charla: “El mundo que no vemos”. Colegio Integral Arturo Prat, Talagante, Región Metropolitana.

2016 - Participación en la feria científica “El científico va a la calle" de la Facultad de Ciencias, Universidad de Chile. Plaza de la Constitución, Santiago, Chile.
- Participación en el Programa Radial “Quiero ser Científico” de la Facultad de Ciencias, Universidad de Chile. (https://tinyurl.com/rjnbab9)
- Participación en la iniciativa 1000 Científicos 1000 Aulas. Charla: Bacterias buenas y malas. Colegio Garden School, Talagante, Región Metropolitana. Agosto.
- Reportaje publicado en revista Heureka: Observatorio de Ciencias. “TARA Oceans: contar a historia de la vida”. (http://heureka-online.com/observatorio-de-ciencias/tara-oceans)
- Entrevista Televisión Nacional de Chile, Programa 24 horas “Revolución Genética: Desde eliminar enfermedades hasta cambiar los rasgos físicos de los hijos" (https://tinyurl.com/jpdb25mp). Periodista: Daniel Silva, (TVN, 24 horas).
- Participación en la feria científica “El científico va a la calle" de la Facultad de Ciencias, Universidad de Chile. Plaza de Armas de Santiago.

2017 - Entrevista Televisión Nacional de Chile Programa 24 horas “El desconocido impacto de las bacterias en nuestro cuerpo" (https://tinyurl.com/cft884bx). Periodista: Daniel Silva, (TVN, 24 horas).
- Reportaje en portal Universidad de Chile. “Rápido, eficiente y barato: Estudiantes crean dispositivo para detectar la marea roja” Periodista: Francisca Siebert (https://www.uchile.cl/noticias/136723/estudiantes-crean-dispositivo-para-detectar-la-marea-roja).
- Reportaje El Mercurio sobre participación del equipo Team_UChile_Biotec en competencia iGEM “Estudiantes desarrollan dispositivo para detectar presencia de marea roja” (http://www.economiaynegocios.cl/noticias/noticias.asp?id=388369),
- Reportaje revista Heureka: Observatorio de Ciencias. “TARA Oceans: contar a historia de la vida”. (http://heureka-online.com/observatorio-de-ciencias/plantas-marinas) Autor: Chávez FP.

2018 - Entrevista Televisión Nacional de Chile Programa 24 horas “Uso de antibióticos: ¿Es necesario respetar todo el tratamiento?" (https://tinyurl.com/j3xvfyaj) Periodista: Daniel Silva, (TVN, 24 horas).
- Reportaje La Tercera. “Equipo de la U. de Chile se impone a 300 universidades en olimpiada científica con detector de marea roja” (https://tinyurl.com/32fzbds)
- Reportaje en Diario El Mostrador. “Jóvenes ganan bronce en competencia científica internacional con innovación que anticipa la presencia de marea roja” (https://tinyurl.com/7ccfd787),
- Reportaje en Diario El Dinamo“Estudiantes chilenos logran medalla de bronce en olimpiada científica de EE.UU. con sensor de marea roja (https://tinyurl.com/bpkr4rmb).
- Reportaje portal Universidad de Chile. “Equipo de la U. de Chile triunfó en olimpiada científica con biosensor rápido de marea roja” (https://www.uchile.cl/noticias/148748/equipo-de-la-u-de-chile-triunfo-en-olimpiada-cientifica-en-boston),
- Entrevista Sitio Explora: Un programa de Conicyt “La religión de las bacterias” (https://www.explora.cl/blog/la-religion-de-las-bacterias-3/). Periodista: Nicolás Alonso.
- Reportaje portal Universidad de Chile. "Gráfica con microbios": El taller de la U. de Chile que vincula el arte con la ciencia. (https://www.uchile.cl/noticias/150339/grafica-con-microbios-el-taller-que-vincula-el-arte-con-la-ciencia).
- Reportaje Las Últimas Noticias: “Gráfica con Microbios: Futuros profesores aprendieron a dibujar con bacterias. (http://www.lun.com/Pages/NewsDetail.aspx?dt=2018-12-24&PaginaId=19&bodyid=0),

2019 - Visita al Colegio Tajamar, Providencia. Realización del Taller Pintando con microbios (André Barbet, Andrés Marcoleta, Julieta Orlando y Macarena Varas), Participación en Trabajo Práctico.
- Semana de la Ciencia. Visita del Colegio Instituto Talagante a la Facultad de Ciencias (Vivero de Peces, Laboratorio Microbiología de Sistemas (SysmicroLab), Unidad de Microscopia Avanzada (UMA).
- Participación en el Programa Radial “Creando Conocimientos” de la Vicerrectoría de investigación y Desarrollo (VID) de la Universidad de Chile (https://radio.uchile.cl/programas/a/creando-conocimiento/).

2020 - Participación en el Programa Radial “La Ciencia del Futuro” TXS Radio (https://soundcloud.com/txsradio/la-ciencia-del-futuro-con-francisco-chavez-2-de-abril ). Conductor: Daniel Silva (TVN). Tema “La Pandemia del Coronavirus”.
- Reportaje Chile Científico “La huella genética del Coronavirus” (https://chilecientifico.com/la-huella-genetica-del-coronavirus-nexstrain/)
- Reportaje TVN 24 Horas Central. Tema “Lo que se sabe del COVID-19: ¿Cuándo llegará la vacuna a Chile? https://www.youtube.com/watch?v=FqsJW2MscJQ,
- Reportaje TVN 24 Horas Central “Las vacunas contra el Covid19”. https://www.youtube.com/watch?v=exiwtjwQ_3o,
- Foro Reflexiones Covid19. Ética en la divulgación científica durante la pandemia de Covid19 (1ra Parte). Conferencistas Dr. Francisco P. Chávez y Daniel Silva, Moderador: Dr. Jorge Ossa Londoño.
- Foro Reflexiones Covid19. Ética en la divulgación científica durante la pandemia de Covid19 (2da Parte). Conferencistas Richard Harris Moderadores: Jorge Ossa Londoño y Dr. Francisco P. Chávez.

2015-2020 - Curso electivo Biotecnología del Liceo Manuel de Salas. Coordinadoras: Alejandra Aguirre. Participación en Clases teóricas y Pasantías en laboratorio de Microbiología de Sistemas (SysmicroLab). Facultad de Ciencias, Universidad de Chile.
2010-2020 - Blog de divulgación científica bioBlogia (http://www.facebook.com/bioblogia), con 4047 seguidores en Facebook y 3487 en twitter @bioblogia.

2014-2020 Quiero ser Científico: Bioquímica en la Cocina BQ321-1 Curso Escuela de Verano (EdV Universidad de Chile). Coordinador Alejandro Roth.
2014-2018 Biología en tus manos. (https://www.edv.uchile.cl/course/biologia-en-tus-manos/). Curso Escuela de Verano (EdV Universidad de Chile).


Premios y Distinciones

  •   Medalla Hermann Niemeyer

    SOCIEDAD DE BIOQUIMICA DE CHILE

    Chile, 2006

    El Premio Anual Medalla Hermann Niemeyer se entrega anualmente por la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular de Chile a un estudiante destacado de los Programas de Doctorado en Bioquímica y Biología Molecular y otras áreas afines.


 

Article (28)

Mapping the microbial diversity and natural resistome of north Antarctica soils
Global Proteomic Profiling of Piscirickettsia salmonis and Salmon Macrophage-Like Cells during Intracellular Infection
The Zebrafish Perivitelline Fluid Provides Maternally-Inherited Defensive Immunity
Transcriptomic Changes of Piscirickettsia salmonis During Intracellular Growth in a Salmon Macrophage-Like Cell Line
Fluorescence enzymatic assay for bacterial polyphosphate kinase 1 (PPK1) as a platform for screening antivirulence molecules
Piscirickettsia salmonis Cryptic Plasmids: Source of Mobile DNA and Virulence Factors
Evaluating Different Virulence Traits of Klebsiella pneumoniae Using Dictyostelium discoideum and Zebrafish Larvae as Host Models
Inhibiting Pathogen Surface Adherence by Multilayer Polyelectrolyte Films Functionalized with Glucofuranose Derivatives
Inorganic Polyphosphate Is Essential for Salmonella Typhimurium Virulence and Survival in Dictyostelium discoideum
Datasets for transcriptomics, q-proteomics and phenotype microarrays of polyphosphate metabolism mutants from Escherichia coli
In vivo Host-Pathogen Interaction as Revealed by Global Proteomic Profiling of Zebrafish Larvae.
Live-cell imaging of Salmonella Typhimurium interaction with zebrafish larvae after injection and immersion delivery methods
Multi-level evaluation of Escherichia coli polyphosphate related mutants using global transcriptomic, proteomic and phenomic analyses
Salmonella Typhimurium induces cloacitis-like symptoms in zebrafish larvae
Transgenerational Diapause as an Avoidance Strategy against Bacterial Pathogens in Caenorhabditis elegans
Dictyostelium discoideum as a surrogate host-microbe model for antivirulence screening in Pseudomonas aeruginosa PAO1
Relevant Genes Linked to Virulence Are Required for Salmonella Typhimurium to Survive Intracellularly in the Social Amoeba Dictyostelium discoideum
Multiple antibiotic susceptibility of polyphosphate kinase mutants (ppk1 and ppk2) from Pseudomonas aeruginosa PAO1 as revealed by global phenotypic analysis
Polyphosphate Synthesis as a Target for Novel Antibiotics
New structural and functional defects in polyphosphate deficient bacteria: A cellular and proteomic study
Constitutive and regulated expression vectors to construct polyphosphate deficient bacteria
Motility and chemotaxis of Pseudomonas sp B4 towards polychlorobiphenyls and chlorobenzoates
Growth of polychlorinated-biphenyl-degirading bacteria in the presence of biphenyl and chlorobiphenyls generates oxidative stress and massive accumulation of inorganic polyphosphate
The exopolyphosphatase gene from Sulfolobus solfataricus: Characterization of the first gene found to be involved in polyphosphate metabolism in Archaea
Cloning and sequence analysis of the gene encoding invertase (INV1) from the yeast Candida utilis
Development of an integrative DNA transformation system for the yeast Candida utilis
Isolation and sequence analysis of the orotidine‐5'‐phosphate decarboxylase gene (URA3) of Candida utilis. Comparison with the OMP decarboxylase gene family
Purification and characterization of an invertase from Candida utilis: comparison with natural and recombinant yeast invertases

BookWhole (2)

Static Immersion and Injection Methods for Live Cell Imaging of Foodborne Pathogen Infections in Zebrafish Larvae
Use of C. elegans Diapause to Study Transgenerational Responses to Pathogen Infection

Patent (1)

Method for Transformation of yeast Candida utilis.

Proyecto (11)

Disarming pathogens: Development and evaluation of novel antimicrobials based on the inhibition of polyphosphate synthesis in hypervirulent and multidrug resistant Klebsiella pneumoniae strains
Diapause formation signaled by the RNAi machinery as a novel innate defense mechanism against bacterial pathogens.
Diapause formation signaled by the RNAi machinery as a novel innate defense mechanism against bacterial pathogens.
Development and evaluation of novel anti-microbial agents based on the inhibition of polyphosphate synthesis in opportunistic pathogenic bacteria.
Development and evaluation of novel anti-microbial agents based on the inhibition of polyphosphate synthesis in opportunistic pathogenic bacteria.
Quorum sensing and c-di-GMP pathway in biomining bacteria (Part II): Time for gene specific mutagenesis, a challenging outlook
Quorum sensing and c-di-GMP pathway in biomining bacteria (Part II)=> Time for gene specific mutagenesis, a challenging outlook.
Estudio de los determinantes de resistencia al cobre en bacterias y arqueas ambientales de uso en biominería y bioremediación.
Estudio de los determinantes de resistencia al cobre en bacterias y arqueas ambientales de uso en biominería y bioremediación.
Estudios de expresión global en bacterias del género Pseudomonas deficientes en los niveles de polifosfatos inorgánicos (poliP).
Estudios de expresión global en bacterias del género Pseudomonas deficientes en los niveles de polifosfatos inorgánicos (poliP).

Review (1)

Adaptive responses and cellular behaviour of biphenyl-degrading bacteria toward polychlorinated biphenyls
37
Francisco Chávez

Profesor Asistente

Departamento de Biología

Universidad de Chile

Santiago, Chile

5
Miguel Allende

Director

Biología

FACULTAD DE CIENCIAS, UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

3
Veronica Cambiazo

Profesora titular

Unidad de Nutrición Básica

UNIVERSIDAD DE CHILE - INTA

Santiago, Chile

2
Ricardo Cabrera

Assitant Pofessor

Biology

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

2
Javiera Ortiz

Postdoctorante

Instituto de Nutrición y Tecnología de los Alimentos

Universidad de Chile

Santiago, Chile

2
Carlos Lagos

Profesor Asociado

FACULTAD DE MEDICINA Y CIENCIA

UNIVERSIDAD SAN SEBASTIÁN

SANTIAGO, Chile

2
Andrés Marcoleta

Profesor Asistente

Biología

FACULTAD DE CIENCIAS, UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

2
Alejandro Maass

Main Researcher

Center for Mathematical Modeling

Universidad de Chile

Santiago, Chile

2
Rodrigo Pulgar

Profesor/Investigador asistente

INTA

UNIVERSIDAD DE CHILE - INSTITUTO DE NUTRICION Y TECNOLOGIA DE ALIMENTOS

Santiago, Chile

2
Felipe Gordillo

UNIVERSIDAD CATÒLICA DEL MAULE

Talca, Chile

1
Andrea Calixto

Full professor

Neuroscience

Universidad de Valparaíso

Valparaiso, Chile

1
Ignacio Poblete

Professor

Universidad Andres Bello

santiago, Chile

1
Cristian Varela

Postdoctoral Research Fellow

Albert Einstein College of Medicine

New York, Estados Unidos

1
Carlos Silva

Academico Hora

Química de los materiales

Universidad de Santiago de Chile

Santiago, Chile

1
JORGE PAVEZ

Professor

Materials Chemistry

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE CHILE

Santiago, Chile

1
Jenny Blamey

Director Científico

Research and Development

FUNDACIÓN CIENTÍFICA Y CULTURAL BIOCIENCIA

Santiago, Chile

1
Rosalba Lagos

Professor

Biología

UNIVERSIDAD DE CHILE, FACULTAD DE CIENCIAS, DEPARTAMENTO DE BIOLOGÍA

Santiago, Chile

1
Octavio Monasterio

Profesor Titular

Departamento de Biología

UNIVERSIDAD DE CHILE, FACULTAD DE CIENCIAS, DEPARTAMENTO DE BIOLOGÍA

Santiago, Chile

1
Bernardo Pollak

Postdoctorante

Fundacion Ciencia y Vida

Santiago, Chile

1
Lidia Verdugo

Profesional I+D

CECTA-USACH

Santiago, Chile

1
Valeria Villalobos

Profesor asistente

Universidad Autónoma de Chile

Santiago, Chile

1
Sergio Álvarez

Profesor Asistente

Bioquímica y Biología Molecular

UNIVERSIDAD DE CHILE. FACULTAD DE CIENCIAS QUÍMICAS Y FARMACÉUTICAS

Santiago, Chile

1
Nicolas Guiliani

Profesor Titular

Biología

UNIVERSIDAD DE CHILE

Santiago, Chile

1
Mauricio Gonzalez

Profesor Titular

INTA

UNIVERSIDAD DE CHILE - INSTITUTO DE NUTRICION Y TECNOLOGIA DE ALIMENTOS

Santiago, Chile

1
María Fernanda Palominos

Estudiante de Doctorado

Instituto de Neurociencia

Universidad de Valparaíso

Valparaiso, Chile