
Herman Silva Ascencio
Professor
Universidad de Chile
Santiago, Chile
Functional Genomics and Bioinformatics in plant species of agronomic interest: a) understand how plants respond to abiotic stress; b) comparative genomics to understand the accumulation of bioactive compounds; c) identification of molecular markers.
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Licenciate in Biochemistry, UNIVERSIDAD DE CONCEPCION. Chile, 1987
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Biochemist, UNIVERSIDAD DE CONCEPCION. Chile, 1988
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Ph. D., Plant Biology, Rutgers, The State University of New Jersey. Estados Unidos, 1998
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Professor Full Time
UNIVERSIDAD DE CHILE
Facultad de Ciencias Agronomicas
Santiago, Chile
2015 - A la fecha
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Associate Professor Full Time
Universidad Andres Bello
Santiago, Chile
2005 - 2010
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Assistant Professor Full Time
Universidad de Chile
Santiago, Chile
1999 - 2005
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Ph. D. Student Full Time
Rutgers University
New Brunswick, New Jersey, Estados Unidos
1994 - 1998
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Senior Lab Technician Full Time
Rutgers University
Piscataway, New Jersey, Chile
1991 - 1993
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Instructor Part Time
Universidad de Chile
La Pintana, Santiago, Chile
1990 - 1991
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Associate Professor Full Time
Universidad de Chile
Santiago, Chile
2011 - 2015
Post-Doctoral supervision:
• Dra. Karina Ruiz, Project Fondecyt postdoc N°3130624 “How does quinoa deal with salt stress? Evaluation of architectural traits and transcription factors related to stress tolerance genes that make it a successful crop in a challenging environment. October 2012-September 2014 (tutor).
• Dra. Lorena Marchant, Identification of metabolic pathways involved in the aroma of Fragaria chiloensis. April 2007-August 2007.
Doctoral students:
• Charleen Copier (Director), Doctorate in Agricultural and Veterinary Sciences, Universidad de Chile, ongoing (2019), CONICYT Fellow.
• Maria Angelica Ormeño (co-director), Doctorate in Agricultural and Veterinary Sciences, Universidad de Chile, ongoing (2019), CONICYT Fellow.
• Cristian Hernandez (co-director), Doctorate in Food and Nutrition, Universidad de Chile, ongoing (2019), CONICYT Fellow.
• Denisse Zamorano (Director), Doctorate in Agricultural and Veterinary Sciences, Universidad de Chile, ongoing (2017); CONICYT Fellow.
• Daniela Arias (co-director), Doctorate in Biotechnology, Universidad de Chile, finished 06/2019.
• Loreto Prat (Director), Doctorate in Biotechnology, Universidad Andres Bello, finished 12/2014. Current position: Associate Professor, University of Chile.
• Sergio Diez de Medina (Director), Doctorate in Biotechnology, Universidad Andres Bello, finished 05/2014, CONICYT fellow.
• Juan Carlos Rios (Director), Doctorate in Biotechnology, Universidad Andres Bello, finished 05/2014.
• Lorena Marchant (co-director), Doctorate in Biology, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, finished: 2004 (CONICYT and Andes Fundation fellow).
Master students:
• Javiera Fuentes, MSc. in Agricultural Sciences, Universidad de Chile, finished 11/2019.
• Barbara Valenzuela, MSc. in Agricultural Sciences, Universidad de Chile, finished 11/2019.
• Jorge Moraga, MSc. in Agricultural Sciences, Universidad de Chile, finished 12/2016.
Undergraduate students
• Romina Moris, Biochemistry, Universidad de Santiago, Undergraduate Thesis, ongoing (2019)
• Diego Caceres, Agronomist Engineering, Universidad de Chile, Undergraduate Thesis, ongoing (2019).
• Rodrigo Corral, Agronomist Engineering, Universidad de Chile, Undergraduate Thesis, 2020.
• Gaëlle Calvez, Agronomist Engineering, Universidad de Chile, Undergraduate Thesis, 2020.
• Kedy Ho, Biotechnology Engineering, Instituto Tecnológico de Costa Rica (TEC), 2018.
• Natalia Molina, Agronomist Engineering, Universidad de Chile, Undergraduate Thesis, 2017.
• Francisca Matus, Agronomist Engineering, Universidad de Chile, Undergraduate Thesis, 2013.
• María Soledad Cabrera, Molecular Biotechnology Engineering, Faculty of Sciences, Universidad de Chile, Undergraduate Thesis, 2011.
• Gabriel Ballesteros, Bioinformatics Engineering, Universidad de Talca, Undergraduate Thesis, 2010.
• Alejandra Cifuentes, Biochemistry, Faculty of Biological Sciences, Pontificia Universidad Católica, Undergraduate Thesis, 2010.
• Jonathan Maldonado, Molecular Biotechnology Engineering, Faculty of Sciences, Universidad de Chile, Undergraduate Thesis, 2010.
• Margarita Santiago, Molecular Biotechnology Engineering, Faculty of Sciences, Universidad de Chile, Undergraduate Thesis, 2007.
• Juan Saba, Civil Engineering in Computer Sciences, Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas, Universidad de Chile. Undergraduate Thesis, 2006 (co-adviser).
• Francisco Duarte, Biochemistry, Universidad de Santiago. Undergraduate Thesis, 2005.
• Andres Tittarelli, Molecular Biotechnology Engineering, Faculty of Sciences, Universidad de Chile, Undergraduate Thesis, 2005.
• Nicolas Loira, Civil Engineering in Computer Sciences, Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas, Universidad de Chile. Undergraduate Thesis, 2005 (co-adviser).
• Luis Milla, Molecular Biotechnology Engineering, Faculty of Sciences, Universidad de Chile, Undergraduate Thesis, 2003.
TEACHING RESPONSABILITIES
Currently: Biochemistry for agronomist undergraduate students (Universidad de Chile) and Advanced Genetics for Ph.D. students (Agricultural and Veterinary Sciences Program).
2015-2017: Rescue and valorization of the blood-flesh peach by generating a bank of live germplasm and the study of its nutritional and culinary properties in the town of Constitucion, Maule Region.(FIA; PYT-2015-0390). This project allowed the establishment of an association for family farmers to comercialize their products and get new peach plants with higher concentration of antioxidants.
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Academic Forum Chile - Japan 2014
CONICYT
Chile, 2014
Member of the chilean delegation to participate in the group Biological Sciences: Genes, cell and organisms. Chilean coordinator: Dr. Miguel Allende; Japanese coordinator: Dr. Hiroyuki Takeda
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Fellowship to attend to RGC7 (7th International Rosaceae Genomics Conference). Seattle, WA
RosBreed
Estados Unidos, 2014
7th International Rosaceae Genomics Conference.
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Associate Editor
Frontiers in Plant Science
Suiza, 2019
Plant Breeding Section
AtUTr1 a UDP-galactose/UDP-glucose transporter from Arabidopsis thaliana is located at the endoplasmic reticulum and is involved in protein folding quality control |
Functional Genomics: Transcriptomics |
Innovación, Desarrollo y Negocios en Biotecnología |
Disentangling the epigenetic influence on fruit development and ripening in three stone fruits (Prunus species) |
ACCLIMATION AND/OR "STRESS MEMORY" IN FRUIT TREES? DISENTANGLING INTERACTIONS BETWEEN ANATOMY, METABOLICS, ECOPHYSIOLOGY, AND TRANSCRIPTOME IN THE RESPONSE TO RECURRENT DROUGHT STRESS IN SPECIES WITH CONTRASTING DROUGHT TOLERANCE. |
CHARACTERIZATION OF FRUIT DEVELOPMENT AND IDENTIFICATION OF POTENTIAL BIOACTIVES COMPOUNDS IN PLUMS, PEACH AND SWEET CHERRY THROUGH CONVENTIONAL BREEDING AND MOLECULAR TECHNIQUES |
Rescate y valorización del durazno betarraga mediante la generación de un banco de germoplasma vivo y el estudio de sus propiedades nutricionales y culinarias en la comuna de Constitución, Región del Maule |
TRANSCRIPTOMIC AND GENOMIC ANALYSIS OF VASCONCELLEA CHILENSIS AND V. PUBESCENS=> AN EVOLUTIONARY AND COMPARATIVE APPROACH USING TWO PHENOTYPICALLY CONTRASTING PAPAYA SPECIES. |
IDENTIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE COMPUESTOS BIOACTIVOS EN PRUNUS AVIUM=> BASES GENÉTICAS Y MOLECULARES PARA ENTENDER LOS MECANISMOS DE S�NTESIS DE ESTOS COMPUESTOS Y SU VARIABILIDAD EN DIFERENTES CULTIVARES DE CEREZO. |
International collaborator: “RosBREED: Combining disease resistance with horticultural quality in new rosaceous cultivars” is provided by the Specialty Crop Research Initiative |
“RosBREED=> Combining disease resistance with horticultural quality in new rosaceous cultivars” |
FUNCTIONAL GENOMICS APPROACH TO UNDERSTAND CRACKING SUSCEPTIBILITY IN SWEET CHERRY=> AN INTEGRATIVE VIEW FOR PRUNUS SPECIES |
HOW DOES QUINOA DEAL WITH SALT STRESS? EVALUATION OF ARCHITECTURAL TRAITS AND TRANSCRIPTION FACTORS RELATED TO STRESS TOLERANCE GENES THAT MAKE IT A SUCCESSFUL CROP IN A CHALLENGING ENVIRONMENT. |
“Creación de una unidad de microscopia avanzada en el Campus Sur” |
Colaborador Internacional. RosBREED=> Enabling marker-assisted breeding in Rosaceae. |
Análisis de cultivos de papas sudamericanas en relación a su potencial uso en la producción de bio-hidrógeno y resistencia a patógenos |
FIELD STUDIES TO DETERMINE THE EFFECTS THAT ENVIRONMENTAL FACTORS MAY HAVE ON THE PHENOTYPE OF TRANSGENIC WHEAT PLANTS DESIGNED TO IMPROVE INORGANIC PHOSPHATE ACQUISITION FROM ACID SOILS. |
Proyecto redes “Análisis Genómico Funcional Comparativo entre Arabidopsis y Rosaceas, para identificar genes conservados que están involucrados en polaridad celular” |
Proyecto redes ”Genómica evolutiva de la interacción planta-insecto=> mecanismos moleculares en el modelo duraznero-áfido” |
Genética funcional de la producción de biomasa en árboles |
Potenciando la competitividad de la Industria de la Cereza de exportación. Sinergia entre agronomía y genética molecular para establecer un programa de mejoramiento genético asistido. |
The Millennium Nucleus in Plant Cell Biology & Biotechnology (PCB). Iniciativa Científica Milenio, Director alterno. |
Consorcio Bicentenario Ciencia-Empresa: Innovación Biotecnológica en la Producción de nuevas variedades de vides y frutales de carozo |
Study of plant cell polarity, The Millennium Nucleus in Plant Cell Biology (PCB) |
Study of the plant cytoskeleton during bacterial pathogen resistance-response |
Genómica Funcional en Nectarines=> Plataforma para potenciar la competitividad de Chile en exportación de frutas. Director alterno. |
Integración de genes de lupino en el genoma del trigo, con potencial para movilizar el fosforo inorgánico retenido en los suelos del centro-sur y sur de Chile. Fundación para la Innovación |
Genómica Funcional en Nectarines: Plataforma para potenciar la competitividad de Chile en exportación de frutas |
Integración de genes de lupino en el genoma del trigo, con potencial para movilizar el fosforo inorgánico retenido en los suelos del centro-sur y sur de Chile |
CHARACTERIZATION OF THE ARABIDOPSIS DEFENSE RESPONSE PATHWAY TO BOTRYTIS CINEREA INFECTION. |
The strawberry germplasm resources research based on genomics and metabolomics |

Cristian Gallardo
Profesor Titular
Departamento de Oceanografía
Universidad de Concepción
Concepcion, Chile

Marlene Gebauer
Profesor Asistente
Departamento de Ciencias Vegetales
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE (PUC)
Santiago, Chile

Gerardo Tapia
Encargado Recursos Geneticos Vegetales
Instituto de investigaciones agropecuarias, INIA
Chillán, Chile

Eduardo Agosin
Full Professor
Chemical and Bioprocess Engineering
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DE CHILE
Santiago, Chile

Carolina Torres
Professor/Researcher
Facultad de Ciencias Agrarias
UNIVERSIDAD DE TALCA
Talca, Chile

Ariel Orellana
Profesor Titular
Centro de Biotecnologia Vegetal
UNIVERSIDAD ANDRES BELLO
Santiago, Chile

Andrés Schwember
Profesor Asociado
Ciencias Vegetales
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE
Santiago, Chile

Gustavo Lobos
Associate Professor
Horticulture
FACULTDAD DE CIENCIAS AGRARIAS, UNIVERSIDAD DE TALCA
Talca, Chile

Mauricio Gonzalez
Profesor Titular
INTA
UNIVERSIDAD DE CHILE - INSTITUTO DE NUTRICION Y TECNOLOGIA DE ALIMENTOS
Santiago, Chile

VILBETT BRIONES
Académico/Director de Escuela
Ingeniería en Alimentos
UNIVERSIDAD DE LA SERENA
la serena, Chile

Leonardo Pavez
Profesor Asociado
Instituto de Ciencias Naturales
Universidad de Las Américas
Santiago, Chile

Veronica Cambiazo
Profesora titular
Unidad de Nutrición Básica
UNIVERSIDAD DE CHILE - INTA
Santiago, Chile

Claudio Meneses
Profesor Asociado
Facultad de Agronomía y Sistemas Naturales
Pontificia Universidad Católica de Chile
Santiago, Chile
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Lee Meisel
Associate Professor
Institute of Nutrition and Food Technology (INTA), University of Chile
Macul, Chile

Ninoska Delgado
Investigador Postdoctoral
Escuela Ingeniería en Medioambiente
Universidad de Valparaíso
Valparaiso, Chile

Andrés Tittarelli
Profesor Asociado
Instituto Universitario de Investigación y Desarrollo Tecnológico (IDT)
Universidad Tecnológica Metropolitana
Santiago, Chile

Máximo González
Investigador
Biotecnología
Centro de Estudios Avanzados en Zonas Aridas
La Serena, Chile

Andrea Morales
Académico de planta, encargada de Investigación
Salud
Universidad Santo Tomas
La Serena, Chile

Carolina Sanhueza
Académico e investigador
Ciencias y tecnología vegetal
Universidad de Concepción
Los Angeles, Chile

Juan Manuel Estrada
Director
Facultad de Ecología y Recursos Naturales
Universidad Andrés Bello
Quintay , Chile

Igor Pacheco
Profesor Asistente
Laboratorio de Bioinformática y Expresión Génica
INTA - Universidad de Chile
Santiago, Chile

Cristian Balbontin
Investigador
Produccion Vegetal
Instituto de Investigaciones Agropecuarias
Chillán, Chile

JONATHAN MALDONADO
Postdoc CONICYT
Dpto. Genética Molecular y Microbiología
Pontificia Universidad Católica de Chile
Santiago, Chile

Daniela Urbina
Profesora Conferenciante
Instituto de Ciencias Biológicas
Universidad de Talca
Talca, Chile

ERIKA SALAZAR
INVESTIGADORA
INSTITUTO DE INVESTIGACIONES AGROPECUARIAS INIA LA PLATINA
SANTIAGO, Chile

Rosa Scherson
Associate Professor
Departamento de Silvicultura y Conservación de la Naturaleza
Universidad de Chile
Santiago, Chile

Yohaily Rodríguez
Asistente de Investigación
Departamento de Ciencias Vegetales
Pontificia Universidad Católica de Chile
Santiago, Chile

Denisse Zamorano
INVESTIGADORA POSTDOCTORAL
CIENCIAS QUIMICAS
Universidad de La Frontera
TEMUCO, Chile